Echo
1. vydání 211 stran, 9 nečíslovaných stran obrazových příloh : ilustrace ; 22 cm
Publikace se zaměřuje na postup koronavirové pandemie, zejména na situaci v Česku. Obsahuje rozhovory se známými osobnostmi. Určeno široké veřejnosti.; Kronika o neobvyklé cestě, kterou prošla česká společnost v časech koronaviru. Jako taková kronika mohou posloužit i články, které mapovaly události minulých měsíců v Týdeníku Echo.
- MeSH
- Betacoronavirus MeSH
- COVID-19 MeSH
- dějiny 21. století MeSH
- koronavirové infekce MeSH
- pandemie MeSH
- socioekonomické faktory MeSH
- významné osobnosti MeSH
- zdravotní politika MeSH
- Check Tag
- dějiny 21. století MeSH
- Publikační typ
- populární práce MeSH
- rozhovory MeSH
- sborníky MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
- Konspekt
- Veřejné zdraví a hygiena
- NLK Obory
- veřejné zdravotnictví
- virologie
During the COVID-19 pandemic, the European biobanking infrastructure is in a unique position to preserve valuable biological material complemented with detailed data for future research purposes. Biobanks can be either integrated into healthcare, where preservation of the biological material is a fork in clinical routine diagnostics and medical treatment processes or they can also host prospective cohorts or material related to clinical trials. The paper discussed objectives of BBMRI-ERIC, the European research infrastructure established to facilitate access to quality-defined biological materials and data for research purposes, with respect to the COVID-19 crisis: (a) to collect information on available European as well as non-European COVID-19-relevant biobanking resources in BBMRI-ERIC Directory and to facilitate access to these via BBMRI-ERIC Negotiator platform; (b) to help harmonizing guidelines on how data and biological material is to be collected to maximize utility for future research, including large-scale data processing in artificial intelligence, by participating in activities such as COVID-19 Host Genetics Initiative; (c) to minimize risks for all involved parties dealing with (potentially) infectious material by developing recommendations and guidelines; (d) to provide a European-wide platform of exchange in relation to ethical, legal, and societal issues (ELSI) specific to the collection of biological material and data during the COVID-19 pandemic.
- MeSH
- antivirové látky terapeutické užití MeSH
- banky biologického materiálu zásobování a distribuce MeSH
- Betacoronavirus účinky léků genetika patogenita MeSH
- biomedicínský výzkum organizace a řízení MeSH
- datové soubory jako téma MeSH
- klinické zkoušky jako téma MeSH
- koronavirové infekce diagnóza farmakoterapie epidemiologie genetika MeSH
- lidé MeSH
- mezinárodní spolupráce zákonodárství a právo MeSH
- pandemie * MeSH
- šíření informací etika metody MeSH
- směrnice pro lékařskou praxi jako téma MeSH
- umělá inteligence MeSH
- veřejné zdravotnictví ekonomika MeSH
- virová pneumonie diagnóza farmakoterapie epidemiologie genetika MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Evropa MeSH
The known challenge of underutilization of data and biological material from biorepositories as potential resources for medical research has been the focus of discussion for over a decade. Recently developed guidelines for improved data availability and reusability-entitled FAIR Principles (Findability, Accessibility, Interoperability, and Reusability)-are likely to address only parts of the problem. In this article, we argue that biological material and data should be viewed as a unified resource. This approach would facilitate access to complete provenance information, which is a prerequisite for reproducibility and meaningful integration of the data. A unified view also allows for optimization of long-term storage strategies, as demonstrated in the case of biobanks. We propose an extension of the FAIR Principles to include the following additional components: (1) quality aspects related to research reproducibility and meaningful reuse of the data, (2) incentives to stimulate effective enrichment of data sets and biological material collections and its reuse on all levels, and (3) privacy-respecting approaches for working with the human material and data. These FAIR-Health principles should then be applied to both the biological material and data. We also propose the development of common guidelines for cloud architectures, due to the unprecedented growth of volume and breadth of medical data generation, as well as the associated need to process the data efficiently.
V tomto sdělení popisujeme národní infrastrukturu výzkumných biobank BBMRI_CZ. Infrastruktura byla založena Ministerstvem školství, mládeže a tělovýchovy a stala se partnerem evropské infrastruktury biobank BBMRI. Infrastruktura je navržena jako síť biobank, které skladují vzorky získané od asociovaných zdravotnických institucí. Biobanky sestávají z dlouhodobého úložiště (různé typy tkání klasifikované podle diagnózy, peroperační sérum, genomová DNA, RNA) a krátkodobého úložiště (séra pacientů odebíraná v čase). Diskutujeme způsob práce infrastruktury, který musí odpovídat její distribuované povaze: získávání vzorků musí být doprovázeno extrakcí dat z nemocničních informačních systémů a tato data musejí být katalogizována v centrálním indexu pro potřeby vyhledávání. Jelikož BBMRI_CZ slouží pouze pro potřeby vědy a výzkumu, jsou data před uložením do indexu anonymizována. Index je poté k dispozici registrovaným výzkumným pracovníkům, kteří mohou o vybrané vzorky podat žádosti správcům biobank. Článek poskytuje přehled struktury dat uložených v indexu. Diskutujeme také monitorovací systém biobank, který je do BBMRI_CZ začleněn pro dohled nad dodržováním kvality uskladnění vzorků.
We introduce the national research biobanking infrastructure, BBMRI_CZ. The infrastructure has been founded by the Ministry of Education and became a partner of the European biobanking infrastructure BBMRI.eu. It is designed as a network of individual biobanks where each biobank stores samples obtained from associated healthcare providers. The biobanks comprise long term storage (various types of tissues classified by diagnosis, serum at surgery, genomic DNA and RNA) and short term storage (longitudinally sampled patient sera). We discuss the operation workflow of the infrastructure that needs to be the distributed system: transfer of the samples to the biobank needs to be accompanied by extraction of data from the hospital information systems and this data must be stored in a central index serving mainly for sample lookup. Since BBMRI_CZ is designed solely for research purposes, the data is anonymised prior to their integration into the central BBMRI_CZ index. The index is then available for registered researchers to seek for samples of interest and to request the samples from biobank managers. The paper provides an overview of the structure of data stored in the index. We also discuss monitoring system for the biobanks, incorporated to ensure quality of the stored samples.
- Klíčová slova
- biobanka, výzkum rakoviny,
- MeSH
- banky biologického materiálu * organizace a řízení MeSH
- biomedicínský výzkum organizace a řízení MeSH
- databáze genetické MeSH
- databáze jako téma * organizace a řízení MeSH
- interinstitucionální vztahy MeSH
- laboratorní medicína * organizace a řízení MeSH
- lidé MeSH
- odběr biologického vzorku metody MeSH
- systémy řízení databází MeSH
- ukládání a vyhledávání informací metody MeSH
- výzkum organizace a řízení MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- databáze MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
A large increase of grasses Calamagrostis epigejos, Bromus inermis and Brachypodium pinnatum has often been observed in many regions enriched by higher nitrogen (N) wet deposition inputs. Competitive relationships between these grasses under enhanced N loads have not yet been studied. Therefore an outdoor experiment was established which involved monocultures of Calamagrostis, Bromus and Brachypodium and their 1:1 mixtures in containers under two N treatments, i.e., unfertilized and fertilized (+50 kg N ha(-1)). In monocultures, the total aboveground biomass of Calamagrostis, Bromus and Brachypodium were 1.1, 3.6 and 2.5 times higher respectively due to enhanced N fertilization. Relative crowding and aggressivity coefficients indicate that Calamagrostis and Bromus dominate when mixed with Brachypodium at both levels of N availability. When mixed with Bromus, Calamagrostis is the poorer competitor at lower N loads, however, it can be dominating in N fertilized treatments.
