Familiární onemocnění krvetvorby (FHD) jsou vzácnou a heterogenní skupinou onemocnění. Variabilní klinické projevy a prolínající se formy FHD zapříčiňují mnohy nesprávné stanovení diagnózy. Díky moderním genomickým přístupům (celoexomové sekvenování) dnes dokážeme vyřešit mnohé dosud neobjasněné případy. Nicméně u některých pacientů detekujeme jedinečnou a rodinně-specifickou genetickou variantu nejasného klinického významu (VUS). Cílem navrhované studie je vyhledávat zárodečné varianty u postižených rodin s FHD. Dále budeme zjišťovat funkční dopad identifikovaných VUS, abychom potvrdili jejich kauzalitu pomocí in vitro modelů (CRISPR/Cas9, mikroskopické a proteomické eseje). Na základě těchto zkušeností plánujeme zavést nový biomedicínský postup funkčního testování VUS do rutinní laboratorní praxe. Stanovení správné diagnózy u pacienta je zásadní i z důvodů určení rizika výskytu onkologických malignit, ke kterým některé zárodečné varianty predisponují. Očekáváme přímý dopad naší studie do translačního výzkumu hematopoézy, karcinogenézy a genové terapie.; Familial haematopoietic disorders (FHD) are a rare and heterogeneous group of disorders. Variable clinical expressivity and overlapping forms of FDH cause many misdiagnoses. Thanks to modern genomic approaches (whole exome sequencing), we are able to solve many previously unclear cases today. However, in some patients we detect a unique and family-specific gene variant of uncertain significance (VUS). The aim of the proposed study is to search for germline variants in affected families with FHD phenotype. Furthermore, we plan to investigate the functional impact of identified VUSs to verify their causality using in vitro models (CRISPR/Cas9, microscopic, and proteomic assays). Based on these experiences, we will introduce new biomedical pipeline for functional testing of VUSs into routine laboratory practice. Determining the correct diagnosis of a patient is also essential to define the risk of cancer, which some germline variants predispose. We expect a direct impact of our study in translational research of haematopoiesis, cancerogenesis and gene therapy.

• Keywords
• variant of uncertain significance, funkční studie, functional studies, familiární poruchy krvetvorby, varianta nejasného klinického významu, whole exome sequencing, familial haematopoietic disorders, celoexomové sekvenování,

• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Navrhovaný projekt je zaměřen na studium genetického podkladu, etiologie a patogeneze nových případů talasémií, erytroenzymopatií, defektů membrány erytrocytů vedoucích k hemolytickým anémiím, vrozených dyserytropoetických anémií, vrozených poruch transportu železa v erytroidních buňkách a vrozených polycytémií. Na základě zkušeností získaných v průběhu předchozích grantových období odhadujeme, že přibližně u dvou set dětských pacientů budou potvrzeny vrozené defekty erytropoézy. V rámci projektu budeme využívat několika moderních přístupů (CRISPR/Cas9 editace, indukované pluripotentní kmenové buňky, myší a rybí modely), které nám umožní odhalit molekulárně-genetické mechanismy přispívající k defektní erytropoéze. Výsledky naší práce pomohou pochopit molekulárně genetické faktory přispívající k patologické erytropoéze, objasnit propojení procesu nevyvážené erytropoézy s metabolismem železa a úlohu proteinů signalizačních cest hypoxie, jednoho z důležitých cílů pro terapeutické intervence u nádorů.; This project aims to establish genetic background, etiology and pathogenesis of new cases of thalassemias, enzymopathies, erythrocyte membrane defects associated with hemolytic anemia, congenital dyserythropoietic anemia as well as some congenital defects of the iron transport pathway in erythroid cells and congenital polycythemias. Based on experiences gained during previous grant periods we estimate that in approximately two hundreds of pediatric patients hereditary defects of erythropoiesis will be confirmed. We propose several approaches (CRISPR/Cas9 editing, induced pluripotent stem cells, zebrafish and mouse model) to unravel the molecular-genetic mechanisms contributing to defective erythropoiesis. Results of our work will improve understanding of the molecular-genetic factors contributing to the pathogenesis of disordered erythropoiesis, and will help to elucidate the interconnections of disbalanced erythropoiesis and iron metabolism and the role of the hypoxia signaling pathway proteins, which emerge as important targets for therapeutic interventions in tumors.

• Keywords
• zebrafish, hemolytická anémie, kongenitální polycytémie, HIF dráha, Danio rerio, hemolytic anemia, congenital polycythemia, HIF pathway,

• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

• MeSH
• Biology MeSH
• Genetics, Medical MeSH
• Molecular Medicine MeSH

• Conspectus
• Lékařské vědy. Lékařství
• Učební osnovy. Vyučovací předměty. Učebnice
• NML Fields
• biologie
• NML Publication type
• učebnice vysokých škol

Biografie Jennifer Doudna, která se zaměřuje na její práci v genetickém inženýrství a na modifikaci DNA. Určeno široké veřejnosti.

• MeSH
• Biochemistry MeSH
• COVID-19 genetics   MeSH
• CRISPR-Cas Systems MeSH
• History, 20th Century MeSH
• History, 21st Century MeSH
• DNA genetics   MeSH
• Genetic Engineering history   MeSH
• Genetics MeSH
• CRISPR-Associated Protein 9 MeSH
• Science MeSH
• Famous Persons MeSH
• Check Tag
• History, 20th Century MeSH
• History, 21st Century MeSH
• Publication type
• Biography MeSH
• Popular Work MeSH
• Geographicals
• United States MeSH

• Conspectus
• Biografie
• Biotechnologie. Genetické inženýrství
• NML Fields
• genetika, lékařská genetika
• dějiny lékařství

• About
• Doudna, Jennifer A Authority

Příručka, která se zaměřuje na základy genetiky. Určeno praktickým lékařům.; Soubor kapitol odráží stav poznatků o dědičnosti, ke kterým genetická věda dospěla během posledního desetiletí, kdy postupně pronikla prakticky do všech klinických oborů, v nichž pevně zakotvila jako jejich nedílná součást. Převážně pochopitelně v diagnostice, neboť náš genom je, jak na úrovni člověka-jedince nebo lidské populace, tak na úrovni jeho základních součástí, tj. buněk, rozhodující pro stav zdraví a nemoci. A vedle porodníků a dětských lékařů jsou to právě všeobecní praktičtí lékaři, kteří stojí v první linii zdravotního systému, aby mohli zásadním způsobem rozhodovat o procesech, do nichž pacient vstoupí. V posledních letech se dokonce začínáme pokoušet o jeho úpravu tzv. genovou editací. A i když se zatím nestala běžnou klinickou aplikací, je pravděpodobné, že se i tento dávný sen genetického inženýrství nakonec splní a budeme moci k diagnostice připojit i terapii.

• MeSH
• Genetics MeSH
• General Practice MeSH
• Publication type
• Handbook MeSH

• Conspectus
• Obecná genetika. Obecná cytogenetika. Evoluce
• NML Fields
• genetika, lékařská genetika
• všeobecné lékařství
• NML Publication type
• kolektivní monografie

Niemann-Pickova choroba typu C (NPC) se může projevit poprvé v jakémkoli věku a zejména v dospělosti může být diagnostikována pozdě nebo chybně. Nový kvantitativní diagnostický test pro NPC, který podstatně usnadní diagnostiku nemoci, je založen na zátěži buněk cholesterol-dextranovými nanočásticemi (Chol/Dex) pro zvýraznění rozdílů v koncentracích metabolitů mezi pacienty s NPC a kontrolami. Deuterovaný cholesterol v Chol/Dex dovolí kvantifikaci endocytovaného cholesterolu tandemovou hmotnostní spektrometrií. Optimalizovaný test bude proveden ve více než 25 kulturách kožních fibroblastů pacientů s různými formami NPC a bude vypočítán poměr cholesterol/cholesteryl ester. Technikou CRISPR-Cas9 připravíme buněčné linie homozygotní pro časté varianty v genu NPC1 spojované s dospělou formou nemoci a pomocí testu určíme jejich patogenitu. Test bude upraven pro užití v bílých krvinkách a kultivovaných lymfocytech a bude zhodnoceno jeho možné diagnostické využití.; Niemann-Pick type C disease (NPC) can present in any age and especially in adulthood it may be misdiagnosed or detected late. The novel diagnostic test for NPC is based on loading of cells with cholesterol-dextran nanoparticles (Chol/Dex) in order to amplify the differences in metabolite levels between NPC controls and patients. Deuterium-labeled cholesterol in Chol/Dex will enable quantification of endocytosed cholesterol by tandem-mass spectrometry. Optimized test will be evaluated in more than 25 skin fibroblast cell lines from patients with different forms of NPC; cholesterol/cholesteryl ester ratio will be calculated. Cell lines homozygous for frequent variants in NPC1 gene implicated in adult forms of NPC will be created by genome editing using CRISPR-Cas9 and evaluated using the Chol/Dex-based test to determine their pathogenicity. The test will be adapted to white blood cells and cultured lymphocytes and its usefulness for diagnostics of NPC will be evaluated.

• MeSH
• Alleles MeSH
• Cholesterol MeSH
• Dextrans MeSH
• Mass Spectrometry methods   MeSH
• Humans MeSH
• Late Onset Disorders diagnosis   MeSH
• Niemann-Pick Disease, Type C diagnosis   MeSH
• CRISPR-Associated Protein 9 MeSH
• Check Tag
• Humans MeSH

• Conspectus
• Patologie. Klinická medicína
• NML Fields
• neurologie
• genetika, lékařská genetika
• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

• MeSH
• Reproductive Techniques, Assisted MeSH
• Gametogenesis genetics   MeSH
• Infertility MeSH
• Genitalia embryology   MeSH
• Preimplantation Diagnosis methods   MeSH
• Publication type
• Handbook MeSH

• Conspectus
• Obecná genetika. Obecná cytogenetika. Evoluce
• Učební osnovy. Vyučovací předměty. Učebnice
• NML Fields
• reprodukční lékařství
• molekulární biologie, molekulární medicína
• embryologie a teratologie
• NML Publication type
• kolektivní monografie

Terapie monoklonálními protilátkami (mAbs) se často potýká s rezistencí způsobenou snížením exprese cílových antigenů. Podstata zapříčiňujících mechanismů zůstává neznámá, stejně jako účinnost nově vyvinutých mAbs. V tomto projektu budeme testovat vliv několika klinicky nejvíce pokročilých mAbs na úroveň exprese jejich cílového antigenu a určíme funkční důsledky snížené exprese na efektivitu protilátek v usmrcování buněk. Charakterizujeme buněčné mechanismy regulující povrchovou expresi antigenů, které jsou downregulovány v reakci na některou z mAbs. Prozkoumáme, jakými mechanismy jsou tyto antigeny degradovány a budeme sledovat změny na úrovni transkripce a translace, změny v aktivitě promotoru a epigenetické modifikace. Na závěr provedeme screening s inhibitory epigenetických enzymů a celogenomový “loss-of-function” screening s využitím nové technologie na úrovni dnešní doby. Tento přístup povede k identifikaci proteinů podílejících se na regulaci povrchové exprese a navrhne intervenční strategie, které mohou vést k upregulaci antigenů na buněčném povrchu.; Monoclonal antibody (mAb) therapy often encounters resistance due to downmodulation of the target antigens. The exact underlying mechanisms remain unknown as well as the efficacy of newly developed mAbs. We propose to investigate the impact of several clinically advanced mAbs on the expression level of their target antigen and determine functional consequences of lower target expression on the potency of mAbs in cell killing. We will characterize cellular mechanisms regulating the surface expression of antigens that are downregulated in response to any of the mAbs. We shall investigate how are these antigens degraded and explore changes on the transcriptional and translational level, changes in promoter activity and epigenetic alterations. Finally, we will perform rescue screen with inhibitors of epigenetic modifying enzymes and a whole genome loss-of-function screen using novel state-of-the-art technique. This will identify proteins involved in the regulation of surface expression and suggest intervention strategies that may lead to upregulation of the antigens on the cell surface.

• MeSH
• Antigens, Surface MeSH
• Leukemia, Lymphocytic, Chronic, B-Cell therapy   MeSH
• Gene Expression MeSH
• Enzyme Inhibitors MeSH
• Drug Resistance MeSH
• Antibodies, Monoclonal therapeutic use   MeSH
• CRISPR-Associated Protein 9 MeSH
• Gene Expression Regulation MeSH

• NML Fields
• onkologie
• biochemie
• genetika, lékařská genetika
• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

• MeSH
• Allergy and Immunology MeSH
• Immune System MeSH
• Publication type
• Textbook MeSH

• Conspectus
• Patologie. Klinická medicína
• Učební osnovy. Vyučovací předměty. Učebnice
• NML Fields
• alergologie a imunologie

Publikace je zaměřena na problémy, které byly nastoleny informací o rozhodnutí britských genetiků editovat genom lidských embryí, druhá část na aktuální problémy veřejného zdravotnictví. Nakladatelská anotace. Kráceno.; Tato monografie představuje další část z tohoto cyklu. Ústředním tématem je stále aktuálnější otázka, zda „můžeme to, co umíme“. I tentokráte jde o řešení kontroverzních témat mezi současnou medicínou a etikou. Publikace je zaměřena zčásti na problémy, které byly nastoleny informací o rozhodnutí britských genetiků editovat genom lidských embryí. Skutečnost, že vědecká komunita připouští editování genomu embryí a jejich transfer do dělohy, navozuje více než kontroverzní pocity. Progresivní metoda CRISPR/Cas9 totiž ve svých důsledcích překonává všechny dosud uvažované možnosti genetiky. To, co bylo donedávna posuzováno jako morální problém a respektované tabu, se stává potenciální hrozbou s nedozírnými důsledky. Druhá část publikace je zaměřena na aktuální problémy veřejného zdravotnictví. Uvedena jsou témata jako např. otázka dostupnosti či nedostupnosti cílené léčby v české onkologii, etika státu a zdravotníků v kontrole tabáku nebo meze a dilemata zachovávání lékařského tajemství v denní klinické praxi, ale i některé diskutované aspekty klinické medicíny.

• MeSH
• Bioethics MeSH
• Ethics, Medical MeSH
• Human Genome Project MeSH
• Public Health MeSH

• Conspectus
• Veřejné zdraví a hygiena
• NML Fields
• etika, bioetika, lékařská etika
• veřejné zdravotnictví
• NML Publication type
• kolektivní monografie