Projekt je zaměřený na využití imunocytometrických/obrazových metod k zpřesnění popisu stavu kloubu u pacientů s gonartrózou (KOA). Tito pacienti jsou dnes léčeni řadou metod s různým stupněm klinické účinnosti. Léčebná metoda je zvolena na základě klinického a rentgenového vyšetření, avšak bez detailnější znalosti konkrétní biologické či biochemické situace postiženého kloubu (týkající se např. zánětlivého/homeostatického stavu, stádia, fáze nemoci). To může vysvětlovat variabilitu v dosažených výsledcích. Navrhujeme proto postižený kloub lépe charakterizovat před léčebnou intervencí (za pomoci průtokové cytometrie, expresních profilů buněk/ synoviální tkáně) a rozlišit specifické subtypy gonartrózy. Syntézou získaných laboratorních a klinických dat vytvoříme podklady pro konkrétní fenotypy KOA a navrhneme elektronický rozhodovací algoritmus, který budeme testovat na skupině léčených pacientů s cílem zefektivnit diagnostický a léčebný proces u KOA.; The project focuses on using immunological/imaging/biochemical methods for better description of the knee joint state in patients with knee osteoarthritis (KOA). These patients are treated with a number of conservative methods of varying degrees of clinical effect. Therapy is chosen on the basis of clinical and x-ray examinations but without detailed knowledge of the particular biological/biochemical state of the affected knee (e.g. in terms of inflammatory/homeostatic status, stage, disease phase). This could explain variability in clinical outcomes. We expect that by synthesizing the obtained laboratory and clinical data, we will distinguish particular KOA phenotypes. Moreover, we will propose an electronic decision support tool that will be tested on a group of treated patients in order to optimise the diagnostic and treatment process of KOA.

• Keywords
• synoviální tekutina, synovial fluid, průtoková cytometrie, flow cytometry, knee osteoarthritis, multivariate analysis, podpora rozhodování, Artróza kolena, Fenotypy, Phenotypes, multivariační analýzy, Decision support tool,

• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Dědičné metabolické poruchy (DMP) tvoří největší skupinu vzácných onemocnění a představují závažný zdravotnický problém. Jsou typicky způsobeny sníženou aktivitou enzymu či abnormální funkcí proteinového transportéru vedoucí ke změnám v hladinách metabolitů. Tyto biochemické odchylky způsobují klinické příznaky a jsou klíčem k diagnostice. Identifikace nových biomarkerů zvyšuje efektivitu diagnostického procesu, což je rozhodující zejména pro populační screeningové programy, kde selektivita a specificita jsou klíčovými pojmy. Nalezení těchto biomarkerů tradičními metodami je experimentálně obtížné a ve většině případů založené na náhodě. V předchozích experimentech jsme ve spolupráci s několika zahraničními pracovišti úspěšně použili metody necílené metabolomiky k popsání nových biomarkerů DMP. Cílem předkládaného projektu je detekce, strukturní elucidace a validace nových biomarkerů DMP pokročilými technikami hmotnostní spektrometrie. Nové biomarkery v konečném důsledku zlepší diagnostiku a screening DMP jak v České republice tak celosvětově.; Inherited metabolic diseases (IMDs) are the largest subgroup of rare diseases constituting serious health problems. They are typically caused by reduced enzyme activity or protein transporter function resulting in changes in metabolite levels. These abnormalities cause clinical symptoms and are key to diagnosis. The identification of novel biomarkers improves the efficiency of the diagnostic process. This is especially true for population-based screening programs where selectivity and specificity are the key issues. Identification of these biomarkers by traditional methods can be either random or based on biochemical principles, however, it is always difficult. In previous studies, we successfully applied tools for untargeted metabolomics to describe novel biomarkers of several IMDs in broad international collaboration. The aim of this project is discovery, structural elucidation, and validation of new biomarkers of IMDs by advanced mass spectrometry techniques. Biomarkers discovered within the project will ultimately improve diagnostics and screening programs of the diseases.

• Keywords
• biomarkery, biomarkers, Metabolomika, Dědičné metabolické poruchy, Hmotnostní spektrometrie, Metabolomics, Inborn Errors of Metabolism, Mass Spectrometry, novorozenecký screening, Mnohorozměrná statistická analýza, Vysoce dimenzionální data, Newborn screening, Multivariate statistical analysis, High-dimensional data,

• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

• MeSH
• Epidemiologic Factors MeSH
• Epidemiologic Methods MeSH
• Clinical Medicine MeSH
• Evidence-Based Medicine MeSH
• Publication type
• Monograph MeSH

• Conspectus
• Patologie. Klinická medicína
• NML Fields
• epidemiologie

Zubní kaz je chronické multifaktoriální onemocnění, které postihuje značnou část světové populace. Jeho etiologie je komplexní a zahrnuje interakci mikrobiálních, genetických, biochemických, sociálních a behaviorálních faktorů. Projekt je koncipován jako kombinace prospektivního sledování vybrané kohorty a průřezových studií [dětí s kazem vs. zdravých kontrol nebo dětí s kazem raného dětství (ECC)] a in vitro studií, které se budou zabývat (i) in vitro kultivací kariogenních bakteriálních kmenů za přítomnosti substrátů s různým kariogenním potenciálem, (ii) analýzou jejich transkriptomu/metabolomu, (iii) multivariační analýzou klinických, biochemických, mikrobiálních, genetických faktorů a vlivů zevního prostředí a (iv) edukací matek dětí – behaviorální intervencí. Začlenění získaných poznatků do praxe by mohlo přispět k redukci nákladů na zdravotní péči související s léčbou kazu. Zhodnocení individuálního rizika rozvoje kazu by umožnilo přechod k “personalizované medicíně“ (zejména v rámci diagnostiky a prevence onemocnění).; Dental caries, a chronic multifactorial disease, is a major oral health problem worldwide. Its etiology involves a complex interplay of microbial, genetic, biochemical, social, physical environmental, and health-influencing behavioral factors. The project is designed as a combination of prospective monitoring of selected cohort and a cross-sectional studies [children with caries vs. healthy controls or children with early childhood caries (ECC)], and in vitro studies addressing (i) in vitro cultivation of cariogenic bacterial strains in the presence of substrates with various cariogenic potential, (ii) their transriptome/metabolome analysis, (iii) multivariate analyses of clinical, biochemical, microbial, genetic and environmental factors, and (iv) education of mothers and children–behavioral intervention. Implementation of obtained knowledge might reduce costs on health care in connection with caries. The assessment of the individual risk could rationalize health care in terms of "personalized medicine" (particularly the disease diagnosis and prevention).

• MeSH
• Bacteriological Techniques MeSH
• Biomedical Technology methods   MeSH
• Child MeSH
• Cariogenic Agents adverse effects   MeSH
• Cohort Studies MeSH
• Culture Techniques methods   MeSH
• Humans MeSH
• Metabolome MeSH
• Metabolomics methods   MeSH
• Cross-Sectional Studies MeSH
• Gene Expression Profiling methods   MeSH
• Health Education, Dental methods   MeSH
• Dental Caries diagnosis   etiology   prevention & control   MeSH
• Check Tag
• Child MeSH
• Humans MeSH

• Conspectus
• Stomatologie
• NML Fields
• zubní lékařství
• biomedicínské inženýrství
• preventivní medicína
• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

• MeSH
• Information Literacy MeSH
• Information Dissemination MeSH
• Health Communication MeSH
• Publication type
• Collected Work MeSH

• Conspectus
• Výchova a vzdělávání
• NML Fields
• knihovnictví, informační věda a muzeologie

V rámci projektu budou na magnetické rezonanci s využitím MR spektroskopie vyšetřováni pacienti s karcinomem prostaty před plánovanou radikální prostatektomií a výsledky budou porovnávány s definitivním histopatologickým nálezem. Vyšetřena bude skupina pacientů na MR přístroji 1,5T a 3T a výsledky budou srovnány s daty získanými ve skupině zdravých dobrovolníků. Všechny výsledky získané pomocí standardních vyhodnocovacích postupů budou srovnány s výsledky automatického zpracování dat specializovaným softwarem. Bude provedena analýza věkové závislosti zastoupení metabolitů v prostatě stanovených 1H MR spektroskopií. Data budou zpracována matematicko-statistickými postupy.; In this grant project patients with prostate cancer before radical prostatectomy will be examined at the MR department using techniques of MR imaging and spectroscopy. The results of MR examination will be compared with the final histopathological findings obtained after surgery. The patients will be examined either at 1.5T or 3T and the results will be compared with the results of healthy volunteers. All results obtained by standard evaluation procedures will be compared to those obtained automatically by means of specialized software. The analysis of age-dependent changes of metabolites determined by 1H MR spectroscopy in prostate will also be provided. All results will be analyzed by means of univariate and multivariate statistical methods.

• MeSH
• Choline analysis   MeSH
• Citrates MeSH
• Creatine analysis   MeSH
• Magnetic Resonance Spectroscopy MeSH
• Prostatic Neoplasms diagnosis   MeSH
• Neoplasm Staging MeSH
• Age Factors MeSH

• Conspectus
• Patologie. Klinická medicína
• NML Fields
• radiologie, nukleární medicína a zobrazovací metody
• urologie
• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Stanovit široké spektrum steroidů u pacientů s úzkostnými a depresivními poruchami (AMD) a získat údaje o patofyziologickém významu a klinické relevanci neuroaktivních a neuroprotektivních steroidů u pacientů s AMD, což bude přínosné pro pochopení patofyziologie AMD a vývoj nových strategií léčby. Navrhnout modely predikující riziko vzniku AMD z laboratorních a anamnestických dat s využitím multikomponentní analýzy. Na základě klinických a metabolomických dat se pokusit o diferenciální diagnostiku jednotlivých poruch CNS.; This research is to quantify a broad spectrum of steroids in patients with anxiety and mood disorders (AMD) and to gain data about the pathophysiological importance and clinical relevance of neuroactive and neuroprotective steroids in AMD patients, which will be valuable for the comprehension of AMD pathophysiology and for the development of novel therapeutic strategies. It is also to complete models predicting the risk of AMD manifestation from laboratory and clinical data with the use of multivariate analysis. Based on clinical and metabolomics data, the completion of a differential diagnostics in individual CNS disturbances will be attempted.

• MeSH
• Diagnosis, Differential MeSH
• Metabolomics MeSH
• Neurotransmitter Agents MeSH
• Gas Chromatography-Mass Spectrometry MeSH
• Mood Disorders MeSH
• Predictive Value of Tests MeSH
• Steroids MeSH
• Anxiety Disorders MeSH

• Conspectus
• Psychiatrie
• NML Fields
• psychiatrie
• endokrinologie
• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Prospektivní registr všech konsekutivních kardiaků, postupujících nekardiální chirurgický výkon: pacienti musí splnit všechna tři vstupní kriteria: (1) Jakákoli operace (elektivní nebo akutní) v celkové nebo v neuroaxiální anestezii, prováděná na Chirurgické, Ortopedické nebo Neurochirurgické klinice. (2) Anamneza kardiovaskulárního onemocnění s rizikem arteriální, intrakardiální či žilní trombozy nebo embolie. (3) Podepsaný informovaný souhlas. Zařazeni budou všichni nemocní, splňující vstupní kriteria, tj. všichni operovaní kardiaci, kteří podepsali informovaný souhlas. Předpokládáme zařazení 2000 až 3000 nemocných. Budou sledovány základní klinické ukazatele, chronická i perioperační medikace, EKG, echokardiografie, laboratoř a samozřejmě veškeré komplikace (zejména ischemické a krvácivé). Ve 2. fázi (randomizovaná studie) předpokládáme zařazení cca 1000 nemocných. Vstupní / vylučovací kriteria pro tuto fázi budou definována na základě výsledků 1. fáze.; Prospective registry of all consecutive cardiac patients undergoing non-cardiac surgery. Patients have to meet all three inclusion criteria: (1) Any kind of non-cardiac surgery (acute or elective) performed under general or neuroaxial anaesthesia in three surgical departments - General surgery, Orthopedics-Trauma and Neurosurgery. (2) History of cardiac disease with risk of arterial, intracardiac or vein thrombosis or embolism. (3) Signed Informed consent. All operated patients who meet the inclusion criteria will be enrolled, i.e. all consecutive cardiacs, who signed Informed consent. Inclusion of cca 2000 - 3000 patients is expected. Baseline clinical indicators, chronic and perioperative medication, ECG, echocardiography, laboratory tests and all complications (especially ischemic and bleeding) will be registered. The second phase (randomized study) will include cca 1000 patients. Inclusion/exclusion criteria will be defined on the basis of results of the first phase.

• MeSH
• Platelet Aggregation Inhibitors MeSH
• Cardiovascular Diseases MeSH
• Coronary Thrombosis MeSH
• Blood Loss, Surgical MeSH
• Multivariate Analysis MeSH
• Coronary Artery Disease MeSH
• Peripheral Arterial Disease complications   MeSH
• Intraoperative Complications MeSH
• Risk Factors MeSH

• Conspectus
• Ortopedie. Chirurgie. Oftalmologie
• NML Fields
• chirurgie
• kardiologie
• farmacie a farmakologie
• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Analýza neurosteroidů má velký význam v klinické diagnostice celé řady endokrinních onemocnění. Mnohem menší pozornost byla dosud věnována výzkumu jejich konjugovaných forem reprezentovaných zejména glukuronidy a sulfáty. Tyto kyselé metabolity kolují vtělních tekutinách a buňkách v koncentracích, často řádově vyšších než volné steroidy a jejich robustní analýza představuje dosud problém. Předkladatel se spolunavrhovatelem vypracují a zvalidují nové postupy zpracování klinických vzorků moči a krve se zaměřením na rychlé profilování steroidních konjugátů pomocí techniky UPLC/MS/MS. Nová diagnostická metoda bude otestována při vyšetření vybranných endokrinních onemocnění a vyhodnocena její perspektiva v klinické diagnostice.; The project is focused on the development of new methods for simultaneous quantification of steroid metabolome with particular attention on the polar conjugates of neuroactive steroids in body fluids. These novel methods will serve as a basis for the construction of multivariate models enabling simultaneous prediction of various forms of congenital adrenal hyperplasia, postpartum mental disorders and intrahepatic cholestasis. The proposed project is in accordance with priorities of the Departmental program of the Czech Ministry of Health in the theme ?Disturbances of metabolism and nutrition, endocrine disorders and diabetes mellitus? involving the research in the field of neuroendocrine and immunoendocrine diseases. In addition our project agree withthe priorities of the theme ?Pediatrics and genetics? and with the priorities of the theme ?Neurology, psychiatry, psycho-social questions, geriatrics?.

• MeSH
• Early Diagnosis MeSH
• Glucuronides analysis   MeSH
• Cholestasis, Intrahepatic diagnosis   MeSH
• Clinical Laboratory Techniques MeSH
• Adrenal Hyperplasia, Congenital diagnosis   MeSH
• Metabolome MeSH
• Endocrine System Diseases MeSH
• Neurotransmitter Agents analysis   diagnostic use   blood   urine   MeSH
• Puerperal Disorders diagnosis   MeSH
• Molecular Docking Simulation MeSH
• Sulfates analysis   MeSH
• Steroids analysis   MeSH
• Tandem Mass Spectrometry MeSH
• Chromatography, High Pressure Liquid MeSH

• Conspectus
• Patologie. Klinická medicína
• NML Fields
• endokrinologie
• diagnostika
• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

• MeSH
• Biostatistics MeSH
• Epidemiologic Studies MeSH
• Public Health Surveillance MeSH
• Preventive Medicine MeSH
• Public Health MeSH

• Conspectus
• Veřejné zdraví a hygiena
• NML Fields
• veřejné zdravotnictví
• epidemiologie
• preventivní medicína
• statistika, zdravotnická statistika
• NML Publication type
• kolektivní monografie