- Klíčová slova
- Spinraza,
- MeSH
- genetická terapie metody MeSH
- genetické testování metody MeSH
- lidé MeSH
- oligonukleotidy terapeutické užití MeSH
- předškolní dítě MeSH
- prenatální diagnóza MeSH
- spinální svalová atrofie * genetika patofyziologie terapie MeSH
- svalová slabost etiologie MeSH
- výsledek terapie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- předškolní dítě MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
BACKGROUND: Autosomal dominant polycystic kidney disease (ADPKD) is the most common hereditary renal disorder caused by mutation in either one of two genes, PKD1 and PKD2. High structural and sequence complexity of PKD genes makes the mutational diagnostics of ADPKD challenging. The present study is the first detailed analysis of both PKD genes in a cohort of Czech patients with ADPKD using High Resolution Melting analysis (HRM) and Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification (MLPA). METHODS: The mutational analysis of PKD genes was performed in a set of 56 unrelated patients. For mutational screening of the PKD1 gene, the long-range PCR (LR-PCR) strategy followed by nested PCR was used. Resulting PCR fragments were analyzed by HRM; the positive cases were reanalyzed and confirmed by direct sequencing. Negative samples were further examined for sequence changes in the PKD2 gene by the method of HRM and for large rearrangements of both PKD1 and PKD2 genes by MLPA. RESULTS: Screening of the PKD1 gene revealed 36 different likely pathogenic germline sequence changes in 37 unrelated families/individuals. Twenty-five of these sequence changes were described for the first time. Moreover, a novel large deletion was found within the PKD1 gene in one patient. Via the mutational analysis of the PKD2 gene, two additional likely pathogenic mutations were detected. CONCLUSIONS: Probable pathogenic mutation was detected in 71% of screened patients. Determination of PKD mutations and their type and localization within corresponding genes could help to assess clinical prognosis of ADPKD patients and has major benefit for prenatal and/or presymptomatic or preimplantational diagnostics in affected families as well.
- MeSH
- genetická vazba MeSH
- genetické testování metody MeSH
- kationtové kanály TRPP genetika MeSH
- kohortové studie MeSH
- lidé MeSH
- multiplexová polymerázová řetězová reakce MeSH
- mutace genetika MeSH
- polycystické ledviny autozomálně dominantní genetika MeSH
- polymerázová řetězová reakce MeSH
- sekvenční analýza DNA MeSH
- tranzitní teplota MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
- MeSH
- diagnostické techniky molekulární využití MeSH
- dospělí MeSH
- genetická predispozice k nemoci genetika MeSH
- genetické testování MeSH
- lidé MeSH
- preimplantační diagnóza MeSH
- pseudohypoparatyreóza diagnóza genetika metabolismus MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
- MeSH
- diagnostické techniky porodnicko-gynekologické využití MeSH
- embryonální vývoj genetika MeSH
- genetické testování využití MeSH
- lidé MeSH
- močové ústrojí embryologie MeSH
- nemoci ledvin diagnóza genetika vrozené MeSH
- nemoci plodu diagnóza MeSH
- polycystická choroba ledvin diagnóza embryologie genetika MeSH
- prenatální diagnóza MeSH
- těhotenství MeSH
- ultrasonografie prenatální MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- těhotenství MeSH
Laboratoře zabývající se analýzou lidského genomu, ať dědičnými či nedědičnými poruchami, používají obdobné metodické a technologické přístupy. Genetické odchylky však identifikují v různém rozsahu – vyhledávají běžně se vyskytující mutace, populačně vzácnější mutace, mutace s rodinným výskytem nebo identifikují dosud neznámé genetické změny. Kromě spektra mutací se DNA laboratoře vzájemně liší také v ročním počtu vyšetřených vzorků. Při porovnávání je rovněž třeba brát v úvahu, že klinické požadavky mohou zabírat velice široké indikační pole nebo mohou být naopak velmi specifické. Údaje uvedené v tabulkách jsou z roku 2004 a ukazují „záchytnost“ tj. počet pozitivních nálezů ve srovnání s počtem vzorků zaslaných k vyšetření. Vedle skupiny diagnóz, které vyšetřuje velký počet laboratoří, a které patří metodicky k nejjednodušším, existuje i velký počet vyšetření, která jsou prováděna jen jednou laboratoří uvedenou v databázi CZDDNAL http://www.uhkt.cz/lab_a_vysetreni/nr_lab_dna_diag/dna_lab_db. Údaje o počtu vyšetření jsou hodnocena z různých hledisek, na prvním místě z hlediska nabídky pokrývající v různé míře požadavky zákazníků, pracovní a finanční náročnosti a v neposlední řadě pak účelností takových vyšetření.
Laboratories dealing with human genome, both inherited and acquired changes, dispose with similar methods and technology. The spectrum of genetic tests is relatively broad and the number of mutations or variants tested differs substantially. Also the number of examinations carried out in individual laboratories varies. Data presented in the tables come from the year 2004 and indicate the number of examinations requested and number of positive results. Many laboratories mentioned in the registry CZDDNAL (http://www.uhkt.cz/lab_a_vysetreni/nr_lab_dna_diag/dna_lab_db.) perform the same tests but there is also a great number of tests carried out by only one laboratory. Reasons of the request, cost-effectiveness and clinical utility of genetic testing is being discussed.
Malé, většinou nadpočetné chromozómy označované jako marker chromozómy, popř. markery mohou mít velmi rozdílné fenotypové vyjádření, které závisí na jejich původu a rozsahu. Článek uvádí výsledky molekulárně cytogenetické analýzy (FISH) 34 pacientů, u nichž byl základním cytogenetickým vyšetřením identifikován marker chromozóm. V 21 případech byl zjištěn marker vzniklý z akrocentrického chromozómu, v 9 případech markery gonozomálního původu [der(X), der(Y)], a ve 4 případech prokázány markery z jiných chromozómů (5, 17, 18). Nejběžnějším nálezem byly markery vzniklé z chromozómu 15 (8 případů). Dokumentujeme dva případy pacientů s rozdílným fenotypem, který byl zřejmě výrazně ovlivněn rozsahem pseudoizodicentrického chromozómu 15. Ve shodě s dosud publikovanými výsledky předpokládáme, že přítomnost nadbytečných kopií kritického regionu PWACR (tj. parciální trizomie, resp. tetrazomie 15qll-ql3) je v naprosté většině případů zodpovědná za těžké postižení pacienta označované jako syndrom invertované duplikace chromozómu 15. K nejtypičtějším příznakům patří psychomotorická retardace, hypotonie, neurologické symptomy a autistické rysy. Článek upozorňuje na význam FISH při prenatálním vyšetření marker chromozómů.
Small, usually supernumerary chromosomes, denoted as marker chromosomes oř markers, can be represented by various phenotypic expression, that depends on their origin and extent. Our article presents results of molecular cytogenetic analysis (FISH) of 34 patients with identified marker chromosome. In 21 cases a marker derived from acrocentric chromosome was identified, in 9 cases markers of gonosomal origin [der(X), der(Y)], and in 4 patients markers of some other chromosomes (5, 17, 18) were proved. The most frequent marker was that originating from chromosome 15 (8 cases). Two patients with different phenotype, markedly influenced by the extent of pseudoizo-dicentric chromosome 15 are described. In accordance with hitherto presented data, presence of supernumerary copies of the critical region PWACR (it is the partial trisomy, resp. tetrasomy 15q1 l-ql3) in majority of cases brings about serious affection described as syndrome of the inverted duplication of chromosome 15. The most typical symptoms are psychomotoric retardation, hypotony, neurological symptoms and autistic features. The article stresses the importance of FISH method in the prenatal examination of marker chromosomes.
- MeSH
- genetické markery MeSH
- lidé MeSH
- lidské chromozomy, pár 15 genetika MeSH
- Praderův-Williho syndrom diagnóza genetika MeSH
- trizomie genetika patologie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
