Východiska: Maligní lymfomy představují vysoce heterogenní skupinu nádorů s rozmanitým klinickým chováním – od indolentních až po velmi agresivní formy s přežitím v rámci měsíců. Tato onemocnění jsou od počátku považována za systémová, často se vyskytující na několika místech současně. Nicméně diagnóza a přesná klasifikace obvykle probíhá z biopsie jediné patologické uzliny či infiltrátu. Klinické zkušenosti přitom ukazují, že biologické chování lymfomu nemusí být v různých jeho lokalizacích zcela shodné. Ve snaze vyřešit tento problém, ale také zlepšit diagnostiku z obtížně dostupných kompartmentů, je poslední dobou intenzivně zkoumána tzv. volná cirkulující DNA (cfDNA), jejíž součástí je také DNA uvolněná z nádorových buněk – cirkulující nádorová DNA (ctDNA). Tuto DNA lze snadno získat z tekutých biopsií, jako je krev, případně jiné tělní tekutiny. Cíl: Tento článek shrnuje dosavadní poznatky o cfDNA a ctDNA, zejména pak právě v kontextu maligních lymfomů, a nastiňuje potenciální směry jejího budoucího praktického využití. Závěr: Detekce a analýza ctDNA představuje novou modalitu, která může v budoucnu vést ke zkvalitnění všech fází léčby maligních lymfomů od diagnostiky až po sledování tzv. minimální zbytkové choroby.

Background: Malignant lymphomas represent a highly heterogeneous group of tumors with varied clinical behavior – from indolent to very aggressive forms with survival in the order of months. From the very beginning, these diseases are considered systemic, often occurring in several anatomical locations simultaneously. However, diagnosis and exact classification are usually inferred from a biopsy of a single pathological lymph node or infiltrate, even though clinical experience shows that the biological behavior of lymphoma is not necessarily identical across anatomical locations. In an effort to address this issue as well as the problem of biopsy of not easily accessible compartments, circulating free DNA (cfDNA), which contains circulating tumor DNA (ctDNA) released from dead tumor cells, has been extensively studied in recent years. This DNA is easily accessible from liquid biopsies such as blood or other patient‘s bodily fluids. Purpose: This article summarizes current scientific knowledge on cfDNA and ctDNA, particularly in the context of malignant lymphoma, and foreshadows its potential future uses. Conclusion: Detection and analysis of cfDNA represents a new approach that can lead to future improvements in all phases of lymphoma treatment from diagnostics to minimal residual disease monitoring.

• MeSH
• cirkulující nádorová DNA analýza   MeSH
• difúzní velkobuněčný B-lymfom diagnóza   genetika   MeSH
• lidé MeSH
• lymfom diagnóza   genetika   klasifikace   MeSH
• progrese nemoci MeSH
• reziduální nádor diagnóza   genetika   MeSH
• tekutá biopsie metody   MeSH
• volné cirkulující nukleové kyseliny * analýza   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH
• přehledy MeSH

B-cell neoplasms represent a clinically heterogeneous group of hematologic malignancies with considerably diverse genomic architecture recently endorsed by next-generation sequencing (NGS) studies. Because multiple genetic defects have a potential or confirmed clinical impact, a tendency toward more comprehensive testing of diagnostic, prognostic, and predictive markers is desired. This study introduces the design, validation, and implementation of an integrative, custom-designed, capture-based NGS panel titled LYmphoid NeXt-generation sequencing (LYNX) for the analysis of standard and novel molecular markers in the most common lymphoid neoplasms (chronic lymphocytic leukemia, acute lymphoblastic leukemia, diffuse large B-cell lymphoma, follicular lymphoma, and mantle cell lymphoma). A single LYNX test provides the following: i) accurate detection of mutations in all coding exons and splice sites of 70 lymphoma-related genes with a sensitivity of 5% variant allele frequency, ii) reliable identification of large genome-wide (≥6 Mb) and recurrent chromosomal aberrations (≥300 kb) in at least 20% of the clonal cell fraction, iii) the assessment of immunoglobulin and T-cell receptor gene rearrangements, and iv) lymphoma-specific translocation detection. Dedicated bioinformatic pipelines were designed to detect all markers mentioned above. The LYNX panel represents a comprehensive, up-to-date tool suitable for routine testing of lymphoid neoplasms with research and clinical applicability. It allows a wide adoption of capture-based targeted NGS in clinical practice and personalized management of patients with lymphoproliferative diseases.

• MeSH
• chromozomální aberace MeSH
• diagnostické techniky molekulární MeSH
• genetická predispozice k nemoci * MeSH
• genetická variace MeSH
• genomika metody   MeSH
• lidé MeSH
• lymfoidní leukemie diagnóza   genetika   MeSH
• lymfom diagnóza   genetika   MeSH
• mutace INDEL MeSH
• nádorové biomarkery * MeSH
• prognóza MeSH
• translokace genetická MeSH
• variabilita počtu kopií segmentů DNA MeSH
• výpočetní biologie metody   MeSH
• vysoce účinné nukleotidové sekvenování * metody   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

Lymphoma involving CNS represents one of the most aggressive malignancies with poor prognosis and high mortality. Currently, their diagnosis suffers from low sensitivity and specificity. More powerful tools for early detection, response evaluation and CNS relapse risk prediction are urgently needed. Lymphomas overexpress short oncogenic regulatory RNAs called microRNAs that influence tumor growth and spreading. Unlike longer species, microRNAs are surprisingly stable and detectable in body fluids including cerebrospinal fluid (CSF). Proposed aim is to develop a method for sensitive and early detection and monitoring of CNS lymphoma, based on measurement of extracellular microRNAs in CSF and plasma that can serve as criteria for more effective early treatment or CNS prophylaxis. Our preliminary data indicate that we identified specific set of oncogenic microRNAs that can with high sensitivity and several months in advance identify CNS lymphoma involvement, reflects therapy efficiency or predict progression or relapse, thus substituting the weakness of current diagnostic methods.

Lymfomy centrální nervové soustavy (CNS) představují jednu z nejagresivnějších malignit, vyznačující se špatnou prognózou a krátkou dobou přežití. Jejich současná diagnóza je založena na metodách s nízkou citlivostí a specifičností, schopných zachytit až již rozvinutý a hůře léčitelný lymfom. MikroRNA jsou krátké nekódující, nádorově specifické RNA, regulující genovou expresi na post-transkripční úrovni, jejichž specifickou vlastností je vysoká stabilita v tělních tekutinách. Cílem návrhu je vyvinout metodu pro včasnou a citlivou detekci lymfomů CNS na základě měření extracelulární mikroRNA v mozkomíšním moku a plazmě, která by umožnila včasnou a tím efektivnější léčbu nebo CNS profylaxi. V laboratoři 1.LF UK jsme vyvinuli metodu stanovení mikroRNA v mozkomíšním moku a předběžné výsledky ukazují, že jsme identifikovali index specifických nádorových mikroRNA, schopný s vysokou senzitivitou a s několikaměsíčním předstihem detekovat lymfomové postižení CNS, předpovědět jeho progresi či relaps a odrážející účinnost léčby; nahrazující tak nedostatky současných diagnostických metod. ...

• MeSH
• časná detekce nádoru MeSH
• exprese genu MeSH
• krevní plazma MeSH
• lidé MeSH
• lymfom diagnóza   genetika   MeSH
• mikro RNA krev   mozkomíšní mok   MeSH
• mozkomíšní mok MeSH
• nemoci centrálního nervového systému diagnóza   genetika   MeSH
• recidiva MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• genetika, lékařská genetika
• neurologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

• MeSH
• biologické modely * MeSH
• imunoterapie * metody   MeSH
• individualizovaná medicína * metody   MeSH
• inhibitory proteinkinas * terapeutické užití   MeSH
• lidé MeSH
• lymfom * genetika   metabolismus   patologie   terapie   MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• zvířata MeSH
• Publikační typ
• přehledy MeSH

Cytogenomic investigations of haematological neoplasms, including chromosome banding analysis, fluorescence in situ hybridisation (FISH) and microarray analyses have become increasingly important in the clinical management of patients with haematological neoplasms. The widespread implementation of these techniques in genetic diagnostics has highlighted the need for guidance on the essential criteria to follow when providing cytogenomic testing, regardless of choice of methodology. These recommendations provide an updated, practical and easily available document that will assist laboratories in the choice of testing and methodology enabling them to operate within acceptable standards and maintain a quality service.

• MeSH
• akutní myeloidní leukemie genetika   MeSH
• chronická myeloidní leukemie MeSH
• hematologické nádory genetika   MeSH
• hybridizace in situ fluorescenční MeSH
• lidé MeSH
• lymfom genetika   MeSH
• mikročipová analýza MeSH
• mnohočetný myelom genetika   MeSH
• myelodysplastické syndromy MeSH
• pruhování chromozomů MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• přehledy MeSH

In this study, chromosomal imbalances in tumor tissues (lymphomas) and nucleotide changes in tumor suppressor TP53 were studied in a Bernese Mountain dog bitch and a cross breed bitch. Using comparative genomic hybridization, numerous chromosomal rearrangements were detected, which indicated the heterogeneity in tumor growth: in the cross breed bitch, a deletion on the chromosome 9, and duplications on chromosomes 5, 8 and 17 have been found. In the Bernese Mountain Dog bitch, losses on chromosomes 1, 5, 8, 12, 18, 22, 27, 29 and gains on chromosomes 1, 2, 9, 11, 15, 16, 18, 20, 23, 24, 25, 28, 29, 30, 34, 36, 37 and 38 were identified. With the sequencing of the TP53 gene, one silent mutation, transition A/G at position 138 in exon 5 was detected, without changing the amino acid.

• MeSH
• chromozomální aberace * MeSH
• chromozomy genetika   MeSH
• DNA genetika   MeSH
• exony genetika   MeSH
• genová přestavba genetika   MeSH
• geny p53 genetika   MeSH
• lymfom genetika   patologie   veterinární   MeSH
• mutace MeSH
• nemoci psů genetika   MeSH
• polymerázová řetězová reakce metody   MeSH
• psi MeSH
• sekvenční analýza DNA MeSH
• srovnávací genomová hybridizace metody   MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• psi MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• zvířata MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH

Sledování hladiny minimální reziduální nemoci (MRN) má obrovský význam pro pacienta a často rozhoduje o jeho dalším osudu. U pacientů s hematologickými malignitami je sledování MRN již součástí léčebných protokolů, nicméně se ukazuje, že sledování MRN, někdy vyjadřované také jako cirkulující nádorové buňky nebo minimální diseminovaná nemoc, má význam i u pacientů se solidními nádory. Principem molekulárního sledování MRN je najít na nádorové buňce marker na DNA, RNA nebo proteinové úrovni, kterým se bude lišit od normálních buněk kostní dřeně a/nebo periferní krve a který bude možno detekovat s vysokou specifitou a senzitivitou pomocí molekulárních metod. Rozvoj kvantitativních metod detekce MRN nám umožňuje i vyjádřit se k případnému úbytku či nárůstu MRN. V přehledu je pojednáno o jednotlivých molekulárních metodikách detekce MRN, jejich úskalích, výhodách, limitacích a nárocích na vstupní materiál a zpracování. Také je uveden přehled molekulárních markerů hematologických i nehematologických onemocnění. Klíčová slova: minimální reziduální nemoc – minimální diseminovaná nemoc – cirkulující nádorové buňky – PCR – kvantitativní PCR – Ig/TCR přestavby

Minimal residual disease (MRD) monitoring is of a great importance for the patients and often determines their future therapy. At present, MRD detection in patients suffering from hematologic malignancies is included in most of treatment protocols. However, it appears that the MRD detection, sometimes described as circulating tumor cells or minimal disseminated disease, is important in patients with solid tumors as well. Molecular MRD monitoring principles include detection of specific DNA, RNA or protein markers of tumour cells, which are not present in bone marrow and/or peripheral blood cells. High specificity and sensitivity of this specific molecular tumour marker is necessary. Quantitative MRD monitoring by means of molecular methods can determine the decrease or increase of MRD level. In this review, we describe different molecular methods used, an overview on their advantages, limitations, and the sample quality and processing requirements. A summary of molecular markers employed in hematological and non-hematological diseases is also presented. Keywords: minimal residual disease – minimal disseminated disease – circulating tumor cells – PCR – quantitative PCR – Ig/TCR rearrangement

• Klíčová slova
• minimální diseminovaná nemoc, Ig/TCR přestavby,
• MeSH
• buňky kostní dřeně patologie   MeSH
• DNA primery MeSH
• DNA genetika   MeSH
• genová přestavba T-lymfocytů genetika   MeSH
• geny TcR genetika   MeSH
• hematologické nádory diagnóza   genetika   patologie   MeSH
• imunofenotypizace MeSH
• krevní buňky patologie   MeSH
• kvantitativní polymerázová řetězová reakce metody   MeSH
• lidé MeSH
• lymfom diagnóza   genetika   MeSH
• nádorové biomarkery analýza   krev   MeSH
• nádorové cirkulující buňky * patologie   MeSH
• nádory * diagnóza   genetika   patologie   MeSH
• polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí MeSH
• polymerázová řetězová reakce metody   MeSH
• průtoková cytometrie MeSH
• reziduální nádor * diagnóza   genetika   patologie   MeSH
• RNA genetika   MeSH
• translokace genetická genetika   MeSH
• vyšetřování kostní dřeně metody   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH
• přehledy MeSH

Maligní lymfomy představují klinicky, biologicky a geneticky velmi pestrou skupinu neoplazií. Poslední dekáda navíc přinesla do moderní hemato-onkologie řadu nových biologicky aktivních léčiv, která rozšířila terapeutické možnosti a změnila osud nemocných. Éra personalizované medicíny klade na rozhodovací proces lékaře nové nároky. Kvalifikovaná předpověď osudu nemocných je nyní nezbytným nástrojem volby léčebné strategie. Prediktivní nástroje – tedy prognostické faktory, prodělaly ruku v ruce s vývojem terapie dramatický rozvoj. Původní klinická schémata a prognostické indexy postulovaná v éře před zavedením imunoterapie a intenzivních protokolů léčby mají v dnešní době limitovanou výpovědní schopnost. Nové prognostické faktory více reflektují povahu samotného nádoru, umožňují odhadnout efektivitu chemoimunoterapie a zohledňují imunitní interakci mezi nádorem a organismem pacienta. Použití moderních molekulárně-cytogenetických a imunohistochemických metod přináší mnoho důležitých přídatných prognostických informací. Cílem sdělení je poskytnout přehled současně používaných prediktivních nástrojů od klasických skórovacích systémů až po nové poznatky na poli cytogenetiky a imunogenomiky nádorů.

Malignant lymphomas represent a clinically, biologically and genetically varied group of neoplasms. Moreover, the last decade has provided modern haemato-oncology with numerous novel biologically active drugs that have extended therapeutic options and changed our patients' lives. The era of personalized medicine places new demands on physicians' decision-making processes. A confident prediction of the patient's outlook is now an indispensable tool for selecting treatment strategy. Predictive tools, or predictive factors, hand in hand with changes in therapy, have undergone dramatic development. Previous clinical schemes and prognostic indices postulated in the era prior to the introduction of immunotherapy and intensive treatment protocols have limited information value today. Novel prognostic factors are better at reflecting the nature of tumours themselves, allowing estimation of chemo-immunotherapy effectiveness and take into consideration the immune interaction between a tumour and the patient's organism. Modern molecular cytogenetic and immunohistochemical methods yield important additional prognostic information. The article aims at providing a review of currently used predictive tools, from traditional scores to novel findings in the field of tumour cytogenetics and immunogenomics.

• Klíčová slova
• imunogenomika, klinické prognostické faktory,
• MeSH
• antigeny CD20 imunologie   MeSH
• antigeny CD279 imunologie   MeSH
• cytogenetické vyšetření metody   MeSH
• cytogenetika MeSH
• difúzní velkobuněčný B-lymfom diagnóza   genetika   klasifikace   MeSH
• folikulární lymfom diagnóza   genetika   MeSH
• imunohistochemie metody   MeSH
• imunoterapie MeSH
• lidé MeSH
• lymfom z plášťových buněk diagnóza   genetika   MeSH
• lymfom * diagnóza   genetika   MeSH
• monoklonální protilátky terapeutické užití   MeSH
• nádorové biomarkery * analýza   genetika   imunologie   MeSH
• počet lymfocytů MeSH
• prognóza * MeSH
• proteiny regulující apoptózu imunologie   MeSH
• receptory Fc imunologie   MeSH
• rituximab MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH
• přehledy MeSH

Tumor necrosis factor-related apoptosis-inducing ligand (TRAIL) is a death ligand with selective antitumor activity. However, many primary tumors are TRAIL resistant. Previous studies reported that roscovitine, a cyclin-dependent kinase inhibitor, sensitized various solid cancer cells to TRAIL. We show that roscovitine and TRAIL demonstrate synergistic cytotoxicity in hematologic malignant cell lines and primary cells. Pretreatment of TRAIL-resistant leukemia cells with roscovitine induced enhanced cleavage of death-inducing signaling complex-bound proximal caspases after exposure to TRAIL. We observed increased levels of both pro- and antiapoptotic BCL-2 proteins at the mitochondria following exposure to roscovitine. These results suggest that roscovitine induces priming of cancer cells for death by binding antiapoptotic BCL-2 proteins to proapoptotic BH3-only proteins at the mitochondria, thereby decreasing the threshold for diverse proapoptotic stimuli. We propose that the mitochondrial priming and enhanced processing of apical caspases represent major molecular mechanisms of roscovitine-induced sensitization to TRAIL in leukemia/lymphoma cells.

• MeSH
• antitumorózní látky farmakologie   MeSH
• apoptóza účinky léků   MeSH
• cytotoxicita imunologická účinky léků   MeSH
• genetická transkripce účinky léků   MeSH
• leukemie genetika   metabolismus   patologie   MeSH
• lidé MeSH
• ligand Fas farmakologie   MeSH
• lymfom genetika   metabolismus   patologie   MeSH
• mitochondrie účinky léků   metabolismus   MeSH
• myši MeSH
• nádorové buněčné linie MeSH
• protein bcl-X metabolismus   MeSH
• protein TRAIL farmakologie   MeSH
• proteosyntéza účinky léků   MeSH
• protoonkogenní proteiny c-bcl-2 metabolismus   MeSH
• puriny farmakologie   MeSH
• signální adaptorové proteiny receptorové domény smrti metabolismus   MeSH
• TNF-alfa farmakologie   MeSH
• tumor burden účinky léků   MeSH
• xenogenní modely - testy antitumorózní aktivity MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• myši MeSH
• zvířata MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

• MeSH
• adjuvantní chemoterapie metody   MeSH
• analýza přežití MeSH
• B-lymfocyty cytologie   fyziologie   patologie   účinky léků   MeSH
• Burkittův lymfom diagnóza   genetika   mortalita   terapie   MeSH
• difúzní velkobuněčný B-lymfom diagnóza   farmakoterapie   genetika   klasifikace   terapie   MeSH
• lidé MeSH
• lymfom z plášťových buněk diagnóza   mortalita   terapie   MeSH
• lymfom * diagnóza   farmakoterapie   genetika   klasifikace   komplikace   terapie   MeSH
• nehodgkinský lymfom * diagnóza   farmakoterapie   klasifikace   komplikace   terapie   MeSH
• prognóza MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH