Článek se zabývá významem rutinní mikrobiologické analýzy zubního biofilmu pro léčbu parodontitidy. Autoři nabízejí různé pohledy na toto komplexní téma, ve kterém se protínají prvky mikrobiologické, patofyziologické a etiologické, s množnostmi využití analytických metod a rutinní parodontologické diagnostiky. Tradiční pohled na parodontální mikrobiom jako souhrn „bakteriálních komplexů“ vychází ze studií založených na kultivaci relativně malého množství bakterií. V současné době existují pokročilé metody mikrobiální analýzy využívající sekvenování nukleových kyselin, které významně rozšiřují a mění pohled na orální mikrobiom u parodontitidy. Spolu s aktuálním pojetím etiopatogeneze parodontitidy se proto mění náš pohled na klinický význam mikrobiologického testování a z části se odvrací od Socranského komplexů. Díky sekvenačním metodám dnes známe několik set bakterií souvisejících s parodontitidou. V klinické praxi se však využívá stále spíše levnějších metod vycházejících z kultivace malého počtu druhů, u nichž se předpokládá souvislost s onemocněním. Využití složitějších a nákladnějších metod je v běžné diagnostice zatím málo dostupné. Mezi parodontology nepanuje jednoznačný konsenzus ohledně využitelnosti poznatků mikrobiologického testování pro zlepšení klinického rozhodování, a tedy úspěšnosti lékařské péče. Cílem tohoto přehledového sdělení je přiblížit široké odborné veřejnosti z různých úhlů problematiku mikrobiálního testování v klinické parodontologické praxi.
The review deals with importance of routine microbiological analysis of dental biofilm for clinical periodontology. Authors offer different points of view of this complex topic. Advanced PCR-based methods bring new insights and change our knowledge of periodontal aetiology and pathogenesis. Recent methods are able to detect hundreds of microbes with just one test, many of them otherwise uncultivable. In clinical practice, however, cheap and simple methods are used instead to analyse only few of the relevant bacterial taxa. Research in this field helps to identify disease-related, as well as health-related bacteria. That helps with our understanding of periodontitis and defining new therapeutic options. On the other hand, advanced methods are usually expensive and often unavailable, and their use in daily practice is still controversial. There is no consensus to date on interpretation of data obtained from microbiological assays, their prognostic or therapeutic value. The aim of this article is to elaborate on current knowledge and relevance of microbiological analysis for clinical periodontology.
- MeSH
- biofilmy MeSH
- interakce mikroorganismu a hostitele fyziologie imunologie MeSH
- lidé MeSH
- mikrobiota MeSH
- parodontitida * farmakoterapie komplikace mikrobiologie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
Úvod a cíl práce: Parodontitida, která u dospělé populace patří mezi onemocnění s hromadným výskytem, ve svých důsledcích představuje u osob starších než 35 let téměř stejně častý důvod ztráty zubu jako následky zubního kazu. Cílem této studie bylo zhodnotit využitelnost sekvenačních metod nové generace jako nástroje pro komplexní charakterizaci subgingiválního bakteriálního biofilmu u pacientů s pokročilou parodontitidou a pro sledování dynamiky změn složení subgingiválního bakteriálního biofilmu v průběhu terapie. Předpokládá se, že sekvenační metody nové generace poskytnou novou kvalitu sledování průběhu léčby a nabídnou parodontologům nástroj pro objektivní hodnocení účinnosti zvoleného terapeutického postupu a volbu další léčby. Metody: Do studie vstoupilo 43 pacientů s diagnózou pokročilé parodontitidy. Pacienti byli rozděleni do dvou podskupin a léčeni jednou ze dvou standardně schválených metod – pouze deep scaling a root planing (podskupina A – 20 pacientů) a deep scaling a root planing doplněný o antibiotickou terapii (podskupina B – 23 pacientů). Stav jejich parodontu byl hodnocen parodontálními indexy PPD (periodontal pocket depth), BOP (bleeding on probing), CAL (clinical attachment loss) před léčbou a dva týdny, tři měsíce a 18 měsíců po léčbě. Každému pacientovi byla ve shodných časových intervalech odebrána sada čtyř vzorků z nejhlubšího parodontálního chobotu pro stanovení složení mikrobiomu. Výsledky: V průběhu léčby došlo k významnému poklesu parodontálních indexů BOP, CAL a PPD u obou podskupin pacientů. V průběhu léčby došlo také k významnému poklesu indexu parodontálního rizika R/G. U podskupiny pacientů léčených deep scaling a root planing navíc s aplikací antibiotik (podskupina B) došlo 14 dní po léčbě k významně vyššímu poklesu R/G indexu v porovnání s podskupinou A léčenou pouze deep scaling a root planing. Tři měsíce a 18 měsíců po léčbě byly hodnoty indexu parodontálního rizika R/G u obou podskupin pacientů obdobné. Závěr: Taxonomická charakterizace mikrobiomu vyjádřená formou R/G indexu umožňuje monitorovat dynamické změny v průběhu léčby, na rozdíl od pouhého sledování klinických parametrů ukazuje jednoznačné rozdíly mezi skupinami s použitím a bez použití antibiotik v čase 14 dnů po terapii deep scaling a root planing. S ohledem na klinické parametry obou skupin, které se po třech ani 18 měsících v podstatě neliší, je ovšem na místě velmi pečlivě zvážit, zda je antibiotická podpora terapie deep scaling a root planing přínosem, neboť existuje nezanedbatelné riziko rozvoje a šíření rezistencí. Použití antibiotik v parodontologii by mělo být podloženo podrobným klinickým, mikrobiologickým a celkově medicínským vyšetřením.
Introduction, aim: Periodontitis, which is one of the most common diseases in the adult population, is almost as common cause of tooth loss in people over the age of 35 as it is due to tooth decay. The aim of this study was to evaluate the utility of new-generation sequencing methods as a tool for complex characterization of subgingival bacterial biofilm in patients with advanced periodontitis and for monitoring the dynamics of changes in the composition of subgingival bacterial biofilm during therapy. We assume that next-generation sequencing methods will provide a new quality of monitoring the course of treatment and offer periodontologists a tool for objective evaluation of the effectiveness of the chosen therapeutic procedure and choice of further treatment. Methods: The study included 43 patients with a diagnosis of advanced periodontitis. Patients were divided into two subgroups and treated with one of two standard approved methods – deep scaling and root planing only (subgroup A – 20 patients) and deep scaling and root planing supplemented with antibiotic therapy (subgroup B – 23 patients) – and their periodontal status was assessed by periodontal indices BOP (bleeding on probing), CAL (clinical attachment loss) a PPD (periodontal pocket depth) before treatment and two weeks, three months and 18 months after therapy. A set of four samples was taken from each deepest periodontal pocket at equal time intervals to determine the microbiome composition. Results: During treatment, there was a significant decrease in the periodontal indices PPD, BOP and CAL in both subgroups of patients. There was also a significant decrease in the periodontal risk index R/G during treatment. In addition, the subgroup of patients treated with deep scaling and root planing with antibiotics (subgroup B) had a significantly higher decrease in R/G index 14 days after treatment compared to subgroup A treated with deep scaling and root planing alone. Three months and 18 months after treatment, the periodontal risk index R/G values were similar in both subgroups of patients. Conclusion: Taxonomic characterization of the microbiome expressed in the form of R/G index allows to monitor dynamic changes during treatment, in contrast to mere monitoring of clinical parameters shows clear differences between groups with and without antibiotics at 14 days after deep scaling and root planing therapy. However, given the clinical parameters of the two groups, which do not differ significantly after three or 18 months, it is appropriate to carefully consider whether antibiotic support for deep scaling and root planing is beneficial, as there is a significant risk of developing and spreading resistance. The use of antibiotics in periodontology should be based on detailed clinical, microbiological and general medical examination.
- Klíčová slova
- orální mikrobiom,
- MeSH
- antibakteriální látky terapeutické užití MeSH
- klinická studie jako téma MeSH
- lidé MeSH
- mikrobiota MeSH
- parodontitida * farmakoterapie mikrobiologie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- MeSH
- idiopatické střevní záněty imunologie mikrobiologie MeSH
- interakce hostitele a parazita imunologie účinky léků MeSH
- lidé MeSH
- mikrobiota fyziologie MeSH
- orální zdraví * MeSH
- parodontitida mikrobiologie MeSH
- střevní mikroflóra fyziologie MeSH
- ústa mikrobiologie MeSH
- zubní kaz mikrobiologie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- MeSH
- aterosklerotický plát mikrobiologie MeSH
- dospělí MeSH
- kardiovaskulární nemoci * MeSH
- klinická studie jako téma MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mikrobiologické techniky MeSH
- parodont mikrobiologie MeSH
- parodontitida * komplikace mikrobiologie MeSH
- rizikové faktory MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- zubní plak * mikrobiologie MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
The formation and development of bacterial as well as yeast or filamentous fungi biofilms, which is connected with dangerous or even fatal human infections, represents a relatively new and poorly studied problem in current medicine. The understanding of the processes running in biofilms of pathogenic microorganisms and finding of new possibilities of the biofilm prevention or eradication and also the regulation of biofilm resistance development is necessary for proposing advanced treatment procedures for wide range of illnesses.
- Klíčová slova
- extracelulární polymerní látky,
- MeSH
- antibiotická rezistence účinky léků MeSH
- antiinfekční látky MeSH
- Aspergillus fumigatus patogenita MeSH
- aspergilóza alergická bronchopulmonální mikrobiologie MeSH
- bakteriální adheze fyziologie MeSH
- biofilmy * růst a vývoj účinky léků MeSH
- Candida klasifikace patogenita MeSH
- cystická fibróza mikrobiologie MeSH
- dezinfekce MeSH
- Escherichia coli patogenita MeSH
- extracelulární matrix - proteiny MeSH
- extracelulární matrix fyziologie ultrastruktura MeSH
- infekce spojené s protézou etiologie mikrobiologie MeSH
- katétry mikrobiologie MeSH
- otitis media mikrobiologie MeSH
- parodontitida mikrobiologie MeSH
- Pseudomonas aeruginosa patogenita MeSH
- Staphylococcus aureus patogenita MeSH
- Staphylococcus epidermidis patogenita MeSH
- Streptococcus mutans patogenita MeSH
- Trichosporon patogenita MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- MeSH
- antiinfekční látky terapeutické užití MeSH
- chronická parodontitida * farmakoterapie mikrobiologie terapie MeSH
- lidé MeSH
- orální hygiena metody MeSH
- parodontální chobot farmakoterapie mikrobiologie terapie MeSH
- parodontální index MeSH
- parodontitida * farmakoterapie mikrobiologie terapie MeSH
- parodontologické ošetření využití MeSH
- probiotika * terapeutické užití MeSH
- výsledek terapie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
This work presents a summary of current knowledge on the laboratory diagnosis of periodontitis. It focuses on the theoretical foundations and is supplemented with new knowledge. It subsequently describes specifically the laboratory diagnosis methods of periodontitis: the protein expression of inflammation, oral microbiology and molecular diagnostics. Periodontitis is a serious disease worldwide and its confirmed association with systemic diseases means its severity is increasing. Its laboratory diagnosis has the potential to rise to the level of clinical and diagnostic imaging. The transfer of diagnostic methods from laboratory to clinical use is increasingly used in the prevention and monitoring of the exacerbation and treatment of periodontal disease, as well as of its impact on systemic disease.
- MeSH
- biologické markery MeSH
- diferenciální diagnóza MeSH
- gingivální exsudát * mikrobiologie MeSH
- indexy plaku MeSH
- lidé MeSH
- parodont imunologie mikrobiologie patologie MeSH
- parodontální index MeSH
- parodontitida diagnóza epidemiologie mikrobiologie prevence a kontrola terapie MeSH
- prevalence MeSH
- stupeň závažnosti nemoci MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- přehledy MeSH
- Geografické názvy
- Slovenská republika MeSH
The aim of this study was to compare the detection frequency of periodontal bacteria in dental plaque in children with early childhood caries (ECC) with and without gingival inflammation. A convenience sample of 25 preschool children (mean age 3.61 years, SD 1.42) was recruited. Dental plaque was taken from periodontal areas with and without visible signs of inflammation and processed using the StomaGene® (Protean s.r.o. Czech Republic) and ParoCheck® 20 (Greiner Bio-one GmbH, Germany) detection kits. The two sample t tests between percents for differences between inflammatory and healthy sites and kappa statistics for the agreement of both systems were used. At the inflammatory sites, Porphyromonas gingivalis and Aggregatibacter actinomycetemcomitans were significantly more frequently detected by StomaGene® while Fusobacterium nucleatum, A. actinomycetemcomitans, Tanarella forsythia and Prevotella intermedia were significantly more frequently identified by ParoCheck® test. The agreement between the two detection systems was substantial for A. actinomycetemcomitans and F. nucleatum in the samples collected from inflamed sites and only for F. nucleatum from clinically healthy sites. Therefore, we recommend that the same system should be used when the same patient is examined repeatedly.
- MeSH
- Bacteria klasifikace izolace a purifikace MeSH
- bakteriální infekce komplikace mikrobiologie MeSH
- bakteriologické techniky MeSH
- diagnostické techniky molekulární MeSH
- lidé MeSH
- parodontitida mikrobiologie MeSH
- předškolní dítě MeSH
- zubní kaz komplikace mikrobiologie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- předškolní dítě MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
Global healthcare systems are struggling with the enormous burden associated with infectious diseases, as well as the incessant rise of antimicrobial resistance. In order to adequately address these issues, there is an urgent need for rapid and accurate infectious disease diagnostics. The H2020 project DIAGORAS aims at diagnosing oral and respiratory tract infections using a fully integrated, automated and user-friendly platform for physicians' offices, schools, elderly care units, community settings, etc. Oral diseases (periodontitis, dental caries) will be detected via multiplexed, quantitative analysis of salivary markers (bacterial DNA and host response proteins) for early prevention and personalised monitoring. Respiratory Tract Infections will be diagnosed by means of DNA/RNA differentiation so as to identify their bacterial or viral nature. Together with antibiotic resistance screening on the same platform, a more efficient treatment management is expected at the point-of-care. At the heart of DIAGORAS lies a centrifugal microfluidic platform (LabDisk and associated processing device) integrating all components and assays for a fully automated analysis. The project involves an interface with a clinical algorithm for the comprehensive presentation of results to end-users, thereby increasing the platform's clinical utility. DIAGORAS' performance will be validated at clinical settings and compared with gold standards.
- MeSH
- bakteriální léková rezistence * MeSH
- centrifugace metody MeSH
- DNA bakterií analýza MeSH
- individualizovaná medicína metody MeSH
- infekce dýchací soustavy diagnóza mikrobiologie virologie MeSH
- laboratorní automatizace MeSH
- lidé MeSH
- mikrofluidní analytické techniky MeSH
- parodontitida diagnóza mikrobiologie MeSH
- RNA virová analýza MeSH
- sliny imunologie mikrobiologie MeSH
- zubní kaz diagnóza MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
