The aim of the study was to compare the prevalence of extended-spectrum beta-lactamase (ESBL)-producing Escherichia coli bovine isolates on a conventional dairy cattle farm with high consumption of parenteral and intramammary cephalosporins (farm A) and on an organic dairy farm with no cephalosporin use (farm B). ESBL-producing E. coli were isolated from rectal swabs and milk filters by selective cultivation on MacConkey agar with cefotaxime (2mg/l). ESBL genes were identified by polymerase chain reaction (PCR) and sequencing, and the genetic diversity of the isolates was determined by XbaI pulsed field gel electrophoresis (PFGE). Conjugative transfer, incompatibility group, and restriction fragment length polymorphism (RFLP) profiles of the ESBL-carrying plasmids were studied. Higher prevalence (39%, n(rectal samples in cows)=309) of CTX-M-1-producing E. coli isolates was found on farm A compared to farm B (<1%, n(rectal samples in cows)=154; 0%, n(rectal samples in calves)=46). Using PFGE, the isolates from farm A were divided into nine pulsotypes. In all ESBL-positive isolates, the bla(CTX-M-1) gene was carried on 40 kb IncN conjugative plasmids of three related HincII restriction profiles. Horizontal gene transfer through transmission of IncN plasmids harboring bla(CTX-M-1) as well as clonal dissemination of a particular clone seems to be involved in dissemination of CTX-M-1-producing E. coli isolates in cows on the farm using cephalosporins in treating bacterial infections. The study demonstrates a possible role of cephalosporin use in the widespread occurrence of CTX-M-1-producing E. coli on the conventional dairy cattle farm compared to the organic farm.

• MeSH
• beta-laktamasy genetika   MeSH
• cefalosporiny farmakologie   MeSH
• DNA bakterií genetika   MeSH
• Escherichia coli klasifikace   genetika   izolace a purifikace   MeSH
• infekce vyvolané Escherichia coli mikrobiologie   veterinární   MeSH
• nemoci skotu mikrobiologie   MeSH
• plazmidy genetika   MeSH
• polymerázová řetězová reakce MeSH
• polymorfismus délky restrikčních fragmentů MeSH
• přenos genů horizontální MeSH
• proteiny z Escherichia coli genetika   MeSH
• pulzní gelová elektroforéza MeSH
• rezistence k cefalosporinům MeSH
• skot mikrobiologie   MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• skot mikrobiologie   MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• zvířata MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• srovnávací studie MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

OBJECTIVES: The aim of the study was to characterize a collection of Escherichia coli and Salmonella harbouring qnr and bla(CTX-M-1) genes on IncN plasmids isolated from humans, food-producing, companion and wild animals, and the environment from six European countries. METHODS: Nineteen IncN plasmids were compared using restriction fragment length polymorphism (RFLP), plasmid multilocus sequence typing (pMLST) and hybridization with repN, qnrS1, qnrB19 or bla(CTX-M-1) probes. Plasmids pKT58A and pHHA45 were sequenced using the 454-Genome Sequencer FLX platform on a library constructed from plasmid DNA purified from the respective E. coli transformants. RESULTS: Three types of IncN plasmids carrying bla(CTX-M-1), qnrS1 and qnrB19 genes were identified in strains isolated from the Czech Republic, Poland, Slovakia, Denmark, Italy and the Netherlands, corresponding to pMLST sequence type (ST) 1, ST3 and ST8, respectively. Related plasmids circulating in human and animal isolates were identified. Complete nucleotide sequences of the ST1 pHHA45 plasmid carrying bla(CTX-M-1), isolated from E. coli from pigs in Denmark, and the ST3 pKT58A plasmid harbouring qnrS1, identified in E. coli from a water bird, were obtained. CONCLUSIONS: Our results demonstrated wide distribution of specific IncN plasmids disseminating bla(CTX-M-1) and qnr genes among animals and humans in Europe.

• MeSH
• bakteriální geny MeSH
• bakteriální infekce mikrobiologie   veterinární   MeSH
• beta-laktamasy genetika   MeSH
• DNA bakterií genetika   MeSH
• Escherichia coli účinky léků   genetika   izolace a purifikace   MeSH
• hybridizace nukleových kyselin MeSH
• lidé MeSH
• mikrobiologie životního prostředí * MeSH
• molekulární sekvence - údaje MeSH
• multilokusová sekvenční typizace MeSH
• plazmidy * MeSH
• polymorfismus délky restrikčních fragmentů MeSH
• proteiny z Escherichia coli genetika   MeSH
• Salmonella účinky léků   genetika   izolace a purifikace   MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• zvířata MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• Geografické názvy
• Evropa MeSH

OBJECTIVES: Fully sequenced IncI1 plasmids obtained from CTX-M-1-producing Escherichia coli of human and animal origin were compared. METHODS: Twelve E. coli isolates sharing identical ESBL genes and plasmid multilocus STs sequenced on Illumina and MinION platforms were obtained from the Danish antimicrobial resistance surveillance programme, DANMAP. After de novo assembly, the sequences of plasmids harbouring blaCTX-M-1 were manually curated and ORFs annotated. Within-group comparisons were performed separately for the IncI1 ST3 plasmid type and the IncI1 ST7 plasmid type. The IncI1 ST3 plasmid group was obtained from 10 E. coli isolates (2 from patients with bloodstream infections, 6 from food and 2 from animals). The IncI1 ST7 plasmids originated from E. coli isolates obtained from a patient with bloodstream infection and from a pig. Sequences of IncI1 ST3 and IncI1 ST7 plasmids harbouring blaCTX-M-1 with determined origin were retrieved from GenBank and used for comparison within the respective group. RESULTS: The 10 IncI1 ST3 blaCTX-M-1 plasmids were highly similar in structure and organization with only minor plasmid rearrangements and differences in the variable region. The IncI1 ST7 blaCTX-M-1 plasmids also showed high similarity in structure and organization. The high level of similarity was also observed when including plasmids from E. coli of animal origin from Australia, Switzerland, the Netherlands and France. CONCLUSIONS: This study shows broad spread of a very successful CTX-M-1-producing IncI1 type plasmid among E. coli of both human and animal origin.

• MeSH
• antibakteriální látky farmakologie   MeSH
• bakteriemie mikrobiologie   MeSH
• beta-laktamasy genetika   MeSH
• Escherichia coli klasifikace   účinky léků   enzymologie   MeSH
• infekce vyvolané Escherichia coli krev   mikrobiologie   přenos   MeSH
• lidé MeSH
• mnohočetná bakteriální léková rezistence genetika   MeSH
• multilokusová sekvenční typizace MeSH
• nemoci prasat mikrobiologie   přenos   MeSH
• plazmidy genetika   MeSH
• potravinářská mikrobiologie MeSH
• prasata MeSH
• sekvenční analýza DNA MeSH
• techniky typizace bakterií MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• zvířata MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• srovnávací studie MeSH

Cíl práce: Cílem předložené regionální studie bylo sledování výskytu enterobakterií s produkcí širokospektrých beta-laktamáz u jatečných prasat a jejich základní molekulárně-biologická analýza. Materiál a metody: V rámci prezentované studie byly vyšetřeny rektální výtěry 118 jatečných prasat pocházejících z 5 farem Olomouckého kraje. Bakteriologické vyšetření bylo zaměřeno na průkaz a identifikaci bakterií z čeledi Enterobacteriaceae s produkcí širokospektrých beta-laktamáz. Suspektní izoláty byly dále typizovány fenotypovými i genotypovými metodami. Výsledky: Ze souboru 118 vyšetřených vzorků bylo izolováno 7 kmenů Escherichia coli s přítomností bla genů kódujících beta-laktamázy typu CTX-M-1. Geny pro enzymy typu TEM a SHV detekovány nebyly. Jedná se o první popis ESBL-pozitivních izolátů Escherichia coli u prasat v České republice.

Background: The goals of the presented regional study were monitoring the prevalence of Enterobacteriaceae producing broad-spectrum beta-lactamases in slaughter pigs and their basic molecular biology analysis. Material and methods: In the presented study, rectal swabs from 118 slaughter pigs from 5 farms in the Olomouc Region were analyzed. Bacteriological tests aimed at detection and identification of bacteria from the Enterobacteriaceae family producing broad-spectrum beta-lactamases. Suspected isolates were further analyzed using both phenotypic and genotypic methods. Results: From the group of 118 analyzed samples, seven Escherichia coli strains with the presence of the bla genes encoding CTX-M-1 beta-lactamases were isolated. Genes for TEM and SHV enzymes were not detected. This is the first report of ESBL-positive isolates of Escherichia coli in pigs in the Czech Republic.

• Klíčová slova
• CTX-M-1,
• MeSH
• bakteriální léková rezistence MeSH
• beta-laktamasy genetika   izolace a purifikace   sekrece   MeSH
• DNA bakterií MeSH
• Escherichia coli enzymologie   genetika   MeSH
• feces mikrobiologie   MeSH
• financování organizované MeSH
• mikrobiální testy citlivosti MeSH
• plazmidy genetika   MeSH
• polymerázová řetězová reakce MeSH
• prasata MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• zvířata MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

Cíl práce: Zhodnocení kinetických parametrů izolovaných širokospektrých beta-laktamáz a vyhodnocení jejich substrátové specifity. Materiál a metodika: Ve studii bylo použito 40 kmenů Escherichia coli s prokázanou produkcí širokospektrých beta-laktamáz (ESBL), jejichž typ byl určen pomocí polymerázové řetězové reakce a sekvencováním. Kmeny byly uloženy v bakteriologické sbírce na Ústavu mikrobiologie FN a LF UP v Olomouci a pocházely z klinického materiálu od pacientů z JIP Fakultní nemocnice Ostrava a Krajské nemocnice T. Bati ve Zlíně. Kmeny byly sbírány od hospitalizovaných pacientů v období jednoho roku (1. 1. 2009–31. 12. 2009). Izolované enzymy byly použity ke spektrofotometrickému měření specifických aktivit hydrolýzy antibiotik. Beta-laktamáza z šesti vybraných kmenů byla přečištěna a použita pro měření dalších kinetických parametrů. Výsledky: Měření specifických aktivit v lyzátech s částečně purifikovaným enzymem (širokospektrou beta-laktamázou CTX-M-15 ­nebo CTX-M-27) ukázalo, že nejlépe hydrolyzovaným antibiotikem byl cefazolin. Širokospektrá beta-laktamáza typu CTX-M-15 měla nejvyšší afinitu k cefoperazonu, nejvyšší katalytickou účinnost a vysokou hydrolytickou aktivitu k cefazolinu. Hodnoty kinetických parametrů přečištěných ESBL typu CTX-M-27 se mírně lišily mezi kmeny a vykazovaly vysokou afinitu k cefoperazonu a cefuroximu, vysokou hydrolytickou aktivitu pro cefazolin a silnou katalytickou účinnost k cefazolinu a cefotaximu. Závěry: Srovnání naměřených dat umožnilo vyhodnotit cefazolin jako nejlepší substrát pro použité ESBL. K cefazolinu vykazovaly studované enzymy velice silnou hydrolytickou aktivitu a katalytickou účinnost.

Objective: Evaluation of kinetic parameters isolated extended spectrum beta-lactamases and evaluation of their substrate specifities. Materials and methods: Fourty strains of Escherichia coli with evidence of producing extended spectrum beta-lactamases (ESBLs) and their designated type by polymerase chain reaction and sequencing was used in the study. Strains were stored in bacteriological collection at the Department of Microbiology Teaching Hospital and Palacký University and originated from clinical specimens of ICU, Faculty Hospital Ostrava and Regional Hospital of T. Bata patients. Strains were collected from hospitalized patients in one year (1. 1. 2009–31. 12. 2009). The isolated enzymes were used for spectrofotometric measurement of specific activities by hydrolysis of antibiotics. Beta-lactamases of the six selected strains were purified and used for the measurement of other kinetic parameters. Results: Measurement of specific activities in lysates with partially purified enzyme (beta-lactamases CTX-M-15 or CTX-M-27) showed that the best hydrolyzed antibiotic was cefazolin. Extended spectrum beta-lactamase-type CTX-M-15 had the highest affinity for cefoperazon, the highest catalytic efficiency and high hydrolytic efficiency against cefazolin. The values of kinetic parameters of purified type ESBLs CTX-M-27 was slightly different between strains and showed a high efficiency against cefoperazone and cefuroxime, high hydrolytic activity against cefazolin and strong catalytic effeciency against cefazolin and cefotaxime. Conclusion: Comparison of the measured data enabled to evaluate cefazolin as the best substrate for used ESBLs. The studied enzymes showed very strong hydrolytic activity and catalytic efficiency against cefazolin.

• MeSH
• antibakteriální látky terapeutické užití   MeSH
• beta-laktamasy metabolismus   MeSH
• Escherichia coli enzymologie   MeSH
• infekce vyvolané Escherichia coli farmakoterapie   mikrobiologie   MeSH
• kinetika MeSH
• lidé MeSH
• substrátová specifita MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

Cíl práce: Vyvinout metodu detekce genů podmiňujících ESBL (extended spectrum beta lactamase) fenotyp bakterií přímo z klinického materiálu pacienta. Metoda umožňuje detekci genu blaCTX-M kódujícího CTX-M beta-laktamázy a detekci variant blaSHV genu technologií real-time PCR s využitím locked nucleic acid (LNA) oligonukleotidů. Materiál a metody: V pilotní studii byly testovány tracheální aspiráty získané od pacientů s umělou plicní ventilací hospitalizovaných na oddělení KAR FN Olomouc v období 1. 3. až 30. 8. 2010. Každý vzorek byl standardně mikrobiologicky vyšetřen, u enterobakterií bylo provedeno fenotypové stanovení přítomnosti ESBL. Každý klinický materiál byl současně podroben analýze na přítomnost nukleových kyselin (DNA) kódujících CTX-M a SHV ESBL beta-laktamázy metodou real-time PCR. Výsledky: Do testování bylo zařazeno 150 vzorků tracheálního aspirátu od 71 pacientů. V souboru bylo kultivačně identifikováno 13 (8,7 %) ESBL pozitivních vzorků, zatímco metodou real-time PCR jich bylo identifikováno 27 (18 %). Z 27 PCR pozitivních vzorků bylo pozitivních na přítomnost blaCTX-M sekvence 24 vzorků, dva na přítomnost ESBL blaSHV genu a v jednom vzorku byly identifikovány oba geny. Všechny kultivačně pozitivní vzorky byly zároveň PCR pozitivní na přítomnost blaCTX-M a/nebo blaSHV sekvence. Závěr. Nová metoda výrazně zkracuje dobu detekce kmenů enterobakterií s geny pro produkci SHV a CTX-M beta-laktamáz ze 48 na hodin. Umožňuje klinické využití stanovení přítomnosti ESBL-pozitivní enterobakterie v tracheálním aspirátu u pacientů se život ohrožující nozokomiální pneumonií, kde včasné zavedení adekvátní antimikrobiální terapie hraje významnou roli.

Objectives: A new method has been developed for detecting genes determining the extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) phenotype directly from patients' clinical material. The method enables detection of the blaCTX-M gene encoding CTX-M beta-lactamases and the blaSHV gene variants with real-time PCR technology using locked nucleic acid oligonucleotides. Material and methods: In this pilot study, tracheal aspirates obtained from patients with mechanical ventilation hospitalized at Department of Anaesthesiology and Resuscitation of the University Hospital in Olomouc between 1st March and 30th December 2010 period were tested. Each sample was identified with standard microbiological procedures including phenotypic determination of ESBL-positive enterobacteria. At the same time, each sample was analyzed for the presence of nucleic acids (DNA) which encode CTX-M and SHV ESBL using real-time PCR . Results: 150 samples of tracheal aspirates from 71 patients were included into testing. In the set, 13 (8.7 %) ESBL-positive samples were identified by culture methods while 27 (18 %) positive samples were identified by the real-time PCR method. Of the 27 PCR-positive samples, 24 were positive for the blacTx gene; in 2 samples, the ESBL blasHv gene was detected, and both genes were present in 1 sampie. All culture-positive samples were also PCR-positive for the presence of blaCTX and/or blaSHV sequences. Conclusions: The new real-time PCR assay is likely to shorten the time for detection of enterobacteria producing SHV and CTX-M beta-lactamases from 48 to 6 hours. It enables ESBL-positive enterobacteria determination in tracheal aspirates of patients suffered from life-threatening nosocomial pneumonia where the early introduction of adequate antimicrobial treatment plays the important role.

• MeSH
• bakteriální infekce diagnóza   etiologie   farmakoterapie   genetika   MeSH
• beta-laktamasy * analýza   diagnostické užití   genetika   MeSH
• enterobakteriální infekce diagnóza   etiologie   genetika   komplikace   mikrobiologie   MeSH
• fenotyp MeSH
• hlen mikrobiologie   MeSH
• infekce spojené se zdravotní péčí * diagnóza   etiologie   mikrobiologie   prevence a kontrola   přenos   MeSH
• kultivační techniky * metody   statistika a číselné údaje   trendy   MeSH
• lidé MeSH
• oligoribonukleotidy analýza   diagnostické užití   genetika   MeSH
• pneumonie diagnóza   etiologie   prevence a kontrola   MeSH
• tělesné sekrety * mikrobiologie   MeSH
• ventilace umělá s výdechovým přetlakem statistika a číselné údaje   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH

Cíl práce: Cílem naší studie bylo stanovení výskytu qnr genů u ESBL-pozitivních izolátů Klebsiella pneumoniae získaných z klinického materiálu pacientů hospitalizovaných na jednotkách intenzivní péče několika klinik Fakultní nemocnice Olomouc. Materiál a metody: Do studie bylo zařazeno 100 ESBL-pozitivních izolátů Klebsiella pneumoniae získaných od pacientů hospitalizovaných v období od 1. 1. 2008 do 31. 1. 2011. Geny kódující jednotlivé typy beta-laktamáz blaTEM, blaSHV, blaCTX-M a geny qnr byly detekovány prostřednictvím PCR (polymerázové řetězové reakce). Identita, resp. podobnost izolátů byla analyzována porovnáním restrikčních profilů pomocí PFGE (pulzní gelové elektroforézy). Výsledky a závěr: Gen blaSHV byl detekován u 99 ze 100 izolátů Klebsiella pneumoniae, což odpovídá publikovaným údajům, které předpokládají umístění genu blaSHV-1 na chromozomu jmenovaného druhu. U 77 izolátů byl rovněž zachycen gen blaCTX-M. Přítomnost genu qnr byla odhalena u 56 izolátů, většina z tohoto počtu (76,8 %) nesla současně geny pro beta-laktamázy CTX-M a TEM. Ve všech případech se jednalo o variantu qnrB. Byly identifikovány plasmidy patřící do devíti různých inkompatibilních skupin, nejčastěji ze skupiny IncFII (52 izolátů). Byla prokázána vysoká míra rezistence nejen k beta-laktamovým antibiotikům, ale současně i k aminoglykosidům, tetracyklinu a kotrimoxazolu. PFGE odhalila 65 jedinečných kmenů a několik skupin izolátů se shodným restrikčním profilem. Přestože klinický význam qnr genů zatím není zcela jednoznačně definován, jejich výskyt u ESBL-pozitivních enterobakterií je významný.

Background: The study aimed at determining the presence of qnr genes in ESBL-positive strains of Klebsiella pneumoniae isolated from clinical material obtained from patients hospitalized in several intensive care units in the University Hospital Olomouc. Material and methods: The study comprised 100 ESBL-producing Klebsiella pneumoniae isolates from clinical samples obtained from patients hospitalized between 1 January 2008 and 31 January 2011. blaTEM, blaSHV, blaCTX-M and qnr genes were detected by polymerase chain reaction (PCR). To compare the similarity or identity of the isolates, pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) of DNA fragments was used. Results and Conclusion: The blaSHV gene was detected in 99 from 100 isolates of Klebsiella pneumoniae, which is in accordance with the published data that suppose the chromosomal position of the blaSHV-1 gene in this species. The blaCTX-M gene was detected in 77 isolates. The qnr genes were revealed in 56 isolates and majority (76.8 %) of these qnr-positive bacteria carried also the genes encoding the beta-lactamases CTX-M and TEM. In all cases, the qnrB variant was detected. Plasmids from nine different incompatibility groups were identified, in most cases from the IncFII group (52 isolates). Antibiotic susceptibility tests revealed high frequency of resistance not only to beta-lactams, but also to aminoglycosides, tetracycline and sulfamethoxazole/trimethoprim. PFGE detected 65 different strains and several groups of isolates with the same restriction profile. Although the clinical significance of the qnr genes is not well established, their presence in ESBL-positive Enterobacteriaceae is not negligible and it should be kept in mind.

• MeSH
• bakteriální léková rezistence genetika   MeSH
• bakteriologické techniky MeSH
• beta-laktamasy genetika   izolace a purifikace   MeSH
• beta-laktamová rezistence genetika   MeSH
• DNA bakterií genetika   MeSH
• financování organizované MeSH
• Klebsiella pneumoniae genetika   izolace a purifikace   patogenita   MeSH
• kohortové studie MeSH
• kultivační média chemie   MeSH
• lidé MeSH
• mikrobiální testy citlivosti MeSH
• mnohočetná léková rezistence genetika   MeSH
• pacienti hospitalizovaní MeSH
• plazmidy analýza   MeSH
• polymerázová řetězová reakce MeSH
• pulzní gelová elektroforéza MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

A total of 2,683 nonrepetitive Escherichia coli isolates were collected from microbiological laboratories covering all regions of the Czech Republic, during April 2011. Antimicrobial susceptibility patterns of E. coli were assessed. All 38 cefotaxime-resistant (CTX-R) isolates were found to be extended-spectrum β-lactamase (ESBL)-positive by the double-disc synergy test. Thirty-two of those isolates produced enzymes of CTX-M-1 family, five of CTX-M-9 family, and one isolate both CTX-M types. Genotyping by multilocus sequence typing classified all ESBL-producing isolates into 13 sequence types (STs). ST131 was the most prevalent and was exclusively correlated with E. coli belonging to the more-virulent phylogroup B2. blaCTX-M-15 and blaCTX-M-9-like genes were mainly carried by plasmids belonging to the IncF group, while replicon I1 was predominant among CTX-M-1-encoding plasmids. Additionally, 63% of the ESBL-producing isolates were also resistant to ciprofloxacin. Sequence analysis of quinolone resistance-determining regions of gyrA and parC revealed the presence of amino acid substitutions in 22 out of 23 ciprofloxacin-resistant isolates. The acc(6')-Ib-cr and qnrB1 plasmid-mediated quinolone resistance genes were also detected in some of the isolates. This is the first report on the emergence and spread of CTX-M-producing E. coli in the community of the Czech Republic, indicating the high prevalence of ST131 clone among CTX-M producers.

• MeSH
• antibakteriální látky farmakologie   MeSH
• bakteriální geny MeSH
• beta-laktamasy genetika   MeSH
• buněčné klony MeSH
• diskové difúzní antimikrobiální testy MeSH
• dítě MeSH
• DNA bakterií genetika   MeSH
• dospělí MeSH
• Escherichia coli účinky léků   enzymologie   genetika   izolace a purifikace   patogenita   MeSH
• fluorochinolony farmakologie   MeSH
• fylogeneze MeSH
• infekce vyvolané Escherichia coli epidemiologie   mikrobiologie   MeSH
• infekce získané v komunitě epidemiologie   mikrobiologie   MeSH
• kojenec MeSH
• konjugace genetická MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• mnohočetná bakteriální léková rezistence genetika   MeSH
• multilokusová sekvenční typizace MeSH
• plazmidy genetika   MeSH
• předškolní dítě MeSH
• prevalence MeSH
• proteiny z Escherichia coli genetika   MeSH
• pulzní gelová elektroforéza MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• virulence genetika   MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• dospělí MeSH
• kojenec MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• předškolní dítě MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

Enterobaktérie tvoria základné chromozomálne enzýmy, β-laktamázy triedy A: TEM a SHV (Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae), z ktorých môžu vzniknúť plazmidom kódované širokospektrálne β-laktamázy (ESBL) objavené r. 1980 (E. coli, K. pneumoniae, Enterobacter cloacae). Prvá cefotaximáza (CTX-M, MEN-1) bola hlásená v Európe r. 1990. Tento enzým je omnoho aktívnejší voči cefotaximu než ceftazidimu a aztreonamu. Chromozomálna hyperprodukcia K1 β-laktamázy sa líši od ostatných ESBL citlivosťou na ceftazidim (Klebsiella oxytoca). Nie však všetky enterobaktérie sú rezistentné len na podklade ESBL, ale aj pôsobením AmpC β-laktamázy triedy C chromozomálne či plazmidom kódovanej (MIR-l, CMY-l, BIL-l, FOX-1, MOX-1, DHA-1, LAT-1, ACC-1), odolnej voči β-laktamázovým inhibítorom a cefoxitinu (Enterobacter spp., Proteus vulgaris, Citrobacter freundii, Morganella spp., Serratia spp.). Pri strate vonkajších membránových porínov (OMP) môžu nadobudnúť rezistenciu na karbapenémové antibiotiká. U nás zatiat cidivosť enterobaktérií na karbapenémové aktibiotiká je 100%, celosvetovo je však vznik rezistencie hlásený výskytom karbapenem-hydrolyzujúcich β-laktamáz (karbapenemáz), u K. pneumoniae Amblerova molekulárna trieda B (metalo-β-laktamázy IMP-1, VIM-1) a trieda A (KPC-1), U Serratia marcescens (SME-1) a u E. cJoacae (IMI-1, NMC-A). Karbapenemázy u enterobaktérií sú účinné len za účasti impermeability a „ostatných" mechanizmov rezistencie.

Enterobacteria produce elementary chromosomal enzymes, β-lactamases of class A: TEM and SPIV [Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae). These can give rise to plasmid-coded broad-spectrum β-lactamases (ESBL) discovered in 1980 (E. coli, K. pneumoniae, Enterobacter cioacae). The first cefotaximase (CTX-M, MEN-1) was reported in Europe in 1990. This enzyme is far more active against cefotaxime than against ceftazidime and aztreonam. Chromosomal hyperpoduction of K1 β-lactamase differs from all other ESBLs due its sensitivity to ceftazidime [Klebsiella oxytoca). However, not all enterobacteria are resistant only because of ESBLs, but also as a resuit of the action of chromosomally or plasmid coded AmpC β-lactamase of class C (MIR-1, CMY-1, BIL-1, FOX-1, MOX-1, DHA-1, ACC-1), resistant to β-lactamase inhibitors and to cefoxitin (Enterobacter spp., Proteus vulgaris, Citrobacter freundii, Morganelle spp., Serratia spp.). With the loss of outside-membrane porins (OMP) they can become resistant to carbapenem antibiotics. The 100% resistance of enterobacteria to carbapenems that so far exists in this country is elsewhere in the world compromised by the incidence of carbapenem-hydrolysing plasmid-determined β-lactamase of class B (lMP-1, VIM-1) and of class A (KPC-1) in K pneumoniae, (SME-1) in Serratia marcescens and (IMI-1, NMC-A) in E. clocae. Carbapenemases in enterobacteria are only effective in the presence of impermeability and „other" resistance mechanisms.

• MeSH
• beta-laktamasy klasifikace   účinky léků   MeSH
• beta-laktamová rezistence MeSH
• beta-laktamy dějiny   klasifikace   terapeutické užití   MeSH
• Enterobacteriaceae metabolismus   účinky léků   MeSH
• karbapenemy antagonisté a inhibitory   MeSH
• lidé MeSH
• mikrobiologické techniky metody   využití   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

Individual cloacal swabs of mallards (Anas platyrhynchos) and of herring gulls (Larus argentatus), as well as samples of waterbird feces obtained in 2008 and 2009, were cultivated for Escherichia coli. Isolates of E. coli were tested for susceptibilities to 12 antimicrobial agents by the disk diffusion method. Moreover, the samples were subcultivated on MacConkey agar (MCA) containing cefotaxime (2 mg liter(-1)) to detect E. coli with extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) and subsequently on MCA supplemented with ciprofloxacin (0.05 mg liter(-1)) and MCA with nalidixic acid (20 mg liter(-1)) to isolate fluoroquinolone-resistant E. coli. PCR was used to detect specific antibiotic resistance genes. We found 9 E. coli isolates producing ESBL with bla genes: bla(CTX-M-1) (6 isolates), bla(CTX-M-9) plus bla(TEM-1b) (1 isolate), bla(CTX-M-15) plus bla(OXA-1) (1 isolate), and bla(SHV-12) (1 isolate). In the isolate with bla(CTX-M-15), the gene aac(6)-Ib-cr was also detected. The bla genes were harbored by transferable plasmids of the IncN and IncI1 groups. Nine quinolone-resistant E. coli isolates with qnrS genes were found and characterized. The gene qnrS was associated with a Tn3-like transposon on the IncX1 plasmid together with bla(TEM-1) in two isolates. The gene qnrS was also harbored by conjugative plasmids of the IncN and IncX2 groups. Even if populations of wild birds are not directly influenced by antibiotic practice, we have demonstrated that antibiotic-resistant E. coli strains, including strains with various ESBL and qnrS genes, are found in the feces of wild birds on the coast of the Baltic Sea in Poland.

• MeSH
• Anseriformes mikrobiologie   MeSH
• antibakteriální látky farmakologie   MeSH
• bakteriální geny MeSH
• bakteriální léková rezistence MeSH
• beta-laktamasy biosyntéza   MeSH
• Charadriiformes mikrobiologie   MeSH
• Escherichia coli účinky léků   enzymologie   genetika   izolace a purifikace   MeSH
• feces mikrobiologie   MeSH
• kloaka mikrobiologie   MeSH
• kultivační média chemie   MeSH
• mikrobiální testy citlivosti MeSH
• oceány a moře MeSH
• plazmidy analýza   MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• zvířata MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• Geografické názvy
• oceány a moře MeSH
• Polsko MeSH