Non-invasive prenatal tests for the detection of fetal aneuploidies are predominantly based on the analysis of cell-free DNA (cfDNA) from the plasma of pregnant women by next-generation sequencing. The development of alternative tests for routine genetic laboratories is therefore desirable. Multiplex digital droplet PCR was used to detect 16 amplicons from chromosome 21 and 16 amplicons from chromosome 18 as the reference. Two fluorescently labeled lock nucleic acid probes were used for the detection of reaction products. The required accuracy was achieved by examining 12 chips from each patient using Stilla technology. The plasma cfDNA of 26 pregnant women with euploid pregnancies and 16 plasma samples from pregnancies with trisomy 21 were analyzed to determine the cutoff value for sample classification. The test was validated in a blind study on 30 plasma samples from pregnant patients with a risk for trisomy 21 ranging from 1:4 to 1:801. The results were in complete agreement with the results of the invasive diagnostic procedure (sensitivity, specificity, PPV, and NPV of 100%). Low cost, and speed of analysis make it a potential screening method for implementation into the clinical workflow to support the combined biochemical and ultrasound results indicating a high risk for trisomy 21.
- MeSH
- aneuploidie MeSH
- Downův syndrom * diagnóza genetika MeSH
- lidé MeSH
- polymerázová řetězová reakce MeSH
- prenatální diagnóza metody MeSH
- těhotenství MeSH
- trizomie MeSH
- volné cirkulující nukleové kyseliny * genetika MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- těhotenství MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- Klíčová slova
- NIPS, neinvazivní prenatální screening,
- MeSH
- amniocentéza MeSH
- chromozomální poruchy diagnóza MeSH
- lidé MeSH
- odběr choriových klků MeSH
- prenatální diagnóza * metody MeSH
- senzitivita a specificita MeSH
- těhotenství MeSH
- volné cirkulující nukleové kyseliny * krev MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- těhotenství MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- Publikační typ
- abstrakt z konference MeSH
Syndrom fragilního X chromozomu je X vázané dědičné onemocnění projevující se mentální retardací u postižených mužů a lehčí mentální dysfunkcí u postižených žen. Většina nemocných má také poruchy chování včetně hyperaktivity a autismu. Na molekulární úrovni jsou známy 2 rozdílné typy syndromu fragilního X chromozomu: FRAXA a FRAXE. Článek pojednává o klinické a molekulárně-genetické analýze rodiny s výskytem syndromu fragilního X chromozomu typu FRAXE, která zatím v naší literatuře nebyla popsána. U probanda s psychomotorickou retardací byl molekulární analýzou vyloučen syndrom typu FRAXA. Kombinací polymerázové řetězové reakce (PCR) a Southernova blottingu byla zavedena metoda pro detekci syndromu typu FRAXE. Popsaná technika umožňuje určit zvětšení a přibližnou velikost (CCG)n repetice v 5' oblasti FMR2 genu. Bylo zjištěno, že matka probanda je nositelkou mutantní FRAXE alely, kterou předala svému synovi. V souladu s dříve publikovanými údaji byla potvrzena nestabilita (CCG)n repetitivní oblasti FMR2 genu v průběhu přenosu z jedné generace do druhé jak ve smyslu její expanze, tak také její kontrakce. Sdělení poukazuje na důležitost DNA analýzy nejen FMR1 genu (typ FRAXA), ale i FMR2 genu (typ FRAXE) u pacientů s mentální retardací s podezřením na syndrom fragilního X chromozomu.
Fragile X syndrome is X linked inherited disease which manifests with mental retardation at affected males and mild mental dysfunction at affected females. Majority of patients háve also behavioral problems including hyperactivity and autism. There are two different types of fragile X syndrome on the molecular level: FRAXA and FRAXE. Present article deal with clinical and molecular genetics analysis of affected family for the FRAXE type of fragile X syndrome that has not been described in the Czech literatuře yet. First, the FRAXA type of syndrome was excluded by molecular analysis at the proband with psychomotor retardation. Consecutively, a method for detection of the FRAXE type of syndrome was established by combination of polymerase chain reaction (PCR) and Southern blotting. Described technique allows to determine an expansion and approximate size of (CCG)n repeat at the 5' end of the FMR2 gene. It was found that mother of the proband is a carrier of the mutant FRAXE allele which passed to her son. In agreement with previously published results, it was confirmed that the (CCG)n repeat at the FMR2 gene is unstable when passed through one generation to the next. Both, the expansion and the contraction of the (CCG)n repeat was observed at studied family. Our report indicates that not only DNA analysis of FMR1 gene (FRAXA type) but also DNA analysis of FMR2 gene (FRAXE type) is important at patients with mental retardation that are suspected for fragile X syndrome.
- MeSH
- finanční podpora výzkumu jako téma MeSH
- incidence MeSH
- lidé MeSH
- registrace MeSH
- statistika jako téma MeSH
- statistika přirozeného pohybu MeSH
- teratologie MeSH
- vrozené vady MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
- MeSH
- anencefalie diagnóza MeSH
- atrézie jícnu diagnóza MeSH
- Downův syndrom diagnóza MeSH
- financování organizované MeSH
- hydrocefalus diagnóza MeSH
- hypospadie diagnóza MeSH
- lidé MeSH
- novorozenecký screening využití MeSH
- plošný screening statistika a číselné údaje využití MeSH
- prenatální diagnóza statistika a číselné údaje využití MeSH
- pupeční kýla diagnóza MeSH
- rektum abnormality MeSH
- retrospektivní studie MeSH
- rozštěp patra diagnóza MeSH
- rozštěp rtu diagnóza MeSH
- spina bifida diagnóza MeSH
- stenóza jícnu diagnóza vrozené MeSH
- vrozené deformity končetin diagnóza MeSH
- vrozené vady MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
- MeSH
- delece genu MeSH
- dítě MeSH
- hypertrofická kardiomyopatie diagnóza patologie MeSH
- kraniofaciální abnormality diagnóza patologie MeSH
- lidé MeSH
- mutace MeSH
- nemoci centrálního nervového systému genetika patologie MeSH
- vrozené vady patologie MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- lidé MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH