Juvenile idiopathic arthritis (JIA) is a multifactorial autoimmune disease with involvement of adaptive and also innate immunity. The biological therapy (IL-1ß, IL-6 and TNFa inhibitors) revolutionized patient care, but there is still substantial variability in response to these drugs among JIA patients. Predictors for good clinical outcome are still missing and moreover, the therapy might bring complications such as drug-induced autoimmune diseases or increased susceptibility to infections. Neutrophils have an important role in pathology of these adverse effects, therefore we plan to focus on neutrophil functions in JIA patients during biological therapy. Our approach will include detailed phenotyping, functional tests, neutrophil extracellular trap formation and an effect on other immune cells. Subsequently, we will investigate especially neutrophils from the synovial fluid by mass cytometry and transcriptomics to obtain their complex characteristics. We believe that, our work will help to define neutrophil-related biomarker that could help to improve clinical decision-making.

Juvenilní idiopatická artritida (JIA) je multifaktoriální autoimunitní onemocnění zahrnující jak adaptivní tak i přirozenou imunitu. I přes revoluční přínos biologické léčby při péči o pacienty, je stále velká variabilita u JIA pacientů v odpovídavosti na léčbu. Predikátory dobrého klinického vývoje se stále hledají a terapie také může přinést řadu komplikací, jako například indukci autoimunitních onemocnění nebo náchylnost k infekcím. Jelikož je známo, že se neutrofily se podílejí na patologii těchto nežádoucích účinků, plánujeme se zaměřit na funkční vlastnosti neutrofilů u JIA pacientů během biologické léčby (IL-1ß, IL-6, TNFa inhibitory). Projekt bude zahrnovat detailní fenotypizaci, funkční testy, tvorbu neutrofilních extracelulárních pastí a interakce s ostatními imunitními buňkami. Komplexní chatakteristiku doplníme detekcí neutrofilů v synoviální tekutině, jejich fenotypizací pomocí hmotnostní cytometrie a RNA sekvenace. Věříme, že tato práce poslouží k podrobnějšímu definování netrofilů jako biomarkerů, které napomohou nasměrovat klinická rozhodnutí a zlepší péči o pacienty.

• Klíčová slova
• synoviální tekutina, synovial fluid, biologická léčba, neutrofily, neutrophils, dendritické buňky, dendritic cells, juvenilní idiopatická artritida, juvenile idiopathic arthritis, CyTOF, RNA-seq, biologic therapy, RNA-seq, CyTOF,

• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Primary immunedeficiencies (PIDs) are rare diseases of the immune system, manifesting primarily as increased susceptibility to infections, their more severe course, but also immune dysregulations, such as lymphoproliferation or autoimmunity. The diagnostic of PID experienced a massive boom in recent years, enabled by the next-generation sequencing (NGS) methods. However, the impact of newly identified genetic variants on the immune system is frequently uncertain. In this project, we propose to expand the pipeline for genetic diagnosis of patients with unspecified PIDs and subsequent laboratory evaluation of identified variant functional impact. The project will build upon the applicant department’s previous experience in diagnosing and treating patients with complex immunodeficiencies. The knowledge of precise genetic variant and its functional impact will allow us to propose novel therapeutic approaches, targetted at the specific molecular cause of the disease. This specific therapy can be beneficial in severe immune dysregulation resistant to commonly used medication.

Primární imunodeficience (PID) jsou vzácná onemocnění imunitního systému, projevující se zejména zvýšenou náchylností k infekcím, jejich závažnějším průběhem, ale také projevy imunitní dysregulace, jako jsou lymfoproliferace či projevy autoimunity. Diagnostika PID zaznamenala v posledních letech obrovský rozvoj, umožněný zejména metodami sekvenování nové generace (NGS). Vliv nově identifikovaných genetických variant na imunitní systém však často není jednoznačný. V tomto projektu tedy navrhujeme rozšíření postupů pro genetickou diagnostiku pacientů s dosud neurčenými PID a následně rozvoj laboratorních metod umožňujících zkoumání funkčního vlivu nalezených variant. Práce bude navazovat na počáteční zkušenosti s pacienty s komplexními imunodeficity na řešitelském pracovišti. Přesná znalost genetické poruchy a jejího funkčního vlivu nám poté umožní navrhnout nové terapeutické postupy, cílené na konkrétní molekulární podstatu onemocnění pacientů. Tato specifická léčba může příznivě ovlivnit i závažné stavy imunitní dysregualce rezistentní k běžně používaným lékům.

• MeSH
• molekulární medicína MeSH
• primární imunodeficience diagnóza   genetika   MeSH
• vysoce účinné nukleotidové sekvenování MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• alergologie a imunologie
• genetika, lékařská genetika
• molekulární biologie, molekulární medicína
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Již třetí vydání úspěšné publikace je zcela přepracováno zejména v části primárních imunodeficiencí, kde od předchozího vydání došlo za více než 13 let ke zcela zásadním změnám. Publikace je určena lékařům všech oborů, kteří léči nemocné s těmito chorobami - zejména internistům, pediatrům a praktickým lékařům pro děti i dospělé.

• Klíčová slova
• Metabolizmus, imunita,
• MeSH
• genetické nemoci vrozené MeSH
• nemoci imunitního systému MeSH
• syndromy imunologické nedostatečnosti MeSH

• NLK Obory
• alergologie a imunologie
• genetika, lékařská genetika

Publikace se zaměřuje na imunodeficience a vrozené poruchy imunitního systému. Určeno odborné veřejnosti.

• MeSH
• genetické nemoci vrozené MeSH
• nemoci imunitního systému MeSH
• syndromy imunologické nedostatečnosti MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• alergologie a imunologie
• genetika, lékařská genetika
• NLK Publikační typ
• kolektivní monografie

Sborník prací ze semináře, který se zaměřil na biologickou léčbu v pediatrii. Určeno odborné veřejnosti.

• MeSH
• biologická terapie MeSH
• biologické přípravky MeSH
• dítě MeSH
• klinické lékařství MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• Publikační typ
• sborníky MeSH

• Konspekt
• Pediatrie
• NLK Obory
• pediatrie
• biomedicínské inženýrství
• NLK Publikační typ
• semináře

The type 1 diabetes (T1D) is an autoimmune disease with multifactorial etiology. The involvement of adaptive immunity was clearly demonstrated. The role of innate immunity in T1D is intensively studied, mainly the role of dendritic cells (DCs) as key players in evolvement and maintenance of peripheral immune tolerance. Studies in animal models demonstrated the interactions between multiple immune cells contribute to autoimmune reaction against beta-cells. DCs after autoantigen processing and presentation produce proinflammatory cytokines, including IFNalpha and stimulate autoreactive T cells. Moreover, neutrophils induce DC maturation and influence the activation of IFNalpha-producing pDCs. This innate cell interrelation suggests the role of DCs, mainly pDCs and IFNalpha in T1D pathogenesis. This project will focused on the study of analogical interactions in T1D patients using in vitro DC models.

Diabetes mellitus 1. typu (T1D) je autoimunitní multifaktoriální onemocnění. V patogenezi T1D se uplatňují především mechanismy adaptivní imunity. V posledních letech je významně zkoumána úloha vrozené imunity u T1D, hlavně dendritických buněk (DC) jako klíčových buněk v rozvoji a udržení periferní tolerance. Mnohé studie u myší prokázaly vzájemnou interakci imunitních buněk (DC, makrofágy, lymfocyty) vedoucí k autoimunitní reakci namířené proti beta-buňkám pankreatu. DC po pohlcení autoantigenů produkují prozápalové cytokiny, včetně IFNalpha a jsou schopny stimulovat autoreativní T lymfocyty. Neutrofily indukují maturaci DC a aktivují produkci IFNalpha pDC buňkami. Tato vzájemná interakce potvrzuje roli DC, hlavně pDC, a IFNalpha v patogenezi T1D. Tato studie na in vitro modelech bude zaměřena na sledování obdobných interakcí u pacientů s T1D.

• MeSH
• dendritické buňky MeSH
• diabetes mellitus 1. typu etiologie   imunologie   MeSH
• monocyty MeSH
• neutrofily MeSH
• přirozená imunita MeSH
• techniky in vitro MeSH
• zánět MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• diabetologie
• alergologie a imunologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Immune defects are often a combination of inadequate infection control and autoimmune phenomena caused by overreaction to autologous antigens. Underlying cause may be found at impaired function of T and B cells and improper regulation of their cooperation. In the proposed project, we will characterize composition, abnormalities and systemic relationships of normal and abnormal subsets of lymphocytes using cutting edge techniques of multi-color flow cytometry (MC-FACS) and molecular genetics in all primary immunodeficiency (PID) patients in both centers and in patients with Common Variable Immunodeficiency (CVID) and selective IgA deficiency. Bioinformatic analysis of standardized MC-FACS data from 150 patients will serve us to develop a diagnostic scheme together with EuroFlow PID international group for PIDs with established molecular genetic lesion. Furthermore, cases with commonalities in MC-FACS and clinical presentation will be investigated by whole exome sequencing to elucidate new genetic variations leading to PID.

Defekty imunity se často vyznačují kombinací nedostatečné kontroly infekce a zároveň autoimunitními projevy způsobenými reakcí organismu proti vlastním antigenům. Patogenetickým podkladem mohu být poruchy ve funkci T a B lymfocytů a špatná regulace jejich vzájemné spolupráce. V navrhovaném projektu plánujeme pomocí nejmodernějších technik mnohobarevné průtokové cytometrie (MC-FACS) a molekulární genetiky podrobně charakterizovat složení, aberace a vzájemné systémové vztahy fyziologických i patologických subpopulací lymfocytů u všech primárních imunodeficitů (PID) diagnostikovaných na zúčastněných pracovištích v průběhu řešení projektu a u souboru pacientů s běžným variabilním imunodeficitem (CVID) a selektivním deficitem IgA. Na základě bioinformatické analýzy výsledků MC-FACS od přibližně 150 pacientů bude vypracováno v součinnosti s mezinárodní skupinou EuroFlow-PID diagnostické schéma pro jednotky s již známou genetickou příčinou a budou vytipovány skupiny pacientů s podobným laboratorním a klinickým obrazem k celogenomové analýze a validaci vytipovaných nových variací.

• MeSH
• časná diagnóza MeSH
• genetické testování MeSH
• imunitní systém - jevy MeSH
• lymfocyty MeSH
• molekulární biologie MeSH
• primární imunodeficience diagnóza   MeSH
• průtoková cytometrie MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• alergologie a imunologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

• MeSH
• cystická fibróza terapie   MeSH
• hypofosfatázie diagnóza   terapie   MeSH
• vzácné nemoci MeSH
• Publikační typ
• sborníky MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• pediatrie

Current proposal covers systematic and prospective immunological investigation of a cohort of children with syndrome diGeorge. As a part of their genetic defect these patient have impaired development of thymus that substantially affects their immune functions. We plan to investigate in a prospective study not only T cells that were in past studied in detail, but also B cells potentially affected by impaired T cells help. We also plan to investigate T regulatory cells and T regulatory cells expressing Helios as a marker of thymus derived Tregs. We finally plan to correlate all these finding with age and clinical status of diGeorge children.

Předkládaný projekt se zabývá systematickým a prospektivním sledováním dětí se syndromem diGeorge. Součástí tohoto geneticky podmíněného syndromu je porucha funkce thymu, která následně ovlivňuje vývoj imunitního sysstému. V plánu tohto projektu je studium nejenom T lymfocytů, které byly již v minulosti opakovaně vyšetřovány a výsledky publikovány, ale také B lymfocytů a protilátkové odpovědi, s předpokladem jejich ovlivnění abnormální pomocí T lymfocytů. Tato vyšetření doplníme vyšetřováním T regulačních buněk, včetně T regs exprimujících Helios, který umožní odlišení Tregs pocházejících z thymu. Všechna data budou korelována s klinikou a věkem dětí. Souhrnná analýza umožní detailní zmapování vývoje imunity u dětí se syndromem diGeorge.

• MeSH
• B-lymfocyty cytologie   MeSH
• DiGeorgeův syndrom MeSH
• fenotyp MeSH
• průtoková cytometrie MeSH
• regulační T-lymfocyty MeSH
• syndrom delece 22q11 MeSH
• T-lymfocyty cytologie   MeSH
• thymus imunologie   MeSH
• transkripční faktor Ikaros MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• alergologie a imunologie
• genetika, lékařská genetika
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Type 1 diabetes (T1D) is an autoimmune disease of unknown etiology. The involvement of T and B cells mediated adaptive immunity was clearly demonstrated. Much less is known about innate immunity in the disease onset and progression. Recent studies showedthe disturbances in dendritic cells subsets in T1D. Interesting data were also found on animal models, including studies on inflammation mediated by TLR activation. Thus, we propose a study of innate immunity in a cohort of children with T1D, in the time of the onset and during first year of the disease duration. The studies will concentrate on DCs subsets and their respective function. Specific attention would be paid to pDCs, a population crucial for viral recognition and decreased in T1D and their activation upon TLR9 ligation. Healthy age matched controls and the groups of the first degree relatives of patients will be investigated. We expect to get new, so far unknown facts about the immune response in the critical period of diabetes onset.

Diabetes 1.typu (T1D) je autoimunitní onemocnění neznámé etiologie. V patogeneze onemocnění se uplatňují mechanismy adaptivní imunity zprostředkované T i B lymfocyty. Úloha reakcí vrozené imunity u T1D je daleko méně známa. První poznatky se objevují ažve zcela nedávné době, kdy byly popsány změny v subpopulacích dendritických buněk u T1D. Zajímavá data vzešla ze studií na zvířatech, které se zabývaly mechanismy TLR zprostředkovaného zánětu. Na podkladě těchto nových dat předkládáme studii u dětí T1D.V projektu, který je zaměřen hlavně na populace DC, plánujeme studie mechanismů vrozené imunity v době vzniku a počáteční progrese onemocnění. Chceme specificky zaměřit na populace plasmacytoidních DC, které jsou, v aktivaci přes TLR receptory (včetně TLR9), obzvláště důležité v rozpoznání virové infekce. Kromě studované kohorty dětí s T1D zformujeme skupiny zdravých kontrol a příbuzných pacientů. Očekáváme získání nových dat, přispívajících k poznání patogeneze T1D.

• MeSH
• B-lymfocyty fyziologie   imunologie   MeSH
• dendritické buňky MeSH
• diabetes mellitus 1. typu genetika   imunologie   MeSH
• dítě MeSH
• longitudinální studie MeSH
• přirozená imunita genetika   MeSH
• T-lymfocyty fyziologie   imunologie   MeSH
• toll-like receptory MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• diabetologie
• alergologie a imunologie
• pediatrie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR