Nejvíce citovaný článek - PubMed ID 12931229
High hyperdiploid acute lymphoblastic leukemia (HeH ALL), one of the most common childhood malignancies, is driven by nonrandom aneuploidy (abnormal chromosome numbers) mainly comprising chromosomal gains. In this study, we investigate how aneuploidy in HeH ALL arises. Single cell whole genome sequencing of 2847 cells from nine primary cases and one normal bone marrow reveals that HeH ALL generally display low chromosomal heterogeneity, indicating that they are not characterized by chromosomal instability and showing that aneuploidy-driven malignancies are not necessarily chromosomally heterogeneous. Furthermore, most chromosomal gains are present in all leukemic cells, suggesting that they arose early during leukemogenesis. Copy number data from 577 primary cases reveals selective pressures that were used for in silico modeling of aneuploidy development. This shows that the aneuploidy in HeH ALL likely arises by an initial tripolar mitosis in a diploid cell followed by clonal evolution, in line with a punctuated evolution model.
- MeSH
- akutní lymfatická leukemie * genetika MeSH
- aneuploidie * MeSH
- chromozomální aberace MeSH
- chromozomální nestabilita MeSH
- diploidie MeSH
- lidé MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- MeSH
- akutní lymfatická leukemie diagnóza etiologie metabolismus terapie MeSH
- biologické markery MeSH
- biopsie MeSH
- dítě MeSH
- genová přestavba MeSH
- imunitní dozor * MeSH
- klonální evoluce genetika imunologie MeSH
- kostní dřeň MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- předškolní dítě MeSH
- prekancerózy patologie MeSH
- translokace genetická MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- předškolní dítě MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- dopisy MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Názvy látek
- biologické markery MeSH
BACKGROUND: While there is enough convincing evidence in childhood acute lymphoblastic leukemia (ALL), the data on the pre-natal origin in childhood acute myeloid leukemia (AML) are less comprehensive. Our study aimed to screen Guthrie cards (neonatal blood spots) of non-infant childhood AML and ALL patients for the presence of their respective leukemic markers. METHODS: We analysed Guthrie cards of 12 ALL patients aged 2-6 years using immunoglobulin (Ig) and T-cell receptor (TCR) gene rearrangements (n = 15) and/or intronic breakpoints of TEL/AML1 fusion gene (n = 3). In AML patients (n = 13, age 1-14 years) PML/RARalpha (n = 4), CBFbeta/MYH11 (n = 3), AML1/ETO (n = 2), MLL/AF6 (n = 1), MLL/AF9 (n = 1) and MLL/AF10 (n = 1) fusion genes and/or internal tandem duplication of FLT3 gene (FLT3/ITD) (n = 2) were used as clonotypic markers. Assay sensitivity determined using serial dilutions of patient DNA into the DNA of a healthy donor allowed us to detect the pre-leukemic clone in Guthrie card providing 1-3 positive cells were present in the neonatal blood spot. RESULTS: In 3 patients with ALL (25%) we reproducibly detected their leukemic markers (Ig/TCR n = 2; TEL/AML1 n = 1) in the Guthrie card. We did not find patient-specific molecular markers in any patient with AML. CONCLUSION: In the largest cohort examined so far we used identical approach for the backtracking of non-infant childhood ALL and AML. Our data suggest that either the prenatal origin of AML is less frequent or the load of pre-leukemic cells is significantly lower at birth in AML compared to ALL cases.
- MeSH
- akutní lymfatická leukemie krev embryologie epidemiologie genetika MeSH
- buněčné klony chemie MeSH
- buňky kostní dřeně chemie MeSH
- dítě MeSH
- DNA nádorová krev MeSH
- duplikace genu MeSH
- fetální krev chemie MeSH
- fúzní onkogenní proteiny krev genetika MeSH
- genová přestavba B-lymfocytů * MeSH
- genová přestavba T-lymfocytů * MeSH
- kohortové studie MeSH
- kojenec MeSH
- lidé MeSH
- myeloidní leukemie krev embryologie epidemiologie genetika MeSH
- nádorové biomarkery krev MeSH
- nádorové proteiny krev genetika MeSH
- novorozenec MeSH
- novorozenecký screening MeSH
- polymerázová řetězová reakce MeSH
- předškolní dítě MeSH
- protein PEBP2A2 krev genetika MeSH
- protein RUNX1T1 MeSH
- protoonkogenní protein MLL krev genetika MeSH
- tandemové repetitivní sekvence MeSH
- tyrosinkinasa 3 podobná fms krev genetika MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- kojenec MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- novorozenec MeSH
- předškolní dítě MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Názvy látek
- AML1-ETO fusion protein, human MeSH Prohlížeč
- CBFbeta-MYH11 fusion protein MeSH Prohlížeč
- DNA nádorová MeSH
- FLT3 protein, human MeSH Prohlížeč
- fúzní onkogenní proteiny MeSH
- MLL-AF10 fusion protein, human MeSH Prohlížeč
- MLL-AF6 fusion protein, human MeSH Prohlížeč
- nádorové biomarkery MeSH
- nádorové proteiny MeSH
- promyelocytic leukemia-retinoic acid receptor alpha fusion oncoprotein MeSH Prohlížeč
- protein PEBP2A2 MeSH
- protein RUNX1T1 MeSH
- protoonkogenní protein MLL MeSH
- TEL-AML1 fusion protein MeSH Prohlížeč
- tyrosinkinasa 3 podobná fms MeSH