Nádory tlustého střeva a konečníku (CRC) vznikají v důsledku souhry četných genových variant s faktory životního prostředí. Výživa a střevní mikroflóra významně ovlivňují akumulaci poškození DNA, jejich opravu (udržující genomovou stabilitu a buněčné funkce), jakož i střevní metabolismus, imunologickou aktivitu, a hrají výraznou roli v odpovědi na chemoterapii. V našich studiích se budeme zabývat A) Vnímáním chuti, střevní mikroflórou, poškozením DNA a kapacitou DNA oprav jako faktorů ovlivňujících vznik CRC (pacienti versus kontrolní osoby); B) Střevní mikroflórou, poškozením DNA a kapacitou DNA oprav jako prognostickými znaky progrese CRC, účinnosti terapie a přežívání. Monitorování chuťového vnímání a střevní mikroflóry při současném stanovování kapacity oprav DNA poškození u pacientů s CRC představuje zásadně nový přístup. V naší studii dále zamýšlíme integrovat sledované parametry do prognostických a terapeutických úvah, jež v konečném důsledku přispějí k individualizované terapii a zlepšené kvalitě života pacientů.; Colorectal cancer (CRC) develops as a consequence of inherited multiple low-risk variants in concurrence of environmental factors. Nutrition and intestinal microbiota exert an effect on DNA damage accumulation and its repair (maintaining universal genomic stability and preserves cellular functions), intestinal metabolism, immunological activity and substantially affect the efficacy of chemotherapy. Integrated studies should unveil in humans the role of A) Taste perception, intestinal microbiota, DNA damage and repair in CRC risk (CRC patients vs. control individuals); B) Intestinal microbiota, DNA damage and repair as prognostic markers of CRC progression, treatment efficacy and survival. Monitoring of taste perception and intestinal microenvironment with simultaneous determinations of DNA damage response and repair in cancer patients represent substantial novel contribution. Our project further aims to integrate above parameters into the prognostic and therapeutical considerations, which ultimately result in individually tailored therapy and improved quality of the life.

• MeSH
• chirurgie trávicího traktu MeSH
• geny rRNA MeSH
• kolorektální nádory MeSH
• lidé MeSH
• messenger RNA MeSH
• odběr tkání a orgánů metody   MeSH
• polymerázová řetězová reakce MeSH
• preanalytická fáze MeSH
• reprodukovatelnost výsledků MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• srovnávací studie MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• gastroenterologie
• experimentální medicína
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Projekt je zaměřen na detailní analýzu exprese pěti kandidátních biomarkerů (PBX1, HOXC9, NF1, HMGI-C a HMGA2), které souvisejí s rezistencí k retinoidům v buňkách neuroblastomu. Endogenní exprese těchto biomarkerů bude hodnocena pomocí PCR a imunodetekce ve stabilizovaných neuroblastomových buněčných liniích a v párových vzorcích nádorové tkáně od jednotlivých pacientů. Do studie bude zařazeno nejméně 25-30 párových vzorků nádorové tkáně odebírané pacientům a 25 neuroblastomových buněčných linií. Případné rozdíly v expresi biomarkerů mezi párovými vzorky téhož pacienta, které byly odebrány v době diagnózy a po indukční chemoterapii, budou ověřeny pomocí ovlivnění buněčných linií vybranými retinoidy. Tato studie přinese zejména zcela nové poznatky založené na komplexní analýze všech kandidátních biomarkerů rezistence k retinoidům v rámci jedné experimentální kohorty. Získané informace tak mohou přispět k identifikaci prediktivních biomarkerů, které budou v praxi využitelné ke stanovení léčebné odpovědi na retinoidy u pacientů s vysoce rizikovými neuroblastomy.; This project is aimed at a detailed analysis of the expression of five candidate biomarkers (PBX1, HOXC9, NF1, HMGI-C and HMGA2) associated with the resistance to retinoids in neuroblastoma cells. Endogenous expression of these biomarkers should be evaluated in established neuroblastoma cell lines as well as in paired samples of tumor tissue taken from the individual patients using PCR and immunodetection methods. At least 25-30 paired tumor samples and 25 neuroblastoma cell lines should be included in this study. Possible differences in expression of biomarkers between paired samples taken from the same patient at diagnosis and after induction chemotherapy should be verified on cell lines treated with selected retinoids. This study brings especially completely new information based on multiple analysis of all candidate biomarkers known to be associated with the resistance to retinoids in one experimental cohort. Obtained data may help to identify useful predictive biomarkers of the patient’s response to retinoids within high-risk neuroblastoma category.

• MeSH
• bexaroten MeSH
• chemorezistence MeSH
• fenretinid MeSH
• imunologické techniky MeSH
• nádorové biomarkery MeSH
• neuroblastom MeSH
• neurofibromin 1 chemie   MeSH
• polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí MeSH
• pre-B-buněčný leukemický transkripční faktor 1 chemie   MeSH
• proteiny HMGA chemie   MeSH
• retinoidy MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• pediatrie
• chemie, klinická chemie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR