Cíl: Růst prostatických buněk závisí na hladině aktivního testosteronu, který je již v nízkých dávkách významným tumor promotorem. Sledování aktivity genů zapojených do regulace syntézy testosteronu má proto význam pro výzkum mechanizmu vzniku a proliferace nádorových buněk prostaty. Hlavním záměrem prezentované studie bylo zjištění výskytu a frekvencí nejvýznamnějších jednonukleotidových polymorfizmů skupiny genů syntetické dráhy testosteronu v české populaci u pacientů s karcinomem prostaty. Metodika: Do studie bylo zařazeno celkem 237 pacientů s karcinomem prostaty a 229 kontrolních osob s klinicky ověřenou diagnózou benigní hyperplazie. U každé osoby bylo provedeno vyšetření sady 30 jednonukleotidových polymorfizmů z DNA získané z periferních lymfocytů. Výsledky: Získané frekvence výskytu polymorfních alel se mezi skupinou pacientů s karcinomem a pacientů s benigní hyperplazií u většiny markerů výrazně neliší. Nadějným výsledkem je však identifikace markeru SR-49B (dbSNP ID rs4952219) v genu SRD5A2, u kterého byl zjištěn statisticky významný rozdíl poměrů jednotlivých alel i jednotlivých genotypů při srovnání sledované a kontrolní skupiny. Diskuze: Polymorfizmus SR-49B má potenciál pro odhad vrozené predispozice výskytu karcinomu prostaty. Žádný z ostatních sledovaných markerů takovou asociaci nevykazuje.

Aim: Prostate cell growth is dependent upon the level of active testosterone which, even at low levels, is a significant tumour promoter. Thus, monitoring the activity of the genes involved in the regulation of testosterone synthesis is of relevance for investigating the mechanism of prostate tumour cell origin and proliferation. The main goal of the present study was to determine the incidence rates of the most significant single nucleotide polymorphisms of genes of testosterone synthesis pathways in a population of Czech patients with prostate cancer. Methods: The study included a total of 237 patients with prostate cancer and 229 controls with a clinically confirmed diagnosis of benign hyperplasia. Each person underwent an examination of a set of 30 single nucleotide polymorphisms from DNA obtained from peripheral lymphocytes. Results: The incidence rates obtained on polymorphic alleles did not differ significantly in most markers between the group of cancer patients and the group of patients with benign hyperplasia. However, a promising result is the identification of the SR-49B marker (dbSNP ID rs4952219) in the SRD5A2 gene in which a statistically significant difference of the ratios of individual alleles as well as of individual genotypes was found when the two patient groups were compared. Discussion: The SR-49B polymorphism has the potential to predict a congenital predisposition for developing prostate cancer. No such association was detected in any of the other markers observed.

• MeSH
• DNA genetika   MeSH
• finanční podpora výzkumu jako téma MeSH
• genetické testování MeSH
• genotyp MeSH
• lidé MeSH
• nádory prostaty epidemiologie   genetika   MeSH
• polymorfismus genetický MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH

Increasing importance of single-nucleotide polymorphisms (SNPs) in determination of disease susceptibility or in prediction of therapy response brings attention of many molecular diagnostic laboratories to simple and low-cost SNP genotyping methodologies. We have recently introduced a mutation detection technique based on analysis of homo- and heteroduplex PCR fragments resolved in cycling temperature gradient conditions on a conventional multicapillary-array DNA sequencer. The main advantage of this technique is in its simplicity with no requirement for sample cleanup prior to the analysis. In this report we present a practical application of the technology for genotyping of SNP markers in two separate clinical projects resulting in a combined set of 44 markers screened in over 500 patients. Initially, a design of PCR primers and conditions was performed for each SNP marker. Then, optimization of CE running conditions (limited just to the proper selection of temperature cycling) was performed on pools of 20 DNA samples to increase the probability of having each of the two allele types represented in the sample. After selecting the optimum conditions, screening of markers in patients was performed using a multiple-injection approach for further acceleration of the sample throughput. The rate of successful optimization of experimental conditions without any pre-selection based on the SNP sequence or melting characteristics was 80% from the initial SNP marker candidates. By studying the failed markers, we attempt to identify critical factors enabling successful typing. The presented technique is very useful for low to medium sized SNP genotyping projects mostly applied in pharmacogenomic research as well as in clinical diagnostics. The main advantages include low cost, simple setup and validation of SNP markers.

• MeSH
• elektroforéza kapilární * metody   MeSH
• genetická predispozice k nemoci * genetika   MeSH
• genetické markery genetika   MeSH
• genetické testování * metody   MeSH
• genotyp MeSH
• jednonukleotidový polymorfismus * MeSH
• lidé MeSH
• průtoková injekční analýza MeSH
• schizofrenie genetika   MeSH
• sekvenční analýza DNA * metody   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH
• validační studie MeSH

Proposed project is focused on clinical study of inherited genetic polymorphisms and their association with prostate cancer for their potential application in preventive screening. Current as well as new prostate cancer patients will be registered together with controls. Their positivity or negativity will be confirmed with a set of examinations. Blood samples from each patient and control will be taken for genetic testing. SNP polymorphisms from genes involved in testosterone synthetic pathway (CYP17,CYP3A4, SRD5A2 and Androgen receptor gene) will be selected from public databases based on their association with prostate cancer from prior studies. Project is organized into several phases from initial indentification of potential marker candidates andoptimalization of their analysis conditions till screening of the final marker set in 300 patients and 300 controls.

Předkládaný projekt je zaměřen na výzkum vztahu (asociace) mezi skupinou vybraných vrozených DNA polymorfismů (SNP) a výskytem nádoru prostaty a jeho následné využití pro časnou diagnostiku tohoto onemocnění. Současní a noví pacienti budou registrováni společně s kontrolami. jejich positivita resp. negativita bude potvrzena kombinací několika vyšetření. Vzorky krve pro genetické testování budou odebrány všem pacientům a kontrolám. SNP polymorfismy z genů syntetické dráhy testosteronu (CYP17, CYP3A4, SRD5A2 a gen androgenního receptoru) budou vybrány z veřejně přístupných databází na základě jejich asociace s nádorem prostaty potvrzené v předchozích studií. Projekt je zpracován do několika fází od identifikace potenciálních genetických markerů přes optimalizaci jejich zpracování metodami PCR amplifikace až po klinickou studii zahrnující screening získané markerové sady u 300 pacientů a 300 kontrol.

• MeSH
• diagnostické techniky molekulární MeSH
• genetická predispozice k nemoci MeSH
• mutační analýza DNA MeSH
• nádory prostaty diagnóza   genetika   prevence a kontrola   MeSH
• polymorfismus genetický MeSH
• prognóza MeSH
• testosteron MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• biologie
• onkologie
• andrologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR