Using expression profiling arrays we will identify intracellular (from endomyocardial biopsies) as well as circulating (from plasma, urine and peripheral blood mononuclear cells) miRNAs that will distinguish heart transplant patients with graft rejection from those without rejection; different miRNA profile during cellular and antibody-mediated rejection will be identified. We will further validate panel of miRNAs that will enable more comfort and non-invasive detection of both types of rejection without the need of economically and technically demanding invasive diagnostics.

S využitím expresního profilováni identifikujeme intracelulární (z endomyokardiálních biopsií) a cirkulující (z plasmy, moči a periferních mononukleárních buněk) miRNA, které rozliší pacienty po srdeční transplantaci prodělávající rejekci od jedinců bez rejekce; dále identifikujeme profil miRNA, který od sebe odliší buněčnou rejekci od rejekce zprostředkované protilátkami. Následně validujeme panel miRNA, který umožní komfortnější neinvazivní detekci obou typů rejekce srdečního štěpu, bez nutnosti ekonomicky i technicky náročné invazivní diagnostiky.

• MeSH
• analýza moči metody   MeSH
• biochemická analýza krve metody   MeSH
• biologické markery analýza   MeSH
• biopsie metody   MeSH
• cirkulující mikroRNA analýza   MeSH
• lidé MeSH
• mikro RNA analýza   MeSH
• rejekce štěpu diagnóza   MeSH
• reprodukovatelnost výsledků MeSH
• senzitivita a specificita MeSH
• transplantace srdce MeSH
• vysoce účinné nukleotidové sekvenování metody   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• transplantologie
• kardiologie
• biochemie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Heat shock proteins (Hsps) are a family of molecular chaperones inducible by high temperature and cellular stress that prevent irreversible aggregation of proteins and exert immunomodulatory functions. Our recent publication demonstrated pro-fibrotic properties of Hsp90 in systemic sclerosis (SSc) and an efficient prevention of experimental dermal fibrosis by Hsp90 inhibition. In idiopathic inflammatory myopathies (IIM), Hsp90 expression was shown to be increased in few muscle tissue specimens of IIM. Our preliminary data on 20 SSc and 36 IIM patients show increased Hsp90 plasma levels in IIM associated with muscle involvement, disease activity/damage, and positive correlation with skin/lung involvement and disease activity in SSc. This study aims to assess potential role of Hsp90 as a biomarker and predictor of treatment response in IIM and SSc in large cohorts of these rare rheumatic diseases (est. 250 IIM, 80 SSc, 100 healthy), to analyze the role of Hsp90 in pathogenesis of IIM and assess the efficacy of Hsp90 inhibition in treatment of established experimental dermal fibrosis.

Proteiny tepelného šoku (Hsps) jsou skupinou molekulárních chaperonů indukovaných zvýšenou teplotou a buněčným stresem, které brání nereverzibilní agregaci proteinů a mají imunomodulační funkci. V naší nedávné publikaci jsme demonstrovali profibrotické vlastnosti Hsp90 u systémové sklerodermie (SSc) a účinné zabránění rozvoje experimentální kožní fibrózy pomocí inhibice Hsp90. U idiopatických zánětlivých myopatií (IZM) byla popsána zvýšená exprese Hsp90 v malém počtu vzorků svalové tkáně od pacientů s IZM. Naše předběžné výsledky u 20 SSc a 36 IZM pacientů poukazují na zvýšenou plasmatickou hladinu Hsp90 u IZM asociovanou se svalovým postižením a aktivitou/závažností nemoci a dále na pozitivní korelaci s postižením kůže/plic a aktivitou nemoci u SSc. Cílem této studie je zhodnotit potenciální roli Hsp90 jako biomarkeru a prediktoru léčebné odpovědi u IZM a SSc ve velké kohortě těchto vzácných revmatických onemocnění (cca 250 IIM, 80 SSc, 100 zdravých), dále prozkoumat roli Hsp90 v patogenezi IZM a zhodnotit účinnost inhibice Hsp90 v léčbě etablované experimentální kožní fibrózy.

• MeSH
• biologické markery analýza   MeSH
• fibróza MeSH
• lidé MeSH
• modely nemocí na zvířatech MeSH
• myozitida etiologie   metabolismus   MeSH
• myši MeSH
• proteiny tepelného šoku HSP90 analýza   metabolismus   škodlivé účinky   MeSH
• senzitivita a specificita MeSH
• systémová sklerodermie etiologie   metabolismus   MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• myši MeSH
• zvířata MeSH
• Publikační typ
• hodnotící studie MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• revmatologie
• ortopedie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Over past decade, the crucial role of microRNAs (small RNA molecules of 20-22 nucleotides) as perspective biomarkers, main players of the cardiovascular disease or both, has become widely recognized. By controlling the post-transcriptional gene expression, several miRNAs have been shown to modulate the cholesterol metabolism, function of endothelial cells, vascular smooth muscle cells, and macrophages, thereby regulating the development and progression of atherosclerosis. Based on our pilot studies we intend to analyze (i) selected circulating microRNAs mostly involved in regulation of genes, (ii) their target proteins/clinical parameters and (iii) genetic polymorphisms related to atherosclerosis in patients with severe hypercholesterolemia under lipoprotein apheresis treatment. We expect that robust changes of lipid homeostasis, induced by lipoprotein apheresis, might bring further insights into the role of selected circulating microRNAs mostly involved in regulation of genes and their target proteins related to the crucial atherogenic mechanisms.

Během posledního desetiletí byla objasněna zásadní role mikroRNA (malé RNA s 20-22 nukleotidy) jako perspektivních biomarkerů a/nebo kauzálních faktorů kardiovaskulárních onemocnění. MikroRNA regulují posttranskripční expresi genů, a tím významně zasahují do metabolismu cholesterolu, funkce endoteliálních buněk, hladkých svalových buněk a makrofágů. Tím se podílejí na regulaci vzniku a progrese aterosklerózy. Na základě výsledků našich pilotních studií je záměrem předkládaného projektu analyzovat (i) vybrané cirkulující mikroRNA, které se podílejí na regulaci exprese genů, (ii) jejich cílových proteinů/klinických parametrů a (iii) genetické polymorfismy ve vztahu k ateroskleróze u pacientů se závažnou hypercholesterolémií, léčených lipoproteinovou aferézou. Předpokládáme, že robustní změny v homeostáze lipidů, navozené lipoproteinovou aferézou, umožní dále objasnit úlohu vybraných cirkulujících mikroRNA, účastnících se řízení exprese genů a tvorby cílových proteinů v procesu aterogeneze.

• MeSH
• ateroskleróza etiologie   komplikace   MeSH
• biologické markery analýza   MeSH
• exprese genu MeSH
• hyperlipoproteinemie typ II diagnóza   farmakoterapie   MeSH
• lidé MeSH
• lipoproteiny LDL terapeutické užití   MeSH
• mikro RNA analýza   škodlivé účinky   MeSH
• polymorfismus genetický MeSH
• separace krevních složek MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• genetika, lékařská genetika
• vnitřní lékařství
• kardiologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

The grade of portal hypertension, expressed as portohepatic gradient (HVPG), determines the risk of severe complications in cirrhosis and represents an important factor in decision-making in variceal bleeding. We are able to reliably assess the degree of portal hypertension only by hepatic veins cathetrisation. The data published so far show a linear correlation between liver stiffness assessed by shear-wave elastography (SWE) and HVPG lower than 10 mm Hg. We presume that the correlation between liver stiffness and HVPG >12 mm Hg is not linear and that, with liver stiffness measurement and blood fibrosis markers assessment, we would be able to find a correlation also in HVPG > 12 mm Hg. The aim of the study is to find an easy and rapid algorithm to distinguish patients with severe portal hypertension (HVPG >12 mm Hg). The study will be performed in 100 patients with advanced cirrhosis awaiting liver transplantation. They will be examined by SWE, HVPG will be measured and blood fibrosis markers will be assessed. The collagen content will be assessed in the explanted liver.

Úroveň portální hypertenze vyjádřená portohepatálním gradientem (HVPG) determinuje výši rizika závažných komplikací u cirhotiků a je důležitým faktorem při rozhodování o léčbě při variceálním krvácení. Spolehlivě lze stupeň portální hypertenze změřit jen invazivně katetrizací jaterních žil. Dosud publikované práce ukazují na lineární korelaci mezi tuhostí jater změřenou shear-wave elestografií (SWE) a HVPG pouze do výše 10 mm Hg. Předpokládáme, že korelace mezi tuhostí jater a HVPG nad 12 mm Hg není lineární a že kombinací SWE a sérových markerů fibrózy bude možno nalézt korelaci i s vyššími hodnotami HVPG. Cílem je navrhnout algoritmus, kterým by bylo možno rychle a neinvazivně odlišit pacienty s významnou portální hypertenzí (HVPG 12 mm Hg a více). Studie bude provedena na 100 pacientech s pokročilou jaterní cirhózou čekajících na transplantaci jater. Před transplantací jim bude prováděna SWE, invazivní měření HVPG a vyšetření krevních markerů fibrózy. V explantovaných játrech bude stanoven obsah kolagenu.

• MeSH
• biologické markery analýza   MeSH
• elastografie MeSH
• jaterní cirhóza diagnostické zobrazování   komplikace   MeSH
• lidé MeSH
• portální hypertenze diagnostické zobrazování   komplikace   MeSH
• prognóza MeSH
• transplantace jater MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• hepatologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Effective search for producers of novel, pharmaceutically attractive natural compounds requires application of new screening techniques using genomic data. Growing information on the genetics of biosynthesis of natural compounds and their structural components, brings the possibility to use newly characterized enzymatic systems as markers in genetic screening of potential producers of structuraly and functionaly unique active metabolites, which may find it application as novel antibiotics, immunomodulators and cancerostatics. Two model enzymes of actinomycetes, the cyclizing aminolevulinate synthase and a novel type of type II polyketides synthase specific for short linear polyketide chains, will be employed in the project.

Efektivní vyhledávání producentů nových, farmaceuticky atraktivních, přírodních látek vyžaduje uplatnění nových skríningových technik s využitím genomových informací. Rostoucí informace o genetice biosyntézy přírodních látek a jejich strukturních komponent umožňuje využít nově charakterizované enzymové systémy jako markery při genetickém skríningu potenciálních producentů strukturně a funkčně unikátních aktivních látek, které se mohou uplatnit jako nová antibiotika, imunomodulátory a kancerostatika. V projektu budou takto využity dva modelové enzymy aktinomycet, cyklizující aminolevulinátsyntáza a nový typ polyketidsyntázy specifický pro krátké lineární polyketidy.

• MeSH
• Actinomycetaceae izolace a purifikace   MeSH
• antibakteriální látky MeSH
• biologické markery analýza   MeSH
• biosyntetické dráhy MeSH
• enzymy MeSH
• genetické testování metody   MeSH
• imunologické faktory MeSH
• lidé MeSH
• objevování léků metody   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• biochemie
• farmacie a farmakologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Neuroblastoma is the most frequent extra-cranial solid tumor in early childhood. Intensive combined therapy of high-risk neuroblastoma consists of surgery followed by chemotherapy and autologous hematopoietic stem cell transplantation, as well as radiotherapy. Such intensive therapeutic approach generates negative burden for patients’ immune system. Particularly radiotherapy and treatment using 13-cis-retinoid acid or topotecan are initiating processes that may result in accelerated ageing and immunosenescence. This project aims to address the impact of persistent chronic inflammation, as it occurs in neuroblastoma patients, to the progress of immunosenescence. We hypothesize that long-term inflammation caused by intense therapy changes the properties of subsets of myeloid cells and their precursors circulating in peripheral blood and negatively impact patient’s immunity. This project aims to develop new prognostic markers allowing to assess the progress of immunosenescence in order to prevent further serious complications, which occur long-term after the successful therapy.

Neuroblastom je nejčastější extrakraniální solidní nádor dětského věku. Intensivní kombinovaná terapie vysoce rizikové formy neuroblastomu zahrnuje chirurgické odstranění nádoru následované chemoterapií a autologní transplantací krvetvorné tkáně spolu s radioterapií. Takto intensivní terapeutický přístup má značný negativní vliv na imunitu. Především radioterapie a léčba pomocí 13-cis-retinové kyseliny a topotecanu mohou iniciovat procesy, které jsou zodpovědné za rozvoj předčasného stárnutí a imunosenescence. Tento projekt se zaměřuje na vliv chronického zánětu, který vzniká následkem léčby neuroblastomu, na rozvoj imunosenescence. Předpokládáme, že dlouhodobý zánět způsobený intenzivní léčbou mění vlastnosti myeloidních buněk a jejich prekurzorů v periferní krvi a to může mít negativní vliv na pacientovu imunitu. Cílem projektu je vyvinout prognostické znaky, které pomohou k časné detekci případných závažných následků léčby, které se vyskytují po úspěšné terapii pacientů s neuroblastomem.

• MeSH
• antitumorózní látky škodlivé účinky   MeSH
• biologické markery analýza   MeSH
• chronická nemoc MeSH
• dítě MeSH
• imunosenescence MeSH
• lidé MeSH
• myeloidní buňky účinky léků   MeSH
• neuroblastom farmakoterapie   komplikace   MeSH
• nežádoucí účinky léčiv diagnóza   MeSH
• prognóza MeSH
• stárnutí buněk MeSH
• telomery MeSH
• zánět MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• alergologie a imunologie
• onkologie
• pediatrie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Alzheimer disease (AD) is one of the most common disorders of elderly. Treatment options for AD especially in later stages are rather limited. Therefore, there is an increasing effort to find new highly specific biomarkers of AD sensitive especially in early stages of the disease. Previously, we evaluated new biomarkers of AD (complexes of amyloid beta peptides and some intracellular proteins) in cerebrospinal fluid. Here, we plan to develop more sensitive methods (ELISA, SPR biosensor) and to detect complexes of oligomeric amyloid or of amyloid beta 1-42 with intracellular binding targets (protein tau, mitochondrial enzymes 17beta-hydroxysteroid dehydrogenase type 10 and cyclophilin D). Values of the new biomarkers will be compared with the current biomarkers (amyloid beta 1-42, tau and phospho-tau) and with the degree of cognitive impairment. New biomarkers are expected to improve an ability to discriminate either AD from other types of dementia either mild cognitive impairment due to AD from that caused by other ethiology.

Alzheimerova demence (AD) je jedním z nejběžnějších typů onemocnění ve vysokém věku. Léčení AD je omezené zejména v pozdějších stádiích onemocnění. Sílí proto úsilí nalézt nové specifické biomarkery AD, které budou senzitivní zejména k časným stádiím nemoci. Během předchozího výzkumu jsme testovali nové biomarkery AD (komplexy amyloidu beta a některých intracelulárních proteinů) v likvoru. V tomto projektu plánujeme vyvinout nové více senzitivní metody (ELISA, SPR senzor) k detekci komplexů oligomerniho amyloidu beta nebo amyloidu beta 1-42 s intracelulárními vazebnými partnery (protein tau, mitochondriální enzymy 17beta-hydroxysteroidová dehydrogenáza typu 10 a cyklofilin D). Hladiny nových biomarkerů budou srovnány s běžnými biomarkery (amyloid beta 1-42, tau a fosfo-tau) i se stupněm kognitivního poškození. Očekáváme, že nové biomarkery pomohou zlepšit jednak rozlišení AD od jiných typů demencí jednak mírné kognitivní poškození způsobené AD od poškození způsobeného jinými příčinami.

• MeSH
• Alzheimerova nemoc diagnóza   MeSH
• amyloidní beta-protein analýza   MeSH
• biologické markery analýza   MeSH
• lidé MeSH
• mozkomíšní mok MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• neurologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

• MeSH
• akutní koronární syndrom diagnóza   MeSH
• biologické markery analýza   MeSH
• fibrilace síní diagnóza   MeSH
• imunochemie MeSH
• intrakraniální krvácení prevence a kontrola   MeSH
• krevní plazma chemie   MeSH
• růstový diferenciační faktor 15 analýza   MeSH
• sérologické testy metody   MeSH
• sérum chemie   MeSH
• srdeční selhání diagnóza   MeSH
• Publikační typ
• letáky MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• biochemie
• alergologie a imunologie
• diagnostika

• Klíčová slova
• metoda NAT-Nucleic Acid Test, komplexní rozšířený screening,
• MeSH
• biologické markery analýza   krev   MeSH
• dárci krve MeSH
• diagnostické techniky molekulární MeSH
• infekční nemoci MeSH
• krevní plazma MeSH
• krevní transfuze MeSH
• plošný screening metody   MeSH
• výběr dárců MeSH

The exact role of visfatin in the processes of pathological joint diseases has not yet been fully explained. The grant project focuses upon the evaluation of the function visfatin fulfils in the immune response in the course of RA. Using cytometry methods, visfatin-producing cells of the peripheral blood and synovial fluid will be characterised in more detail. Using gene interference, the intracellular role of visfatin in these cells will be monitored and the impact of biotherapeutic pharmacological intervention upon visfatin levels will be monitored in order to obtain a more detailed characteristics of visfatin as a potential prognostic marker for rheumatoid arthritis, and, furthermore, to study the potential therapeutic application of its inhibition in autoimmune diseases.

Přesná úloha visfatinu v průběhu patologických kloubních onemocnění není doposud zcela objasněna. Grantový projekt je zaměřen na zhodnocení podílu visfatinu na imunitní odpovědi v průběhu RA. Pomocí cytometrických metod budou blíže typizovány buňky periferní krve a synoviální tekutiny produkující visfatin. Pomocí genové interference bude sledována intracelulární role visfatinu v těchto buňkách a bude hodnocen vliv farmakologické intervence biologickou léčbou na hladiny visfatinu s cílem blíže charakterizovat visfatin jako potenciální prognostický marker revmatoidní artritidy a dále prostudovat potenciální terapeutické využití jeho inhibice u autoimunitních onemocnění.

• MeSH
• antigeny CD20 krev   účinky léků   MeSH
• biologická terapie MeSH
• biologické markery analýza   MeSH
• nikotinamidfosforibosyltransferasa MeSH
• prognóza MeSH
• průtoková cytometrie MeSH
• revmatoidní artritida patofyziologie   MeSH
• RNA interference MeSH
• synoviální tekutina MeSH
• TNF-alfa antagonisté a inhibitory   krev   účinky léků   MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• biochemie
• farmacie a farmakologie
• alergologie a imunologie
• revmatologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR