Chronic myeloid leukemia (CML) is malignant disease characterised by a presence of BCR-ABL1 fusion gene and successfully treated by tyrosine kinase inhibitors (TKI). Treatment failure can be caused by factors on the side of patient, e.g. pharmacokinetics, or by the cancer cell characteristics. Here the main reason are mutations in the BCR-ABL1 kinase domain, leading to TKI resistance, or other mutations in non-BCR-ABL1 genes. They can be detected at diagnosis, but often disappear after the start of TKI therapy, therefore their clinical significance is unclear. The reason may be the fact that they originate in more mature progenitors which are then eliminated by TKIs, while mutations originating in therapy resistant stem cells persist. This hypothesis may be confirmed by the analysis of BCR-ABL1 and non-BCR-ABL1 mutations in hierarchically sorted progenitor and stem-cell enriched populations at diagnosis and early follow-up. The expected results may explain if mutations in stem cells have higher probability to survive the TKI treatment and may lead to treatment failure or relapse.

Chronická myeloidní leukémie (CML) je nádorové onemocnění charakterizované přítomností fúzního genu BCR-ABL1 a úspěšně léčena tyrozin kinázovými inhibitory (TKI). Selhání léčby může být zapříčiněno jednak faktory na straně pacienta (např. farmakokinetika), a jednak vlastnostmi nádorové buňky. Zde jsou hlavními příčinami mutace v kinázové doméně BCR-ABL1, způsobující rezistenci k TKI, nebo jiné mutace v genech mimo BCR-ABL1. Mutace v BCR-ABL1 genu i mimo BCR-ABL1 detekované v době diagnózy často mizí po zahájení TKI terapie a jejich klinický význam je proto nejasný. Příčinou může být fakt, že nevznikají v leukemických kmenových buňkách ale až ve vyzrálejších progenitorech, které jsou následkem TKI eliminované. Zatímco mutace v leukemických kmenových buňkách rezistentních na terapii mohou přetrvávat. Objasnění může přinést analýza mutací BCR-ABL1 a jiných genů v hierarchicky roztříděných populacích progenitorů a kmenových buněk v době diagnózy a na začátku terapie. Předpokládané výsledky objasní, zda mutace v kmenových buňkách mají větší předpoklad přežít TKI léčbu a vést k selhání.

• MeSH
• bcr-abl fúzové proteiny genetika   MeSH
• chronická myeloidní leukemie genetika   MeSH
• genetické techniky MeSH
• inhibitory tyrosinkinasy MeSH
• kmenové buňky patologie   MeSH
• lidé MeSH
• mutace genetika   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• genetika, lékařská genetika
• onkologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

There is an emerging body of evidence that patients with chronic myeloid leukaemia (CML) may carry not only breakpoint cluster region-Abelson murine leukaemia viral oncogene homologue 1 (BCR-ABL1) kinase domain mutations (BCR-ABL1 KD mutations), but also mutations in other genes. Their occurrence is highest during progression or at failure, but their impact at diagnosis is unclear. In the present study, we prospectively screened for mutations in 18 myeloid neoplasm-associated genes and BCR-ABL1 KD in the following populations: bulk leucocytes, CD34+ CD38+ progenitors and CD34+ CD38- stem cells, at diagnosis and early follow-up. In our cohort of chronic phase CML patients, nine of 49 patients harboured somatic mutations in the following genes: six ASXL1 mutations, one SETBP1, one TP53, one JAK2, but no BCR-ABL1 KD mutations. In seven of the nine patients, mutations were detected in multiple hierarchical populations including bulk leucocytes at diagnosis. The mutation dynamics reflected the BCR-ABL1 transcript decline induced by treatment in eight of the nine cases, suggesting that mutations were acquired in the Philadelphia chromosome (Ph)-positive clone. In one patient, the JAK2 V617F mutation correlated with a concomitant Ph-negative myeloproliferative neoplasm and persisted despite a 5-log reduction of the BCR-ABL1 transcript. Only two of the nine patients with mutations failed first-line therapy. No correlation was found between the mutation status and survival or response outcomes.

• MeSH
• bcr-abl fúzové proteiny genetika   MeSH
• chronická myeloidní leukemie diagnóza   genetika   terapie   MeSH
• lidé MeSH
• mutace MeSH
• následné studie MeSH
• prognóza MeSH
• prospektivní studie MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

The occurrence of mutations in the BCR-ABL1 kinase domain (KD) can lead to treatment resistance in chronic myeloid leukaemia patients. Nowadays, next-generation sequencing (NGS) is an alternative method for the detection of kinase domain mutations, compared to routinely used Sanger sequencing, providing a higher sensitivity of mutation detection. However, in the protocols established so far multiple rounds of amplification limit reliable mutation detection to approximately 5% variant allele frequency. Here, we present a simplified, one-round amplification NGS protocol for the Illumina platform, which offers a robust early detection of BCR-ABL1 KD mutations with a reliable detection limit of 3% variant allele frequency.

• MeSH
• bcr-abl fúzové proteiny genetika   MeSH
• chronická myeloidní leukemie genetika   MeSH
• lidé MeSH
• mutace MeSH
• vysoce účinné nukleotidové sekvenování metody   MeSH
• zdraví dobrovolníci pro lékařské studie MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

• MeSH
• antitumorózní látky škodlivé účinky   MeSH
• antropometrie MeSH
• chronická myeloidní leukemie farmakoterapie   MeSH
• dasatinib škodlivé účinky   MeSH
• hyperinzulinismus chemicky indukované   patofyziologie   MeSH
• imatinib mesylát škodlivé účinky   MeSH
• inhibitory proteinkinas škodlivé účinky   MeSH
• inzulin krev   MeSH
• inzulinová rezistence * MeSH
• lidé MeSH
• porucha glukózové tolerance chemicky indukované   patofyziologie   MeSH
• prospektivní studie MeSH
• pyrimidiny škodlivé účinky   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• dopisy MeSH
• multicentrická studie MeSH
• práce podpořená grantem MeSH