-
Je něco špatně v tomto záznamu ?
Molekulární detekce a typizace Treponema pallidum subsp. pallidum v klinickém materiálu
[Molecular detection and subtyping of Treponema pallidum subsp. pallidum in clinical specimens]
M. Flasarová, D. Šmajs, P. Matějková
Jazyk čeština, angličtina Země Česko
Typ dokumentu srovnávací studie
- MeSH
- diagnostické techniky molekulární metody statistika a číselné údaje využití MeSH
- finanční podpora výzkumu jako téma MeSH
- lidé MeSH
- odběr biologického vzorku klasifikace metody statistika a číselné údaje MeSH
- polymerázová řetězová reakce klasifikace metody statistika a číselné údaje MeSH
- sekvence nukleotidů účinky léků MeSH
- techniky typizace bakterií metody statistika a číselné údaje využití MeSH
- Treponema pallidum genetika izolace a purifikace klasifikace MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- srovnávací studie MeSH
Zavedli jsme metodu detekce chromozomální DNA Treponema pallidum subsp. pallidum dvoukrokovou (nested) PCR reakcí, která amplifikuje část genu TP0319, kódujícího hypotetický membránový lipoprotein (gen tmpC). Vyšetřili jsme 138 sér od 111 dospělých pacientů v primárním, sekundárním, časně latentním a pozdně latentním stadiu a také pacientů s podezřením na syfilis. Chromozomální DNA T. p. pallidum se v séru dospělých pacientů nepodařilo detegovat. Při vyšetření 11 kožních a slizničních stěrů (7 genitálních, 4 faryngeálních) jsme nalezli 6 pozitivních od 3 pacientů ve stadiu primární a sekundární syfilis. Pozitivní byl rovněž jeden stěr pacienta s časnou kongenitální syfilis. Sekvenování DNA genů TP0136 a TP0548 z pozitivních vzorků prokázalo výskyt dvou kmenů sekvenčně identických s kmenem T. p. pallidum SS14 a dvou unikátních syfilitických kmenů, doposud u T. p. pallidum nepopsaných. U jednoho vyšetřovaného novorozence s pozitivním výsledkem vyšetření kožního vzorku jsme prokázali treponemální DNA také v séru a v cerebrospinálním moku. Pokroky v molekulární typizaci T. p. pallidum v klinickém materiálu přispějí k rozvoji epidemiologie syfilis a přinesou možnosti rozlišení mezi reinfekcí a reaktivací syfilitického procesu.
An in-house two-step nested PCR amplification targeting the tmpC gene (TP0319, encoding putative membrane lipoprotein) was used for detection of chromosomal DNA of Treponema pallidum subsp. pallidum in clinical specimens.We tested 138 blood serum samples from 111 adult patients with suspected, primary, secondary, early or late latent syphilis. T. p. pallidum DNA was not detected in any of the analyzed specimens. Out of 11 mucocutaneous swabs (7 genital and 4 pharyngeal), 6 collected from 3 patients with primary or secondary syphilis tested positive. One skin swab from a patient with early congenital syphilis was also positive as were his serum and cerebrospinal fluid samples. DNA sequencing of the genes TP0136 and TP0548 from the positive samples revealed two strains with DNA sequences identical to that of T. p. pallidum strain SS14 and two unique previously undescribed T. p. pallidum strains. The advances in molecular typing of T. p. pallidum in clinical specimens will be of relevance to the epidemiology of syphilis and will allow for clinical discrimination between reinfection and syphilitic reactivation.
Molecular detection and subtyping of Treponema pallidum subsp. pallidum in clinical specimens
Molekulární detekce a typizace Treponema pallidum subsp. pallidum v klinickém materiálu = Molecular detection and subtyping of Treponema pallidum subsp. pallidum in clinical specimens /
Molecular detection and subtyping of Treponema pallidum subsp. pallidum in clinical specimens /
Lit. 24
- 000
- 00000naa a2200000 a 4500
- 001
- bmc06010136
- 003
- CZ-PrNML
- 005
- 20140403143525.0
- 008
- 061005s2006 xr u cze||
- 009
- AR
- 040 __
- $a ABA008 $b cze $c ABA008 $d ABA008 $e AACR2
- 041 0_
- $a cze $a eng
- 044 __
- $a xr
- 100 1_
- $a Flašarová, M. $4 aut
- 245 10
- $a Molekulární detekce a typizace Treponema pallidum subsp. pallidum v klinickém materiálu = $b Molecular detection and subtyping of Treponema pallidum subsp. pallidum in clinical specimens / $c M. Flasarová, D. Šmajs, P. Matějková
- 246 11
- $a Molecular detection and subtyping of Treponema pallidum subsp. pallidum in clinical specimens
- 314 __
- $a Biologický ústav, LF MU, Brno, CZ
- 504 __
- $a Lit. 24
- 520 3_
- $a Zavedli jsme metodu detekce chromozomální DNA Treponema pallidum subsp. pallidum dvoukrokovou (nested) PCR reakcí, která amplifikuje část genu TP0319, kódujícího hypotetický membránový lipoprotein (gen tmpC). Vyšetřili jsme 138 sér od 111 dospělých pacientů v primárním, sekundárním, časně latentním a pozdně latentním stadiu a také pacientů s podezřením na syfilis. Chromozomální DNA T. p. pallidum se v séru dospělých pacientů nepodařilo detegovat. Při vyšetření 11 kožních a slizničních stěrů (7 genitálních, 4 faryngeálních) jsme nalezli 6 pozitivních od 3 pacientů ve stadiu primární a sekundární syfilis. Pozitivní byl rovněž jeden stěr pacienta s časnou kongenitální syfilis. Sekvenování DNA genů TP0136 a TP0548 z pozitivních vzorků prokázalo výskyt dvou kmenů sekvenčně identických s kmenem T. p. pallidum SS14 a dvou unikátních syfilitických kmenů, doposud u T. p. pallidum nepopsaných. U jednoho vyšetřovaného novorozence s pozitivním výsledkem vyšetření kožního vzorku jsme prokázali treponemální DNA také v séru a v cerebrospinálním moku. Pokroky v molekulární typizaci T. p. pallidum v klinickém materiálu přispějí k rozvoji epidemiologie syfilis a přinesou možnosti rozlišení mezi reinfekcí a reaktivací syfilitického procesu.
- 520 9_
- $a An in-house two-step nested PCR amplification targeting the tmpC gene (TP0319, encoding putative membrane lipoprotein) was used for detection of chromosomal DNA of Treponema pallidum subsp. pallidum in clinical specimens.We tested 138 blood serum samples from 111 adult patients with suspected, primary, secondary, early or late latent syphilis. T. p. pallidum DNA was not detected in any of the analyzed specimens. Out of 11 mucocutaneous swabs (7 genital and 4 pharyngeal), 6 collected from 3 patients with primary or secondary syphilis tested positive. One skin swab from a patient with early congenital syphilis was also positive as were his serum and cerebrospinal fluid samples. DNA sequencing of the genes TP0136 and TP0548 from the positive samples revealed two strains with DNA sequences identical to that of T. p. pallidum strain SS14 and two unique previously undescribed T. p. pallidum strains. The advances in molecular typing of T. p. pallidum in clinical specimens will be of relevance to the epidemiology of syphilis and will allow for clinical discrimination between reinfection and syphilitic reactivation.
- 650 _2
- $a Treponema pallidum $x genetika $x izolace a purifikace $x klasifikace $7 D014210
- 650 _2
- $a odběr biologického vzorku $x klasifikace $x metody $x statistika a číselné údaje $7 D013048
- 650 _2
- $a diagnostické techniky molekulární $x metody $x statistika a číselné údaje $x využití $7 D025202
- 650 _2
- $a techniky typizace bakterií $x metody $x statistika a číselné údaje $x využití $7 D015373
- 650 _2
- $a sekvence nukleotidů $x účinky léků $7 D001483
- 650 _2
- $a polymerázová řetězová reakce $x klasifikace $x metody $x statistika a číselné údaje $7 D016133
- 650 _2
- $a finanční podpora výzkumu jako téma $7 D012109
- 650 _2
- $a lidé $7 D006801
- 650 _2
- $a mužské pohlaví $7 D008297
- 650 _2
- $a ženské pohlaví $7 D005260
- 655 _2
- $a srovnávací studie $7 D003160
- 700 1_
- $a Šmajs, David, $d 1969- $4 aut $7 xx0061318
- 700 1_
- $a Matějková, Petra $4 aut $7 xx0061319
- 700 1_
- $a Woznicová, V. $4 aut
- 700 1_
- $a Dvořáková Heroldová, Monika $4 aut $7 xx0076503
- 700 1_
- $a Votava, Miroslav, $d 1942-2020 $4 aut $7 jk01150802
- 773 0_
- $w MED00011002 $t Epidemiologie, mikrobiologie, imunologie $g Roč. 55, č. 3 (2006), s. 105-111 $x 1210-7913
- 856 41
- $y plný text volně přístupný $u https://www.prolekare.cz/casopisy/epidemiologie/2006-3/molekularni-detekce-a-typizace-treponema-pallidum-subsp-pallidum-v-klinickem-materialu-3773
- 910 __
- $a ABA008 $b A 981 $c 560 $y 0 $z 0
- 913 __
- $a CZ $b NI7351 Česko. Ministerstvo zdravotnictví. Interní grantová agentura
- 990 __
- $a 20061011 $b ABA008
- 991 __
- $a 20140403143604 $b ABA008
- BAS __
- $a 3
- BMC __
- $a 2006 $b Roč. 55 $c č. 3 $d s. 105-111 $i 1210-7913 $m Epidemiologie, mikrobiologie, imunologie $x MED00011002
- LZP __
- $b přidání abstraktu