- Klíčová slova
- Covid 19,
- MeSH
- COVID-19 * diagnóza imunologie MeSH
- klinické zkoušky jako téma MeSH
- lidé MeSH
- protilátky virové analýza MeSH
- SARS-CoV-2 imunologie patogenita MeSH
- testování na COVID-19 metody MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
Acute lymphoblastic leukemia (ALL) cells depend on the microenvironment of the host in vivo and do not survive in in vitro culture. Conversely, the suppression of non-malignant tissues is one of the leading characteristics of the course of ALL. Both the non-malignant suppression and malignant cell survival may be partly affected by soluble factors within the bone marrow (BM) environment. Here, we aimed to identify proteins in BM plasma of children with ALL that may contribute to ALL aggressiveness and/or the microenvironment-mediated survival of ALL cells. LBMp (leukemic bone marrow plasma) at the time of ALL diagnosis was compared to control plasma of bone marrow (CBMp) or peripheral blood (CPBp) using a cytokine antibody array. The cytokine antibody array enabled simultaneous detection of 79 proteins per sample. Candidate proteins exhibiting significantly different profiles were further analyzed and confirmed by ELISA. mRNA expression of one of the candidate proteins (TIMP1) was studied using quantitative reverse transcriptase polymerase chain reaction (qRTPCR). The cytokine antibody array experiments identified 23 proteins that differed significantly (p<0.05); of these, two proteins (TIMP1 and LIF) withstood the Bonferroni correction. In contrast, little difference was observed between CBMp and CPBp. At the diagnosis of ALL, changes in the soluble microenvironment are detectable in BM plasma. These changes probably participate in the pathogenesis and/or result from the changes in the cell composition.
- MeSH
- akutní lymfatická leukemie krev patologie MeSH
- čipová analýza proteinů MeSH
- cytokiny krev MeSH
- dítě MeSH
- kostní dřeň metabolismus MeSH
- leukemický inhibiční faktor biosyntéza MeSH
- lidé MeSH
- messenger RNA biosyntéza MeSH
- nádorové biomarkery krev MeSH
- tkáňový inhibitor metaloproteinasy 1 biosyntéza krev MeSH
- viabilita buněk MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
Některé klinické symptomy u akutní leukemie (AL) mohou vznikat v důsledku působení solubilních faktorů secernovaných leukemickými buňkami do mikroprostředí kostní dřeně. Na druhé straně jsou leukemické buňky často závislé na mikroprostředí hostitele, takže většina leukemických buněk podlehne apoptóze během prvních dnů v in vitro podmínkách. I tento podpůrný vliv na leukemické buňky může být zprostředkován solubilními faktory. Většina pozornosti se logicky soustřeďuje na maligní buňky, a tak složení solubilních faktorů může být neprávem opomíjeno. Vyšetřovali jsme proteiny v kostní plazmě dětí s akutní lymfoblastickou leukemií (ALL), které mohou být zodpovědné za agresivitu ALL blastů nebo za mikroprostředím zprostředkované přežívání ALL buněk. Plazma z kostní dřeně a periferní krve byla analyzovaná pomocí proteinové array a dvojrozměrné elektroforézy (2-DE). Metodou proteinové array jsme detekovali 23 proteinů, jejichž koncentrace byla signifikantně odlišná u pacientů a kontrolních vzorků. Z kostní plazmy jsme před provedením 2-DE depletovali 12 abundatních proteinů pomocí afinitní chromatografie. Tím se nám podařilo zvýšit počet spotů, které jsme analyzovali pomocí softwaru PDQuest.
In acute leukemia (AL), several clinical symptoms may be caused by soluble factors secreted by AL cells into the bone marrow (BM) microenvironment. On the other hand, AL cells are often dependent on the microenvironment of the host, with most AL cells dying during first days after transferred to in vitro. This support of leukemic cells may be mediated by soluble factors as well. Attention is logically focused on malignant cells and the composition of soluble factors may be unjustly omitted. We aimed at identifying proteins in BM plasma of children with lymphoblastic AL (ALL), which may be responsible for ALL aggressiveness or for microenvironment-mediated survival of ALL cells. BM plasma and blood samples were analyzed by protein microarray and/or by two-dimensional electrophoresis (2D PAGE). We detected 23 proteins with a significantly different concentration in patients by Protein microarray. Before 2D PAGE, BM plasma was immuno-depleted from 12 abundant proteins by affinity chromatography. With this approach we succeeded to increase the number of spots that were analyzed by the PDQuest software.
- Klíčová slova
- akutní lymfoblastická leukemie, proteinová array, dvojrozměrná elektroforéza 2-DE, protein,
- MeSH
- 2D gelová elektroforéza metody využití MeSH
- akutní lymfatická leukemie genetika metabolismus patologie MeSH
- akutní nemoc MeSH
- dítě MeSH
- financování organizované MeSH
- leukemie genetika patologie MeSH
- lidé MeSH
- proteiny analýza MeSH
- vyšetřování kostní dřeně přístrojové vybavení MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- lidé MeSH
- Publikační typ
- abstrakt z konference MeSH
