- MeSH
- lidé MeSH
- rizikové faktory MeSH
- žilní tromboembolie * diagnóza prevence a kontrola terapie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
- MeSH
- hrudní chirurgie * MeSH
- lidé MeSH
- podpůrné srdeční systémy normy MeSH
- směrnice pro lékařskou praxi jako téma * MeSH
- společnosti lékařské * MeSH
- srdeční selhání chirurgie MeSH
- transplantace plic normy MeSH
- transplantace srdce normy MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- přehledy MeSH
- MeSH
- časové faktory MeSH
- funkce levé komory srdeční * MeSH
- hodnocení rizik MeSH
- implantace protézy škodlivé účinky přístrojové vybavení mortalita normy MeSH
- kardiologie normy MeSH
- klinické rozhodování MeSH
- konsensus MeSH
- lidé MeSH
- medicína založená na důkazech normy MeSH
- obnova funkce MeSH
- podpůrné srdeční systémy normy MeSH
- protézy - design normy MeSH
- rizikové faktory MeSH
- seznamy čekatelů * mortalita MeSH
- srdeční selhání diagnóza mortalita patofyziologie terapie MeSH
- transplantace plic škodlivé účinky mortalita normy MeSH
- transplantace srdce škodlivé účinky mortalita normy MeSH
- výběr pacientů MeSH
- výsledek terapie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- přehledy MeSH
- směrnice pro lékařskou praxi MeSH
- MeSH
- dospělí MeSH
- gestační stáří MeSH
- hereditární angioedémy farmakoterapie MeSH
- inhibiční protein komplementu C1 aplikace a dávkování škodlivé účinky terapeutické užití MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- mladý dospělý MeSH
- rekombinantní proteiny aplikace a dávkování škodlivé účinky terapeutické užití MeSH
- těhotenství MeSH
- výsledek těhotenství MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- mladý dospělý MeSH
- těhotenství MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- dopisy MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
BACKGROUND: Genome-wide association studies are widely used to map genomic regions contributing to lung cancer (LC) susceptibility, but they typically do not identify the precise disease-causing genes/variants. To unveil the inherited genetic variants that cause LC, we performed focused exome-sequencing analyses on genes located in 121 genome-wide association study-identified loci previously implicated in the risk of LC, chronic obstructive pulmonary disease, pulmonary function level, and smoking behavior. METHODS: Germline DNA from 260 case patients with LC and 318 controls were sequenced by utilizing VCRome 2.1 exome capture. Filtering was based on enrichment of rare and potential deleterious variants in cases (risk alleles) or controls (protective alleles). Allelic association analyses of single-variant and gene-based burden tests of multiple variants were performed. Promising candidates were tested in two independent validation studies with a total of 1773 case patients and 1123 controls. RESULTS: We identified 48 rare variants with deleterious effects in the discovery analysis and validated 12 of the 43 candidates that were covered in the validation platforms. The top validated candidates included one well-established truncating variant, namely, BRCA2, DNA repair associated gene (BRCA2) K3326X (OR = 2.36, 95% confidence interval [CI]: 1.38-3.99), and three newly identified variations, namely, lymphotoxin beta gene (LTB) p.Leu87Phe (OR = 7.52, 95% CI: 1.01-16.56), prolyl 3-hydroxylase 2 gene (P3H2) p.Gln185His (OR = 5.39, 95% CI: 0.75-15.43), and dishevelled associated activator of morphogenesis 2 gene (DAAM2) p.Asp762Gly (OR = 0.25, 95% CI: 0.10-0.79). Burden tests revealed strong associations between zinc finger protein 93 gene (ZNF93), DAAM2, bromodomain containing 9 gene (BRD9), and the gene LTB and LC susceptibility. CONCLUSION: Our results extend the catalogue of regions associated with LC and highlight the importance of germline rare coding variants in LC susceptibility.
- MeSH
- celogenomová asociační studie metody MeSH
- dospělí MeSH
- genetická variace genetika MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- nádory plic genetika patologie MeSH
- rizikové faktory MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Research Support, N.I.H., Extramural MeSH
- Research Support, N.I.H., Intramural MeSH