An increased prevalence of familial neurodegenerative parkinsonism or cognitive deterioration was recently found in a small region of southeastern Moravia.The aim of the study was to assess the genetic background of this familial disease.Variants in the ADH1C, EIF4G1, FBXO7, GBA + GBAP1, GIGYF2, HTRA2, LRRK2, MAPT, PRKN, DJ-1, PINK1, PLA2G6, SNCA, UCHL1, VPS35 genes were examined in 12 clinically positive probands of the pedigree in which familial atypical neurodegenerative parkinsonism was identified in previous epidemiological studies. Libraries were sequenced by massive parallel sequencing (MPS) on the Personal Genome Machine (PGM; Ion Torrent). Data were analyzed using Torrent Suite and IonReporter software. All variants were then verified and confirmed by Sanger sequencing.We identified 31 rare heterozygous variants: 11 missense variants, 3 synonymous variants, 8 variants in the UTR region, and 9 intronic variants. Six variants (rs1801334, rs33995883, rs35507033, rs781737269, rs779760087, and rs63750072) were evaluated as pathogenic by at least one in-silico predictor.No single "founder" pathogenic variant associated with parkinsonism has been found in any of the probands from researched pedigree. It may rather be assumed that the familial occurrence of this disease is caused by the combined influence of several "small-effect" genetic variants that accumulate in the population with long-lasting inbreeding behavior.
- MeSH
- elektroencefalografie MeSH
- elektromyografie MeSH
- genetická predispozice k nemoci MeSH
- lidé MeSH
- motorické evokované potenciály MeSH
- neuropsychologické testy MeSH
- Parkinsonova nemoc etnologie genetika MeSH
- rodokmen * MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- pozorovací studie MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
- Publikační typ
- abstrakt z konference MeSH
BACKGROUND: An epidemiological study conducted over four years revealed increased prevalence of neurodegenerative parkinsonism in a small, isolated region (10 villages, with a combined population of 8664, with approx. 2927 over 50 years of age) of south-eastern Moravia, Czech Republic. The aim of this study was to obtain more detailed information on the medical history of the relatives of individuals with confirmed parkinsonism in an isolated rural population in south-eastern Moravia, Czech Republic. METHODS: We did detailed genealogical research on the families of all inhabitants with confirmed parkinsonism and compiled the pedigrees. These were modified on the basis of information from a consecutive door-to-door survey and local municipal and church registers. RESULTS: In the first stage, three large pedigrees with a familial occurrence of parkinsonism were found; two originated in one of the region's villages. In the second stage, these two pedigrees were combined into one large family tree. CONCLUSIONS: The high prevalence of parkinsonism in the researched area is caused by the familial aggregation of parkinsonism that was found in two large family trees. This is probably the result of the genetic isolation of the regional population due to the very low migration rate of its inhabitants to neighboring regions in the last two centuries.
- MeSH
- epidemiologické metody MeSH
- kognitivní poruchy epidemiologie genetika MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- parkinsonské poruchy epidemiologie genetika MeSH
- rodokmen MeSH
- senioři MeSH
- Check Tag
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika epidemiologie MeSH
Úvod: Je uváděno, že prevalence neurodegenerativních onemocnění v malých evropských komunitách izolovaných od okolí je vyšší ve srovnání s běžnou populací. Tentýž jev jsme pozorovali v malém, relativně izolovaném regionu jihovýchodní Moravy. Cíl: Zjištění prevalence neurodegenerativního parkinsonizmu v izolovaném regionu jihovýchodní Moravy. Metodika: Byla použita metoda třífázového vyšetření. V první fázi byly do ordinací praktických lékařů distribuovány dotazníky, které byly vyplněny všemi pacienty, kteří se z jakéhokoliv důvodu dostavili v průběhu tří měsíců do ordinace praktického lékaře. Ve druhé fázi byly u pozitivních respondentů příznaky parkinsonizmu objektivizovány vyšetřením edukovaným ambulantním neurologem. Ve třetím stupni byli respondenti, u kterých byly při skríningovém vyšetření příznaky parkinsonizmu objektivizovány, přijati k detailnímu vyšetření za hospitalizace v terciárním centru pro diagnostiku a léčbu neurodegenerativních onemocnění. Výsledky: Celková prevalence parkinsonizmu v populaci starší 50 let byla 2,8 % (95% CI: 2,2-3,4); prevalence v populaci 50-64 let byla 1,9 % (95% CI: 1,2-2,5); a v populaci nad 65 let byla 4,06 % (95% CI: 2,9-5,1). Byly získány tři velké rodokmeny s patrnou autozomálně dominantní dědičností parkinsonizmu. Závěr: Zjištěná prevalence byla překvapivě vysoká a podstatně odlišná od hodnot prevalence publikovaných v jiných evropských zemích. Vzhledem k charakteristice regionu je předpokládán vliv genetických faktorů. Současný výzkum je zaměřen na genetické pozadí a DNA analýzu probandů z rodokmenů, ve kterých byla identifikována autozomálně dominantní dědičnost parkinsonizmu. Klíčová slova: parkinsonism – neuroepidemiology – prevalence studies – three-stage ascertainment method – inheritance Autoři deklarují, že v souvislosti s předmětem studie nemají žádné komerční zájmy. Redakční rada potvrzuje, že rukopis práce splnil ICMJE kritéria pro publikace zasílané do biomedicínských časopisů.
Introduction: It has been suggested that the prevalence of neurodegenerative diseases in small, isolated European communities might be higher than in the general population. We recently observed this phenomenon in a small specific region of south-eastern Moravia. Objective: To assess the prevalence of neurodegenerative parkinsonism in an isolated region with a rural population in south-eastern Moravia. Methods: A three-stage method of data collection was used. In the first phase, originally designed questionnaires were distributed to general practitioners and completed by all patients who visited them for any reason during a three-month period. In the second phase, positive responders were examined by trained primary care neurologists. Finally, the diagnosis was confirmed or excluded by a movement disorders specialist. Results: The overall prevalence in the population older than 50 years of age was 2.8% (95% CI: 2.2-3.4); the prevalence in the population from 50 to 64 years was 1.9% (95% CI: 1.2-2.5), and it was 4.06% (95% CI: 2.9-5.1) in the population over 65 years of age. Three large families with an autosomal-dominant inheritance patterns of parkinsonism were identified. Conclusions: The prevalence rates were surprisingly high; they substantially differed from the published prevalence rates in other European countries. Due to the characteristics of the region, we expected a particular impact of genetic factors, most probably the autosomal-dominant inheritance of parkinsonism. Our current research focusses on the genetic background and DNA analysis of probands from the families in which autosomal-dominant parkinsonism was identified.
- Klíčová slova
- třístupňová vyšetřovací metoda, neuroepidemiologie,
- MeSH
- dědičnost * MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- Parkinsonova nemoc * diagnóza epidemiologie MeSH
- parkinsonské poruchy * diagnóza epidemiologie MeSH
- plošný screening MeSH
- prevalence MeSH
- průřezové studie statistika a číselné údaje MeSH
- průzkumy a dotazníky MeSH
- rodokmen MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- věkové rozložení MeSH
- Check Tag
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
- Publikační typ
- abstrakt z konference MeSH
- MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- neurodegenerativní nemoci diagnóza epidemiologie MeSH
- parkinsonské poruchy diagnóza epidemiologie MeSH
- prevalence MeSH
- průzkumy a dotazníky MeSH
- zdravotnické přehledy MeSH
- Check Tag
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- dopisy MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
- Publikační typ
- abstrakt z konference MeSH
