We report the case of isolation of Bordetella trematum from the respiratory tract of a patient with lung carcinoma. This gram-negative, opportunistic rod was firstly described in 1996. To date, only several strains of Bordetella trematum have been isolated and reported, mostly from skin and soft tissue infections. The patient was admitted to the ICU of the Pulmonary Department in incipient septic shock with respiratory failure. Intravenous fluid resuscitation and non-invasive ventilation were administered immediately. A broad spectrum antibiotic piperacillin/tazobactam was administered empirically after sampling of material for microbiological examination. The bronchoscopy showed a large cavern of decayed tumour invading into mediastinum. Both sample cultures showed significant quantities of gram-negative non-fermenting bacteria. The isolate was identified using MALDI-TOF MS as Bordetella trematum and the identification was confirmed using 16S ribosomal RNA sequencing. In the last few years, routine bacterial identification using MALDI-TOF MS has enabled correct discrimination of this species. Nevertheless, isolation of Bordetella trematum in clinical samples is still very uncommon, and it is appropriate to confirm the species identification via 16S ribosomal RNA sequencing. To our knowledge, this is the first case of B. trematum isolated from the human respiratory tract since its first description. The clinical significance of Bordetella trematum in the rapid deterioration of the patient's status remains unclear.

• MeSH
• antibakteriální látky terapeutické užití   MeSH
• Bordetella účinky léků   izolace a purifikace   MeSH
• dýchací soustava mikrobiologie   MeSH
• fatální výsledek MeSH
• infekce bakteriemi rodu Bordetella diagnóza   farmakoterapie   MeSH
• lidé MeSH
• nádory plic komplikace   MeSH
• RNA ribozomální 16S genetika   MeSH
• senioři MeSH
• spektrometrie hmotnostní - ionizace laserem za účasti matrice MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• senioři MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• kazuistiky MeSH

• Klíčová slova
• adaptace patogenu, multiplexová analýza,
• MeSH
• acelulární vakcíny aplikace a dávkování   imunologie   MeSH
• bakteriologické techniky MeSH
• Bordetella parapertussis izolace a purifikace   MeSH
• Bordetella pertussis * imunologie   izolace a purifikace   patogenita   MeSH
• dítě MeSH
• dospělí MeSH
• ELISA MeSH
• faktory virulence rodu Bordetella MeSH
• imunita získaná od matky imunologie   MeSH
• incidence MeSH
• infekce bakteriemi rodu Bordetella diagnóza   imunologie   MeSH
• kvantitativní polymerázová řetězová reakce MeSH
• lidé MeSH
• novorozenec MeSH
• očkovací schéma MeSH
• odběr biologického vzorku MeSH
• pertuse * diagnóza   epidemiologie   imunologie   prevence a kontrola   MeSH
• pertusová vakcína aplikace a dávkování   imunologie   MeSH
• pertusový toxin imunologie   MeSH
• protilátky bakteriální imunologie   krev   MeSH
• sekundární imunizace MeSH
• sérologické testy metody   MeSH
• těhotenství imunologie   MeSH
• vakcína proti záškrtu, tetanu a černému kašli aplikace a dávkování   imunologie   MeSH
• vakcinace MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• dospělí MeSH
• lidé MeSH
• novorozenec MeSH
• těhotenství imunologie   MeSH
• ženské pohlaví MeSH

Bordetella parapertussis is a causative agent of whooping cough in humans, and B. bronchiseptica is causing wide variety of respiratory infections in mammals, including humans. Specific diagnostic tests are not currently available. Our first objective was to develop a real-time PCR test for the specific detection of B. bronchiseptica based on the previously described end-point PCR, targeting an intergenomic sequence of the fla gene locus, but it has not been reached. However, there is cross-reactivity between B. parapertussis and B. bronchiseptica. Therefore, the targeted region of several clinical isolates of both species was sequenced, and alignment of the sequences allowed the development of a 2-step real-time PCR assay. The first PCR assay detected the DNA of all clinical isolates of both B. bronchiseptica and B. parapertussis tested. The second PCR assay detected only the DNA of B. parapertussis clinical isolates, thereby allowing discrimination between B. parapertussis and B. bronchiseptica.

• MeSH
• Bordetella bronchiseptica genetika   izolace a purifikace   MeSH
• Bordetella parapertussis genetika   izolace a purifikace   MeSH
• diagnostické techniky molekulární metody   MeSH
• diferenciální diagnóza MeSH
• DNA bakterií chemie   genetika   MeSH
• infekce bakteriemi rodu Bordetella diagnóza   mikrobiologie   MeSH
• kvantitativní polymerázová řetězová reakce metody   MeSH
• lidé MeSH
• molekulární sekvence - údaje MeSH
• sekvenční analýza DNA MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• hodnotící studie MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

Pertuse je vysoce nakažlivé onemocnění závažné svým průběhem zejména pro novorozence a kojence do jednoho roku života. Z epidemiologického hlediska je proto nezbytným požadavkem rychlé a správné stanovení diagnózy. Článek shrnuje aktualizovaná doporučení pro laboratorní diagnostiku onemocnění pertuse a parapertuse.

Pertussis is a highly contagious disease that can have a severe course particularly in newborns and infants under one year of age. From the epidemiological perspective, rapid and accurate diagnosis is crucial. The article summarizes the updated recommendations for laboratory diagnosis of pertussis and parapertussis.

• Klíčová slova
• sérologický průkaz,
• MeSH
• Bordetella parapertussis * genetika   imunologie   izolace a purifikace   MeSH
• Bordetella pertussis * genetika   imunologie   izolace a purifikace   MeSH
• infekce bakteriemi rodu Bordetella diagnóza   MeSH
• kultivační techniky metody   MeSH
• lidé MeSH
• odběr biologického vzorku metody   MeSH
• pertuse * diagnóza   genetika   krev   mikrobiologie   MeSH
• polymerázová řetězová reakce metody   MeSH
• sérologické testy metody   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• směrnice MeSH

• Klíčová slova
• černý kašel, perzistující kašel,
• MeSH
• Bordetella pertussis MeSH
• diferenciální diagnóza MeSH
• dítě MeSH
• dospělí MeSH
• incidence MeSH
• infekce bakteriemi rodu Bordetella diagnóza   farmakoterapie   MeSH
• kašel diagnóza   farmakoterapie   MeSH
• kojenec MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• novorozenec MeSH
• pertuse etiologie   farmakoterapie   MeSH
• pertusová vakcína MeSH
• předškolní dítě MeSH
• příznaky a symptomy MeSH
• protilátky diagnostické užití   terapeutické užití   MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• sérologické testy využití   MeSH
• výběr pacientů MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• dospělí MeSH
• kojenec MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• novorozenec MeSH
• předškolní dítě MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH

V roce 2011 byly prostřednictvím systému hlášení infekčních nemocí EPIDAT zaznamenány 324 případy onemocnění pertusí; nemocnost 3,1/100 000 obyvatel (v roce 2010 byly hlášeny 662 případy, nemocnost 6,3/100 000 obyvatel). Pokračuje pokles hlášené nemocnosti ve všech věkových skupinách. Stejně jako v předcházejících letech zůstává nejvyšší počet nemocných registrován ve skupině 10-14letých, bylo hlášeno 116 případů, což je nemocnost 25,6/100 000 obyv. V roce 2011 nebylo hlášeno žádné úmrtí v souvislost s pertusí. Z celkového počtu 324 případů bylo podle záznamů v EPIDATu laboratorně vyšetřeno 320 případů; 7 vzorků bylo potvrzeno metodou PCR, kultivačně bylo vyšetřeno 17 a potvrzeno 13 vzorků, většina případů byla diagnostikována sérologicky. Do Národní referenční laboratoře pro pertusi a difterii v SZÚ nebyl ke konfirmaci a k další charakterizaci poslán ani jeden kmen Bordetella pertussis.

In 2011, 324 pertussis cases were reported to the EPIDAT system in the Czech Republic, with a morbidity rate of 3.1/100,000 population, in comparison to 662 pertussis cases, with a morbidity rate of 6.3/100,000 population, recorded in 2010. The downward trend in reported pertussis cases continues in all age groups. Similarly to the previous years, the highest number of pertussis cases, i.e. 116 (25.6/100,000), occurred in 10-14-year-olds. In 2011, no pertussis-related death was recorded. Of the reported total of 324 pertussis cases, 320 were laboratory tested: most cases were diagnosed serologically, 13 of 17 samples tested were culture positive, and seven cases were confirmed by PCR. No Bordetella pertussis strain was referred to

• Klíčová slova
• nemocnost,
• MeSH
• Bordetella pertussis patogenita   MeSH
• Bordetella MeSH
• dítě MeSH
• dospělí MeSH
• hlášení nemocí metody   statistika a číselné údaje   MeSH
• incidence MeSH
• infekce bakteriemi rodu Bordetella diagnóza   epidemiologie   MeSH
• klinické laboratorní techniky statistika a číselné údaje   využití   MeSH
• kojenec MeSH
• kontrola infekčních nemocí metody   statistika a číselné údaje   MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• mladý dospělý MeSH
• morbidita MeSH
• pertuse diagnóza   epidemiologie   mortalita   MeSH
• pertusová vakcína terapeutické užití   MeSH
• předškolní dítě MeSH
• statistika jako téma MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• dospělí MeSH
• kojenec MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• mladý dospělý MeSH
• předškolní dítě MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

• Klíčová slova
• enterococcus gallinarum,
• MeSH
• bakteriologické techniky * statistika a číselné údaje   MeSH
• Bordetella pertussis izolace a purifikace   MeSH
• Enterococcus izolace a purifikace   účinky léků   MeSH
• Erysipelothrix izolace a purifikace   MeSH
• Escherichia coli izolace a purifikace   účinky léků   MeSH
• infekce bakteriemi rodu Bordetella diagnóza   MeSH
• laboratoře statistika a číselné údaje   MeSH
• mikrobiální testy citlivosti * statistika a číselné údaje   MeSH
• řízení kvality MeSH
• testování odbornosti laboratoří * statistika a číselné údaje   MeSH
• Yersinia enterocolitica izolace a purifikace   MeSH
• Publikační typ
• tabulky MeSH

Pertuse je vysoce nakažlivé onemocnění závažné svým průběhem zejména pro novorozence a kojence do jednoho roku života. Z epidemiologického hlediska je proto nutným požadavkem rychlé a správné stanovení diagnózy a následná cílená antibiotická terapie osob s pertusí. Spolu s očkováním adolescentů a dospělých proti pertusi tak lze snížit cirkulaci původce onemocnění Bordetella pertussis v populaci na minimum. Skupina reprezentující dvanáct evropských referenčních laboratoří „EU Pertstrain Group“ na základě mnoha studií doporučuje změnit přístup k laboratorní diagnostice pertuse a uvádí ve svých závěrech zásadní pravidla pro sérologickou diagnostiku pertuse.

Pertussis is a highly infectious disease that can have a severe course, particularly in newborns and infants under one year of age. From the epidemiological perspective, there is a need for a rapid and accurate diagnosis of pertussis and subsequent targeted antibiotic therapy. Vaccination of adolescents and adults against pertussis is another step in minimizing the circulation of the causative agent Bordetella pertussis. Based on multiple studies, the EU Pertstrain Group representative of 12 European reference laboratories recommends that the approach to the laboratory diagnosis of pertussis should be revised and summarizes the basic rules of the serological diagnosis of pertussis.

• Klíčová slova
• PCR,
• MeSH
• biologické toxiny škodlivé účinky   toxicita   MeSH
• dítě MeSH
• dospělí MeSH
• ELISA metody   normy   využití   MeSH
• infekce bakteriemi rodu Bordetella diagnóza   epidemiologie   prevence a kontrola   MeSH
• klinické laboratorní techniky metody   normy   využití   MeSH
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• novorozenec MeSH
• odběr biologického vzorku metody   normy   využití   MeSH
• pertuse diagnóza   mikrobiologie   prevence a kontrola   MeSH
• pertusový toxin MeSH
• předškolní dítě MeSH
• sérologické testy metody   normy   využití   MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• dospělí MeSH
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• novorozenec MeSH
• předškolní dítě MeSH
• Publikační typ
• směrnice pro lékařskou praxi MeSH

• MeSH
• bakteriologické techniky metody   MeSH
• Bordetella parapertussis izolace a purifikace   MeSH
• Bordetella pertussis izolace a purifikace   MeSH
• dítě MeSH
• infekce bakteriemi rodu Bordetella diagnóza   MeSH
• kultivační média MeSH
• lidé MeSH
• odběr biologického vzorku MeSH
• pertuse diagnóza   MeSH
• sérologické testy metody   MeSH
• směrnice pro lékařskou praxi jako téma MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• lidé MeSH

Využívanie poznatkov molekulárnej biológie nie je v súeasnosti už len doménou výskumných a vývojových pracovísk, ale eoraz eastejšie sa aplikujú aj do mikrobiologickej praxe. Zavádzanie diagnostických metód založených na princípoch molekulárnej biológie do laboratórií klinickej mikrobiológie výrazne u3aheí a hlavne urýchli identifikáciu jednotlivých agens vo vyšetrovaných vzorkách. Tento fakt je ve3mi významný z h3adiska lieeby, ale aj zahájenia úeinných epidemiologických a bezpeenostných opatrení. Neraz sa stane že práve molekulárno-biologické metódy sú jediné, pomocou ktorých je možné dokázaś klinicky stanovenú diagnózu i tam, kde ostatné metódy dôkazu už zlyhali.

The application of knowledge of bacterial genetics is no longer a new issue and the domain of research and development centers, being increasingly applied in routine microbiological practice. The introduction of new diagnostic methods, based on principles of molecular biology, to the clinical microbiology laboratories has simplified the identification of etiological agents in examined samples. This fact is especially significant in relation to therapy and in the introduction of efficient epidemiological measures and safety precautions. Using molecular-biology methods it is possible to confirm clinical diagnoses, where other detection methods had failed.

• MeSH
• Bacillus anthracis patogenita   MeSH
• Bordetella pertussis patogenita   MeSH
• infekce bakteriemi rodu Bordetella diagnóza   MeSH
• klinické laboratorní techniky metody   využití   MeSH
• lidé MeSH
• mikrobiologické techniky metody   trendy   využití   MeSH
• molekulární biologie metody   trendy   MeSH
• polymerázová řetězová reakce metody   využití   MeSH
• Toxoplasma patogenita   MeSH
• toxoplazmóza diagnóza   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH