During the microbiological research performed within the scope of activities of Czech expeditions based at the Johann Gregor Mendel Station at James Ross Island, Antarctica, two psychrotrophic gram-stain negative non-fluorescent strains CCM 8506T and CCM 8507 from soil were extensively characterized using genotypic and phenotypic methods. Initial characterization using ribotyping with HindIII restriction endonuclease and phenotyping implies that both isolates belong to a single Pseudomonas species. Sequencing of rrs, rpoB, rpoD and glnA genes of strain CCM 8506(T) confirmed affiliation of investigated strains within the genus Pseudomonas. Further investigation using automated ribotyping with EcoRI (RiboPrinter(®) Microbial Characterisation System), whole-cell protein profiling using the Agilent 2100 Bioanalyzer system, extensive biochemical testing and DNA-DNA hybridization experiments confirmed that both investigated strains are members of a single taxon which is clearly separated from all hitherto described Pseudomonas spp. Based on all findings, we describe a novel species Pseudomonas gregormendelii sp. nov. with the type strain CCM 8506(T) (=LMG 28632T).

• MeSH
• bakteriální proteiny genetika   metabolismus   MeSH
• DNA bakterií genetika   MeSH
• fylogeneze MeSH
• Pseudomonas klasifikace   genetika   izolace a purifikace   metabolismus   MeSH
• půdní mikrobiologie * MeSH
• ribozomální DNA genetika   MeSH
• RNA ribozomální 16S genetika   MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• Geografické názvy
• Antarktida MeSH

Despite the fact that chlorinated paraffins have been produced in relatively large amounts, and high concentrations have been found in sewage sludge applied to soils, there is little information on their concentrations in soils and the effect on soil organisms. The aim of this study was to investigate the toxicity of chlorinated paraffins in soils. The effects of short-chain chlorinated paraffins (64% chlorine content) on invertebrates (Eisenia fetida, Folsomia candida, Enchytraeus albidus, Enchytraeus crypticus, Caenorhabditis elegans) and substrate-induced respiration of indigenous microorganisms were studied. Differences were found in the sensitivity of the tested organisms to short-chain chlorinated paraffins. F. candida was identified as the most sensitive organism with LC(50) and EC(50) values of 5733 and 1230 mg/kg, respectively. Toxicity results were compared with available studies and the predicted no effect concentration (PNEC) of 5.28 mg/kg was estimated for the soil environment, based on our data.

• MeSH
• bezobratlí účinky léků   MeSH
• chlorované uhlovodíky chemie   toxicita   MeSH
• druhová specificita MeSH
• financování organizované MeSH
• hodnocení rizik MeSH
• látky znečišťující půdu chemie   toxicita   MeSH
• monitorování životního prostředí metody   MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• zvířata MeSH

Two Gram-positive, catalase-negative bacterial strains were isolated from the cloaca of common kingfishers (Alcedo atthis). Repetitive sequence-based PCR fingerprinting using the (GTG)5 primer grouped these isolates into a single cluster separated from all known enterococcal species. The two strains revealed identical 16S rRNA gene sequences placing them within the genus Enterococcus with Enterococcus aquimarinus LMG 16607(T) as the closest relative (97.14 % similarity). Further taxonomic investigation using sequencing of the genes for the superoxide dismutase (sodA), phenylalanyl-tRNA synthase alpha subunit (pheS) and the RNA polymerase alpha subunit (rpoA) as well as application of whole-cell protein fingerprinting, automated ribotyping and extensive phenotyping confirmed that both strains belong to the same species. Based on data from this polyphasic study, these strains represent a novel species of the genus Enterococcus, for which the name Enterococcus alcedinis sp. nov. is proposed. The type strain is L34(T) (= CCM 8433(T) = LMG 27164(T)).

• MeSH
• bakteriální geny MeSH
• DNA bakterií genetika   MeSH
• DNA řízené RNA-polymerasy genetika   MeSH
• Enterococcus klasifikace   genetika   izolace a purifikace   MeSH
• fenylalanin-tRNA-ligasa genetika   MeSH
• fylogeneze * MeSH
• molekulární sekvence - údaje MeSH
• peptidové mapování MeSH
• ptáci mikrobiologie   MeSH
• ribotypizace MeSH
• RNA ribozomální 16S genetika   MeSH
• sekvenční analýza DNA MeSH
• superoxiddismutasa genetika   MeSH
• techniky typizace bakterií MeSH
• zastoupení bazí MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• zvířata MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

V letošním roce byl popsán nový druh stafylokoka, Staphylococcus petrasii. Kmeny tohoto druhu se vyskytují v humánním klinickém materiálu a hrají zřejmě roli podmíněného patogena podobně jako řada dalších koagulázanegativních stafylokoků. Dosud byly nejspíše identifikovány jako atypické Staphylococcus warneri, s kterými jsou fenotypově nejbližší. Fylogeneticky jsou nejblíže k druhům Staphylococcus haemolyticus, Staphylococcus hominis, Staphylococccus devriesei a Staphylococccus lugdunensis.

A novel staphylococcal species, Staphylococcus petrasii, has recently been described. Strains of this species were isolated from human clinical specimens and are likely to be opportunistic pathogens, similarly to other coagulase- negative staphylococci. Previously, they may have been identified as atypical Staphylococcus werneri, to which they are phenotypically closest. Phylogenetically, they are closest to the species Staphylococcus haemolyticus, Staphylococcus hominis, Staphylococccus devriesei, and Staphylococccus lugdunensis.

• Klíčová slova
• koagulázanegativní stafylokoky, S. petrasii, taxonomie rodu Staphylococcus,
• MeSH
• fenotyp MeSH
• fylogeneze MeSH
• genotyp MeSH
• lidé MeSH
• Staphylococcus * izolace a purifikace   klasifikace   patogenita   růst a vývoj   účinky léků   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

Strain CCM 4446T, with notable biodegradation capabilities, was investigated in this study in order to elucidate its taxonomic position. Chemotaxonomic analyses of quinones, polar lipids, mycolic acids, polyamines and the diamino acid of the cell-wall peptidoglycan corresponded with characteristics of the genus Rhodococcus. Phylogenetic analysis, based on the 16S rRNA gene sequence, assigned strain CCM 4446T to the genus Rhodococcus and placed it in the Rhodococcus erythropolis 16S rRNA gene clade. Further analysis of catA and gyrB gene sequences, automated ribotyping with EcoRI restriction endonuclease, whole-cell protein profiling, DNA-DNA hybridization and extensive biotyping enabled differentiation of strain CCM 4446T from all phylogenetically closely related species, i.e., Rhodococcus baikonurensis, Rhodococcus qingshengii, Rhodococcus erythropolis and Rhodococcus globerulus. The results obtained show that the strain investigated represents a novel species within the genus Rhodococcus, for which the name Rhodococcus degradans sp. nov., is proposed. The type strain is CCM 4446T ( = LMG 28633T).

• MeSH
• bakteriální geny MeSH
• DNA bakterií genetika   MeSH
• fosfolipidy chemie   MeSH
• fylogeneze * MeSH
• hybridizace nukleových kyselin MeSH
• kyselina diaminopimelová chemie   MeSH
• kyseliny mykolové chemie   MeSH
• mastné kyseliny chemie   MeSH
• molekulární sekvence - údaje MeSH
• peptidoglykan chemie   MeSH
• polyaminy chemie   MeSH
• půdní mikrobiologie * MeSH
• Rhodococcus klasifikace   genetika   izolace a purifikace   MeSH
• ribotypizace MeSH
• RNA ribozomální 16S genetika   MeSH
• sekvenční analýza DNA MeSH
• techniky typizace bakterií MeSH
• vitamin K 2 chemie   MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• Geografické názvy
• Švýcarsko MeSH

Seven coagulase-negative, oxidase-negative and novobiocin-susceptible staphylococci assigned tentatively as Staphylococcus petrasii were investigated in this study in order to elucidate their taxonomic position. All strains were initially shown to form a genetically homogeneous group separated from remaining species of the genus Staphylococcus by using a repetitive sequence-based PCR fingerprinting with the (GTG)5 primer. Phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene, hsp60, rpoB, dnaJ, gap and tuf sequences showed that the group is closely related to Staphylococcus petrasii but separated from the three hitherto known subspecies, S. petrasii subsp. petrasii, S. petrasii subsp. croceilyticus and S. petrasii subsp. jettensis. Further investigation using automated ribotyping, MALDI-TOF mass spectrometry, fatty acid methyl ester analysis, DNA-DNA hybridization and extensive biotyping confirmed that the analysed group represents a novel subspecies within S. petrasii, for which the name Staphylococcus petrasii subsp. pragensis subsp. nov. is proposed. The type strain is NRL/St 12/356(T) ( = CCM 8529(T) = LMG 28327(T)).

• MeSH
• bakteriální geny MeSH
• chaperon hsp60 genetika   MeSH
• DNA bakterií genetika   MeSH
• fylogeneze * MeSH
• hybridizace nukleových kyselin MeSH
• lidé MeSH
• mastné kyseliny chemie   MeSH
• molekulární sekvence - údaje MeSH
• oxidoreduktasy genetika   MeSH
• ribotypizace MeSH
• RNA ribozomální 16S genetika   MeSH
• sekvenční analýza DNA MeSH
• spektrometrie hmotnostní - ionizace laserem za účasti matrice MeSH
• Staphylococcus klasifikace   genetika   izolace a purifikace   MeSH
• zastoupení bazí MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

Thirteen coagulase-negative, oxidase-negative, and novobiocin-susceptible staphylococci were isolated from human clinical specimens. The isolates were differentiated from known staphylococcal species on the basis of 16S rRNA, hsp60, rpoB, dnaJ, tuf, and gap gene sequencing, automated ribotyping, (GTG)5-PCR fingerprinting, and MALDI-TOF MS analysis. Phylogenetic analysis based on the 16S rRNA gene sequence indicated phylogenetic relatedness of the analyzed strains to Staphylococcus haemolyticus, Staphylococcus hominis, Staphylococcus devriesei, and Staphylococcus lugdunensis. DNA-DNA hybridization experiments between representative strains CCM 8418(T), CCM 8421(T), and the closest phylogenetic neighbors confirmed that the isolates represent novel Staphylococcus species, for which the name Staphylococcus petrasii sp. nov. is proposed. Genotypic and phenotypic analyses unambiguously split the strains into two closely related subclusters. Based on the results, two novel subspecies S. petrasii subsp. petrasii subsp. nov. and S. petrasii subsp. croceilyticus subsp. nov. are proposed, with type strains CCM 8418(T) (=CCUG 62727(T)) and CCM 8421(T) (=CCUG 62728(T)), respectively.

• MeSH
• antibakteriální látky metabolismus   MeSH
• bakteriální proteiny genetika   MeSH
• DNA bakterií chemie   genetika   MeSH
• fylogeneze MeSH
• hybridizace nukleových kyselin MeSH
• koagulasa metabolismus   MeSH
• lidé MeSH
• molekulární sekvence - údaje MeSH
• novobiocin metabolismus   MeSH
• oxidoreduktasy metabolismus   MeSH
• ribozomální DNA chemie   genetika   MeSH
• RNA ribozomální 16S genetika   MeSH
• sekvenční analýza DNA MeSH
• shluková analýza MeSH
• stafylokokové infekce mikrobiologie   MeSH
• Staphylococcus klasifikace   genetika   izolace a purifikace   metabolismus   MeSH
• techniky typizace bakterií MeSH
• ucho mikrobiologie   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

Černohlávek obecný (Prunella vulgaris L.) byl v minulosti používán především jako prostředek zmírňující bolesti v krku, horečky a urychlující hojení ran. Vysoký obsah kyseliny rozmarinové, imunomodulační účinky polysacharidu prunellinu a antivirová aktivita některých obsahových látek činí tuto rostlinu zajímavou z hlediska terapeutických aplikací. Článek shrnuje současné fytochemické poznatky o černohlávku a výsledky farmakologických studií extraktů a čistých látek této rostliny.

In the past, the self-heal (Prunella vulgaris L.) was primarily used as a remedy alleviating pains in the throat, fevers and accelerating wound healing. A high content of rosmgirinic acid, immunomodulatin effects of the polysaccharide prunelline and antiviral activity of some constituents make the plant interesting from the viewpoint of therapeutical applications. The paper summarizes the contemporary phytochemical knowledge about the self-heal and the results of pharmacological studies of the extracts and pure substances from this plant.

• MeSH
• biofarmacie dějiny   MeSH
• dějiny MeSH
• léčivé rostliny analýza   dějiny   chemie   MeSH
• tradiční lékařství metody   MeSH
• Publikační typ
• přehledy MeSH

Politická ekonomie je jediný český vědecký časopis z oblasti základního ekonomického výzkumu dokumentovaný v Social Science Citation Index. Uveřejňuje statě a analytické studie českých i zahraničních autorů, zaměřené na rozvíjení ekonomické teorie, hospodářské politiky, ekonometrie, na systémové komparace a modelování ekonomických procesů, na informace o aktuálních problémech a mezinárodním vědeckém životě

• MeSH
• ekonomika MeSH
• politika MeSH
• Publikační typ
• periodika MeSH

• Konspekt
• Ekonomie
• NLK Obory
• ekonomie, ekonomika, ekonomika zdravotnictví
• politologie, politika, zdravotní politika