• MeSH
• dítě MeSH
• dospělí MeSH
• gastroezofageální reflux chirurgie   MeSH
• kardie chirurgie   MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• nemoci jícnu chirurgie   MeSH
• senioři MeSH
• spasmus chirurgie   MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• senioři MeSH

• MeSH
• ezofágus chirurgie   patologie   MeSH
• gastroezofageální reflux etiologie   patologie   terapie   MeSH
• lidé MeSH
• terapie metody   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Publikační typ
• abstrakt z konference MeSH

• Publikační typ
• abstrakt z konference MeSH

• MeSH
• ezofágus chirurgie   patologie   MeSH
• lidé MeSH
• nádory jícnu etiologie   patologie   terapie   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• MeSH
• fraktury zubů terapie   MeSH
• lidé MeSH
• ortodontická extruze metody   přístrojové vybavení   MeSH
• prodloužení zubní korunky metody   přístrojové vybavení   MeSH
• zubní korunka (anatomie) zranění   MeSH
• zubní korunky využití   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• kazuistiky MeSH

• MeSH
• beta-laktamasy analýza   biosyntéza   MeSH
• dítě MeSH
• Escherichia coli enzymologie   izolace a purifikace   MeSH
• infekce vyvolané Escherichia coli mikrobiologie   MeSH
• lidé MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• lidé MeSH

• MeSH
• dítě MeSH
• dospělí MeSH
• jejunum chirurgie   MeSH
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• nádory jícnu chirurgie   MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• dospělí MeSH
• lidé MeSH
• mladiství MeSH

Motivation: The many thousands of high-quality genomes available now-a-days imply a shift from single genome to pan-genomic analyses. A basic algorithmic building brick for such a scenario is online search over a collection of similar texts, a problem with surprisingly few solutions presented so far. Results: We present SOPanG, a simple tool for exact pattern matching over an elastic-degenerate string, a recently proposed simplified model for the pan-genome. Thanks to bit-parallelism, it achieves pattern matching speeds above 400 MB/s, more than an order of magnitude higher than of other software. Availability and implementation: SOPanG is available for free from: https://github.com/MrAlexSee/sopang. Supplementary information: Supplementary data are available at Bioinformatics online.

• MeSH
• algoritmy MeSH
• genom * genetika   MeSH
• genomika * metody   MeSH
• internet MeSH
• software * normy   MeSH
• ukládání a vyhledávání informací MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

• MeSH
• jejunum chirurgie   MeSH
• lidé MeSH
• nádory jícnu chirurgie   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH