"NV15-34904A"
Dotaz
Zobrazit nápovědu
Introduction: The yield of genetic testing in hypertrophic cardiomyopathy (HCM) is variable. The Mayo HCM Genotype Predictor score (Mayo Score) provides the pre-test probability of a positive HCM genetic test. In the original cohort of Mayo Score patients, only 9 HCM-associated myofilament genes were evaluated. The aim of this study was to validate the Mayo Score in the national HCM cohort and assess the yield of genetic testing using next generation sequencing (NGS) evaluating up to 229 genes. Material and methods: We included 336 consecutive unrelated HCM patients (41% women, mean age: 53 ±15 years). We performed NGS-based genomic testing with classification of identified variants according to American College of Medical Genetics and Genomics guidelines. NGS findings were compared with the Mayo Score (ranging from -1 to 5) based on clinical and echocardiographic variables. Results: We identified 72 variants classified as pathogenic or likely pathogenic in 70 (21%) HCM patients. One patient with the highest Mayo Score of 5 had a pathogenic mutation (100% yield). Patients with a Mayo Score of 4 had a pathogenic mutation in 71% of cases. Patients with a Mayo Score of 3 or 2 had a pathogenic mutation in 50 and 35% of cases, respectively. The yield of genetic testing in patients with a Mayo Score of -1 to 1 was low (6-21%). Conclusions: The overall yield of genetic testing using NGS evaluating up to 229 genes was low. The yield of genetic testing was consistently predicted with Mayo Score values.
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
Závěrečná zpráva o řešení grantu Agentury pro zdravotnický výzkum MZ ČR
Nestr.
Kardiomyopatie jsou heterogenní skupinou onemocnění s poruchou struktury a/nebo funkce srdečního svalu, které představují významnou příčinu kardiovaskulární morbidity a mortality a mají často familiární výskyt. Hypertrofická kardiomyopatie je nejčastější monogenně dědičné onemocnění srdce s velkou alelickou a genetickou variabilitou. Vztah dané mutace, fenotypu a klinických komplikací není ve většině případů detailně objasněn. Použití sekvenování nové generace vede k získání dat o větší skupině genů, případně celém exomu u vyšetřovaného pacienta. Navrhovaný projekt je zaměřen: 1) na klinické a genetické vyšetření pacientů s hypertrofickou kardiomyopatií a kardiomyopatiemi s familiárním výskytem a jejich příbuzných pomocí sekvenování nové generace, 2) na identifikaci nových genetických variant a průkaz jejich kauzality k vývoji onemocnění, 3) na vztah konkrétních mutací k projevům onemocnění, rozvoji fenotypu zjištěného klinickým, elektrokardiografickým a echokardiografickým vyšetřením a k riziku vzniku závažných kardiovaskulárních komplikací.; Cardiomyopathies (CMP) are a heterogeneous group of diseases with impaired cardiac structure and/or function, which represent an important cause of cardiovascular morbidity and mortality, and are often hereditary. Hypertrophic cardiomyopathy is the most common monogenic cardiac disorder with substantial allelic and genetic heterogeneity. The relationship between a particular mutation and CMP development, including its clinical complications, is not straightforward and requires further studies. Next Generation Sequencing (NGS) detects mutations in large number of genes or even in the patient’s entire exome. This multidisciplinary proposal focuses on the: 1) detailed clinical examination (phenotyping) and NGS in patients and their relatives with hypertrophic cardiomyopathy, including other hereditary CMP, 2) identification of novel genetic variants and assessment of their disease liability, 3) genotype-phenotype correlations in CMP diagnosed by clinical, electrocardiographic and echocardiographic examinations, including the risk of serious cardiovascular complications.
- MeSH
- časná diagnóza MeSH
- genetické asociační studie MeSH
- genetické testování MeSH
- hypertrofická kardiomyopatie diagnóza terapie MeSH
- individualizovaná medicína MeSH
- vysoce účinné nukleotidové sekvenování MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- kardiologie
- genetika, lékařská genetika
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR