Non-invasive prenatal tests for the detection of fetal aneuploidies are predominantly based on the analysis of cell-free DNA (cfDNA) from the plasma of pregnant women by next-generation sequencing. The development of alternative tests for routine genetic laboratories is therefore desirable. Multiplex digital droplet PCR was used to detect 16 amplicons from chromosome 21 and 16 amplicons from chromosome 18 as the reference. Two fluorescently labeled lock nucleic acid probes were used for the detection of reaction products. The required accuracy was achieved by examining 12 chips from each patient using Stilla technology. The plasma cfDNA of 26 pregnant women with euploid pregnancies and 16 plasma samples from pregnancies with trisomy 21 were analyzed to determine the cutoff value for sample classification. The test was validated in a blind study on 30 plasma samples from pregnant patients with a risk for trisomy 21 ranging from 1:4 to 1:801. The results were in complete agreement with the results of the invasive diagnostic procedure (sensitivity, specificity, PPV, and NPV of 100%). Low cost, and speed of analysis make it a potential screening method for implementation into the clinical workflow to support the combined biochemical and ultrasound results indicating a high risk for trisomy 21.

• MeSH
• aneuploidie MeSH
• Downův syndrom * diagnóza   genetika   MeSH
• lidé MeSH
• polymerázová řetězová reakce MeSH
• prenatální diagnóza metody   MeSH
• těhotenství MeSH
• trizomie MeSH
• volné cirkulující nukleové kyseliny * genetika   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• těhotenství MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH

Spontánní potraty v prvním trimestru představují klinicky významný problém, který může postihnout až 15 % rozpoznaných gravidit. Příčiny časných těhotenských ztrát jsou velmi heterogenní a zahrnují faktory genetické, environmetální i imunologické. Ačkoli je hlavním úkolem patologa především vyloučení molární gravidity, může i konvenční histologické vyšetření v některých případech přispět k objasnění příčiny abortu a managementu další gravidity, zvláště v případě lézí s vysokým rizikem recidivy, které mohou vést k habituálnímu potrácení.

Spontaneous abortions in the first trimester of gravidity represent a clinically significant problem that can affect up to 15% of recognized pregnancies. The causes of early pregnancy loss are very heterogeneous and include genetic, environmental and immunological factors. Although the pathologist‘s main task is to exclude molar pregnancy, in some cases conventional histological examination can also contribute to the elucidation of the cause of miscarriage and the management of subsequent pregnancies, especially in the case of lesions with a high risk of recurrence that may lead to habitual abortion.

• MeSH
• abnormální karyotyp MeSH
• komplikace těhotenství MeSH
• lidé MeSH
• první trimestr těhotenství MeSH
• samovolný potrat * patologie   MeSH
• těhotenství MeSH
• trizomie MeSH
• zánět MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• těhotenství MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• přehledy MeSH

OBJECTIVE: The aim of the study was to analyze the results of screening for chromosomal aberrations in a population with a high rate of first-trimester screening and low rate of cell-free DNA testing. METHODS: The data were obtained from the National Registry of Congenital Anomalies of the Czech Republic. We calculated and compared the proportion of autosomal trisomies (Down, Edwards, and Patau syndrome) and of other chromosomal aberrations identified during prenatal diagnostics. RESULTS: We identified 3009 prenatally diagnosed cases of chromosomal aberrations in the 2012-2016 period. The number of major autosomal trisomies has increased from 329 cases (30.86 per 10,000 live births) in 2012 to 423 cases (37.41) in 2016 (p = 0.014). The numbers of other aberrations decreased from 246 cases (23.07 per 10,000) in 2012 to 217 cases (19.19) in 2016 (p = 0.017). The usage of invasive diagnostic procedures decreased from 1099.54 in 2012 to 622.73 in 2016 (per 10,000 live births). CONCLUSIONS: Our population-based study confirmed a decrease in prenatal detection of nonmajor chromosomal aberrations wherein a decrease of invasive testing occurred. With the introduction of cell-free DNA testing, further decrease of invasive procedures and detection of nonmajor aberrations may be expected.

• MeSH
• chromozomální aberace MeSH
• lidé MeSH
• Patauův syndrom MeSH
• prenatální diagnóza MeSH
• těhotenství MeSH
• trizomie * MeSH
• volné cirkulující nukleové kyseliny * MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• těhotenství MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH

• MeSH
• aberace pohlavních chromozomů MeSH
• dystonie * genetika   MeSH
• lidé MeSH
• lidské chromozomy X MeSH
• poruchy pohlavního vývoje spojené s poruchami pohlavních chromozomů * MeSH
• trizomie genetika   MeSH
• vazebné proteiny DNA v oblastech připojení k matrix * genetika   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• dopisy MeSH

• MeSH
• lidé MeSH
• lidské chromozomy, pár 9 MeSH
• novorozenec MeSH
• trizomie * diagnóza   genetika   patologie   MeSH
• výsledek terapie MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• novorozenec MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• kazuistiky MeSH

The single-celled parasite Giardia intestinalis (Diplomonadida) has two equally sized nuclei in one cell. The nuclei have been considered identical. We have previously shown that they contain different chromosomal sets and proceed through the cell cycle with some asynchrony. Here, we demonstrate by fluorescence in situ hybridization that several genes from chromosome 5 are lost in one of the two nuclei of the WBc6 Giardia line. The missing segment stretches over at least 50kb near the 5' chromosome end. In both WB and WBc6 Giardia cell lines, chromosome 5 is trisomic in one nucleus and monosomic in the other nucleus. The described chromosomal deletion has always been observed at the monosomic chromosome in WBc6; however, the deletion was not detected in the parent line WB. The chromosomal segment was thus initially lost after biological cloning of WB, which gave rise to clone WBc6. We show that Giardia is capable of carrying out gene expression from only one nucleus. The two nuclei display a certain level of diversity, making each of them irreplaceable. The doubled karyomastigonts of diplomonads likely have separate functions both in the mastigont/flagellar organization and in chromosomal and gene content. To our knowledge, our results offer the first methodical approach to differentiating the two, so far indistinguishable nuclei. Copyright © 2019 Australian Society for Parasitology. Published by Elsevier Ltd. All rights reserved.

• MeSH
• buněčné jádro genetika   MeSH
• časové faktory MeSH
• chromozomální delece MeSH
• delece genu MeSH
• Giardia lamblia * genetika   ultrastruktura   MeSH
• hybridizace in situ fluorescenční normy   MeSH
• komplementární DNA MeSH
• kvantitativní polymerázová řetězová reakce metody   MeSH
• mitóza MeSH
• monozomie * MeSH
• polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí MeSH
• regulace genové exprese fyziologie   MeSH
• reverzní transkripce MeSH
• RNA protozoální genetika   izolace a purifikace   MeSH
• signální transdukce MeSH
• trizomie genetika   MeSH

Activation-induced cytidine deaminase (AID) is a mutator enzyme essential for somatic hypermutation (SHM) and class switch recombination (CSR) during effective adaptive immune responses. Its aberrant expression and activity have been detected in lymphomas, leukemias, and solid tumors. In chronic lymphocytic leukemia (CLL) increased expression of alternatively spliced AID variants has been documented. We used real-time RT-PCR to quantify the expression of AID and its alternatively spliced transcripts (AIDΔE4a, AIDΔE4, AIDivs3, and AIDΔE3E4) in 149 CLL patients and correlated this expression to prognostic markers including recurrent chromosomal aberrations, the presence of complex karyotype, mutation status of the immunoglobulin heavy chain variable gene, and recurrent mutations. We report a previously unappreciated association between higher AID transcript levels and trisomy of chromosome 12. Functional analysis of AID splice variants revealed loss of their activity with respect to SHM, CSR, and induction of double-strand DNA breaks. In silico modeling provided insight into the molecular interactions and structural dynamics of wild-type AID and a shortened AID variant closely resembling AIDΔE4, confirming its loss-of-function phenotype.

• MeSH
• alternativní sestřih * MeSH
• biologické modely * MeSH
• chronická lymfatická leukemie * enzymologie   genetika   patologie   MeSH
• cytidindeaminasa * biosyntéza   chemie   genetika   MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• lidské chromozomy, pár 12 enzymologie   genetika   MeSH
• myši knockoutované MeSH
• myši MeSH
• nádorové proteiny * biosyntéza   chemie   genetika   MeSH
• počítačová simulace MeSH
• regulace genové exprese enzymů * MeSH
• regulace genové exprese u nádorů * MeSH
• senioři MeSH
• simulace molekulární dynamiky MeSH
• trizomie * genetika   patologie   MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• myši MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• zvířata MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH

The single-celled parasite Giardia intestinalis (Diplomonadida) has two equally sized nuclei in one cell. The nuclei have been considered identical. We have previously shown that they contain different chromosomal sets and proceed through the cell cycle with some asynchrony. Here, we demonstrate by fluorescence in situ hybridization that several genes from chromosome 5 are lost in one of the two nuclei of the WBc6 Giardia line. The missing segment stretches over at least 50 kb near the 5' chromosome end. In both WB and WBc6 Giardia cell lines, chromosome 5 is trisomic in one nucleus and monosomic in the other nucleus. The described chromosomal deletion has always been observed at the monosomic chromosome in WBc6; however, the deletion was not detected in the parent line WB. The chromosomal segment was thus initially lost after biological cloning of WB, which gave rise to clone WBc6. We show that Giardia is capable of carrying out gene expression from only one nucleus. The two nuclei display a certain level of diversity, making each of them irreplaceable. The doubled karyomastigonts of diplomonads likely have separate functions both in the mastigont/flagellar organization and in chromosomal and gene content. To our knowledge, our results offer the first methodical approach to differentiating the two, so far indistinguishable nuclei.

• MeSH
• buněčné jádro genetika   MeSH
• časové faktory MeSH
• chromozomální delece MeSH
• delece genu MeSH
• Giardia lamblia genetika   ultrastruktura   MeSH
• hybridizace in situ fluorescenční normy   MeSH
• komplementární DNA genetika   MeSH
• kvantitativní polymerázová řetězová reakce metody   MeSH
• mitóza MeSH
• monozomie * genetika   MeSH
• polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí MeSH
• regulace genové exprese fyziologie   MeSH
• reverzní transkripce MeSH
• RNA protozoální genetika   izolace a purifikace   MeSH
• signální transdukce MeSH
• trizomie * genetika   MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

• MeSH
• buněčné klony * MeSH
• chromozomální aberace MeSH
• chromozomální delece * MeSH
• cytogenetické vyšetření metody   MeSH
• lenalidomid terapeutické užití   MeSH
• lidé MeSH
• lidské chromozomy, pár 5 * genetika   MeSH
• lidské chromozomy, pár 8 * genetika   MeSH
• myelodysplastické syndromy * farmakoterapie   genetika   MeSH
• retrospektivní studie MeSH
• trizomie * diagnóza   genetika   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• multicentrická studie MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• přehledy MeSH

Cílem práce je představit spektrum chromosomových aberací zachycených v rámci prenatální diagnostiky v České republice v roce 2016. Retrospektivní epidemiologická studie vychází z oficiálních dat shromažďovaných v rámci Národního registru vrozených vad v rámci Ústavu zdravotnických informací a statistky České republiky a také z doplňkové registrace prenatálně diagnostikovaných případů získávaných pod záštitou Společnosti lékařské genetiky a genomiky ČLS JEP. V roce 2016 bylo prenatálně zachyceno celkem 577 chromosomových aberací. Nejvýznamnější skupinou chromosomových aberací, které byly zachyceny při prenatální diagnostice, jsou hlavní autosomová trisomie - tedy Downův, Edwardův a Patauův syndrom, které dohromady tvoří 64,8 % všech identifikovaných aberací. Nejčastější je Downův syndrom, který byl v roce 2016 prenatálně zachycen ve 271 případech (47 %). Ostatní aberace (gonosomové aberace a další odchylky autosomů) ale tvoří stále více jak třetinu případů, přestože na jejich detekci není prenatální screening cílen primárně. Prenatální diagnostika chromosomových aberací v přímé závislosti na stále častěji prováděném kombinovaném screeningu v I. trimestru zachycuje především hlavní autosomová trisomie. Screeningová vyšetření jsou v tuto chvíli nejvýznamnější indikací k provádění invazivní prenatální diagnostiky. Dále pozorujeme významný trend ke snižování počtu potřebných výkonů invazivní prenatální diagnostiky při neklesající úspěšnosti prenatálního záchytu chromosomových aberací. Klíčová slova: chromosomové aberace, prenatální diagnostika, prenatální screening

The main goal of this study was to analyse the spectrum of chromosomal aberrations that were diagnosed during prenatal diagnostics in the Czech Republic in 2016. We present a retrospective epidemiological analysis that is based on the official data from the National Registry of Congenital Anomalies that is run by the Institute of Health Information and Statistics of the Czech Republic. Additional data were obtained actively from the departments of medical genetics and prenatal diagnostics under the guidance of the Czech Society of Medical Genetics and Genomics. In 2016 there were 577 cases of chromosomal aberrations identified during prenatal diagnostics in the Czech Republic. The most important group of aberrations were the three main autosomal trisomies - Down, Edwards and Patau syndromes which were identified in 64.8 % of cases. The most frequent of them was the Down syndrome, that was identified in 271 cases (47 % of all cases identified in 2016). Other aberrations (including the abnormalities of the gonosomes and other autosomal anomalies) were still identified in more than one third of cases, although the screening programs do not primarily focus on them. Combined screening in the first trimester and following prenatal diagnostics mostly identify main autosomal trisomies. Screening is currently the most important clinical referral for the invasive prenatal diagnostics procedures. We also observe important time trend of decreasing numbers of invasive diagnostics procedures - while the overall prenatal detection rate of chromosomal aberrations is not negatively affected. Keywords: hromosomal aberrations, prenatal diagnostics, prenatal screening

• MeSH
• chromozomální aberace * klasifikace   MeSH
• epidemiologické studie MeSH
• lidé MeSH
• prenatální diagnóza * MeSH
• retrospektivní studie MeSH
• trizomie diagnóza   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH