Bude stanovena genová exprese syncytinu-1 a 2 na úrovni mRNA v nádorech mužské germinální linie, zejména seminomech, smíšených germinálních karcinomech a choriokarcinomech. Bude sledována korelace s histologickým obrazem nádorů, hlavně s přítomností mnohojaderných obřích buněk. Exprese syncytinů bude posouzena co do prediktivního a diagnostického významu pro klinickou praxi. Dále budeme sledovat sestřih syncytinové mRNA pomocí PCR se specifickými primery umístěnými v intronech nebo exonech. Pomocí bisulfitové reakce popíšeme rovněž pattern CpG methylace syncytinového promotoru a LTR. Na buněčných liniích odvozených od příslušných nádorů germinální linie budeme sledovat pomocí chromatinové imunoprecipitace histonové modifikace a další epigentické parametry syncytinových lokusů.; We will examine the gene expression of syncytin-1 and 2 at the level of mRNA in tumors of the male germ line, particularly seminomas, mixed germinal carcinomas, and choriocarcinomas. This will be correlated with the tumor histology, mainly with the representation of of multinuclear giant cells. Expression of syncytins will be assessed as to their predictive and diagnostic value for the clinics. Furthermore, we will follow the splicing of syncytin mRNAs using the PCR with splice-specific primers localized in exons and introns. Using the bisulfite technique, we will describe the patterns of CpG methylation of syncytin promoters and LTRs in aforementioned tumors. In the cell lines derived from respective germ line tumors, we will examine histone modifications and other epigenomic features of syncytin loci using the chromatin immunoprecipitation.

• MeSH
• choriokarcinom MeSH
• chromatinová imunoprecipitace MeSH
• exony MeSH
• exprese genu MeSH
• genové produkty env MeSH
• germinální a embryonální nádory MeSH
• histony MeSH
• mikro RNA analýza   MeSH
• polymerázová řetězová reakce MeSH
• Retroviridae - proteiny onkogenní MeSH
• seminom MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• molekulární biologie, molekulární medicína
• andrologie
• onkologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

• MeSH
• nádorové biomarkery MeSH
• nádory prsu genetika   terapie   patologie   MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• embryologie a teratologie
• genetika, lékařská genetika
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

• MeSH
• Retroviridae MeSH
• virologie MeSH
• Publikační typ
• nekrology MeSH

• O autorovi
• Svoboda, Jan, 1934-2017 Autorita

• MeSH
• dějiny 20. století MeSH
• experimentální nádory MeSH
• infekce onkogenními viry genetika   přenos   MeSH
• kur domácí MeSH
• leukemie * veterinární   virologie   MeSH
• nádorová transformace buněk MeSH
• nádory dějiny   etiologie   klasifikace   virologie   MeSH
• onkogenní viry klasifikace   patogenita   MeSH
• onkogeny * MeSH
• proviry * enzymologie   genetika   MeSH
• pseudogeny MeSH
• ptačí sarkom * etiologie   virologie   MeSH
• ptáci MeSH
• replikace viru MeSH
• retroelementy MeSH
• Retroviridae účinky léků   MeSH
• reverzní transkripce MeSH
• reverzní transkriptasa dějiny   MeSH
• savci MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• dějiny 20. století MeSH
• zvířata MeSH

• MeSH
• dějiny 20. století MeSH
• molekulární biologie MeSH
• Retroviridae MeSH
• socialismus MeSH
• Check Tag
• dějiny 20. století MeSH
• Publikační typ
• biografie MeSH

• O autorovi
• Svoboda, Jan, 1934-2017 Autorita

• MeSH
• experimentální nádory genetika   MeSH
• geneticky modifikovaná zvířata MeSH
• geny env MeSH
• geny src MeSH
• hlavní histokompatibilní komplex MeSH
• inbrední kmeny zvířat MeSH
• kur domácí * MeSH
• laboratorní zvířata MeSH
• metastázy nádorů MeSH
• modely nemocí na zvířatech * MeSH
• onkogeny MeSH
• ptačí sarkom * MeSH
• rejekce štěpu MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• zvířata MeSH

• MeSH
• endogenní retroviry * fyziologie   genetika   MeSH
• genom MeSH
• inbrední kmeny zvířat MeSH
• kur domácí MeSH
• lidé MeSH
• molekulární evoluce * MeSH
• Phascolarctidae MeSH
• prasata MeSH
• replikace viru MeSH
• transplantace heterologní škodlivé účinky   MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• zvířata MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH

• MeSH
• epigenetická represe genetika   MeSH
• HIV infekce farmakoterapie   genetika   patofyziologie   MeSH
• infekce RNA viry genetika   imunologie   MeSH
• Retroviridae * genetika   MeSH
• transdukce genetická MeSH
• umlčování genů MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH

Syncytin-1 and -2, human fusogenic glycoproteins encoded by the env genes of the endogenous retroviral loci ERVWE1 and ERVFRDE1, respectively, contribute to the differentiation of multinucleated syncytiotrophoblast in chorionic villi. In non-trophoblastic cells, however, the expression of syncytins has to be suppressed to avoid potential pathogenic effects. We studied the epigenetic suppression of ERVWE1 and ERVFRDE1 5'-long terminal repeats by DNA methylation and chromatin modifications. Immunoprecipitation of the provirus-associated chromatin revealed the H3K9 trimethylation at transcriptionally inactivated syncytins in HeLa cells. qRT-PCR analysis of non-spliced ERVWE1 and ERVFRDE1 mRNAs and respective env mRNAs detected efficient splicing of endogenously expressed RNAs in trophoblastic but not in non-placental cells. Pointing to the pathogenic potential of aberrantly expressed syncytin-1, we have found deregulation of transcription and splicing of the ERVWE1 in biopsies of testicular seminomas. Finally, ectopic expression experiments suggest the importance of proper chromatin context for the ERVWE1 splicing. Our results thus demonstrate that cell-specific retroviral splicing represents an additional epigenetic level controling the expression of endogenous retroviruses.

• MeSH
• buněčné linie MeSH
• endogenní retroviry MeSH
• epigeneze genetická MeSH
• genetická transkripce MeSH
• genové produkty env genetika   metabolismus   MeSH
• germinální a embryonální nádory genetika   metabolismus   MeSH
• glykoproteiny genetika   metabolismus   MeSH
• HeLa buňky MeSH
• histony metabolismus   MeSH
• lidé MeSH
• messenger RNA metabolismus   MeSH
• proviry genetika   metabolismus   MeSH
• sestřih RNA MeSH
• těhotenské proteiny genetika   metabolismus   MeSH
• testis metabolismus   MeSH
• umlčování genů MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH