-
Je něco špatně v tomto záznamu ?
První hodnocená zkušenost s testem Septin 9 v České republice
[First evaluation of the Septin 9 test in the Czech Republic]
Sychra P., Procházka V., Roubalová L., Zapletalová J., Konečný M.
Jazyk čeština Země Česko
Typ dokumentu práce podpořená grantem
- Klíčová slova
- test Epi proColon 2.0,
- MeSH
- adenom genetika krev MeSH
- časná detekce nádoru metody MeSH
- DNA nádorová genetika krev MeSH
- dospělí MeSH
- falešně negativní reakce MeSH
- falešně pozitivní reakce MeSH
- kohortové studie MeSH
- kolorektální nádory * genetika krev MeSH
- kvantitativní polymerázová řetězová reakce MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- metylace DNA genetika MeSH
- nádorové biomarkery * genetika krev MeSH
- okultní krev MeSH
- pilotní projekty MeSH
- plošný screening MeSH
- reagenční diagnostické soupravy MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- senzitivita a specificita MeSH
- septiny * genetika krev MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
Rakovina tlustého střeva a konečníku zůstává přes pokrok v diagnostice i terapii nadále celospolečenským problémem. Některá nenaplněná očekávání screeningových programů vedou ke zkoumání možností využití stávajících poznatků molekulární biologie k časné diagnostice. Zprávy o možnostech testování epigenetických známek nositelů rakoviny tlustého střeva nás vedly ke studii proveditelnosti testu Septin 9 pomocí Epi proColon Plasma Quick kit na skupině 108 pacientů podstupujících kolonoskopii, která byla referenční metodou. Zajímala nás senzitivita a specificita testu v našich klinických podmínkách. V souboru 108 osob byl kolonoskopicky zjištěn u 41 osob adenom, u 21 osob karcinom a 46 osob mělo negativní kolonoskopický nález. V kategorii osob s negativním kolonoskopickým nálezem byl Septin 9 u 34 negativní a u dvou pozitivní, u 10 osob byl test hodnocen pro nízkou koncentraci DNA v izobátu jako nezjištěno (ND – non detected). V kategorii pacientů s prokázaným adenomem byl Septin 9 ve 26 případech negativní a v jednom pozitivní a u 14 osob byl výsledek ND. Ve skupině pacientů s karcinomem byl Septin 9 negativní u sedmi osob, pozitivní u sedmi osob, u dalších sedmi osob byl test hodnocen jako ND. Senzitivita testu Septin 9 pro predikci karcinomu nebo adenomu byla 19,5 % a specificita 94,4 %. Pozitivita testu Septin 9 byla zjištěna signifikantně častěji u osob s karcinomem než u osob s adenomem nebo s negativním nálezem při kolonoskopii (p = 0,003). Septin 9 jako test prokázal vysokou specificitu (94,4 %). Zklamáním byla velmi nízká senzitivita u osob s adenomem v testovaném souboru (jen 3,7 %). Celkové výsledky studie jsou ve velké míře ovlivněny testy, ve kterých byla koncentrace DNA v izolátu vyhodnocena jako nedostatečná a výsledek byl stanoven jako ND.
Colorectal cancer still persists despite advances in diagnosis and therapy. The unfulfilled expectations of screening programs has led to the development of new tests based on molecular biology for early diagnosis. Reports over the past 15 years concerning the possibility of using epigenetic markers of colon cancer for colon cancer diagnosis led us to study the feasibility of using the Septin 9 test comprised in the Epi proColon Plasma Quick Kit on a group of 108 patients undergoing colonoscopy, the reference method. We were interested in the sensitivity and specificity of the test under our clinical conditions. Among the 108 patients, colonoscopy detected adenomas in 41, carcinomas in 21, and no findings in 46 persons. In the patients with negative colonoscopic findings, the Septin 9 test was negative for 34 and positive for two, with 10 people were classified as “not detected” (ND) because the DNA concentration in the isobath was below the required level. In patients with a confirmed adenoma, the Septin 9 test was negative in 26 and positive in one, and 14 people were classified as ND. In patients with cancer, the Septin 9 test was negative in seven and positive in seven, and seven were classified as ND. The sensitivity of the Septin 9 assay was 19.5% and the specificity was 94.4%. Septin 9 test positivity was found significantly more often in people with cancer than in those with an adenoma or with negative findings on colonoscopy (p = 0.003). The Septin 9 test showed a high degree of specificity (94.4%). It was disappointing that the test showed very low sensitivity in patients with adenoma (only 3.7%). The overall results of the study were affected by the high proportion of tests in which the concentration of DNA in the isolate was insufficient, necessitating that these patients be classified as ND.
2 interní klinika gatroenterologická a hepatologická LF UP a FN Olomouc
First evaluation of the Septin 9 test in the Czech Republic
Citace poskytuje Crossref.org
- 000
- 00000naa a2200000 a 4500
- 001
- bmc16024812
- 003
- CZ-PrNML
- 005
- 20160919112217.0
- 007
- ta
- 008
- 160909s2016 xr f 000 0|cze||
- 009
- AR
- 024 7_
- $a 10.14735/amgh2016300 $2 doi
- 040 __
- $a ABA008 $b cze $d ABA008 $e AACR2
- 041 0_
- $a cze $b eng
- 044 __
- $a xr
- 100 1_
- $a Sychra, Pavel $u II. interní klinika – gatroenterologická a hepatologická LF UP a FN Olomouc $7 xx0145693
- 245 10
- $a První hodnocená zkušenost s testem Septin 9 v České republice / $c Sychra P., Procházka V., Roubalová L., Zapletalová J., Konečný M.
- 246 31
- $a First evaluation of the Septin 9 test in the Czech Republic
- 520 3_
- $a Rakovina tlustého střeva a konečníku zůstává přes pokrok v diagnostice i terapii nadále celospolečenským problémem. Některá nenaplněná očekávání screeningových programů vedou ke zkoumání možností využití stávajících poznatků molekulární biologie k časné diagnostice. Zprávy o možnostech testování epigenetických známek nositelů rakoviny tlustého střeva nás vedly ke studii proveditelnosti testu Septin 9 pomocí Epi proColon Plasma Quick kit na skupině 108 pacientů podstupujících kolonoskopii, která byla referenční metodou. Zajímala nás senzitivita a specificita testu v našich klinických podmínkách. V souboru 108 osob byl kolonoskopicky zjištěn u 41 osob adenom, u 21 osob karcinom a 46 osob mělo negativní kolonoskopický nález. V kategorii osob s negativním kolonoskopickým nálezem byl Septin 9 u 34 negativní a u dvou pozitivní, u 10 osob byl test hodnocen pro nízkou koncentraci DNA v izobátu jako nezjištěno (ND – non detected). V kategorii pacientů s prokázaným adenomem byl Septin 9 ve 26 případech negativní a v jednom pozitivní a u 14 osob byl výsledek ND. Ve skupině pacientů s karcinomem byl Septin 9 negativní u sedmi osob, pozitivní u sedmi osob, u dalších sedmi osob byl test hodnocen jako ND. Senzitivita testu Septin 9 pro predikci karcinomu nebo adenomu byla 19,5 % a specificita 94,4 %. Pozitivita testu Septin 9 byla zjištěna signifikantně častěji u osob s karcinomem než u osob s adenomem nebo s negativním nálezem při kolonoskopii (p = 0,003). Septin 9 jako test prokázal vysokou specificitu (94,4 %). Zklamáním byla velmi nízká senzitivita u osob s adenomem v testovaném souboru (jen 3,7 %). Celkové výsledky studie jsou ve velké míře ovlivněny testy, ve kterých byla koncentrace DNA v izolátu vyhodnocena jako nedostatečná a výsledek byl stanoven jako ND.
- 520 9_
- $a Colorectal cancer still persists despite advances in diagnosis and therapy. The unfulfilled expectations of screening programs has led to the development of new tests based on molecular biology for early diagnosis. Reports over the past 15 years concerning the possibility of using epigenetic markers of colon cancer for colon cancer diagnosis led us to study the feasibility of using the Septin 9 test comprised in the Epi proColon Plasma Quick Kit on a group of 108 patients undergoing colonoscopy, the reference method. We were interested in the sensitivity and specificity of the test under our clinical conditions. Among the 108 patients, colonoscopy detected adenomas in 41, carcinomas in 21, and no findings in 46 persons. In the patients with negative colonoscopic findings, the Septin 9 test was negative for 34 and positive for two, with 10 people were classified as “not detected” (ND) because the DNA concentration in the isobath was below the required level. In patients with a confirmed adenoma, the Septin 9 test was negative in 26 and positive in one, and 14 people were classified as ND. In patients with cancer, the Septin 9 test was negative in seven and positive in seven, and seven were classified as ND. The sensitivity of the Septin 9 assay was 19.5% and the specificity was 94.4%. Septin 9 test positivity was found significantly more often in people with cancer than in those with an adenoma or with negative findings on colonoscopy (p = 0.003). The Septin 9 test showed a high degree of specificity (94.4%). It was disappointing that the test showed very low sensitivity in patients with adenoma (only 3.7%). The overall results of the study were affected by the high proportion of tests in which the concentration of DNA in the isolate was insufficient, necessitating that these patients be classified as ND.
- 650 _2
- $a dospělí $7 D000328
- 650 _2
- $a lidé $7 D006801
- 650 _2
- $a lidé středního věku $7 D008875
- 650 _2
- $a mužské pohlaví $7 D008297
- 650 _2
- $a senioři $7 D000368
- 650 _2
- $a senioři nad 80 let $7 D000369
- 650 _2
- $a ženské pohlaví $7 D005260
- 650 _2
- $a pilotní projekty $7 D010865
- 650 _2
- $a kohortové studie $7 D015331
- 650 12
- $a kolorektální nádory $x genetika $x krev $7 D015179
- 650 _2
- $a adenom $x genetika $x krev $7 D000236
- 650 _2
- $a senzitivita a specificita $7 D012680
- 650 _2
- $a falešně negativní reakce $7 D005188
- 650 _2
- $a falešně pozitivní reakce $7 D005189
- 650 12
- $a septiny $x genetika $x krev $7 D058112
- 650 _2
- $a metylace DNA $x genetika $7 D019175
- 650 _2
- $a DNA nádorová $x genetika $x krev $7 D004273
- 650 12
- $a nádorové biomarkery $x genetika $x krev $7 D014408
- 650 _2
- $a okultní krev $7 D009780
- 650 _2
- $a plošný screening $7 D008403
- 650 _2
- $a kvantitativní polymerázová řetězová reakce $7 D060888
- 650 _2
- $a časná detekce nádoru $x metody $7 D055088
- 650 _2
- $a reagenční diagnostické soupravy $7 D011933
- 653 00
- $a test Epi proColon 2.0
- 655 _2
- $a práce podpořená grantem $7 D013485
- 700 1_
- $a Procházka, Vít $u II. interní klinika – gatroenterologická a hepatologická LF UP a FN Olomouc $7 xx0143822
- 700 1_
- $a Roubalová, Lucie $u Oddělení klinické biochemie, FN Olomouc $7 xx0243311
- 700 1_
- $a Zapletalová, Jana $u Ústav lékařské biofyziky, LF UP Olomouc $7 xx0111614
- 700 1_
- $a Konečný, Michal, $u II. interní klinika – gatroenterologická a hepatologická LF UP a FN Olomouc $d 1965- $7 nlk20030127458
- 773 0_
- $w MED00173896 $t Gastroenterologie a hepatologie $x 1804-7874 $g Roč. 70, č. 4 (2016), s. 300-304
- 856 41
- $u https://www.prolekare.cz/casopisy/ceska-slovenska-gastro/2016-4-5/prvni-hodnocena-zkusenost-s-testem-septin-9-v-ceske-republice-58910 $y plný text volně dostupný
- 910 __
- $a ABA008 $b B 222 $c 279 $y 4 $z 0
- 990 __
- $a 20160909 $b ABA008
- 991 __
- $a 20160919112542 $b ABA008
- 999 __
- $a ok $b bmc $g 1162539 $s 949395
- BAS __
- $a 3
- BAS __
- $a PreBMC
- BMC __
- $a 2016 $b 70 $c 4 $d 300-304 $i 1804-7874 $m Gastroenterologie a hepatologie $x MED00173896 $y 80058
- LZP __
- $c NLK188 $d 20160919 $b NLK111 $a Meditorial-20160909