• MeSH
• Abscess etiology   therapy   MeSH
• Patient Compliance MeSH
• Leg pathology   MeSH
• Cellulitis etiology   therapy   MeSH
• Surgical Procedures, Operative MeSH
• Adult MeSH
• Wound Healing * MeSH
• Wound Infection * etiology   therapy   MeSH
• Ill-Housed Persons MeSH
• Leg Injuries complications   MeSH
• Staphylococcus aureus isolation & purification   MeSH
• Treatment Outcome MeSH
• Check Tag
• Adult MeSH
• Publication type
• Case Reports MeSH

Komplexní patologické změny při chronické bakteriální infekci spolu s antibiotickou terapií představují stres, který selektuje adaptovanou bakteriální populaci na účinek antibiotik. Staphylococcus aureus je modelovým příkladem mimořádně úspěšného patogena, jehož neobvyklými strategiemi tolerance a alternativní rezistence k antibiotikům (perzistence, mutace cílového místa pro antibiotika a hypermutabilita) při chronické infekci se bude navrhovaný projekt prioritně zabývat. V rámci projektu bude pomocí fenotypových, genotypových a transkriptomických metod analyzován soubor vybraných časných a pozdních izolátů S. aureus od kohorty pacientů s cystickou fibrózou a porovnán s kontrolními kmeny z akutní infekce novorozenců a referenčními stafylokokových kmenů (n=100). Průkaz molekulárních mechanismů adaptací povede k lepšímu pochopení tohoto fenoménu a může vést k optimalizaci léčby konkrétních pacientů Pražského centra pro cystickou fibrózu.; Complex structural changes in the affected tissues develop during the course of chronic bacterial infection and along with antibiotic therapy act as strong stressors exerting a severe selective pressure and resulting in adapted bacterial population tolerant to antibiotics. Staphylococcus aureus is an extraordinarily successful opportunistic pathogen whose survival adaptation strategies like tolerance and alternative resistance to antibiotics (persistence, target site mutation, hypermutability) will be the main object of the Project. Therefore, a collection of early and subsequent late S. aureus isolates cultured from respiratory samples of chronically infected cystic fibrosis patients cohort will be analyzed using phenotypic, genotypic and transcriptomic methods and compared with the controls - S. aureus strains from newborn acute infections, and control reference strains (n=100). Determination of these molecular adaptation mechanisms may lead to improve understanding of the phenomena and optimization of antibiotic therapy for individual patients of Prague Cystic Fibrosis Centre.

• MeSH
• Drug Resistance, Bacterial MeSH
• Bacteriological Techniques methods   MeSH
• Molecular Diagnostic Techniques methods   MeSH
• Phenotype MeSH
• Genotype MeSH
• Humans MeSH
• Mutation MeSH
• Persistent Infection microbiology   MeSH
• Staphylococcal Infections microbiology   MeSH
• Staphylococcus aureus isolation & purification   MeSH
• Drug Tolerance MeSH
• Transcriptome MeSH
• Check Tag
• Humans MeSH

• Conspectus
• Patologie. Klinická medicína
• NML Fields
• infekční lékařství
• molekulární biologie, molekulární medicína
• farmacie a farmakologie
• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

• Keywords
• barierová ošetřovatelská péče,
• MeSH
• Security Measures MeSH
• Occupational Health MeSH
• Cross Infection prevention & control   MeSH
• Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus MeSH
• Nurses MeSH

Rostoucí výskyt rezistencí u původců nozokomiálních infekcí je jedním z hlavních problémů současné medicíny. Úspěšnou léčbu dále komplikuje schopnost těchto bakterií růst ve formě biofilmu. Mezi perspektivní alternativy léčby takových infekcí patří využití bakteriofágů. V rámci projektu budou izolovány nové fágy či jejich subtypy účinné vůči nozokomiálním kmenům stafylokoků a pseudomonád. Fágy budou podrobně charakterizovány z hlediska jejich biologických a genetických vlastností, včetně kompletní sekvence genomu. Pomocí metod kapilární elektroforézy bude ověřena možnost jejich kvantifikace ve vzorku pro účely kontroly kvality fágové kultury. Účinky těchto fágů či jejich synergické kombinace s antimikrobiálními látkami budou ověřovány na nozokomiálních izolátech, zejm. na multirezistentních kmenech. Na základě analýzy schopnosti testovaných fágů infikovat bakterie perzistující uvnitř makrofágů a bakterie rostoucí ve formě biofilmu bude navržena optimální terapeutická strategie pro léčbu chronických infekcí spojených s intracelulárním přežíváním bakterií či s tvorbou biofilmu.; The increasing resistance in agents of nosocomial infections is one of the main problems of current medicine. The efficient treatment is also complicated by their ability to form biofilm. One of perspective alternatives to the treatment of these infections is the use of bacteriophages. The project is focused on the isolation of new phages and their subtypes effective against multiresistant strains of staphylococci and pseudomonades. Phages will be biologically and genetically characterized, including complete genome sequence. Capillary electrophoresis methods will be employed for the detection of phages in cultures. The lytic effect of the virulent phages as well as the synergistic effect of bacteriophages with antimicrobials will be assessed on nosocomial isolates. Within the analysis of tested phages and their ability to induce infections in bacteria persisting intracellulary in macrophages and bacteria growing in biofilm, the optimal therapeutic strategy for the treatment of chronic infections caused by intracellular-living and/or biofilm-forming bacteria will be proposed.

• MeSH
• Anti-Infective Agents therapeutic use   MeSH
• Biofilms drug effects   MeSH
• Electrophoresis MeSH
• Phage Therapy methods   MeSH
• Cross Infection therapy   MeSH
• Humans MeSH
• Drug Resistance, Multiple, Bacterial drug effects   MeSH
• Pseudomonas aeruginosa isolation & purification   MeSH
• Staphylococcus aureus isolation & purification   MeSH
• Check Tag
• Humans MeSH

• Conspectus
• Patologie. Klinická medicína
• NML Fields
• infekční lékařství
• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

• MeSH
• Erysipelas therapy   MeSH
• Wound Healing MeSH
• Staphylococcus aureus MeSH
• Publication type
• Case Reports MeSH

• MeSH
• Clostridium isolation & purification   classification   MeSH
• Disinfection MeSH
• Environmental Health MeSH
• Cross Infection MeSH
• Infections MeSH
• Patient Isolation MeSH
• Intensive Care Units MeSH
• Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus isolation & purification   classification   MeSH
• Critical Care MeSH
• Carrier State MeSH
• Publication type
• Newspaper Article MeSH

• MeSH
• Vancomycin-Resistant Enterococci MeSH
• Escherichia coli MeSH
• Cross Infection epidemiology   etiology   prevention & control   transmission   therapy   MeSH
• Klebsiella MeSH
• Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus MeSH
• Staphylococcal Infections MeSH

Nově zavedenými molekulárními metodami na přímý průkaz infekcí S. aureus, MRSA, small colny variants (SCV) S. aureus a SCV-MRSA a speciálními kultivačními metodami opakovaně vyšetříme klinický materiál pacientů s CF (ročně zhruba 300 kmenů). Nově zavedené molekulárně diagnostické a typizační metody umožní přímý průkaz a klonální charakterizaci patogena, ale i analýzu rezistence (determinanty rezistence, hypermutatorový typ rezistence) a virulence (superantigeny, gen pvl). Aplikace těchto progresivních metod a interpretace jejich výsledků poslouží k přímé racionalizaci léčby konkrétních pacientů s CF. Analýza intracelulární perzistence a citlivosti kmenů k bakteriofágům, s důrazem na SCV a SCV-MRSA, in vitro vytvoří předpoklady pro další studium specifické fagoterapie u pacientů s CF.; The newly developed molecular methods for direct detection of S. aureus, MRSA, small colony variants (SCV) of S. aureus and SCV-MRSA and special culture methods will be used for repeat analyses of clinical specimens from CF patients (about 300 strains per year). The molecular diagnostic and typing methods will be helpful not only in direct detection and clonal characterization of the pathogen but also in the analysis of resistance (resistance determinants, hypermutator phenotype) and virulence (superantigens, the pvl gene). The obtained results and their interpretation will be vital for tailored treatment of CF patients. The analysis of intracellular persistence of strains and their in vitro susceptibility to bacteriophages, with emphasis on SCV and SCV-MRSA strains, will be a point of departure for the development of candidate phage therapy in CF patients.

• MeSH
• Cystic Fibrosis complications   microbiology   MeSH
• Molecular Diagnostic Techniques MeSH
• Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus MeSH
• Molecular Biology MeSH
• Polymerase Chain Reaction MeSH
• Staphylococcal Infections MeSH
• Staphylococcus aureus pathogenicity   MeSH

• Conspectus
• Mikrobiologie
• NML Fields
• bakteriologie
• genetika, lékařská genetika
• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Směrnice, které se zaměřují na bezpečnost kosmetických výrobků a vyšetřování přítomnosti Staphylococcus aureus v nich.

• MeSH
• Bacteriological Techniques standards   MeSH
• Cosmetics isolation & purification   standards   MeSH
• Staphylococcus aureus isolation & purification   MeSH
• Publication type
• Guideline MeSH

• Conspectus
• Metrologie. Standardizace
• NML Fields
• estetická medicína
• mikrobiologie, lékařská mikrobiologie

Nozokomiální infekce (NI) v intenzivní péči představují závažný problém, neboť dále zhoršuje prognózu pro přežití a současně významně zvyšuje finanční náklady ná léčbu, v nichž se promítají především prodloužená hospitalizace a nákladná antimikrobiální terapie. Vyšší vnímavost kriticky nemocných je způsobena několika faktory: porušením přirozených bariér zavedenými katétry, sníženou motilitou střeva, zhoršeným očišťováním dýchacích cest a v neposlední řadě dysregulací imunitní odpovědi. Časně primární těžké sepsi dochází k systémovému zánětu, který slouží k eliminaci vyvolávající infekce. Nicméně, záhy po zánětlivé stimulaci je tato tlumena mediátory s protizánětlivým účinkem (např. kortizol, IL-10). Dá se předpokládát, že právě tyto protizánětlivé mediátory zvyšují vnímavost k NI a že současně tato dysregulace ovlivňuje i diagnostiku NI. V projektu se proto zaměříme na vytipování vhodných mediátorů, které by mohly sloužit jako biomarkery NI a mohly by tedy být využity pro její časnou diagnostiku.; Nosocomial infections (NI) represent an important problem in intensive care setting, since NI are responsible for a worse outcome and also for higher financial costs caused by prolonged hospitalization and use of broad spectrum antibiotics. Higher susceptibility of patients to NI is due to the following factors: breach integrity of nature barriers by inserted catheters, reduced bowel motility, worse cleaning of the airways and deregulated immune responses. Early after the primary sepsis the systemic inflammation develops, which main purpose is to eliminate primary infection. However, early after the inflammatory stimulation the control anti-inflammatory mediators (i.e. , cortisol, IL-10) are produced. It can be speculated that these mediators can increase the susceptibility to NI and that their deregulation influences diagnostics of NI. Thus, this project is aimed at selection of mediators, which may serve as early diagnostic biomarkers of NI.

• MeSH
• Biomarkers MeSH
• Early Diagnosis MeSH
• Cross Infection diagnosis   MeSH
• Inflammation Mediators MeSH
• Critical Care MeSH
• Prospective Studies MeSH
• Flow Cytometry MeSH
• Pseudomonas Infections immunology   MeSH
• Sepsis prevention & control   MeSH
• Staphylococcus aureus MeSH

• Conspectus
• Patologie. Klinická medicína
• NML Fields
• anesteziologie a intenzivní lékařství
• infekční lékařství
• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR