Přesná úloha visfatinu v průběhu patologických kloubních onemocnění není doposud zcela objasněna. Grantový projekt je zaměřen na zhodnocení podílu visfatinu na imunitní odpovědi v průběhu RA. Pomocí cytometrických metod budou blíže typizovány buňky periferní krve a synoviální tekutiny produkující visfatin. Pomocí genové interference bude sledována intracelulární role visfatinu v těchto buňkách a bude hodnocen vliv farmakologické intervence biologickou léčbou na hladiny visfatinu s cílem blíže charakterizovat visfatin jako potenciální prognostický marker revmatoidní artritidy a dále prostudovat potenciální terapeutické využití jeho inhibice u autoimunitních onemocnění.; The exact role of visfatin in the processes of pathological joint diseases has not yet been fully explained. The grant project focuses upon the evaluation of the function visfatin fulfils in the immune response in the course of RA. Using cytometry methods, visfatin-producing cells of the peripheral blood and synovial fluid will be characterised in more detail. Using gene interference, the intracellular role of visfatin in these cells will be monitored and the impact of biotherapeutic pharmacological intervention upon visfatin levels will be monitored in order to obtain a more detailed characteristics of visfatin as a potential prognostic marker for rheumatoid arthritis, and, furthermore, to study the potential therapeutic application of its inhibition in autoimmune diseases.

• MeSH
• antigeny CD20 krev   účinky léků   MeSH
• biologická terapie MeSH
• biologické markery analýza   MeSH
• nikotinamidfosforibosyltransferasa MeSH
• prognóza MeSH
• průtoková cytometrie MeSH
• revmatoidní artritida patofyziologie   MeSH
• RNA interference MeSH
• synoviální tekutina MeSH
• TNF-alfa antagonisté a inhibitory   krev   účinky léků   MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• biochemie
• farmacie a farmakologie
• alergologie a imunologie
• revmatologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Frekvence a nepříznivá prognosa TEL/ABL-positivních dětských akutních lymfoblastických leukemií byla dosud podceněna. Odhalení okolností vývoje TEL/ABL-positivního (pre)leukemického klonu, biologických vlastností a mechanismů citlivosti a resistence na cílenou léčbu TEL/ABL-positivní ALL přispěje ke zlepšení léčebných výsledků této prognosticky velmi nepříznivé skupiny dětských pacientů.; The frequency and adverse prognosis of TEL/ABL-positive childhood acute lymphoblastic leukaemias have so far been underrated. Discovering the circumstances of the development of the TEL/ABL-positive (pre)leukaemic clone, biological attributes and the mechanisms of its sensitivity and resistance to the targeted treatment of the TEL/ABL-positive ALL will contribute towards improving the treatment of the paediatric patients from this group, who have so far faced a particularly unfavourable prognosis.

• MeSH
• akutní lymfatická leukemie terapie   MeSH
• bcr-abl fúzní proteiny MeSH
• diagnostické techniky molekulární MeSH
• dítě MeSH
• fúze genů MeSH
• fúzní onkogenní proteiny MeSH
• nádorové biomarkery analýza   MeSH
• polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí MeSH
• RNA interference MeSH
• tyrosinkinasy antagonisté a inhibitory   MeSH
• umlčování genů MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH

• Konspekt
• Pediatrie
• NLK Obory
• pediatrie
• onkologie
• hematologie a transfuzní lékařství
• molekulární biologie, molekulární medicína
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Předmětem řešení projektu je studium vzájemných interakcí tumorsupresorového proteinu p53 a prozánětlivého cytokinu interleukinu-1alfa včetně charakterizace vlivu histonacetyltransferáz na tyto interakce. Součástí projektu je i výzkum možnosti ovlivněnífunkčních interakcí p53 s IL-1alfa pomocí specifických nízkomolekulárních inhibitorů. Projekt předpokládá využití sofistikovaných metod molekulární a buněčné biologie včetně imunoprecipitace, konfokální fluorescenční mikroskopie, RNA interference, qRT-PCR a systematického prohledávání kombinatorické knihovny chemických látek potenciálně využitelných v protinádorové terapii.; This project aims to study the interaction between the tumour supressor protein p53 and the proinflammatory cytokine IL-1alpha including the characterization of the influence of histone acetyltransferases on this interaction. Part of the project involvesalso testing the possibility of influencing the functional interaction of p53 and IL-1alpha with specific low-molecular-weight inhibitors. The project supposes the application of sophisticated molecular and cell biology techniques including immunoprecipitation, confocal fluorescence microscopy, RNA interference, qRT-PCR and systematically searching the combinatorial library of drug-like chemical compounds suitable for use in the anti-tumour therapy.

• MeSH
• fluorescenční mikroskopie metody   využití   MeSH
• histonacetyltransferasy MeSH
• imunoprecipitace metody   využití   MeSH
• interleukin-1alfa MeSH
• nádorová transformace buněk MeSH
• nádorové biomarkery MeSH
• nádorový supresorový protein p53 MeSH
• polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí metody   využití   MeSH
• prekancerózy diagnóza   terapie   MeSH
• RNA interference MeSH
• staging nádorů MeSH
• transformované buněčné linie MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• onkologie
• biologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

MikroRNA a malé interferující RNA (siRNA) působí jako sekvenčně specifické modulátory genové exprese. Regulace exprese genů prostřednictvím malých RNA, nazývaná jako RNA interference, má zásadní význam pro vznik i vlastnosti nádorů. Malé RNA jsou u mnohatypů nádorů aberantně exprimovány a každá nádorová tkáň vykazuje specifický expresní profil mikroRNA. Klasifikace a predikce chování nádorů založená na analýze mikroRNA se stává velmi efektivním nástrojem v onkologické diagnostice. Projekt se zabývá analýzou mikroRNA (tzv. miRNomu) u pacientů s chronickou lymfatickou leukémií a dalšími malignitami a využitím siRNA pro specifickou inhibici exprese významných genů aberantně exprimovaných v nádorových buňkách. Sledování exprese mikroRNA v nádorových buňkách a korelace výsledků s klinickými daty a ostatními prognostickými markery umožní zpřesnění diagnózy a prognózy nádorových onemocnění i zvýšení efektivity terapie z lékařského i ekonomického hlediska.; MicroRNAs and small interfering RNAs (siRNA) function as sequence-specific modulators of a gene expression. Regulation of the gene expression using small RNAs, called RNA interference, has a crucial role in tumor formation and properties. Small RNAs areaberrantly expressed in many tumors and each cancerous tissue exhibits a specific miRNA expression profile. Classification and prediction of tumor behavior based on miRNA analysis become an effective instrument in oncological diagnostics. The project will include miRNA analysis (so called miRNome) in patients with chronic lymphocytic leukemia and other tumors and use of siRNA molecules for specific inhibition of the expression of important genes aberrantly expressed in cancer cells. Evaluation of miRNAexpression profiles in tumor cells and correlation of results with clinical data and other prognostic markers enables to specify cancer diagnosis and prognosis and improve therapy effectivity from both medical and economical aspects.

• MeSH
• genetická terapie MeSH
• leukemie diagnóza   terapie   MeSH
• malá interferující RNA MeSH
• mikro RNA MeSH
• mikročipová analýza MeSH
• polymerázová řetězová reakce MeSH
• regulace genové exprese MeSH
• RNA interference MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• hematologie a transfuzní lékařství
• onkologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Úkolem této studie je porozumění změn v genové expresi na buněčné úrovni v souvislosti se zablokováním exprese COX1 resp. COX2 pomocí RNA interference (RNAi). Pomocí RNAi, syntetických siRNA nebo shRNA exprimujících plasmidů či retrovirů, budou vytvořenybuněčné linie se zablokovanou expresí COX1 resp. COX2. Profil genové exprese bude určen pomocí DNA mikročipů srovnáním s mateřskou linií a ověřením pomocí real-time PCR. Na základě prvních výsledků bude sestaven experimentální jednoúčelový DNA mikročipobsahující vybrané geny. Na základě výsledků bude posouzena fyziologická funkce COX1 a COX2 v souvislosti s absencí jedné z izoforem.; The aim of this study is to better understand the cellular gene expression changes upon the RNA interference (RNAi) mediated down-regulation of COX1 resp. COX2 gene expression. The corresponding cell-lines with COX1 resp. COX2 gene expression down regulated will be constructed via RNAi, the synthetic siRNA or plasmid or retrovirus mediated shRNA expression, respectively. The gene expression profile will be determined by DNA microarrays comparing the gene expression with parental cell-line. Based on theresults, experimental, single-purpose DNA microarray containing selected genes will be constructed. Altered physiological function of COX1 resp. COX2 in the absence of one of the isoforms will be discussed.

• MeSH
• cyklooxygenasa 1 fyziologie   MeSH
• cyklooxygenasa 2 fyziologie   MeSH
• exprese genu MeSH
• inhibitory cyklooxygenasy škodlivé účinky   MeSH
• malá interferující RNA MeSH
• mikročipové analytické postupy MeSH
• polymerázová řetězová reakce MeSH
• RNA interference MeSH
• zánět MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• biologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Cílem projektu je funkční charakterizace exprese mutantních forem genů BRCA1 a BRCA2 v in vitro modelu primárních buněk kultivovaných ze žlázové tkáně prsu nosiček mutací v genech BRCA1 nebo BRCA2. Po odběru punkční biopsií budou buňky kultivovány s využitím "feeder-layer" techniky. V buňkách in vitro bude exprese wt alely inhibována pomocí RNA interference. Studována bude BRCA1/2-dependentní exprese genů, resp. její alterace, pomocí cDNA array. Charakterizace cílů defektní signalizace BRCA1/2 bude kvantifikována pomocí qRT-PCR a western blottingu; defektní lokalizace genových produktů bude studována pomocí separační centrifugace. V primárních buňkách bude studován účinek protinádorových léčiv v závislosti na diferencované expresi mutantních resp. wt forem genů BRCA1/2.; The aim of the project is characterization of cellular changes produced by expression of mutant BRCA1 and BRCA2 genes in the in vitro model of mammary cells cultivated from breast glandular structures of BRCA1/2 mutation carriers. Following fine-needle biopsy, the cells will be cultivated using "feeder layer technique". BRCA1/2 wt allele expression will be silenced using RNA interference. BRCA1/2-dependent gene expression will be studied using cDNA arrays. Selected targets of altered BRCA1/2 signalization will be quantified using qRT-PCR and western blotting; mislocalization of gene products will be fractionated using centrifugation. The effect of anticancer therapy will be studied in primary mammary cells expressing wt, or mutant, or both alleles of the BRCA1/2 specified gene alterations.

• MeSH
• cytostatické látky MeSH
• nádory prsu genetika   MeSH
• polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí MeSH
• protein BRCA1 MeSH
• protein BRCA2 MeSH
• RNA interference MeSH
• sekvenční analýza hybridizací s uspořádaným souborem oligonukleotidů MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• gynekologie a porodnictví
• onkologie
• biologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

• MeSH
• hluboká mozková stimulace MeSH
• kuřecí embryo inervace   MeSH
• nervové dráhy MeSH
• RNA interference MeSH
• světelná stimulace metody   MeSH
• transkraniální magnetická stimulace MeSH
• Check Tag
• kuřecí embryo inervace   MeSH
• Publikační typ
• sborníky MeSH

• Konspekt
• Lékařské vědy. Lékařství
• NLK Obory
• neurovědy

Navrhovaná studie se zaměří na vztrah mezi hybridním genem TEL/AML1, L-asparaginasou a regulací genu pro asparagin synthetasu v leukemických buńkách. Budeme využívat moderní přístupy včetně kvantitativní PCR v reálném čase a RNA interference. Budeme studovat mechanismy regulace exprese asparagin synthetasy, aktivitu asparagin synthetasy, vztah mezi TEL/AML1 a expresí asparagin synthetasy a resistencí na L-asparaginasu.; Proposed study will concentrate on relationship between TEL/AML1 hybrid gene, L-Asparaginase and Asparagine Synthetase regulation in leukaemic cells. We will employ modern approaches including quantitative real-time PCR and RNA interference. We will study the mechanisms of Asparagine Synthetase expression regulation, Asparagine Synthetase activity, relationship between TEL/AML1 and Asparagine Synthetase exúression and resistance to L-asparaginase.

• MeSH
• akcelerovaná fáze myeloidní leukemie MeSH
• asparaginsynthetasa MeSH
• dítě MeSH
• exprese genu MeSH
• leukemie genetika   patologie   MeSH
• polymerázová řetězová reakce metody   MeSH
• průtoková cytometrie MeSH
• RNA interference MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• hematologie a transfuzní lékařství
• onkologie
• pediatrie
• biologie
• histologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

• MeSH
• Nobelova cena MeSH
• RNA interference MeSH
• Publikační typ
• sborníky MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• biologie
• humanitní vědy a umění

• MeSH
• genetická terapie metody   trendy   MeSH
• komplex RISC terapeutické užití   MeSH
• malá interferující RNA MeSH
• RNA interference MeSH
• Publikační typ
• sborníky MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• biologie
• biochemie