"NV 16-32198A" Dotaz Zobrazit nápovědu
Závěrečná zpráva o řešení grantu Agentury pro zdravotnický výzkum MZ ČR
Nestr.
Metastazing colorectal carcinoma (mCRC) is 2nd the most frequent cancer-related cause of death in Europe. Despite the advances in surgery, radio-, chemotherapy and biological treatment, 5-year survival of mCRC patients remains low (7.5%) and therefore, validated predictive biomarkers are seeked for. This project aims to bring new knowledge regarding mCRC, to personalize its treatment and thus minimize drug side effects. The means is multidisciplinary cooperation among Palacky University, Teaching Hospital Olomouc, and CGB in investigating genetic and epigenetic biomarkers for adjusting therapy choice and, potentially, for new therapies. Namely, we will follow biomarkers for potentially predictive biomarkers to antiVEGF (bevacizumab) treatment, chosen based on online cancer genome database searches. These biomarkers belong to somatic, germinal, and epigenetic changes of genetic materiál and, based on literature data, they warrant to expect predictive potential for drug response.
Metastazující kolorektální karcinom(mCRC) je 2.nejčastější příčinou úmrtí na nádorové onemocnění v Evropě. Přes možnosti chirurgie, radio-, chemoterapie a biologické léčby je pětileté přežití pacientů s mCRC nízké (7,5%), a proto se hledají validované prediktivní biomarkery. Tento projekt si klade za cíl získat nové znalosti týkající se mCRC, personalizovat jeho léčbu a tím minimalizovat vedlejší účinky léků. Prostředkem je multidisciplinární spolupráce mezi Univerzitou Palackého, Fakultní nemocnicí Olomouc a CGB při zkoumání genetických a epigenetických biomarkerů pro výběr z možných terapií a pro směřování k novým terapiím. Jmenovitě se budeme věnovat potenciálně prediktivním biomarkerům pro léčbu antiVEGF protilátkou bevacizumabem, získaným z online databází nádorové genetiky. Tyto biomarkery patří mezi somatické, germinální a epigenetické změny genetického materiálu a dle literární rešerše jsou nadějí pro predikci klinické odpovědi na léčbu.
- MeSH
- bevacizumab terapeutické užití MeSH
- epigenomika MeSH
- inhibitory angiogeneze terapeutické užití MeSH
- kolorektální nádory farmakoterapie MeSH
- lidé MeSH
- metastázy nádorů farmakoterapie MeSH
- nádorové biomarkery genetika MeSH
- výsledek terapie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- onkologie
- gastroenterologie
- genetika, lékařská genetika
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR
Mutations in IDH1/2 genes are a marker of good prognosis for glioma patients, associated with low grade gliomas and secondary glioblastomas. Immunohistochemistry and Sanger sequencing are current standards for IDH1/2 genotyping while many other methods exist. The aim of this study was to validate Competitive amplification of differentially melting amplicons (CADMA) PCR for IDH genotyping by comparison with SNaPshot assay and two immunohistochemical methods. In our study, 87 glioma patients (46 from Olomouc and 41 from Ostrava) were analyzed. IDH1/2 mutations in native bioptical samples were analyzed at DNA level by CADMA and SNaPshot while IDH1 mutations in FFPE samples were analyzed at protein level by two IHC methods. CADMA PCR sensitivity for IDH1 was 96.4% and specificity 100% for 86 concluded samples. SNaPshot assay sensitivity was 92.9% and specificity of 100% for 85 concluded samples. IHC in the laboratory no. 2 reached sensitivity 85.7% and specificity 100% for 86 concluded samples. IHC in the laboratory no. 4 reached sensitivity of 96.4% and specificity of 79.7% in 74 concluded samples. Only one IDH2 mutation was found by SNaPshot while CADMA yielded false negative result. In conclusion, CADMA is a valid method for IDH1 p.(R132H) testing with higher sensitivity than SNaPshot assay. Also, molecular genetic methods of IDH1 testing from native samples were more robust than IHC from FFPE.
- MeSH
- glioblastom genetika MeSH
- gliom genetika MeSH
- imunohistochemie metody MeSH
- isocitrátdehydrogenasa genetika MeSH
- lidé MeSH
- mutace genetika MeSH
- mutační analýza DNA metody MeSH
- nádorové biomarkery genetika MeSH
- nádory mozku genetika MeSH
- senzitivita a specificita MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- Publikační typ
- abstrakt z konference MeSH
- Publikační typ
- abstrakt z konference MeSH
x
x
- MeSH
- Bayesova věta MeSH
- biomedicínský výzkum * metody normy trendy MeSH
- farmaceutický výzkum metody trendy MeSH
- klinická studie jako téma MeSH
- lidé MeSH
- pravděpodobnost MeSH
- reprodukovatelnost výsledků * MeSH
- statistika jako téma MeSH
- translační biomedicínský výzkum metody trendy MeSH
- validační studie jako téma MeSH
- vědecký podvod etika psychologie zákonodárství a právo MeSH
- výsledky a postupy - zhodnocení (zdravotní péče) * metody trendy využití MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- Publikační typ
- abstrakt z konference MeSH
- Publikační typ
- abstrakt z konference MeSH
- Publikační typ
- abstrakt z konference MeSH
