Specifika nádorů dětského věku si postupem času vynutila věkově specifickou klasifikaci s cílem spolehlivě a reprodukovatelně popisovat a analyzovat průběh a výsledky léčby nádorových onemocnění u dětí. Pokroky v poznání biologie nádorů dětí a mladých dospělých navíc přináší nutnost dalších souvisejících změn klasifikačních metod, jež jsou v současnosti asi nejlépe reflektovány mezinárodním standardem ICCC (International Classification for Childhood Cancer) [1]. Stejně jako u dospělých, i u dětí platí již od roku 1953 [2] zákonná povinnost odeslat hlášení o každém novém výskytu onkologického onemocnění do Národního onkologického registru (NOR) založeném na mezinárodní klasifikaci ICD-O (International Classification of Diseases for Oncology) [3]. Potřeba kvalifikované a spolehlivé interpretace klinických a laboratorních dat, jak dle ICD-O, tak i ICCC a dalších, pro jednotlivé diagnózy specifických klasifikačních systémů, přináší potřebu spolehlivého a uživatelsky přátelského informačního systému (IS) umožňujícího pružně reagovat na aktuální vývoj a současně automatizovat přenos dat do NOR i jejich analýz. Díky spolupráci Kliniky dětské onkologie FN a LF MU Brno a Institutu biostatistiky a analýz (IBA) byl vytvořen IS využívající obou klasifikačních standardů. Oproti NOR bylo rozšířeno spektrum sbíraných a analyzovaných dat podle potřeb kliniky. Tímto způsobem je možné získat z informačního systému strukturované informace například o nově diagnostikovaných pacientech, výskytu různých typů dětských nádorů v různých oblastech ČR, jednotlivých diagnostických skupinách, používaných léčebných protokolech, výsledcích léčby, a to i v grafické podobě křivek celkového přežití a bezpříznakového přežití. Po úspěšném ověření informačního systému úvodní studií v klinických podmínkách byl následně implementován a využíván i na Klinice dětské hematologie onkologie FN Motol v Praze. IS se osvědčil v klinických podmínkách a je neocenitelným zdrojem spolehlivých dat využitelných jak klinickými lékaři, vědeckými pracovníky, tak i organizátory a plátci péče.

The specifics of childhood tumours have over time necessitated an age-specific classification in order to reliably and reproducibly describe and analyze the process and outcomes of childhood cancer treatment. Moreover, the advances in understanding the biology of tumours in children and young adults has brought about the need for further related changes to classification methods, which are currently probably best-reflected in the international standards of the ICCC (International Classification for Childhood Cancer) [1]. As is the case with adults, there has been a statutory requirement in force since 1951 [2] to report any new occurrence of paediatric oncological disease to the National Cancer Registry (NCR), using the ICD-O (International Classification of Diseases for Oncology) [3]. The need for a qualified and reliable interpretation of clinical and laboratory data – such as the ICD-O, ICCC and other individual diagnosis-specific classification systems – has in turn created the need for a reliable and user-friendly information system (IS) which would allow for a flexible response to current developments and automatic data transfer to the NCR and a subsequent analysis of this. Thanks to the cooperation between the University Hospital’s Department of Paediatric Oncology at Masaryk University’s Faculty of Medicine and the Institute of Biostatistics and Analyses (IBA), an IS using both classification standards was developed. Compared to the NCR, the spectrum of collected and analyzed data was extended according to the needs of the clinics, and so it is possible to use the IS to obtain structured information such as newly-diagnosed patients, the incidence of various types of tumours in children in different areas of the Czech Republic, individual diagnostic groups, therapeutic protocols used, and treatment outcomes and survival curves for overall survival and disease-free survival rates. Upon successful verification of the information system’s initial studies in clinical conditions, it was subsequently implemented at the Department of Paediatric Haematology and Oncology, Motol University Hospital in Prague. The IS has proved its worth in clinical conditions, and is an invaluable source of reliable data for both oncologists and researchers, as well as for health care financing..

• MeSH
• dítě MeSH
• hlášení nemocí * MeSH
• informační systémy MeSH
• lidé MeSH
• mezinárodní klasifikace nemocí MeSH
• nádory * klasifikace   MeSH
• oznamovací povinnost MeSH
• registrace MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• lidé MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

CGH arrays se v dnešní době staly významnou technikou v analýze genomu. Využívají se pro detekci změn v počtu kopií genů nebo chromozomů, popřípadě jiných chromosomových přestaveb. Základní metodou je porovnávání DNA vzorku a zdravé kontroly pomocí komparativní genomové hybridizace (CGH). Analýza genetické nestability u nádoru a s ní spojené hledání nádorových markerů se dá využít jak v diagnostice nádorů (klasifikace nádorů do již existujících skupin, hledání nových podskupin), tak i v predikci jejich odpovědi na léčbu. Výhodou technologie CGH arrays je možnost analýzy celého genomu v jediném experimentu. To ovšem znamená, že metoda produkuje velké množství dat, které musí být správně matematicky vyhodnoceny a základním cílem článku je tak představení těchto matematických metod a jejich softwarové implementace.

Nowadays, array CGH experiments became a powerful technique for analysing changes in DNA by comparing control DNA and DNA of interest. This is widely used for example in genome cancer studies. Analysis of the tumour genome instabilities and the search for tumour markers can be used for the tumour diagnostics (tumour classification, detection of the new clinical groups of tumours) or for the prediction of the response to therapy. The method produce huge amount of data and special statistic techniques for detecting of genomic changes are necessary. The purpose of this paper is to provide brief summary of existing statistical methods used in CGH array analysis and their software implementation.

• MeSH
• DNA nádorová diagnostické užití   genetika   izolace a purifikace   MeSH
• financování organizované MeSH
• genomika metody   statistika a číselné údaje   trendy   MeSH
• hybridizace genetická MeSH
• internet trendy   využití   MeSH
• lékařská onkologie metody   trendy   MeSH
• lidé MeSH
• software klasifikace   statistika a číselné údaje   trendy   MeSH
• srovnávací genomová hybridizace MeSH
• statistické modely MeSH
• statistika jako téma MeSH
• systémy řízení databází využití   MeSH
• teoretické modely MeSH
• zlomy DNA MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• přehledy MeSH