Cíle: Od prosince roku 2022 je pozorován v České republice zvýšený výskyt invazivního onemocnění způsobeného Streptococcus pyogenes s posunem klinické prezentace a věkové hranice postižených osob. Invazivní onemocnění se projevují ve srovnání s předchozími roky častěji u dětí do 18 let věku a dosud zdravých dospělých středního věku. Zvýšil se počet izolátů S. pyogenes získaných z primárně sterilních míst, jako je hemokultura, mozkomíšní mok, pleurální výpotek, kloubní punktát a sekční materiál. Rutinním stanovováním typu genu emm bylo zjištěno, že převažujícím emm typem S. pyogenes je emm1. V období od ledna 2023 do července 2023 46 % všech izolátů S. pyogenes z invazivních onemocnění odpovídalo typu emm1. Globálně rozšířená sublinie M1UK je charakterizována ve srovnání s historickými kmeny iGAS typu emm1 odlišnou expresí sedmi genů, mezi které patří i gen streptokokového pyrogenního toxinu A (speA). Cílem studie je stanovit, zda ve větší míře toxigenní sublinie M1UK je spojena se zvýšeným výskytem invazivního onemocnění v České republice. Metody: Celogenomová sekvenace 41 izolátů S. pyogenes izolovaných v České republice v letech 2018 a 2019 a od prosince 2022 do května 2023 od pacientů s invazivním onemocněním byla provedena přístrojem MiSeq (Illumina). Bioinformatická analýza byla provedena volně dostupnými online nástroji Bacterial and Viral Bioinformatics Resource Center. Výsledky: Na základě dat celogenomové sekvenace 41 izolátů S. pyogenes typu emm1 izolovaných od pacientů s invazivním infekčním onemocněním v období let 2018 a 2019 a od prosince 2022 do května 2023 bylo zjištěno, že mezi invazivními kmeny S. pyogenes typu emm1 převládá od prosince 2022 do května 2023 v České republice sublinie M1UK. Závěr: Důvod rozšíření sublinie M1UK v České republice na konci roku 2022 a v první polovině roku 2023 není zcela zřejmý, ale může být spojen se sníženou imunitou v souvislosti s omezeným přenosem GAS během lockdownů, zvláště u dětí. Dalším faktorem, který mohl přispět k vysokému výskytu invazivních infekčních onemocnění, je sezonní cirkulace respiračních virů.
Aims: Since December 2022, an increase in invasive disease caused by Streptococcus pyogenes has been observed in the Czech Republic, with a shift in the clinical presentation and age of patients. Unlike in previous years, invasive disease is more common in children and adolescents under 18 years of age and in previously healthy middle-aged adults. An increase has been noticed in the number of S. pyogenes isolates from primarily sterile sites such as haemoculture, cerebrospinal fluid, pleural effusion fluid, joint fluid, and postmortem specimens. Routine emm gene typing revealed emm1 to be the predominant emm type of S. pyogenes. Between January 2023 and July 2023, 46% of all S. pyogenes isolates from invasive cases were assigned to the emm1 type. The globally spread M1UK sublineage is characterized by differences in the expression of seven genes, including the streptococcal pyrogenic toxin A (speA) gene, compared to historical emm1 iGAS strains. The aim of this study is to determine whether the more toxigenic M1UK sublineage is associated with the increase in invasive disease in the Czech Republic. Methods: Whole genome sequencing of 41 S. pyogenes isolates from patients with invasive disease recovered in the Czech Republic in 2018 and 2019 and from December 2022 to May 2023 was performed using the MiSeq instrument (Illumina). Bioinformatics analysis was performed using freely available online tools the Bacterial and Viral Bioinformatics Resource Center. Results: Based on whole genome sequencing data of 41 emm1 isolates of S. pyogenes from patients with invasive infectious disease recovered in 2018 and 2019 and from December 2022 to May 2023, the M1UK sublineage was found to be predominant from December 2022 to May 2023. Conclusion: The reason for the spread of the M1UK sublineage in the Czech Republic late in 2022 and in the first half of 2023 is not entirely clear, but it may be related to reduced immunity due to limited GAS transmission during lockdowns, especially in children. Another factor that may have contributed to the high incidence of invasive infectious diseases is the seasonal circulation of respiratory viruses.
- MeSH
- antigeny bakteriální MeSH
- bakteriální proteiny genetika izolace a purifikace MeSH
- exotoxiny MeSH
- lidé MeSH
- proteiny vnější bakteriální membrány genetika MeSH
- sekvenování celého genomu MeSH
- Streptococcus pyogenes genetika izolace a purifikace MeSH
- streptokokové infekce * epidemiologie mikrobiologie MeSH
- superantigeny MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Streptococcus pyogenes způsobuje rozličná lidská onemocnění od nekomplikovaných infekcí dýchacích cest a kůže až po vážná invazivní onemocnění, která mohou být doprovázena syndromem toxického šoku. Významnými faktory virulence vedle M proteinu kódovaného genem emm jsou pyrogenní exotoxiny, které se považují za superantigeny. V Národní referenční laboratoři pro streptokokové nákazy byly nově zavedeny bioinformatické nástroje pro zpracování dat z celogenomové sekvenace S. pyogenes. Použitím programu SRST2 a platformy BV-BRC byla analyzována WGS data 10 kmenů S. pyogenes izolovaných od pacientů s invazivním onemocněním a byly stanoveny emm typy, sekvenční typy a profily genů kódujících superantigeny. K sestavení sekvencí genomů z krátkých čtení byla zvolena assembly pipeline Unicycler s de novo assemblerem SPAdes.
Streptococcus pyogenes causes a variety of human diseases ranging from uncomplicated respiratory tract and skin infections to severe invasive diseases possibly involving toxic shock syndrome. Besides the emm gene-encoded M protein, important virulence factors are pyrogenic exotoxins, referred to as superantigens. The National Reference Laboratory for Streptococcal Infections has newly introduced bioinformatics tools for processing S. pyogenes whole genome sequencing data. Using the SRST2 software and BV-BRC platform, WGS data of 10 S. pyogenes isolates from patients with invasive disease were analysed, and emm type, sequence type, and superantigen encoding gene profiles were determined. The Unicycler assembly pipeline with the SPAdes de novo assembler was used to assemble genome sequences from short reads.
- MeSH
- klinická studie jako téma MeSH
- klinické laboratorní techniky metody MeSH
- lidé MeSH
- sekvenování celého genomu metody MeSH
- Streptococcus pyogenes genetika izolace a purifikace patogenita MeSH
- superantigeny * analýza genetika izolace a purifikace klasifikace MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- přehledy MeSH
The aim of the present study was to investigate the relaxatory function of adenosine receptor subtypes in rat urinary bladder, and if it is altered in the state of inflammation. The in vitro responses to the P1 receptor agonist adenosine were investigated in the presence of the general P2 receptor antagonist pyridoxal-phosphate-6-azophenyl-2',4'-disulfonic acid (PPADS; 1*10(-4)M). Experiments were performed on preparations from normal (healthy) rats and rats with cyclophosphamide (CYP; 100mg kg(-1) i. p.)-induced cystitis. The specific P1A(1) antagonist 1,3-dipropyl-8-cyclopentylxanthine (DPCPX; 1*10(-5)M) decreased the adenosine relaxatory response in normal bladders (-60%), but not in preparations from CYP pre-treated rats. Immunohistochemical findings support the hypothesis that the expression of P1A(1) receptors in the rat urinary bladder is decreased during cystitis. The adenosine-evoked relaxation was not affected by the specific P1A(2A) antagonist SCH 58261 (3*10(-7)M), neither in normal nor in CYP pre-treated rats. The relaxation to adenosine was, however, significantly increased by the specific P1A(3) antagonist MRS 1523 (1*10(-5)M) in preparations from both normal and CYP pre-treated rats, suggesting P1A(3) to be mediating bladder contraction. Thus, in the rat urinary bladder the relaxation to adenosine is mainly due to the P1A(1) receptor, while the P1A(3) receptor seems to be responsible for contractile responses. The DPCPX-resistant part of the relaxation is possibly due to the P1A(2B) receptor, the fourth subtype of the adenosine receptor family.
- MeSH
- adenosin farmakologie fyziologie MeSH
- agonisté purinergních receptorů P1 farmakologie MeSH
- antagonisté purinergního receptoru P1 farmakologie MeSH
- antagonisté purinergního receptoru P2 farmakologie MeSH
- cystitida metabolismus patofyziologie MeSH
- hladké svalstvo účinky léků metabolismus patofyziologie MeSH
- krysa rodu rattus MeSH
- léková rezistence účinky léků fyziologie MeSH
- mediátory zánětu fyziologie MeSH
- močový měchýř účinky léků metabolismus fyziologie MeSH
- modely nemocí na zvířatech MeSH
- potkani Sprague-Dawley MeSH
- receptor adenosinový A1 fyziologie MeSH
- svalová kontrakce účinky léků fyziologie MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- krysa rodu rattus MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
Závěrečná zpráva o řešení grantu Interní grantové agentury MZ ČR
59 l. : il. ; 32 cm
Mezi klinickými izoláty S.pyogenes budou vyhledávány invazivní klony charakterizované invazivním restrikčním profilem(přítomnost T12-like DNA, genu pro erytrogenní toxin typu A),serotypem M1 nebo M3 a schopností vstoupit do epiteliálních buněk. XXX XXX XXX
- Konspekt
- Buněčná biologie. Cytologie
- NLK Obory
- mikrobiologie, lékařská mikrobiologie
- parazitologie
- infekční lékařství
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR