Cíl studie: Cílem této publikace bylo popsat výskyt maligní hypertermie (MH) v české a slovenské populaci, včetně genetických výsledků a důvodů hlášení do MH diagnostického centra. Typ studie: Retrospektivní observační kohortová studie. Typ pracoviště: Akademické centrum maligní hypertermie Masarykovy univerzity. Materiál a metody: Zkoumáni byli všichni probandi referovaní do našeho diagnostického centra MH od roku 2002 do 2022. Každý proband byl zástupcem jedné nepříbuzné rodiny. Probandi byli vyšetřováni dle diagnostických doporučení aktuálně platných v době hlášení prostřednictvím molekulárně genetického vyšetření a svalového in vitro kontrakčního testu (IVCT). Do výsledné analýzy byli zařazeni všichni probandi s ukončenou MH diagnostikou. Výsledky: Do konce 2022 bylo zaznamenáno v souvislosti s rizikem MH celkem 303 hlášení. Bylo provedeno 236 IVCT testů, 129 negativních a 107 pozitivních. Celkem je v našem souboru 223 osob vnímavých k MH (MHS) ze 75 českých a 8 slovenských rodin. Diagnostická patogenní varianta v genu RYR1 byla nalezena pouze u 37 MHS rodin (45 %). U 87 rodin byla MH vyloučena (MHN). Závěr: Za 20 let systematické práce je evidován v naší české a slovenské populaci unikátní soubor 83 MHS rodin. I přes rutinní zpřístupnění nejmodernější diagnostiky MH více než polovina našich MHS rodin nemá potvrzen genetický podklad MH, a může profitovat z vědeckého pokroku a dalšího výzkumu.
Objective: The aim of this publication was to describe the occurrence of malignant hyperthermia (MH) in the Czech and Slovak populations, including genetic results and reasons for reporting to the MH diagnostic centre. Design: Retrospective observational cohort study. Setting: Academic Centre of Malignant Hyperthermia of Masaryk University. Material and methods: All probands referred to our MH diagnostic centre from 2002 to 2022 were enrolled. Each proband was a representative of one unrelated family. Probands were investigated according to diagnostic guidelines valid at the time of reporting by molecular genetic testing and muscle in vitro contraction test (IVCT). All probands with completed MH diagnostics were included in the final analysis. Results: By the end of 2022, there were a total of 303 reports related to the risk of MH. A total of 236 IVCT tests were performed, 129 negatives and 107 positives. There were 223 persons susceptible to MH (MHS) registered from 75 Czech and 8 Slovak families. A diagnostic pathogenic variant in the RYR1 gene was found only in 37 MHS families (45%). MH was excluded in 87 families (MHN). Conclusion: In 20 years of systematic work, a unique set of 83 MHS families has been collected in our Czech and Slovak populations. Despite the routine availability of state-of-the-art MH diagnostics, more than half of our MH families do not have a confirmed MH genetic background and can benefit from scientific progress and further research.
- MeSH
- lidé MeSH
- maligní hypertermie * terapie MeSH
- mutace MeSH
- ryanodinový receptor vápníkového kanálu genetika MeSH
- vápníkové kanály - typ L MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- dopisy MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
- Slovenská republika MeSH
- Publikační typ
- abstrakt z konference MeSH
Cíl: Cílem práce bylo zhodnotit využívání farmakogenetického testování u nemocných s psychiatrickou diagnózou. Metoda: Od roku 1997 je ve FN Brno-Bohunice dostupná a hrazená pojišťovnou genotypizace a fenotypizace CYP2D6. Žádosti o farmakogenetickou analýzu poskytlo oddělení lékařské genetiky FN Brno-Bohunice. Výsledky: V letech 1997-2019 bylo vyžádáno 223 vyšetření u nemocných s psychiatrickou diagnózou. Nejvíce vyšetření bylo realizováno v první dekádě v rámci klinických studií zaměřených na vliv aktivity CYP2D6 na účinnost a toleranci léčby antidepresivy. Postupně pak počet žádostí soustavně klesal. Diskuse: Jsou rozebírány možné příčiny včetně neprovázanosti s dostupným stanovením plazmatických hladin. Závěr: Stanovení genotypu a/nebo fenotypů nejdůležitějších enzymů metabolizujících psychofarmaka usnadní a urychlí u nereagujícího jedince volbu další léčebné strategie. Farmakogenetické testování léky metabolizujících enzymů společně s terapeutickým monitorováním léků (TDM) by měly být dostupné alespoň v univerzitních nemocnicích, kde se kumulují obtížně léčitelní pacienti.
Aim: The aim of the paper is to evaluate the use of pharmacogenetic testing in patients with a psychiatric diagnosis. Methods: In the Faculty Hospital Brno-Bohunice the genotyping and phenotyping of CYP2D6 is available and covered by insurance since 1997. The requests for pharmacogenetic analysis were provided by the Department of Medical Genetics, University Hospital Brno. Results: Between 1997 and 2019 totally 223 requests were collected and pharmacogenetic analyses performed in patients with psychiatric diagnosis. Most of analyses were performed in the first decade. The patients were recruited in studies aiming at exploring the influence of CYP2D6 activity on efficacy and tolerability of treatment with antidepressants. In further years there was a progressive decrease of requests. Discussion: The possible reasons are discussed including absence of interconnection with drug plasma levels measurement. Conclusions: Genotyping and/or phenotyping of drug metabolising enzymes in unresponsive individuals facilitates and accelerates choice of further treatment strategy. Pharmacogenetic testing together with therapeutic drug monitoring should be available at least at university hospitals with cumulation of difficult to treat patients.
The variant c.926C > T (p.T309I) in KCNQ1 gene was identified in 10 putatively unrelated Czech families with long QT syndrome (LQTS). Mutation carriers (24 heterozygous individuals) were more symptomatic compared to their non-affected relatives (17 individuals). The carriers showed a mild LQTS phenotype including a longer QTc interval at rest (466 ± 24 ms vs. 418 ± 20 ms) and after exercise (508 ± 32 ms vs. 417 ± 24 ms), 4 syncopes and 2 aborted cardiac arrests. The same haplotype associated with the c.926C > T variant was identified in all probands. Using the whole cell patch clamp technique and confocal microscopy, a complete loss of channel function was revealed in the homozygous setting, caused by an impaired channel trafficking. Dominant negativity with preserved reactivity to β-adrenergic stimulation was apparent in the heterozygous setting. In simulations on a human ventricular cell model, the dysfunction resulted in delayed afterdepolarizations (DADs) and premature action potentials under β-adrenergic stimulation that could be prevented by a slight inhibition of calcium current. We conclude that the KCNQ1 variant c.926C > T is the first identified LQTS-related founder mutation in Central Europe. The dominant negative channel dysfunction may lead to DADs under β-adrenergic stimulation. Inhibition of calcium current could be possible therapeutic strategy in LQTS1 patients refractory to β-blocker therapy.
- MeSH
- beta blokátory aplikace a dávkování škodlivé účinky MeSH
- detekce genetických nosičů MeSH
- dospělí MeSH
- draslíkový kanál KCNQ1 genetika MeSH
- fenotyp MeSH
- genetická predispozice k nemoci * MeSH
- genetické asociační studie MeSH
- genotyp MeSH
- haplotypy genetika MeSH
- heterozygot MeSH
- homozygot MeSH
- lidé MeSH
- mutace genetika MeSH
- rodokmen MeSH
- syndrom dlouhého QT genetika patologie MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Evropa MeSH
BACKGROUND: For most of the >2000 CFTR gene variants reported, neither the associated disease liability nor the underlying basic defect are known, and yet these are essential for disease prognosis and CFTR-based therapeutics. Here we aimed to characterize two ultra-rare mutations - 1717-2A > G (c.1585-2A > G) and S955P (p.Ser955Pro) - as case studies for personalized medicine. METHODS: Patient-derived rectal biopsies and intestinal organoids from two individuals with each of these mutations and F508del (p.Phe508del) in the other allele were used to assess CFTR function, response to modulators and RNA splicing pattern. In parallel, we used cellular models to further characterize S955P independently of F508del and to assess its response to CFTR modulators. RESULTS: Results in both rectal biopsies and intestinal organoids from both patients evidence residual CFTR function. Further characterization shows that 1717-2A > G leads to alternative splicing generating <1% normal CFTR mRNA and that S955P affects CFTR gating. Finally, studies in organoids predict that both patients are responders to VX-770 alone and even more to VX-770 combined with VX-809 or VX-661, although to different levels. CONCLUSION: This study demonstrates the high potential of personalized medicine through theranostics to extend the label of approved drugs to patients with rare mutations.
- MeSH
- alely MeSH
- aminofenoly terapeutické užití MeSH
- aminopyridiny terapeutické užití MeSH
- benzodioxoly terapeutické užití MeSH
- chinolony terapeutické užití MeSH
- cystická fibróza farmakoterapie genetika MeSH
- elektrofyziologie MeSH
- fluorescenční protilátková technika MeSH
- genotyp MeSH
- individualizovaná medicína metody MeSH
- indoly terapeutické užití MeSH
- lidé MeSH
- mutace genetika MeSH
- protein CFTR genetika metabolismus MeSH
- western blotting MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
Cystická fibróza (CF) je závažným nevyléčitelným monogenním onemocněním s autosomálně recesivní dědičností. Výrazným prvkem, jenž může přispět jak ke zkvalitnění, tak k prodloužení života nemocných, je časná diagnóza, nejlépe již v novorozeneckém věku. Novorozenecký screening cystické fibrózy umožňuje diagnostikovat pacienty s cystickou fibrózou v době, kdy ještě nejsou klinické příznaky plně vyjádřeny. Na základě časné diagnostiky pak mohou být pacienti s cystickou fibrózou léčeni již před vznikem ireverzibilních změn v organismu, což jejich život významně prodlužuje a také zlepšuje jeho kvalitu. V České republice byl novorozenecký screening CF zahájen po vzoru řady dalších vyspělých zemí v roce 2009. Výsledek screeningu může být buď negativní a diagnóza cystické fibrózy je nepravděpodobná, nebo pozitivní, a pak je třeba vyloučit či potvrdit CF. Zvláštní skupinu tvoří určitý počet novorozenců, u nichž je screening pozitivní, ale výsledek dalšího diagnostického testování na CF je nejednoznačný. V Evropě se začal pro tuto skupinu používat termín CFSPID (Cystic Fibrosis Screen Positive, Inconclusive Diagnosis). Od zavedení screeningu bylo do konce roku 2018 v rámci celé ČR identifikováno a zařazeno 59 jedinců do kategorie CFSPID. Z nich 7 jedinců bylo z CFSPID později překlasifikováno a zařazeno mezi nemocné s CF. Práce upozorňuje na problematiku nové diagnostické jednotky CFSPID a uvádí první, prozatím dílčí výsledky sledování pacientů s touto diagnózou. Hodnocení vývoje zdravotního stavu bylo možné u 38 sledovaných, kteří byli původně zařazeni do kategorie CFSPID. Většině pacientů s CFSPID se daří relativně dobře, nejeví jasné známky onemocnění CF. Dokonce i děti, které byly překlasifikovány a zařazeny mezi nemocné s CF, jsou kromě dvou v dobrém stavu, bez klasických projevů nemoci. Rozhodně není tedy vhodné rodiny CFSPID pacientů stresovat, na druhou stranu je ale potřeba doporučit sledování v centru CF a poučit rodiče o možných příznacích cystické fibrózy, které by se mohly objevit a při nichž by měli kontaktovat lékaře.
Cystic fibrosis (CF) is a serious autosomal recessive disorder. Newborn screening (NBS) for CF allows for early diagnosis of CF before clinical symptoms occur. The patient´s benefits from NSCF are longer life expectancy and better quality of life. NBS for CF in Czech Republic was introduced in 2009, based on experience from other developed countries. Results from newborn screening can be either negative, in which case the CF diagnosis is unlikely, or positive, which calls for further testing to confirm or exclude CF diagnosis. In some cases of positive NBS for CF, further tests results are inconclusive. Therefore, the term CFSPID (Cystic Fibrosis Screen Positive, Inconclusive Diagnosis) has been established in Europe. From the Czech Republic 59 children were classified as CFSPID during the period between 2009 and 2018. Seven children from this group were later classified as CF patients. The aim of this study is to describe the CFSPID group in the Czech Republic. Health status of 38 CFSPID patients could have been obtained. The majority of CFSPID patients are in good health status and do not display clear signs of CF. Even those children who have been reclassified as CF patients (except two patients) are in good health status without classical symptoms of the disease. Therefore, there is no reason to stress the families of CFSPID children, though it is highly recommendable to take care of these children in a specialized CF centre and parents should be informed about possible symptoms of cystic fibrosis.
- Klíčová slova
- Cystic Fibrosis Screen Positive, Inconclusive Diagnosis (CFSPID),
- MeSH
- časná diagnóza MeSH
- cystická fibróza * diagnóza genetika patologie MeSH
- lidé MeSH
- mutace genetika MeSH
- novorozenec MeSH
- novorozenecký screening * MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- novorozenec MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
Haploinsufficiency of FOXF1 causes alveolar capillary dysplasia with misalignment of pulmonary veins (ACDMPV), a lethal neonatal lung developmental disorder. We describe two similar heterozygous CNV deletions involving the FOXF1 enhancer and re-analyze FOXF1 missense mutation, all associated with an unexpectedly mitigated disease phenotype. In one case, the deletion of the maternal allele of the FOXF1 enhancer caused pulmonary hypertension and histopathologically diagnosed MPV without the typical ACD features. In the second case, the deletion of the paternal enhancer resulted in ACDMPV rather than the expected neonatal lethality. In both cases, FOXF1 expression in lung tissue was higher than usually seen or expected in patients with similar deletions, suggesting an increased activity of the remaining allele of the enhancer. Sequencing of these alleles revealed two rare SNVs, rs150502618-A and rs79301423-T, mapping to the partially overlapping binding sites for TFAP2s and CTCF in the core region of the enhancer. Moreover, in a family with three histopathologically-diagnosed ACDMPV siblings whose missense FOXF1 mutation was inherited from the healthy non-mosaic carrier mother, we have identified a rare SNV rs28571077-A within 2-kb of the above-mentioned non-coding SNVs in the FOXF1 enhancer in the mother, that was absent in the affected newborns and 13 unrelated ACDMPV patients with CNV deletions of this genomic region. Based on the low population frequencies of these three variants, their absence in ACDMPV patients, the results of reporter assay, RNAi and EMSA experiments, and in silico predictions, we propose that the described SNVs might have acted on FOXF1 enhancer as hypermorphs.
- MeSH
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- fenotyp MeSH
- forkhead transkripční faktory genetika MeSH
- genomový imprinting MeSH
- jednonukleotidový polymorfismus * MeSH
- lidé MeSH
- missense mutace * MeSH
- novorozenec MeSH
- prognóza MeSH
- sekvenční delece * MeSH
- syndrom přetrvávajícího fetálního oběhu genetika patologie prevence a kontrola MeSH
- zesilovače transkripce * MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- lidé MeSH
- novorozenec MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- kazuistiky MeSH
Duchenne muscular dystrophy (DMD) affects 1:3500-5000 newborn boys and manifests with progressive skeletal muscle wasting, respiratory failure and eventual heart failure. Symptoms show different onset from patients' childhood to the second decade of age. We reprogrammed fibroblasts from two independent DMD patients with a complete loss of dystrophin expression, carrying deletions of exons 45-50 and 48-50. The resulting hiPSCs show expression of pluripotency markers (NANOG, OCT4, SSEA4), differentiation capacity into all three germ layers, normal karyotype, genetic identity to the originating parental fibroblasts and the patient-specific dystrophin mutation.
- MeSH
- buněčná diferenciace MeSH
- buněčné linie cytologie metabolismus MeSH
- dítě MeSH
- Duchennova muskulární dystrofie genetika metabolismus patofyziologie MeSH
- dystrofin genetika metabolismus MeSH
- exony MeSH
- indukované pluripotentní kmenové buňky cytologie metabolismus MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- oktamerní transkripční faktor 3 genetika metabolismus MeSH
- sekvenční delece MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
