BACKGROUND: Increasingly large and complex biomedical data sets challenge conventional hypothesis-driven analytical approaches, however, data-driven unsupervised learning can detect inherent patterns in such data sets. METHODS: While unsupervised analysis in the medical literature commonly only utilizes a single clustering algorithm for a given data set, we developed a large-scale model with 605 different combinations of target dimensionalities as well as transformation and clustering algorithms and subsequent meta-clustering of individual results. With this model, we investigated a large cohort of 1383 patients from 59 centers in Germany with newly diagnosed acute myeloid leukemia for whom 212 clinical, laboratory, cytogenetic and molecular genetic parameters were available. RESULTS: Unsupervised learning identifies four distinct patient clusters, and statistical analysis shows significant differences in rate of complete remissions, event-free, relapse-free and overall survival between the four clusters. In comparison to the standard-of-care hypothesis-driven European Leukemia Net (ELN2017) risk stratification model, we find all three ELN2017 risk categories being represented in all four clusters in varying proportions indicating unappreciated complexity of AML biology in current established risk stratification models. Further, by using assigned clusters as labels we subsequently train a supervised model to validate cluster assignments on a large external multicenter cohort of 664 intensively treated AML patients. CONCLUSIONS: Dynamic data-driven models are likely more suitable for risk stratification in the context of increasingly complex medical data than rigid hypothesis-driven models to allow for a more personalized treatment allocation and gain novel insights into disease biology.
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
Standard first-line therapy of chronic myeloid leukemia is treatment with imatinib. In the randomized German Chronic Myeloid Leukemia-Study IV, more potent BCR-ABL inhibition with 800 mg ('high-dose') imatinib accelerated achievement of a deep molecular remission. However, whether and when a de-escalation of the dose intensity under high-dose imatinib can be safely performed without increasing the risk of losing deep molecular response is unknown. To gain insights into this clinically relevant question, we analyzed the outcome of imatinib dose reductions from 800 mg to 400 mg daily in the Chronic Myeloid Leukemia-Study IV. Of the 422 patients that were randomized to the 800 mg arm, 68 reduced imatinib to 400 mg after they had achieved at least a stable major molecular response. Of these 68 patients, 61 (90%) maintained major molecular remission on imatinib at 400 mg. Five of the seven patients who lost major molecular remission on the imatinib standard dose regained major molecular remission while still on 400 mg imatinib. Only two of 68 patients had to switch to more potent kinase inhibition to regain major molecular remission. Importantly, the lengths of the intervals between imatinib high-dose treatment before and after achieving major molecular remission were associated with the probabilities of maintaining major molecular remission with the standard dose of imatinib. Taken together, the data support the view that a deep molecular remission achieved with high-dose imatinib can be safely maintained with standard dose in most patients. Study protocol registered at clinicaltrials.gov 00055874.
- MeSH
- antitumorózní látky terapeutické užití MeSH
- časové faktory MeSH
- chronická myeloidní leukemie farmakoterapie patologie MeSH
- imatinib mesylát terapeutické užití MeSH
- indukce remise MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- lokální recidiva nádoru farmakoterapie patologie MeSH
- míra přežití MeSH
- následné studie MeSH
- nenasazení léčby statistika a číselné údaje MeSH
- retrospektivní studie MeSH
- senioři MeSH
- výsledek terapie MeSH
- vztah mezi dávkou a účinkem léčiva MeSH
- Check Tag
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- multicentrická studie MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- randomizované kontrolované studie MeSH
Karcinom prsu je během těhotenství často diagnostikován v jeho pozdější fázi a již ve vyšším stadiu onemocnění. Podezřelé nálezy, které perzistují déle než dva až čtyři týdny by měly být vyšetřeny punkční biopsií. Díky prenatální ultrazvukové diagnostice jsou detekovány ovariální nálezy v časném stadiu, kdy jde většinou o benigní cysty. ultrazvukové suspektní nálezy na ovariích by měly být histologicky ověřeny. karcinom děložního hrdla je většinou díky rutinnímu vyšetřování nalezen v časném stadiu. Při suspektním cytologickém či kolposkopickém nálezu by mělo následovat histologické ověření a testace HPV. Podezřelá pigmentózní léze by měla být během těhotenství vyšetřena podle pravidla abCD a eventuálně by měla být pacientka časně odeslána do dermatologické poradny k dalšímu posouzení nálezu. klinická symptomatologie kolorektálního karcinomu je obvykle nespecifická a je většinou přisuzována těhotenství. Stejně jako u netěhotných pacientek máme k dispozici digitální vyšetření per rectum, test na okultní krvácení ve stolici a endoskopické vyšetření. Prevalence uzlů štítné žlázy v těhotenství je vysoká. každý ultrazvukově suspektní uzel by měl být nehledě na těhotenství vyšetřen pomocí biopsie tenkou jehlou. u pacientek s Hodgkinovou chorobou často chybí během těhotenství typické b-symptomy. Diagnóza je většinou stanovena stejně jako u netěhotných pacientek pomocí exstirpace suspektní lymfatické uzliny. Výskyt akutní leukémie během těhotenství je velmi vzácný, přesto musí v případě podezření proběhnout obzvláště rychlá hematologická diagnostika. během těhotenství není vhodná radioterapie. Operace nebo chemoterapie je možná podle gestačního stáří plodu. Pro cílenou léčbu ještě nemáme dostatečná data. Jen vzácně (výjimkou je např. akutní leukémie v 1. trimestru) je indikováno ukončení těhotenství za účelem zlepšení prognózy pacientky. Téměř ve všech případech lze i přes těhotenství zajistit pacientce adekvátní léčbu. každá malignita diagnostikovaná v těhotenství představuje pro pacientku, její rodinu i ošetřující lékařský tým extrémní zátěž. každý terapeutický postup je třeba i přes předložená doporučení individualizovat a týmově řešit.
- MeSH
- hematologické komplikace těhotenství diagnóza klasifikace terapie MeSH
- Hodgkinova nemoc diagnóza terapie MeSH
- kolorektální nádory diagnóza terapie MeSH
- leukemie diagnóza klasifikace terapie MeSH
- lidé MeSH
- melanom diagnóza terapie MeSH
- nádorové komplikace v těhotenství diagnóza klasifikace terapie MeSH
- nádory děložního čípku diagnóza terapie MeSH
- nádory prsu diagnóza terapie MeSH
- nádory štítné žlázy diagnóza terapie MeSH
- nádory vaječníků diagnóza terapie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
