- Klíčová slova
- technika sekvenování, rychlá a přesná diagnostika, nové patogeny,
- MeSH
- antibakteriální látky ekonomika farmakologie terapeutické užití MeSH
- bakteriální infekce * diagnóza etiologie mikrobiologie mortalita prevence a kontrola MeSH
- bakteriální léková rezistence * MeSH
- bakteriální nemoci kůže * MeSH
- infekce v ráně * diagnóza etiologie mikrobiologie MeSH
- kultivační techniky * metody využití MeSH
- kvantitativní polymerázová řetězová reakce * metody trendy využití MeSH
- lidé MeSH
- molekulární biologie * metody trendy MeSH
- rychlé screeningové testy metody využití MeSH
- sekvenční analýza hybridizací s uspořádaným souborem oligonukleotidů * metody využití MeSH
- spektrometrie hmotnostní - ionizace laserem za účasti matrice * metody využití MeSH
- Staphylococcus aureus patogenita účinky léků MeSH
- techniky typizace bakterií * klasifikace metody využití MeSH
- vysoce účinné nukleotidové sekvenování metody využití MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
Nové molekulárně biologické metody umožnily zpřesnění průkazu chromozomálních změn v nádorové tkáni. Tyto změny lze prokázat u většiny maligních nádorů. Rychlý rozvoj celogenomových molekulárně biologických metod napomohl zlepšení poznání genetického pozadí nádorů. V současné době je jejich průkaz součástí diagnostických nebo prognostických schémat používaných u jednotlivých nádorových onemocnění. Jako první bylo v klinické praxi využíváno klasické cytogenetické vyšetření karyotypu, které je využíváno dodnes, i když s nástupem nových molekulárně biologických technik se jeho význam zmenšil. Metodami dnes nejčastěji používanými ke stanovení chromozomálních delecí nebo zmnožení při celogenomovém vyšetření jsou komparativní genomová hybridizace (CGH), array-CGH a SNP array. První dvě jsou založeny na principu porovnání nádorové DNA a normální, kontrolní DNA. Princip SNP array využívá přítomnosti jednonukleových polymorfismů rozložených po celém genomu u každého jedince. SNP array prokazuje nejen delece nebo zmnožení chromozómů, tak jak je tomu u CGH technik, ale je schopna prokázat i ztrátu heterozygozyty nebo unipaternální dizomii. Vyšetření chromozomálních změn se dnes stává rutinním a v některých případech také nezbytným vyšetřením pro stanovené diagnózy a prognózy nádorového onemocnění a správného výběru onkologické terapie.
New molecular biology methods have specified the evidence of chromosomal changes in the tumor tissue. These alterations can be proven to exist in the majority of malignant tumors. The fast progress of whole genome molecular biological methods has helped to improve the knowledge of tumor genetics. The evidence of genetic changes is a component of currently used diagnostic and prognostic schemes in particular cancer diseases. Karyotyping was the first method used in the clinical practice but its importance has decreased with the arrival of new molecular biological methods. The most common methods used for the detection of chromosomal deletions or amplifications are CGH, array-CGH and SNP array. The first two methods are based on the principle of comparison between tumor DNA and control DNA. The principle of SNP array uses the presence of single nucleotide polymorphisms that are located in the whole genome in each individual. SNP array can prove not only deletions or amplifications of the chromosomes but unlike CGH techniques it can also detect a loss of heterozygosity or uniparental disomy. The screening of chromosomal changes has nowadays become routine. These techniques are used for diagnosis, prognosis and treatment of cancer disease in certain cases.
- MeSH
- chromozomální delece MeSH
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- genom lidský * genetika MeSH
- jednonukleotidový polymorfismus * MeSH
- lidé MeSH
- meduloblastom genetika MeSH
- molekulární biologie MeSH
- neuroblastom genetika MeSH
- sekvenční analýza hybridizací s uspořádaným souborem oligonukleotidů * metody využití MeSH
- srovnávací genomová hybridizace * metody využití MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- přehledy MeSH
- MeSH
- exprese genu genetika účinky léků MeSH
- genetické testování metody využití MeSH
- lidé MeSH
- nádory jícnu farmakoterapie genetika terapie MeSH
- neoadjuvantní terapie využití MeSH
- sekvenční analýza hybridizací s uspořádaným souborem oligonukleotidů metody statistika a číselné údaje využití MeSH
- výsledek terapie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- abstrakt z konference MeSH
Autor se ve svém sdělení zabývá problematikou progrese lokalizovaných renálních karcinomů po chirurgické léčbě. Přináší přehled některých prognostických faktorů, jednak standardně užívaných klinických a patologických ukazatelů (symptomatologie, TNM klasifikace, stupeň histopatologické diferenciace nádoru, mikrovaskulární invaze), jednak některých nově zkoumaných molekulárně biologických markerů (HIF-1?, VEGF, Ki67, p53, CXCR 3, MMP 2, MMP 9, IMP 3). Uvádí rovněž možnost využití DNA čipových technologií ve výzkumu renálních karcinomů.
The author of this review deals with the issue of localized renal carcinoma in patients undergoing surgical treatment. He outlines some of the prognostic factors – standard clinical and patological features used in clinical practice (symptomatology, TNM clasification, histopatological grade, microvascular invasion) and also some new molecular biological markers currently under investigation (HIF-1α, VEGF, Ki67, p53, CXCR 3, MMP 2, MMP 9, IMP 3). He also deals with the role of DNA microchip technologies in renal tu - mours research.
- Klíčová slova
- renální karcinom, prognostické faktory, molekulárně biologické markery, DNA čipová technologie,
- MeSH
- lidé MeSH
- nádorové biomarkery genetika MeSH
- nádory ledvin diagnóza metabolismus MeSH
- sekvenční analýza hybridizací s uspořádaným souborem oligonukleotidů využití MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
Folikulární lymfom (FL) je indolentní B-lymfoproliferace, jehož medián přežití se pohybuje mezi 8–10 lety. U 25–60 % nemocných však dochází k transformaci do agresivního lymfomu s velmi špatnou prognózou. FL se dosud pokládá za nevyléčitelné onemocnění, jehož individuální průběh lze jen těžko určit. Translokace (14;18) je tradičně spojována s FL, avšak její klinický význam je relativně malý. Rovněž dosud používané klinické a laboratorní parametry jsou nedostatečné v individuální stratifikaci pacientů s FL. Stanovení profilu genové exprese s využitím DNA mikročipů nabízí další možnost studia nádorů na molekulární úrovni. Takto lze diferencovat v rámci známé histopatologické diagnózy nové podjednotky, klinicky významné geny, nebo korelovat genovou expresi s prognostickými parametry. Podstatou DNA mikročipu je hybridizace testované nukleové kyseliny (u expresních čipů RNA) s komplementárními oligonukleotidovými sondami pevně lokalizovanými na čipu. Vzhledem k vysokému počtu současně vyšetřovaných genů (obvykle tisíce až desítky tisíc) je nedílnou součástí vyšetření genové exprese statistická analýza. Z výsledků studií zabývajících se významem profilu genové exprese u FL v různém kontextu této diagnózy lze konstatovat, že FL je z pohledu genové exprese relativně homogenní entita, transformovaný FL je klonálně identický s původním FL a liší se od de novo DLBCL. Transformace FL je heterogenní proces, který se děje více mechanismy. Z hlediska chování FL a prognózy mají zřejmě velký význam změny expresního profilu non-B-buněk mikroprostředí uzliny.
- MeSH
- experimenty na zvířatech MeSH
- exprese genu genetika MeSH
- finanční podpora výzkumu jako téma MeSH
- kostní denzita genetika MeSH
- lidé MeSH
- lokus kvantitativního znaku genetika MeSH
- molekulární biologie metody trendy MeSH
- myši genetika MeSH
- osteoporóza etiologie genetika MeSH
- polymerázová řetězová reakce metody trendy využití MeSH
- rizikové faktory MeSH
- sekvenční analýza hybridizací s uspořádaným souborem oligonukleotidů metody trendy využití MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- myši genetika MeSH
- zvířata MeSH
Hyperkinetická porucha patří k nejčastějším příčinám psychiatrické léčby v dětském věku. K rizikovým faktorům patogeneze hyperkinetické poruchy patří nejen faktory genetické, ale i faktory negenetické jako je nízká porodní váha, perinatální hypoxie či vliv toxických látek v prenatálním období. Příčiny onemocnění jsou v posledním desetiletí intenzivně hledány za využití neurozobrazovacích metod a metod molekulárně-biologických. V genetických studiích bylo zjištěno, že biologičtí rodiče a příbuzní s ADHD mají mnohonásobně vyšší procento možného výskytu symptomů hyperaktivity u svých dětí. Důkazem heritability hyperkinetické poruchy jsou i výsledky studií dvojčat. Během posledních deseti let se díky rozmachu molekulární biologie objevily mnohé studie, které jsou zaměřeny na výzkum vlivu tzv. kandidátních genů na patogenezi hyperkinetické poruchy. Naše práce výsledky těchto studií přehledně shrnuje.
Attention-deficit hyperactivity disorder (ADHD) belongs to common causes of psychiatric treatment in childhood. Risk factors of the pathogenesis are not only genetic factors, but also non-genetic ones such as low weight at birth, perinatal hypoxia and influence of toxic substances during the prenatal period. The causes of the disorder have been thoroughly investigated using the neuroimaging and molecular biology methods in the past ten years. It was found that biological parents and relatives with ADHD have much higher percentage of ADHD symptoms in their offsprings. Obviously, the results of twin studies have brought the evidence of the disorder's heritability. During the past few years many molecular-biology studies have appeared, which are focused on the research of influence of so-called candidate genes in the pathogenesis of ADHD. Our review summarises the results of these studies.
- MeSH
- finanční podpora výzkumu jako téma MeSH
- hyperkinetická porucha diagnóza etiologie MeSH
- lékařská genetika metody statistika a číselné údaje trendy MeSH
- lidé MeSH
- molekulární biologie metody trendy MeSH
- nukleární magnetická rezonance biomolekulární metody MeSH
- polymorfismus genetický genetika MeSH
- pozitronová emisní tomografie metody využití MeSH
- sekvenční analýza hybridizací s uspořádaným souborem oligonukleotidů metody využití MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
Východiska: Akutní lymfoblastická leukémie je nejčastěji diagnostikovanou malignitou dětských pacientů v české republice. V posledních desetiletích byl učiněn nebývalý pokrok v její léčbě, k němuž bezesporu napomohla i řada poznatků týkající se molekulárních charakteristik onemocnění. Analýza expresních profilů pomocí „Arrays“ (čipů) se stala jednou z významných metod při identifikaci potenciálních markerů onemocnění, které by umožnily bližší charakterizaci nádorových buněk a přispěly k porozumění procesu vzniku leukémie i stratifikace léčby. Metody a výsledky:V rámci studie byl sledován vliv methotrexátu na expresi genů p53-signální dráhy u maligních blastů izolovaných z kostní dřeně dětských pacientů s akutní leukémií. Změny exprese genů byly detekovány pomocí „GEArray Q series Human p53 Signalling Pathway Gene Array“. Porovnáním získaných expresních profilů jednotlivých pacientů byly pozorovány odlišné hladiny exprese sledovaných genů u kontrolních buněk, taktéž změny transkripční aktivity vlivem methotrexátu byly různorodé. Kromě jiných došlo vlivem methotrexátu k výrazným změnám transkripce genů uplatňující se při apoptóze či regulaci buněčného cyklu. Změny exprese některých genů byly nalezeny u více pacientů, řada ostatních se však projevila individuálně, nezávisle na typu onemocnění. Závěry: Byly detekovány změny v expresi řady genů p53-signální dráhy u maligních blastů kultivovaných ex vivo s methotrexátem. Odlišné hladiny exprese genů potvrzují značnou heterogenitu dětských leukémií, projevující se v našem souboru v expresních profilech a ve způsobu buněčné odpovědi na přítomnost methotrexátu, jejichž důsledkem může být různá míra citlivosti k aplikované látce a také různá odpověď pacienta na terapii.
Backgrounds: Acute lymphoblastic leukemia is the most frequent malignancy diagnosed in children in the Czech Republic. During last few decades, considerable progress in the treatment had been made and it was similarly contributed by many findings on the molecular basis of the disease. Expression profiling analysis using Macro or Micro Arrays has become an important technique to identify potential markers of the disorder, which might characterise malignant cells and help in the understanding of development of leukaemia and treatment stratification. Methods and Results: In the present study, the effect of methotrexate on the expression of p53-signalling pathway genes was investigated in malignant blasts isolated from the bone marrow of patients with acute leukemia. Expression variations were detected using „GEArray Q series Human p53 Signalling Pathway Gene Array“. Having drawn a comparison between expression profiles, variable gene expression levels in the control cells; likewise various transcription activity alterations were observed. Significant changes in the transcription were found among genes involved in the of apoptosis or cell cycle regulation. Regarding some genes, changes in expression were observed in more that one patient. However, the expression levels of most other genes varied individually, independently on the subtype of the disease. Conclusions: Changes in the expression of p53-signalling pathway genes were detected in the malignant blasts cultivated ex vivo with methotrexate. Different levels of the transcription in our series confirm heterogeneity of childhood leukemias, where patients with the same diagnosis do not need to share identical gene expression profiles even the manner of cellular response on the presence of methotrexate, resulting in the various level of perceptiveness to the medication and in the final response to the therapy.
- MeSH
- C-DNA MeSH
- exprese genu genetika účinky léků MeSH
- financování organizované MeSH
- geny p53 genetika imunologie účinky léků MeSH
- hematologické nádory diagnóza etiologie genetika MeSH
- hodnocení léčiv MeSH
- kostní dřeň MeSH
- lékařská onkologie metody trendy MeSH
- leukemie diagnóza etiologie genetika MeSH
- lidé MeSH
- methotrexát aplikace a dávkování terapeutické užití MeSH
- sekvenční analýza hybridizací s uspořádaným souborem oligonukleotidů metody využití MeSH
- systémy cílené aplikace léků metody využití MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
