digging detection
Dotaz
Zobrazit nápovědu
... 14 -- 1) Solid phase reactants -- 2) Indicator reagents -- 3) Study subjects -- V Methods 17 -- 1) DIG-ELISA ... ... determination of serum levels of RF and enumeration of RF-secreting cells: methodological aspects a) DIG-ELISA ...
1 svazek : ilustrace ; 25 cm
- MeSH
- revmatoidní artritida MeSH
- rizikové faktory MeSH
- Publikační typ
- vysokoškolské kvalifikační práce MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- revmatologie
In situ hybridization is a tool for evaluation of gene expression within tissues or single cells. This protocol describes optimized sensitive fluorescence detection of gene transcripts (mRNAs) in semithin sections of Schistosoma mansoni adult worms using specifically designed and labeled RNA probes. Due to improved methodologies in tissue preservation, sectioning, amplification of fluorescent signal, and prehybridization tissue treatment, it is possible to detect transcripts in the fine structures of schistosomes. The protocol is sensitive enough to detect very low abundance targets. This procedure is optimized for tissues derived from S. mansoni adult worms; however, it can be successfully applied to other trematode species.
The ibeA gene, one of the important invasion-associated genes in neonatal meningitis Escherichia coli (NMEC), has been recently detected in avian pathogenic E. coli (APEC). Thus, it is necessary to close monitor the possible contamination of the poultry farms and its products to people. Here, a dot blot method for detecting the ibeA gene in E. coli was developed and validated. For the present study, probe sequence was designed and optimized for the specificity of dot blot. A 342-bp conserved fragment of ibeA gene was selected and labeled with digoxigenin (DIG)-dUTP according to the manufacturer's guidelines, which indicated that this probe hybridizes with ibeA. In our established method, the bacteria culture samples were directly spotted on the membrane, following simple lyses on the membrane. Hence, the extraction of genomic DNA is not required, which reduces the workload and shortens the time. Furthermore, this assay was very sensitive, which could detect as few as 2.5 × 10(3) CFU bacteria. The diagnostic reliability of this dot blot was evaluated on 467 APEC bacteria samples by using PCR analysis. Both methods showed that the result was in complete concordance. The dot blot assay was proved to be a simple, rapid, highly accurate, and cost-effective method to identify invasion-associated genes ibeA, which could be applied for initial screening of a large number of clinical samples or direct detection of bacteria culture.
- MeSH
- bakteriologické techniky ekonomika metody MeSH
- barvení a značení metody MeSH
- časové faktory MeSH
- digoxigenin metabolismus MeSH
- Escherichia coli genetika izolace a purifikace MeSH
- faktory virulence genetika MeSH
- hybridizace nukleových kyselin metody MeSH
- infekce vyvolané Escherichia coli mikrobiologie veterinární MeSH
- kur domácí MeSH
- lidé MeSH
- membránové proteiny genetika MeSH
- oligonukleotidové sondy genetika MeSH
- přenašečství mikrobiologie veterinární MeSH
- proteiny z Escherichia coli genetika MeSH
- senzitivita a specificita MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- hodnotící studie MeSH
Provokační testy, jako kožní, nosní, bronchiá lní, konjunktivální, potravinové konsumpční testy, reprezentují důležitou část kli nické in vivo dia- gnostiky alergických on emocnění nebo stavů, ve kterých alergie kauzálně part icipuje v patofyziologickém procesu. Jedná se hlavn ě o onemocnění horních a dolních dýchacích cest, paranasálních sinusů, středního uch a, předního očního segmentu, onemocnění kůže, avšak neposl edně také o jiná onemocnění jako migrénu, afty, onem ocnění zažívacího systému, žláz s vnitřní sekrecí, metabolických onemocnění, některýc h psychických stavů a podobně. Zvláštní skupinu potom tvoří onemocnění nebo stavy, ve kterých jsou kauzálně zúčastněny potraviny nebo jejich integrální či přídatné součásti (např. aditiva) a kde hypersenzitivní reakce mohou být jedny z těchto mechanismů. Provokační testy představuj í definitivní potvrzení kauzální role určitého alergenu (antigenu) nebo nesp ecifického stimulans v daném orgánu a jeho příznacích. Tento alergen (antigen) nebo nespecifický stimulans je tedy schopen v určité dávce, po určité době expozice, vyvolat určitý typ primární orgánové odpovědi doprovázené určitými primárními a sekundárními změnami a symptomy. Provokační testy jsou také jedinou metodou, která j e schopna rozlišit účast alergické komponenty od nespecifické hyperreakt ivity v symptomech určitého orgánu. Kombinací různých klinických parametrů, charakteristických pro posouzení funkcí jednotlivých orgánů nebo systémů, jakož i jiných biochemických, imunologických a cytolo gických parametrů, měřených před a v průběhu provokačních testů, je možno odkrýt a demonstrovat (kauzální) roli jednoho orgánu v odpově di jiného orgánu a také řadu patofyziologických vztahů (příčina – násle dek), které není možno zjistit bě žnými základními alergologickými diagnostickými metodami. Tyto vztahy a aspekty mají vliv na volbu terapie. V tomto článku jsou dále diskut ovány základní indikace, kontraindik ace provokačních testů a základní jakož i rámcové podmínky , které jsou nezbytné pro úspěšné a bezpečné provádění provokačních testů.
Provocation tests (challenges), such as skin, nasal, bronchial, co njunctival tests and food ingestion tests, represent a very i mportant part of the in vivo diagnostic procedure of the allergic diseases or patholog ic disorders in which an involvement of the hypersensitivity m echanism(s) may be suspected. It concerns especially diseases of the upper an d lower airways, paranasal sinuses, middle ear, foresegment of the eye, skin, but also other conditions, like migraine, aphthae, disorders of the dig estive tract, endocrinologic glands, metabolic disorders, some of the psychic aber- rations etc. A special group consists of the disorders due to the adverse reactions to foods, their integrated parts or additio nal parts ( additives, contaminants), where the hypersensitivity might be one of the possible participating mechanisms. Provocation tests form a defin ite confirmation of the causal role of a certain allergen or non-specific stimulus in the appropriate symptoms of a certain organ. They confirm an ability of a certain allergen or a non-specific agent, in a certain dose during a certain period of exposition, to evoke a certain type of response in the appropriate organ. The provocation tests are also only method to discriminate the involvement of a certain allergen and that of a certain n on-specific agent in the given symptoms of the specific organ. The provocation tests can also be supplemented by recording of various clinical pa rameters being typical for the functions of other organs, as well as by various immunologic, biochemical, cytologic and other parameters. By t he comparison of these parameters measured before and after the challenge with a certain allergen / non specific agent, the possible influence a nd involvement of an allergic reaction taking part in one organ in the response of another organ can be demonstrated. Such a relationship cannot be detected by the other (basic) diagnostic techniques. The basic principle of the pr ovocation tests is the comparison of the relative values of the appropriate parameters, which means the comparison of the parameter values recorded after the challenge with a certain allergen / non speci fic agent with the pre-challenge values. Finally, the basic indications and cont ra-indications of the provocation tests and the precautions an d conditions which should be met to keep these tests as useful and safety supplement to the diagnostic procedure in allergology, are presented and discussed.