V programu surveillance bylo v roce 2019 hlášeno 25 závažných onemocnění způsobených Haemophilus influenzae. Do NRL pro hemofilové nákazy bylo odesláno k ověření 21 kmenů H. influenzae a dva izoláty DNA. Původci dalších dvou onemocnění byli identifikováni jen v regionálních laboratořích. Celková nemocnost činila 0,23/100000 obyvatel, nejvyšší byla ve věkové skupině 0–11 měsíců (0,86/100000 obyv.) a ve věkové skupině 65 let a více (0,71/100000 obyv.). V souvislosti s invazivním H. influenzae onemocněním zemřelo osm pacientů, celková smrtnost činila 32 %. Nejčastější klinickou formou byla sepse a pneumonie (obě po10 onemocněních). V roce 2019 byla hlášena dvě závažná onemocnění H. influenzae b (Hib). Z klinického materiálu byl nejčastěji izolován neopouzdřený H. influenzae (HiNT), který způsobil 14 případů onemocnění (2 meningitidy, 4 sepse, 7 pneumonií a 1 artritida). Opouzdřený kmen H. influenzae e (Hie) vyvolal dvě onemocnění (1 meningitida, 1 pneumonie) a opouzdřený H. influenzae f (Hif) byl původcem tří onemocnění (1 sepse, 1 pneumonie, 1 epiglotitida). Čtyři izoláty H. influenzae (3 sepse, 1 pneumonie) nebyly blíže identifikovány. Metodou multilokusové sekvenční typizace (MLST) byly určeny sekvenční typy u 19 izolátů H. influenzae (2 Hib, 1 Hie, 3 Hif a 13 neopouzdřených izolátů HiNT). Při charakterizaci dvou izolátů Hib vykazoval jeden izolát sekvenční typ ST6 a druhý jeho jednolokusovou variantu ST190. Izolát Hie vykazoval ST69. Všechny tři izoláty Hif měly shodný ST124. Dva z testovaných izolátů HiNT vykazovaly shodný sekvenční typ ST12. V letech 2009–2019 bylo celkem zaznamenáno 238 závažných onemocnění způsobených H. influenzae. Nejvyšší věkově specifická nemocnost byla opakovaně zjištěna u dětí do jednoho roku věku a starších osob (65 let a více). Závažné onemocnění způsobené H. influenzae bylo spojeno se smrtností v průměru 15,5 % (0–32 %). Ve sledovaném období byla nejčastěji hlášenou klinickou formou sepse (111 případů) a meningitida (64 případů). Nejčastějším původcem byl neopouzdřený HiNT, který vyvolal 134 onemocnění (56 %). Identifikace 56 původců závažných onemocnění (23 %) probíhala jen na úroveň H. influenzae bez další typizace.

In 2019, 25 cases of invasive Haemophilus influenzae disease were reported in the surveillance programme. Twenty-one Haemophilus influenzae (H. influenzae) strains and two DNA isolates were referred to the National Reference Laboratory for Haemophilus Infection for confirmation. Two other causative strains were only identified in regional laboratories. The overall incidence rate was 0.23 per 100000 population, and the most afflicted age groups were 0–11 months (0.86/100000) and 65 years and over (0.71/100000). Eight cases of H. influenzae disease were fatal, and the overall case fatality rate was 32%. The most common clinical forms were sepsis and pneumonia (10 cases each). Two cases of invasive H. influenzae b (Hib) disease were reported in 2019. The most frequent clinical isolates were non- -encapsulated H. influenzae (HiNT), which were recovered from 14 cases (two cases of meningitis, four cases of sepsis, seven cases of pneumonia and one case of arthritis). Two cases (meningitis and pneumonia) were caused by an encapsulated strain of H. influenzae e (Hie). Encapsulated H. influenzae f (Hif) was identified as the cause of three other cases (sepsis, pneumonia, and epiglottitis). Four H. influenzae isolates (from three cases of sepsis and one case of pneumonia) were not identified in detail. Using multilocus sequence typing (MLST), sequence types were identified in 19 H. influenzae isolates (two Hib, one Hie, three Hif, and 13 non-encapsulated HiNT). Of two Hib isolates, one was assigned to ST6 and the other to ST190, its single locus variant. The Hie isolate was ST69. All three Hif isolates were classified consistently as ST124. Two of HiNT isolates were assigned to ST12. Two hundred and thirty-eight cases of invasive H. influenzae disease were reported in 2009 to 2019. The highest age- -specific incidence was repeatedly found in children under one year of age and adults aged 65 years and over. The average case fatality rate was 15.5% (range 0–32%). The most frequent clinical forms in 2009–2019 were sepsis (111 cases) and meningitis (64 cases). The most common causative agent was non-encapsulated HiNT, responsible for 134 cases (56%). Fifty-six (23%) invasive H. influenzae strains were identified to the species level without further typing.

• MeSH
• bakteriální pneumonie epidemiologie   mikrobiologie   MeSH
• dítě MeSH
• dospělí MeSH
• epiglotitida epidemiologie   mikrobiologie   MeSH
• Haemophilus influenzae typu B izolace a purifikace   izolace a purifikace   MeSH
• Haemophilus influenzae genetika   izolace a purifikace   MeSH
• hemofilové infekce * epidemiologie   klasifikace   mortalita   MeSH
• hemofilové vakcíny terapeutické užití   MeSH
• infekční artritida epidemiologie   mikrobiologie   MeSH
• kojenec MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• meningitida hemofilová epidemiologie   MeSH
• mladiství MeSH
• multilokusová sekvenční typizace statistika a číselné údaje   MeSH
• neúspěšná terapie MeSH
• novorozenec MeSH
• předškolní dítě MeSH
• senioři MeSH
• sepse epidemiologie   mikrobiologie   MeSH
• surveillance populace MeSH
• věkové rozložení MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• dospělí MeSH
• kojenec MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• novorozenec MeSH
• předškolní dítě MeSH
• senioři MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

Cíl práce: Cílem tohoto sdělení je prezentace výsledků klonální analýzy meningokoků izolovaných z invazivního meningokokového onemocnění a od zdravých nosičů z České republiky za více než 40leté období. Materiál a metody: Celkem bylo studováno 2 179 izolátů Neisseria meningitidis z období 1971–2014 (květen), z toho 1 093 izolátů od pacientů s invazivním meningokokovým onemocněním a 1 086 izolátů od zdravých nosičů. Veškeré izoláty byly podrobeny multilokusové sekvenční typizaci (MLST), jedné z hlavních metod molekulární epidemiologie invazivního meningokokového onemocnění. Výsledky: U izolátů N. meningitidis z invazivního meningokokového onemocnění byla zjištěna výrazná převaha výskytu séroskupin B a C (souhrnně přes 94 %). Nejčastěji se vyskytující kmeny séroskupiny B byly geneticky vysoce heterogenní: u 1 093 izolátů bylo zjištěno 25 klonálních komplexů. Stejně tak kmeny druhé nejčastěji se vyskytující séroskupiny C se jevily jako geneticky heterogenní, vykazovaly příslušnost k 19 klonálním komplexům. U třetí nejčastěji se vyskytující séroskupiny Y byl stav opačný. Tato skupina izolátů z invazivních meningokokových onemocnění byla na základě detekce pouze tří klonálních komplexů hodnocena jako vysoce homogenní. Z více než 75 % byly převažující klonální komplexy u invazivních izolátů séroskupiny Y (cc23) i séroskupiny C (cc11) řazeny mezi hypervirulentní uskupení, a vykazovaly tak nejvyšší míru virulence pro hostitelskou populaci. U invazivních izolátů séroskupiny B byly hypervirulentní klonální komplexy zjištěny více než z 80 % (cc32, cc41/44, cc18, cc269 a cc11). U 1086 izolátů N. menin-gitidis od zdravých nosičů převažovaly kmeny, u nichž nelze séroskupinu určit, kmeny značené jako N. meningitidis NG (41,4 %). Zařazení těchto izolátů do klonálních komplexů bylo vysoce heterogenní. Celkem bylo zjištěno 28 klonálních komplexů, jejichž příslušnost k hypervirulentním klonálním komplexům byla minoritní. Závěry: Analýza sekvenčních dat MLST za více než 40leté období prokázala, že populace kmenů N. meningitidis způsobujících invazivní meningokokové onemocnění se jeví jako geneticky odlišná od kmenů N. meningitidis zjišťovaných u zdravých nosičů. Tyto výsledky jsou důležité pro optimální aplikaci preventivních opatření v ohnisku invazivního meningokokového onemocnění i pro vývoj účinné meningokokové vakcíny a doporučení vhodné vakcinační strategie. Klíčová slova: Neisseria meningitidis – multilokusová sekvenční typizace – klonální analýza

Objective: To present the results of clonal analysis of the meningococcal populations isolated from invasive disease and healthy carriers in the Czech Republic over four decades. Material and methods: A total of 2179 isolates of Neisseria meningitidis from 1971–2014 (May) were studied: 1093 isolates from patients with invasive meningococcal disease (IMD) and 1086 isolates from healthy carriers. All study isolates were analysed by multilocus sequence typing (MLST), one of the major methods used in molecular epidemiology of IMD. Results: More than 94 % of N. meningitidis isolates from IMD were assigned to serogroups B or C. The strains of the leading serogroup B were genetically highly heterogeneous: 1093 isolates were assigned to 25 clonal complexes. Similarly, the strains of the second leading serogroup C appeared genetically heterogeneous and were classified into 19 clonal complexes. The third leading serogroup Y of IMD isolates showed an opposite tendency and appeared highly homogeneous, with only three clonal complexes being detected. Over 75% of the predominant clonal complexes of IMD isolates of both serogroup Y (cc23) and serogroup C (cc11) were classified as hypervirulent and, as such, posed the highest risk to the host population. Over 80% of IMD isolates of serogroup B were assigned to hypervirulent clonal complexes (cc32, cc41/44, cc18, cc269, and cc11). Of 1086 N. meningitidis isolates from healthy carriers, 41.4% were non-serogroupable, i.e. designated N. meningitidis NG. Classification of these isolates into clonal complexes was highly heterogeneous. In total, 28 clonal complexes were identified of which only a minority were hypervirulent. Conclusions: The analysis of MLST data on strains collected over four decades revealed that the population of N. meningitidis strains involved in IMD differ genetically from N. meningitidis strains isolated from healthy carriers. These results are relevant to both the optimal use of preventive measures in a focus of IMD and to the development of an effective meningococcal vaccine and vaccination strategy guidelines. Keywords: Neisseria meningitides – multilocus sequence typing – clonal analyse

• Klíčová slova
• klonální analýza, klonální komplex,
• MeSH
• frekvence genu MeSH
• genetická variace MeSH
• lidé MeSH
• meningokokové infekce * genetika   MeSH
• multilokusová sekvenční typizace * statistika a číselné údaje   MeSH
• Neisseria meningitidis séroskupiny B genetika   MeSH
• Neisseria meningitidis séroskupiny C genetika   MeSH
• Neisseria meningitidis séroskupiny Y genetika   MeSH
• Neisseria meningitidis * genetika   MeSH
• přenašečství * mikrobiologie   MeSH
• techniky typizace bakterií MeSH
• virulence genetika   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH
• srovnávací studie MeSH