Out of the twenty-one A. hydrophila complex isolates obtained during a routine examination of human diarrhoeal faeces, two A. hydrophila subsp. dhakensis isolates (P1097 = CCM 7329 and P1165) were successfully identified by ribotyping. The correct taxonomic position of the A. hydrophila subsp. dhakensis CCM 7329 was verified by cpn60 sequencing (GeneBank accession number HM536193). The remaining A. hydrophila complex isolates were identified as A. hydrophila subsp. hydrophila. The ability of biochemical tests and fatty acid methyl ester analysis to reliably discern both A. hydrophila subsp. dhakensis and A. hydrophila subsp. hydrophila was limited. In contrast to the A. hydrophila subsp. hydrophila, the faecal isolates of A. hydrophila subsp. dhakensis did not produce acid from arbutin. When compared in a two-dimensional plot, the A. hydrophila subsp. dhakensis faecal isolates contained higher amounts of the two minor fatty acids C(13:0) and C(17:1) ω8c than the A. hydrophila subsp. hydrophila reference strain. This is the first detected occurrence of the less frequent A. hydrophila subsp. dhakensis in our region and ribotyping was proved as a suitable method for the identification of A. hydrophila subsp. dhakensis.
- MeSH
- Aeromonas hydrophila klasifikace genetika izolace a purifikace MeSH
- bakteriální proteiny genetika MeSH
- chaperonin 10 genetika MeSH
- feces mikrobiologie MeSH
- fenotyp MeSH
- fylogeneze MeSH
- gramnegativní bakteriální infekce epidemiologie mikrobiologie MeSH
- lidé MeSH
- mastné kyseliny analýza MeSH
- molekulární sekvence - údaje MeSH
- polymerázová řetězová reakce MeSH
- průjem epidemiologie mikrobiologie MeSH
- ribotypizace MeSH
- sekvenční analýza DNA MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Závěrečná zpráva o řešení grantu Interní grantové agentury MZ ČR
Přeruš. str. : il., tab. ; 30 cm
Number of severe cases of Aeromonas spp. septicemia or antibiotic treatment failure due to their misidentification is increasing. Extensive idenification based on phenotyping, cellular fatty acid analysis and ribotyping promise better identification of isolates from clinical samples.
Počet závažných septikémii způsobených Aeromonas spp. či selhání antibiotické léčby díky nesprávné identifikaci se zvyšuje. Využití komplexního přístupu - fenotypizace, analýzy celulárních mastných kyselin a ribotypizace - slibuje zlepšení identifikace klinických izolátů aeromonád.
- MeSH
- Aeromonas patogenita MeSH
- epidemiologické faktory MeSH
- imunofenotypizace MeSH
- ribotypizace MeSH
- Konspekt
- Mikrobiologie
- NLK Obory
- bakteriologie
- vnitřní lékařství
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR
