JavaScript NENÍ povolen !

Although the spectrum of cancer biomarkers is constantly expanding, determining the morphology is a decisive criterion for diagnosis. Recent research in breast cancer has shown that the degree of differentiation is accompanied by changes in miRNA expression. However, nothing is known about relationship between the described changes and tumor morphology or whether these changes have an individual or general character. We suggest to compare the miRNA expression profiles from different parts of the same tumor which have different morphology as well as tumors with the same morphology from different patients and analyse whether specific miRNAs are released into blood. Microdissection of cells from paraffin blocks of TNBC and miRNA microarray analysis will be used. Tissue and serum levels of selected miRNAs will be monitored by qPCR in an extended validation set and their functions will be studied by experiments on cell lines. The project could contribute to the discovery of new principles governing morphogenesis in tumors as well as identify novel diagnostic and prognostic markers.

Přestože se spektrum biomarkerů užívaných v onkologii neustále rozšiřuje, zůstává stanovení morfologie nádorů rozhodujícím kritériem diagnostiky. U karcinomů prsu bylo nedávno zjištěno, že stupeň diferenciace je provázen změnami exprese miRNA. Není však nic známo o tom, zda popsané změny souvisí se změnou morfologie a zda mají individuální nebo obecný charakter. Cílem navrhovaného projektu je použít zatím unikátní přístup a srovnat expresní profil miRNA z různých částí téhož nádoru s rozdílnou morfologickou charakteristikou i nádorů se stejnou morfologií od různých pacientek a zároveň zjistit, zda je možné tyto specifické miRNA detekovat v krvi. Pro řešení navrhujeme použít mikrodisekční metody izolace buněk z parafínových bloků TNBC a mikročipovou analýzu miRNA. Tkáňové a sérové hladiny vybraných miRNA budou sledovány pomocí qPCR v rozšířeném validačním souboru a jejich funkce bude studována pomocí experimentů na buněčných liniích. Projekt by mohl přispět k odhalení nových principů řídících morfogenezi v nádorech a rovněž k identifikaci nových diagnostických a prognostických znaků.

MeSH
časná detekce nádoru MeSH
exprese genu MeSH
lidé MeSH
mikro RNA MeSH
mikročipová analýza MeSH
mikrodisekce MeSH
morfogeneze MeSH
nádorové biomarkery analýza MeSH
prognóza MeSH
triple-negativní karcinom prsu diagnóza MeSH
Check Tag
lidé MeSH
ženské pohlaví MeSH

Konspekt
Patologie. Klinická medicína
NLK Obory
onkologie
genetika, lékařská genetika
NLK Publikační typ
závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Výzkumná zpráva

Studie mechanismu účinků biomarkerů korelujících s výsledkem léčby karcinomu prsu

2016

Závěrečná zpráva o řešení grantu Interní grantové agentury MZ ČR

1 svazek : ilustrace, tabulky ; 30 cm

Validation of differences in expression of previously identified genetic markers between patients with breast carcinoma treated by standard, mainly neoadjuvant chemotherapy, will be the main goal of this project. Markers representing metabolism (e.g. cytochromes P450, SOD, NQO) and transport (ABC and SLC transporters) of anticancer drugs will be studied in relation to clinico-pathological characteristics, therapy outcome and survival of patients. Mechanism of action of validated markers will be studied by correlation of gene expression with protein level and analysis of genotype. Methylation of regulatory elements of candidate genes will be studied as independent prognostic or predictive marker. Special attention will be paid to the study of aggressive triple-negative tumors in both patients and cell models. Breast tumor cell line models differing in expression of receptors (estrogen, progesterone, ERBB2) will be employed for elucidation of mechanisms of action of biomarkers by alternative approach.

Hlavním záměrem projektu je validace a studium mechanismu účinku námi nedávno odhalených genetických markerů, tj. genové exprese v nádorových tkáních a genových polymorfismů v krvi pacientů léčených standardní, především neoadjuvantní chemoterapií karcinomu prsu. Cílem jsou markery metabolismu (např.: cytochromy P450, NQO, SOD, dráha 5-fluorouracilu) a transportu (ABC a SLC transportéry) cytostatik ve vztahu ke klinicko-patologickým charakteristikám, přežívání a účinnosti léčby pacientek. U úspěšně validovaných kandidátů budeme studovat mechanismus jakým markery působí korelací genové exprese s hladinou proteinu a zjištěním významu genotypu. Budeme studovat i methylaci regulačních oblastí kandidátních genů jako nezávislý marker. Zvláštní pozornost budeme věnovat studiu agresivních triple-negative karcinomů u pacientů i na modelových buněčných liniích s tímto fenotypem. U buněčných modelů se pokusíme vysledovat mechanismus nezávislou cestou včetně hledání vztahu mezi typem léčiva, jeho dávkou a účinkem

Konspekt
Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
NLK Obory
genetika, lékařská genetika
biologie
farmacie a farmakologie
onkologie
NLK Publikační typ
závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Výzkumná zpráva

Využití proteinů p63/p73 a jejich signálních drah jako prediktivních markerů v klinické onkologii

Holčáková, Jitka
Autor Autorita
Masarykův onkologický ústav (Brno, Česko)
Autor Autorita

2016

Závěrečná zpráva o řešení grantu Interní grantové agentury MZ ČR

1 svazek : grafy ; 30 cm

Primary experiments will be performed using MDA-MB-468 cell line derived from triple-negative breast carcinoma. Inducible expression of p63 protein in this cell line allows characterizing the role of p63 and its isoforms in cancer cell and in the cellular response to genotoxic stress using genomic and proteomic approaches. In the tumor biopsies, we will analyze the expression of p63 and p73 on the mRNA level by qRT-PCR and on the protein level by immunohistochemical staining (IHC) and immunochemical methods. The expression levels will be evaluated in correlation to clinico-patohological characteristics of tumors, to disease-free survival and to total survival of patients. Simultaneously, we will determine the expression levels of proteins selected on the basis of in vitro experiments with cell lines, which could play role of potential markers of sensitivity to cisplatin or to other antitumor drugs. The main objective of the project is to identify new predictive and prognostic markers in order to impro

Základní část projektu bude provedena na upravené buněčné linii MDA-MB-468 odvozené od „triple negativního“ karcinomu mléčné žlázy. Tato buněčná linie inducibilně exprimuje protein p63 a umožní nám pomocí genomických a proteomických přístupů charakterizovat úlohu p63 a jeho izoforem v nádorové buňce a v její odpovědi na genotoxický stres. V bioptickém nádorovém materiálu bude exprese p63 a p73 analyzována na úrovni mRNA pomocí PCR v reálném čase (qRT-PCR) a na úrovni proteinů pomocí imunohistochemického barvení (IHC) a imunochemických metod. Intenzita exprese bude statisticky hodnocena ve vztahu k rutinně stanoveným klinicko-patologickým znakům nádorů, bezpříznakovému i celkovému přežití pacientek. Současně bude analyzována i exprese proteinů, předem vytipovaných na základě studie na buněčných liniích, jako potenciálních markerů citlivosti k cisplatině, případně dalším látkám. Cílem projektu je identifikace nových prediktivních a prognostických ukazatelů využitelných ke zefektivnění samotné terapie.

Konspekt
Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
NLK Obory
molekulární biologie, molekulární medicína
gynekologie a porodnictví
onkologie
NLK Publikační typ
závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Výzkumná zpráva

Prediktivní faktory patologické odpovědi na neoadjuvantní chemoterapii u nemocných s karcinomem prsu a HER-2 pozitivním nebo triple negativním fenotypem

2016

Závěrečná zpráva o řešení grantu Interní grantové agentury MZ ČR

1 svazek : ilustrace, tabulky ; 30 cm

Pathologic complete response is an indicator of long-term disease control after neoadjuvant chemotherapy in breast carcinoma. In our earlier study, patologic complete response was observed significantly more often in patients with tumors expressing HER-2 or triple negative tumors. The aim of the present study is to study biologic response to neoadjuvant chemotherapy in patients treated with standard regimens that will not be affected by the project. In a retrospective study on material from patients in 2 centers difference in tumor infiltrating lymphocytes in patients with different tumor phenotype as well as the association between indoleamine 2,3-dioxygenase expression and the presence of tumor infiltrating lymphocytes will be evaluated together with tumor phenotype using immunohistochemistry. Alterations of iron metabolism and citrulline, an indicator of intestinal toxicity, will also be assessed.

Dosažení patologické kompletní odpovědi po neoadjuvantní chemoterapii je ukazatelem dlouhodobé kontroly onemocnění. V předchozím projektu byla patologická kompletní odpověď pozorována významně častěji u nemocných s nádory expresí HER-2 a bez exprese HER-2 i hormonálních receptorů. Cílem předkládaného projektu je studovat biologickou odpověď na neoadjuvantní chemoterapii. Použity budou standardní režimy chemoterapie používané v jednotlivých centrech a volbu léčby projekt neovlivní. V retrospektivní studii na materiálu nemocných z 2 center budou vyhodnoceny rozdíly tumor infiltrujících lymfocytů u nemocných s různým fenotypem nádoru, bude také studován vliv exprese indoleamin 2,3-dioxygenázy na přítomnost tumor infiltrujících lymfocytů a bude provedeno imunohistochemické zhodnocení fenotypu nádoru. Budou rovněž sledovány změny metabolismu železa a citrulin, ukazatel toxicity léčby.