gen EWSR1
Dotaz
Zobrazit nápovědu
Popisovány jsou dva případy primárního „Ewing-like“ sarkomu ve femuru 12letého chlapce a humeru 28letého muže. Morfologie obou nádorů byla shodná a sestávala ze solidních hnízd mozaikovitě uspořádaných, kulatých buněk se světlou cytoplazmou a pravidelnými jádry. Výsledné organoidní uspořádání, včetně bohaté septální vaskularizace a významné příměsi eozinofilních leukocytů, připomínalo neuroendokrinní tumor. Imunohistochemickým vyšetřením byla zjištěna pozitivita antigenů CD10, CD99, CD138. Molekulární analýza prokázala u obou sarkomů přítomnost fúzního transkriptu EWSR1-NFATc2 vycházející z translokace t(20;22), jež byla zároveň doprovázena amplifikací částí těchto genů a jejich přilehlých oblastí. Oba nádory se chovaly agresívně a byly primárně chemorezistentní. Léze v humeru 4 roky po resekci rozsáhle místně recidivovala s rozpadem osteosyntézy a v plicích byly zjištěny suspektní metastázy. Tumor femuru byl definitivně řešen totální femorální endoprotézou a hoch je po 11 měsících od stanovení diagnózy bez recidivy. Diskutováno je taxonomické postavení těchto vzácných lézí v rámci heterogenní skupiny tzv. „Ewing-like“ sarkomu. Klíčová slova: pažní kost – stehenní kost – Ewingův sarkom – Ewing-like sarkom – translokace t(20;22)(EWSR1-NFATc2) – amplifikace
The authors present two cases of Ewing-like sarcoma of the humerus and femur of a 12-year-old boy and a 28-year-old male, respectively. Identical morphology in both tumors consisted of multiple solid nests with a mosaic collection of small, round, uniform cells with clear cytoplasm and no apparent nuclear atypia. A monotonous structural arrangement, including both rich vascularity of bordering septae and significant admixtures of eosinophil leucocytes, resulted in a final organoid “neuroendocrine-like” pattern. Immunohistochemistry revealed diffuse strong CD10, CD99 and CD138 positivity. Detailed molecular analysis in both tumors confirmed translocation t(20;22) resulting in an EWSR1-NFATc2 fusion gene. Additionally, this translocation was accompanied by amplification of the proximal part of the genes and surrounding areas. Clinically, both neoplasms behaved aggressively and they were primarily chemoresistant. Four years later, the patient with the lesion in the humerus developed a massive local recurrence with a disruption of osteosynthesis. The last follow-up disclosed suspicious metastatic deposits in the lung. The boy with the femoral tumor underwent a total femoral prosthesis and there are no signs of local or systemic recurrence after 11 months of follow-up. The authors discuss the taxonomic placement of these rare examples of Ewing-like sarcoma family in the light of new molecular discoveries.
- Klíčová slova
- Ewing-like sarkom, amplifikace, translokace t(20;22)(EWSR1-NFATc2),
- MeSH
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- Ewingův sarkom * diagnóza genetika patologie MeSH
- fúzní onkogenní proteiny * genetika MeSH
- humerus patologie MeSH
- hybridizace in situ fluorescenční MeSH
- imunohistochemie MeSH
- lidé MeSH
- nádory femuru patologie MeSH
- nádory kostí * diagnóza genetika patologie MeSH
- polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí MeSH
- protein EWS vázající RNA genetika MeSH
- proteiny vázající RNA MeSH
- sekvenční analýza MeSH
- techniky amplifikace nukleových kyselin MeSH
- transkripční faktory NFATC * genetika MeSH
- translokace genetická MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
Prezentujeme případ 67 leté ženy se světlobuněčným sarkomem vulvy. Nádor byl zčásti exofytický a dosáhl velikosti 20 x 15 cm. V době klinické prezentace byly prokázány metastázy v plicích a v ingvinálních a pánevních lymfatických uzlinách. Mikroskopicky byl nádor tvořený oválnými nebo vřetenitými buňkami s pouze mírným jaderným pleomorfismem. Mitózy byly zastiženy pouze řídce (nejvýše 2/10 HPF). Nádorové buňky měly světle eosinofilní či vodojasnou cytoplasmu a byly uspořádány ve splývající plochy. Nádor byl povrchově ulcerovaný, s rozsáhlými ložisky nekróz. Imunohistochemicky byl v nádorových buňkách pozitivní průkaz S-100 proteinu a fokálně průkaz Melanu A a HMB45. Fluorescenční in situ hybridizací jsme prokázali přestavbu genu EWSR1. Prezentujeme první případ primárního světlobuněčného sarkomu vulvy.
We report the case of a 67-year-old female with clear cell sarcoma (CCS) of the vulva. Grossly, the tumor was a partly exophytical vulvar mass, measuring 20 x 15 cm. At the time of presentation, the patient showed metastases to the lung, inguinal and pelvic lymph nodes. Histologically, the tumor consisted of oval or spindle cells with only mild nuclear pleomorphism and rare mitoses (up to 2/10 HPF). The cytoplasm was pale eosinophilic or clear. The tumor cells were arranged in confluent sheets. There were large areas of necrosis and surface ulceration. Immunohistochemically, the tumor cells showed expression of S-100 protein and focal melan A and HMB45 expression. Fluorescent in situ hybridization analysis revealed rearrangement of the EWSR1 gene. To the best of our knowledge, this is the first report of CCS arising in the vulva.
- Klíčová slova
- gen EWSR1,
- MeSH
- biopsie metody MeSH
- diferenciální diagnóza MeSH
- hybridizace in situ fluorescenční metody MeSH
- imunohistochemie metody MeSH
- lidé MeSH
- melanom diagnóza patologie MeSH
- nádory vulvy * diagnóza patologie MeSH
- prognóza MeSH
- sarkom z jasných buněk * diagnóza patologie MeSH
- senioři MeSH
- translokace genetická fyziologie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
Prezentujeme klinický průběh 15leté pacientky s metastazujícím Ewingovým sarkomem do kostní dřeně. MR vyšetření potvrdilo změny ve dřeni dlouhých kostí a molekulárně genetické analýzy odhalily charakteristickou a specifickou translokaci pro Ewingův sarkom (11;22) (q24;q12) s vytvořením fuzního genu EWSR1.
Here we present the clinical course of a 15-year-old patient with metastatic Ewing sarcoma to bone marrow. MRI confirmed changes in the marrow of long bones and molecular genetic studies revealed sensitive and specific Ewing sarcoma translocation (11;22) (q24;q12) with creation of fusion gene EWSR1.
- Klíčová slova
- kostní metastatické šíření, cytogenetická detekce, EWSR1,
- MeSH
- anemie MeSH
- artralgie etiologie MeSH
- C-reaktivní protein MeSH
- cytogenetické vyšetření MeSH
- Ewingův sarkom diagnóza radiografie MeSH
- histologické techniky MeSH
- hmotnostní úbytek MeSH
- kosti a kostní tkáň patologie radiografie MeSH
- lidé MeSH
- magnetická rezonanční tomografie MeSH
- mladiství MeSH
- pediatrie MeSH
- radioisotopová scintigrafie MeSH
- únava MeSH
- vyšetřování kostní dřeně MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
V roce 2023 vydávaná 5. edice WHO klasifikace nádorů kůže doznala v sekci mezenchymálních nádorů několika změn, přičemž mezi nejvýznamnější, jako již tradičně, patří zařazení nově identifikovaných nádorových jednotek, kterými se tento přehledový článek bude zabývat především. Konkrétně se jedná o tři nové kožní mezenchymální tumory s melanocytární diferenciací a rearanžemi genů CRTC1::TRIM11, ACTIN::MITF a MITF::CREM. Dále byly nově zařazeny EWSR1::SMAD3- rearanžované fibroblastické tumory, superficiální CD34 pozitivní fibroblastické tumory a NTRK-rearanžované vřetenobuněčné neoplazie. Z dalších změn budou krátce zmíněny pouze ty nejvýznamnější.
The section on mesenchymal tumors in 5th edition of WHO classification of skin tumors has undergone several changes, the most important of which, as usual, is the inclusion of newly identified tumor entities, which will be the main focus of this review article. These specifically include three novel cutaneous mesenchymal tumors with melanocytic differentiation, and rearrangements of the CRTC1::TRIM11, ACTIN::MITF, and MITF::CREM genes. In addition, EWSR1::SMAD3-rearranged fibroblastic tumors, superficial CD34-positive fibroblastic tumors, and NTRK-rearranged spindle cell neoplasms were newly included. Of the other changes, only the most important ones will be briefly mentioned
- Klíčová slova
- mezenchymální nádory,
- MeSH
- antigeny CD34 analýza MeSH
- diferenciální diagnóza MeSH
- fibroblasty asociované s nádorem klasifikace patologie MeSH
- karcinom klasifikace patologie MeSH
- melanocyty patologie MeSH
- nádory kůže * genetika klasifikace patologie MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- přehledy MeSH
Východiska: Nádorový genom dětských pacientů se vyznačuje řadou charakteristik, které jej značně odlišují od malignit dospělého věku. Mezi tyto charakteristiky patří nízká mutační nálož, významná role epigenetických změn a také četnost výskytu fúzních genů jakožto řídicích prvků kancerogeneze. Fúzní geny vznikají v důsledku několika typů chromozomálních přestaveb, jako jsou translokace, delece, inzerce či inverze, a mohou mít celou řadu funkčních dopadů. Ačkoli byly v minulosti studovány především v kontextu hematologických malignit, jejich význam v diagnostice a terapii solidních nádorů neustále narůstá. Materiál a metody: U 250 pacientů se solidními nádory z Kliniky dětské onkologie Fakultní nemocnice Brno byla provedena analýza fúzních genů metodou cíleného RNA sekvenování. Sekvenační knihovny byly připraveny s pomocí sady TruSight RNA Pan-Cancer Panel (Illumina, USA), který pokrývá 1385 klinicky relevantních genů. Sekvenace knihoven proběhla s využitím NextSeq Mid Output Kit (150 cyklů) na platformě NextSeq 500 (Illumina, USA). Sekvenační čtení byla namapována na referenční genom hg38 s pomocí STAR aligneru s parametry nastavenými tak, aby umožnily detekci fúzních genů. Pro vyhledání fúzních genů byly použity nástroje Arriba a STARfusion a identifikované fúzní geny byly manuálně ověřeny v softwaru IGV. Výsledky: Klinicky relevantní fúzní geny byly identifikovány u 25 % pacientů. Největší podíl identifikovaných fúzí tvořily fúze asociované se sarkomy, jako jsou EWSR1-FLI1, PAX3-FOXO1 nebo SS18-SSX1/2. Druhou největší skupinu představovaly fúze typické pro nádory CNS, zejména KIAA1549-BRAF či jiné fúze aktivující Ras/MAPK signalizaci. U pacientky s renálním karcinomem byla identifikována dosud nepopsaná fúze DVL3-TFE3. Celkem 33 % identifikovaných fúzních genů bylo terapeuticky cílitelných a u 2/3 pacientů s terapeuticky cílitelnou fúzí byla nasazena odpovídající léčba. Závěr: Analýza fúzních genů má velký přínos v diagnostice, prognostické stratifikaci a terapeutickém plánování pediatrických onkologických pacientů. Použití vysokokapacitních přístupů, jako je RNA sekvenování, umožňuje identifikaci nových fúzních genů a tím také hlubší porozumění komplexním změnám doprovázejícím vznik a rozvoj nádorových onemocnění.
Background: Pediatric cancer genome significantly differs from the genome of adult malignancies and is characterized by low tumor mutational burden, the great importance of epigenetic changes, and also the frequent occurrence of fusion genes. Fusion genes arise as a result of several types of chromosomal rearrangements, such as translocations, deletions, insertions, or inversions, and can have a variety of functional impacts. In the past, they were studied mainly in the context of hematological malignancies; however, their importance in the diagnostics and therapy of solid tumors is increasing. Materials and methods: In 250 patients with solid tumors from the Department of Pediatric Oncology of University Hospital Brno, an analysis of fusion genes was performed using targeted RNA sequencing. Sequencing libraries were prepared using the TruSight RNA Pan-Cancer Panel (Illumina), which covers 1 385 clinically relevant genes, and sequenced using the NextSeq Mid Output Kit (150 cycles) on the NextSeq 500 platform (Illumina). Sequencing reads were mapped to hg38 using the STAR aligner with parameters set to allow fusion genes detection. Arriba and STARfusion tools were used to search for fusion genes, which were subsequently manually verified in the IGV software. Results: Clinically relevant fusion genes were identified in 25% of patients. The largest proportion of fusions identified were fusions associated with sarcomas, such as EWSR1-FLI1, PAX3-FOXO1, or SS18-SSX1/2. The second-largest group was represented by CNS tumor fusions, especially KIAA1549-BRAF or other Ras/MAPK-associated fusions. A previously undescribed DVL3-TFE3 fusion was identified in a renal carcinoma patient. 33% of the identified fusion genes were therapeutically targetable, and 2/3 of patients received corresponding treatment. Conclusion: The analysis of fusion genes is of great benefit in the diagnostics, prognostic stratification, and therapeutic planning of pediatric cancer patients. The use of high-throughput approaches such as RNA sequencing enables the identification of novel fusion genes as well as a deeper understanding of the complex changes that are involved in the development of the disease.
BACKGROUND/AIM: Gliomas are primary malignancies of the central nervous system (CNS). High-grade gliomas are associated with poor prognosis and modest survival rates despite intensive multimodal treatment strategies. Targeting gene fusions is an emerging therapeutic approach for gliomas that allows application of personalized medicine principles. The aim of this study was to identify detectable fusion oncogenes that could serve as predictors of currently available or newly developed targeted therapeutics in cross-sectional samples from glioma patients using next-generation sequencing (NGS). PATIENTS AND METHODS: A total of 637 patients with glial and glioneuronal tumours of the CNS who underwent tumour resection between 2017 and 2020 were enrolled. Detection of fusion transcripts in FFPE tumour tissue was performed by a TruSight Tumour 170 assay and two FusionPlex kits, Solid Tumour and Comprehensive Thyroid and Lung. RESULTS: Oncogene fusions were identified in 33 patients. The most common fusion was the KIAA1549-BRAF fusion, detected in 13 patients, followed by FGFR fusions (FGFR1-TACC1, FGFR2-CTNNA3, FGFR3-TACC3, FGFR3-CKAP5, FGFR3-AMBRA1), identified in 10 patients. Other oncogene fusions were also infrequently diagnosed, including MET fusions (SRPK2-MET and PTPRZ1-MET) in 2 patients, C11orf95-RELA fusions in 2 patients, EGFR-SEPT14 fusion in 2 patients, and individual cases of SRGAP3-BRAF, RAF1-TRIM2, EWSR1-PALGL1 and TERT-ALK fusions. CONCLUSION: The introduction of NGS techniques provides additional information about tumour molecular alterations that can aid the multimodal management of glioma patients. Patients with gliomas positive for particular targetable gene fusions may benefit from experimental therapeutics, enhancing their quality of life and prolonging survival rates.
- MeSH
- adaptorové proteiny signální transdukční genetika MeSH
- gliom * genetika patologie MeSH
- kvalita života MeSH
- lidé MeSH
- onkogenní fúze * MeSH
- onkogeny genetika MeSH
- protein-serin-threoninkinasy MeSH
- proteiny asociované s mikrotubuly genetika MeSH
- průřezové studie MeSH
- tyrosinfosfatasy receptorového typu, třída 5 genetika MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
Předkládán je souhrn literárně dokumentovaných poznatků se vzácnou skupinou nediferencovaných sarkomů měkkých tkání a kostí definovaných přeskupením genů CIC resp. BCOR, který je ilustrován osobní zkušeností se třemi případy. Tato skupina nádorů se původně vyčlenila z tzv. Ewing-like family, kde nebyla prokázána rearanže EWSR1 genu. Sarkomy s rearanží CIC a BCOR se částečně liší věkovou i topografickou distribucí, ale i prognostickými a prediktivními parametry. První z nich jsou vysoce agresívní a prakticky nepostihují skelet, ty druhé jsou převážně kostní tumory mladých chlapců s příznivější biologií oproti klasickému Ewingově sarkomu. Zásadním zjištěním je variabilita histologického projevu, přesahující běžný obraz malobuněčného kulatobuněčného sarkomu. Mnohé tyto nádory charakterizuje naopak vřetenobuněčná a myxoidní úprava a relativně blandní vzhled, které posouvají spektrum diferenciální diagnostiky mimo Ewing-like family. Naše tři pozorování poukazují na obtížnost diagnostiky těchto lézí a nutnost implementace cílené molekulární analýzy i v rutinní praxi. Stále však existují případy, kde ani extenzívní genetické vyšetření prvotní označení Ewing-like sarkomu blíže neupřesní.
The literature is reviewed regarding of a rare molecularly defined group of sarcomas with rearrangement of both CIC and BCOR genes, which were originally placed into the EWSR1wt Ewing-like category. Personal experience with three cases demonstrating difficulties of this issue is added. Both groups of lesions differ not only by age and topography, but also vary in both the prognostic and the predictive parameters. CIC-rearranged tumors are very aggressive and almost never occur in the skeleton; in contrary, the BCOR-rearranged ones are predominantly bone tumors in young males behaving even better than classical Ewing sarcoma. From the morphologic point of view, it turned out to be a salient finding that these types of neoplasm might leave canonical morphotype of small blue round cell sarcoma. Instead of it, they are not uncommonly characterized as a relatively uniform spindle cell proliferation with prevailing myxoid transformation deserving much broader differential diagnosis. Our three cases reports display difficulties in reaching the correct diagnosis even by implementing sophisticated molecular techniques in routine practice. Notwithstanding of exhaustive molecular assays used, one may still encounter a lesion where original descriptive term Ewing-lie sarcoma remains uncorrected.
- Klíčová slova
- geny CIC, geny BCOR,
- MeSH
- diferenciální diagnóza MeSH
- dítě MeSH
- Ewingův sarkom * diagnostické zobrazování diagnóza MeSH
- exprese genu MeSH
- hybridizace in situ fluorescenční využití MeSH
- ileus chirurgie terapie MeSH
- imunohistochemie MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- lumbosakrální krajina chirurgie patologie MeSH
- malobuněčný sarkom diagnostické zobrazování diagnóza MeSH
- mladiství MeSH
- nádory kostí MeSH
- nádory měkkých tkání MeSH
- translokace genetická MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
- přehledy MeSH