• MeSH
• biologie MeSH
• lékařská genetika MeSH
• molekulární medicína MeSH

• Konspekt
• Lékařské vědy. Lékařství
• Učební osnovy. Vyučovací předměty. Učebnice
• NLK Obory
• biologie
• NLK Publikační typ
• učebnice vysokých škol

Zobrazovací metody jsou základem diagnostiky, stagingu i sledování efektu terapie plicního karcinomu. Trendem posledních let je využití tzv. funkčních zobrazovacích metod, které kombinují morfologii s určitým klinickým parametrem - např. metabolickou aktivitou (PET/CT), difuzivitou (MR) či vaskularizací (CT). Tato kombinace umožňuje jednak zpřesnění klinického obrazu onemocnění a současně poskytuje informaci o dynamice jeho průběhu. Vývoj metod v oblasti nádorové genomiky v posledních několika letech vedl k novým minimálně-invazivním postupům molekulárních vyšetření DNA uvolňované z nádorové masy do periferního oběhu (circulating tumor DNA, ctDNA) a jejich využití pro zpřesnění diagnostiky a racionální volbu cílené protinádorové terapie. V tomto projektu je předkládán zcela nový koncept funkčních zobrazovacích metod založených na kombinaci PET/CT vyšetření s kvantitativním stanovením ctDNA, který bude vyvinut na souboru celkem 200 pacientů podstupující systémovou terapii bronchogenního karcinomu, u kterých bude v čase sledován a hodnocen klinický průběh onemocnění a léčby.; Imaging methods are fundamental for diagnosis, staging and monitoring of therapy of lung cancer. Functional imaging combines morphology with clinical parameters - e.g. metabolic activity (PET/CT), diffusivity (MR) or vascularization (CT) is a new trend to improve accuracy of clinical description of the actual disease status and information on the dynamics of its progress. Development of methods in the field of cancer genomics in the last few years has led to a new minimally-invasive procedures for molecular profiling of DNA released from the tumor mass into the peripheral circulation (circulating tumor DNA, ctDNA) and its usage for more accurate diagnosis and rational choice of targeted anticancer therapies. The present project proposes an entirely new concept of functional imaging methods based on the combination of PET/CT examination with quantitative determination of ctDNA which will be developed on the set of 200 patients undergoing systemic therapy of lung cancer. The clinical course of the disease treatment will be followed over time using this new combination approach.

• MeSH
• cirkulující nádorová DNA analýza   MeSH
• fenomika metody   MeSH
• genomika metody   MeSH
• genotypizační techniky MeSH
• kombinovaná terapie metody   MeSH
• nádorové biomarkery MeSH
• nádory plic diagnostické zobrazování   genetika   MeSH
• PET/CT metody   MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• radiologie, nukleární medicína a zobrazovací metody
• genetika, lékařská genetika
• onkologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

• MeSH
• Betacoronavirus MeSH
• chřipka lidská MeSH
• COVID-19 MeSH
• epidemický výskyt choroby MeSH
• infekce dýchací soustavy MeSH
• jednotky intenzivní péče MeSH
• klinické lékařství MeSH
• koronavirus MERS MeSH

• Konspekt
• Veřejné zdraví a hygiena
• NLK Obory
• veřejné zdravotnictví
• infekční lékařství
• NLK Publikační typ
• publikace WHO

• MeSH
• pneumologie MeSH

• Konspekt
• Učební osnovy. Vyučovací předměty. Učebnice
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• pneumologie a ftizeologie
• NLK Publikační typ
• učebnice vysokých škol
• kolektivní monografie

Refluxní choroba jícnu (GERD) je rozšířené onemocnění postihující 10-20% světové populace. Může vést k jícnové a mimojícnové (EER) symptomatologii. GERD a EER jsou dvě propojené, ale specifické nemoci s rozdílnými rizikovými faktory, symptomy, patofyziologií a odpovědí na terapii. Diagnostické metody pro potvrzení nebo vyvrácení GERD / EER nedosahují vysokou senzitivitu a specificitu. V klinické praxi je třeba rozlišit pacienty s příznaky v souvislosti s refluxem (zvýšený počet refluxních epizod, nebo hypersenzitivita k normálnímu množství refluxních epizod) od pacientů s příznaky podobnými refluxním, ale ne v důsledku refluxu (funkční poruchy). K detekci GERD je zapotřebí lepších diagnostických metod zejména v případě, že mají nízké náklady, jsou neinvazivní a mohou být prováděny v rámci primární péče. Současný návrh se zaměřuje na vývoj a hodnocení neinvazivních metod založených na analýze kondenzátu vydechovaného vzduchu a slin s cílem zlepšit diagnostiku GERD / EER.; Gastroesophageal reflux disease (GERD) is a highly prevalent disease, affecting 10-20% individuals worldwide. It can lead to esophageal and extraesophageal (EER) symptomatology. GERD and EER are two unique, but related disease entities, with different risk factors, symptoms, pathophysiology and response to therapy. Diagnostic methods to confirm or reject GERD/EER do not achieve high sensitivity and specificity. In routine clinical practice, there is a need to distinguish patients with symptoms that are due to reflux (either increased reflux or hypersensitivity to a normal amount of reflux) from patients with symptoms suggestive of reflux but not due to reflux (ie, FH). Better tools for GERD/EER diagnosis are needed, particularly, if they have low cost, are non-invasive and can be performed in a primary care setting. The development and assessment of non-invasive methods based on monitoring exhaled breath condensate and saliva is proposed to improve the diagnosis of GERD/EER.

• MeSH
• dechové testy metody   MeSH
• gastroezofageální reflux diagnóza   MeSH
• lidé MeSH
• pilotní projekty MeSH
• reprodukovatelnost výsledků MeSH
• sliny MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• hodnotící studie MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• gastroenterologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Roste počet jedinců s náhodně diagnostikovanou mozkovou výdutí, jejíž prasknutí vede k nejtěžší formě cévní mozkové příhody. Metoda počítačového modelování hemodynamiky se snaží popsat patofyziologii a riziko ruptury mozkové výdutě. V našem projektu chceme využít modely hemodynamiky kalkulované na základě neinvazivních radiodiagnostických metod a pomocí vlastního algoritmu vyvinutého v Matematickém ústavu Univerzity Karlovy. Hlavním cílem projektu je u pacientů operovaných pro mozkovou výduť, prasklou i neprasklou, popsat parametry hemodynamiky a tyto korelovat s histologickými změnami cévní stěny vaku aneuryzmatu. Dalším cílem je u skupiny sledovaných neprasklých aneuryzmat, která jsou vedena v multicentrické databázi sdílené několika neurochirurgickými pracovišti v ČR, popsat vývoj hemodynamických parametrů v čase a porovnat s výsledky hemodynamiky prasklých aneuryzmat. Projekt pomáhá vytvářet multioborovou platformu s mezinárodní spoluprácí pro výzkum hemodynamiky mozkových aneuryzmat.; The number of patients incidentally diagnosed for a brain aneurysm, the rupture of which may lead to the most severe type of stroke, is increasing. Modelling hemodynamics in brain aneurysms tries to describe pathophysiology and the risk of rupture of intracranial aneurysms. In our project we will assess models of hemodynamics based non-invasive radiodiagnostic methods and an in-house mathematical algorithm developed at the Mathematical Institute of the Charles University. The main goal of the project is to correlate parameters of hemodynamics with histological changes of the blood vessels wall of the aneurysm sac in patients operated for ruptured as well as unruptured intracranial aneurysms. Another goal of the project is to evaluate hemodynamics in followed unruptured aneurysms from our multicenter database shared among several neurosurgical centers in the Czech Republic and compare with hemodynamic parameters in ruptured aneurysms. The project will help building a multi-modal platform for studying CFD in brain aneurysms with international cooperation.

• MeSH
• cévy patologie   MeSH
• hemodynamika MeSH
• intrakraniální aneurysma komplikace   patofyziologie   MeSH
• lidé MeSH
• počítačová simulace MeSH
• prasklé aneurysma etiologie   patofyziologie   patologie   MeSH
• rizikové faktory kardiovaskulárních chorob MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• neurologie
• angiologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Nealkoholická jaterní steatóza (NAFLD) se pojí se zvýšeným rizikem kardiovaskulárních chorob a vyšší celkovou mortalitou. U pacientů po transplantaci jater je prevalence NAFLD/NASH (steatohepatitida) ve srovnání s běžnou populací významně vyšší. Identifikace časných známek NAFLD/NASH může být relevantní pro další predikci rozvoje onemocnění nejenom u transplantovaných pacientů, ale i v běžné populaci. Zaměříme se na tyto oblasti: 1. profilace rizikových alel vybraných genů asociovaných s vyšší pravděpodobností rozvoje steatózy v genomu příjemce; 2. přítomnost inzulínové rezistence a změn v energetickém metabolismu ve svalu a v játrech příjemce; 3. identifikace změn v expresi (aktivace/suprese) specifických metabolických drah ve štěpu metodou microarray (na úrovni transkriptomu). Dále se zaměříme na validaci neinvazivních metod, které mohou indikovat časné fáze NAFLD. Využijeme možnosti vzájemně korelovat údaje získané magnetickou rezonanční spektroskopií a elastografií s histologickým hodnocením a transkriptomickými daty.; Nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD) is associated with higher risk of cardiovascular disease and overall mortality. Identification of NAFLD/NASH (steatohepatitis) markers is relevant for NAFLD prediction or early diagnosis and treatment not only in liver transplant recipients, included into this study, but also in general population. We will focus on these indicators: 1. recipient ́s profile of genetic polymorphisms associated with higher probability of steatosis; 2. occurrence of insulin resistance and altered liver/skeletal muscle energy metabolism; 3. identification of genes and/or pathways differentially expressed in liver tissue due to NAFLD/NASH. We will also focus on the validation of non-invasive methods such as MR spectroscopy and elastography in identification of early stages of NAFLD. Results obtained from these non-invasive methods together with histological results and the identified set of genetic, metabolic and transcriptomic markers associated with NAFLD/NASH disease will be cross-correlated and assessed for its predictive value for the progression of NAFLD/NASH.

• MeSH
• alely MeSH
• biologické markery MeSH
• dárci tkání MeSH
• genotyp MeSH
• inzulinová rezistence MeSH
• lidé MeSH
• multiomika MeSH
• nealkoholová steatóza jater etiologie   genetika   MeSH
• pooperační období MeSH
• rizikové faktory MeSH
• stanovení celkové genové exprese MeSH
• transplantace jater MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• genetika, lékařská genetika
• hepatologie
• transplantologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Kondenzát vydechovaného vzduchu (EBC) představuje bohatý zdroj biomarkerů, které mohou poskytnout cenné informace o respiračních stejně jako o systémových onemocněních. Nalezení neinvazivních metod pro včasnou detekci poškození plic, zánětu a infekčních komplikací u chronických onemocnění, jako je cystická fibróza (CF) nebo astma bronchiale (AB) by bylo velmi přínosné. Navrhujeme proměřit proteinové "dechové otisky" z EBC, tvořící molekulární podpisy plicního zánětu a specifických respiračních bakteriálních infekcí u pacientů s CF a AB. Předpokládáme, že analýza EBC může odhalit biomarkery specifické pro tíži zánětu a identifikovat infekce způsobené oportunními patogeny, jako je např. P. aeruginosa (PA). Tyto dechové profily plánujeme korelovat s nálezy plicní mikroflóry pomocí tradičních metod a s tíží onemocnění cystickou fibrózou. Předpokládáme, že naše studie urychlí využití analýzy EBC jako nového nástroje pro stanovení správné diagnózy AB a umožní neinvazivní sledování aktivity onemocnění CF, účinnosti léčby a zpřesní diagnostiku oportunních infekcí.; Exhaled breath condensate (EBC) represents a rich source for countless biomarkers that can provide valuable information about respiratory as well as systemic diseases. Finding non-invasive methods for early detection of lung injury, inflamation and infectious complications in chronic diseases like Cystic fibrosis (CF) or bronchial asthma (AB) would be highly beneficial. We propose to establish EBC “breath-prints” revealing molecular signatures of pulmonary inflammation and specific respiratory bacterial infections of CF patients and AB. We hypothesize that the analysis of EBC can reveal biomarkers specific for severity of the inflammation and infection caused by opportunistic pathogens such as P. aeruginosa. With these breath-prints, we also propose to establish correlations between respiratory microbiota using traditional methods and CF lung disease severity. Together, our studies will advance the development and validation of EBC as a novel tool for the proper diagnosis of AB and monitoring of CF disease activity, treatment efficacy and diagnosis of opportunistic infections.

• MeSH
• biologické markery MeSH
• bronchiální astma diagnóza   genetika   MeSH
• cystická fibróza diagnóza   genetika   MeSH
• dechové testy metody   MeSH
• lidé MeSH
• proteomika metody   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• pneumologie a ftizeologie
• genetika, lékařská genetika
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Výdechový plicní kondenzát (exhaled breath condensate, EBC) představuje bohatý zdroj nesčetných biomarkerů, které mohou poskytnout cenné informace o respiračních i systémových onemocněních. Identifikace neinvazivních metod pro sensitivní a specifickou diagnostiku karcinomu plic, která by jej odlišila od jiných plicních nemocí, často doprovázejících nádor (zánět, kouření, infekce), by měla mimořádnou klinickou hodnotu. Proteomická analýza EBC má realistický potenciál detekovat časné změny ve stavu dýchacích cest a pravděpodobně i v dalších orgánech. Tato metoda by mohla nahradit nebo doplnit některé invazivní techniky odběru biologického materiálu v budoucnosti a umožnit neinvazivní skrínink karcinomu plic v rizikových populacích. Předkládaný projekt umožní vývoj a validaci proteomických biomarkerů v EBC pro časnou diagnostiku plicních nádorů, monitorování aktivity onemocnění a stanovení jeho prognózy, případně predikci terapeutické odpovědi.; Exhaled breath condensate (EBC) represents a rich source for countless biomarkers that can provide valuable information about respiratory as well as systemic diseases. Finding non-invasive methods for early detection of lung cancer on the background of underlying lung injury (inflammation, smoking, infections, etc.) would be highly beneficial. Proteomic analysis of EBC has the potential to detect early changes in the status of the respiratory system and possibly other organs. It could also replace or complement some invasive sampling methods in future and provide non-invasive lung cancer screening technique. Together, our studies will advance the development and validation of EBC as a novel tool for the proper diagnosis of lung cancer and monitoring of disease activity, treatment efficacy and prognosis.

• MeSH
• dechové testy metody   MeSH
• lidé MeSH
• nádorové biomarkery analýza   MeSH
• nádory plic diagnóza   genetika   MeSH
• proteomika metody   MeSH
• tekutá biopsie MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• genetika, lékařská genetika
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

• MeSH
• diagnostické techniky a postupy MeSH
• vnitřní lékařství MeSH
• Publikační typ
• učebnice MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• vnitřní lékařství
• diagnostika