In the last decade, undiagnosed disease programs have emerged to address the significant number of individuals with suspected but undiagnosed rare genetic diseases. In our single-center study, we have launched a pilot program for pediatric patients with undiagnosed diseases in the second-largest university hospital in the Czech Republic. This study was prospectively conducted at the Department of Pediatrics at University Hospital Brno between 2020 and 2023. A total of 58 Czech patients with undiagnosed diseases were enrolled in the study. All children underwent singleton WES with targeted phenotype-driven analysis. We identified 28 variants, including 11 pathogenic, 13 likely pathogenic, and 4 VUS according to ACMG guidelines, as diagnostic of genetic diseases in 25 patients, resulting in an overall diagnostic yield of 43%. Eleven variants were novel and had not been previously reported in any public database. The overall clinical utility (actionability) enabling at least one type of change in the medical care of the patient was 76%, whereas the average number of clinical implications to individual patient care was two. Singleton WES facilitated the diagnostic process in the Czech undiagnosed pediatric population. We believe it is an effective approach to enable appropriate counseling, surveillance, and personalized clinical management.
- MeSH
- dítě MeSH
- genetické testování metody MeSH
- kojenec MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- nediagnostikované nemoci * genetika diagnóza epidemiologie MeSH
- novorozenec MeSH
- předškolní dítě MeSH
- prospektivní studie MeSH
- sekvenování exomu * metody MeSH
- vzácné nemoci * genetika diagnóza MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- kojenec MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- novorozenec MeSH
- předškolní dítě MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Úvod: Koronavirus typu 2, jako původce těžkého akutního respiračního syndromu (SARS-CoV-2) zapříčinil celosvětovou pandemii onemocnění COVID-19, která vypukla již koncem roku 2019. Virus postihuje různé orgány, vč. nervového systému. Tato studie zkoumá neurologické komplikace u dětí s COVID-19 nebo multisystem inflammatory syndrome in children (MIS-C) v Jihomoravském kraji (ČR), kde vysoká četnost infekce COVID-19 u dětí (35 790/100 000) umožňuje komplexní analýzu. Metodika: Data Fakultní nemocnice Brno (březen 2020 až únor 2022) byla analyzována pro dvě skupiny hospitalizovaných dětí s diagnózou COVID-19 nebo MIS-C: jednu s neurologickými komplikacemi a druhou bez neurologických komplikací. Analýza zahrnovala demografické údaje, důvod přijetí, tíži infekce a její vývoj, objektivní neurologický nález, detaily hospitalizace, přítomnost MIS-C a specifikaci terapeutických postupů. K posouzení jednotlivých faktorů ovlivňujících výskyt neurologických komplikací v rámci těchto skupin byly použity metody deskriptivní statistiky a statistické testy. Výsledky: Ze 420 hospitalizovaných dětí s COVID-19 nebo MIS-C mělo 26 (6,2 %) neurologické komplikace. Dřívější neurologický deficit zvyšoval pravděpodobnost horšího výsledného stavu (p = 0,0224). Mezi skupinami se objevily významné rozdíly v délce hospitalizace (p = 0,0012), závažnosti průběhu infekce (p = 0,0052) a výsledném stavu (p < 0,0001). Závěr: Pro lepší pochopení průběhu onemocnění a minimalizaci komplikací po infekci je zásadní průběžné sledování a další výzkum neurologických projevů u dětí s COVID-19 nebo MIS-C.
Introduction: Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) has caused the enduring global COVID-19 pandemic, which has already begun in late 2019. The virus affects various organs, including the nervous system. This study investigates neurological complications in children with COVID-19 or multisystem inflammatory syndrome in children (MIS-C) in the South Moravia region (Czech republic), where a high COVID-19 rate among children (35.790/100.000) allows for a comprehensive analysis. Methods: Data from the University Hospital Brno (from March 2020 to February 2022) were analyzed to study two groups of hospitalized children diagnosed with COVID-19 or MIS-C: one experiencing neurological complications, and the other without neurological symptoms. The analysis included demographics, admission reasons, infection severity and progression, objective neurological findings, hospitalization details, MIS-C presence and therapies used. Descriptive statistics and statistical testing were employed to assess how individual factors influenced neurological complication rates within these groups. Results: Among 420 hospitalized children with COVID-19 or MIS-C, 26 (6.2%) had neurological complications. Preexisting neurological deficits increased the likelihood of worse outcomes (P = 0.0224). Significant differences in hospitalization length (P = 0.0012), infection severity (P = 0.0052), and outcome (P < 0.0001) occurred between groups. Conclusion: Continuous monitoring and further research on neurological complications in children with COVID-19 or MIS-C are crucial for better understanding of the course of the disease and minimize complications after infection.
- MeSH
- diagnostické zobrazování MeSH
- hemisferektomie metody MeSH
- levetiracetam terapeutické užití MeSH
- lidé MeSH
- myoklonus diagnóza etiologie MeSH
- novorozenec MeSH
- periventrikulární leukomalacie diagnostické zobrazování diagnóza MeSH
- refrakterní epilepsie * chirurgie diagnóza MeSH
- topiramat terapeutické užití MeSH
- výsledek terapie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- novorozenec MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
Background: The proportion of intensive care unit (ICU) admissions in children that have and have not been directly caused by SARS-CoV-2 remains unclear. The aim of the study is to analyse a cohort of children admitted to the ICU with SARS-CoV-2 and determine whether the infection was the primary cause of their hospitalisation, a significant contributor, a suspected accomplice, or an incidental finding. Methods: This was a retrospective observational study of all the children admitted to the ICU with SARS-CoV-2 from March 2020 to February 2022 from the South Moravia region. The aim of the study was to assess whether the hospitalisation was likely to be directly caused by the virus (i.e., patients with acute COVID-19; the COVID group), whether the virus was a significant contributor to the hospitalisation (i.e., patients with multisystem inflammatory syndrome in children due to COVID-19; the MIS-C group), whether it may have contributed to the worsening of their underlying disease (the WORSENING group), or whether it was an incidental finding very likely unrelated to hospitalisation where SARS-CoV-2 positivity merely placed patients in the COVID-19 unit (the ISOLATION group). The groups were compared using a series of secondary outcomes. Results: The study population represented 150 paediatric ICU cases (age 8.6; IQR 3.5−13.3 years), with 66.7% being male. The COVID group represented 32.7% of cases (49/150); MIS-C, 30% (45/150); WORSENING, 14.7% (22/150); and ISOLATION, 22.7% (34/150). The median length of hospitalisation was found for the MIS-C group (11 days; 9 days in the ICU), the COVID group (6 days; five days in the ICU), WORSENING group (4.5 days; 4.5 days in the ICU) and the ISOLATION group (5.5 days; 3.5 days in the ICU), where the difference was significant (p < 0.001). Asymptomatic and mild cases were most common in the WORSENING (36.4% and 63.6%) and ISOLATION (52.9% and 44.1%) groups. Severe and critical cases were only present in the COVID (6.1% and 12.2%) and MIS-C (4.4% and 11.1%) groups; the severity difference was significant (p < 0.001). The groups did not differ significantly in the proportion of complete recovery and short- and long-term sequelae (p = 0.09). Conclusions: Patients with acute COVID-19 accounted for one-third of all ICU admissions, patients with MIS-C accounted for approximately another third, patients with worsening underlying disease accounted for 15%, and patients with incidental findings of SARS-CoV-2 positivity accounted for one-fifth of ICU admissions. A more significant disease was seen with acute COVID-19 and MIS-C.
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
Dravet’s syndrome – previously known as severe myoclonic epilepsy in infancy, is classifi ed as epilepsy on a genetic basis (1). 70–80 % of the patients with the Dravet’s syndrome phenotype are associated with the detection of a sequence variant in the SCN1A gene (alpha 1 subunit of the voltage-gated sodium channel) (2). However, sequence variants in the SCN1A gene are associated with a very broad clinical spectrum, from asymptomatic carriers to the severe myoclonic epilepsy phenotype with severe disease (3). In the presented work, we retrospectively evaluated a group of 6 patients of the Department of Pediatric Neurology of the Medical Faculty of Masaryk University and the University Hospital in Brno with a proven missense mutation. Based on the specifi c pathogenic sequence variant, we correlated the patient’s phenotype with the location of the sequence variant in the SCN1A gene. The aim of the analysis was to verify the extent, to which the storage of a pathogenic sequence variant in the SCN1A gene corresponds to the clinical picture of the patient (Tab. 2, Fig. 2, Ref. 10).
- MeSH
- dítě MeSH
- epilepsie myoklonické * genetika patofyziologie MeSH
- fenotyp MeSH
- lidé MeSH
- mutace MeSH
- napětím řízený sodíkový kanál, typ 1 * fyziologie genetika MeSH
- retrospektivní studie MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- klinická studie MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Zánětlivé procesy v mozku jsou součástí patofyziologického mechanismu, který se podílí na procesu epileptogeneze, spouštění záchvatové aktivity a rozvoji farmakorezistence. V průběhu rekurentních záchvatů nebo status epilepticus selhává endogenní protizánětlivá odpověď a dochází k rozvoji zánětu, který může hrát zásadní roli v udržování záchvatové aktivity a pokračování záchvatů. Vztah zánětu a epilepsie je tedy reciproční. Antikonvulzivní efekt kortikoidů a ACTH je částečně zprostředkován jejich protizánětlivými vlastnostmi. Díky svému komplexnímu účinku dosáhly v epileptologii širokého uplatnění jak v rámci chronické léčby farmakorezistentní epilepsie, tak jako součást akutního managementu nově vzniklého refrakterního epileptického statu.
The inflammatory processes in the brain are a part of the pathophysiological mechanism; involved in epileptogenesis, an onset of seizure activity and the development of drug resistance. The endogenous anti-inflammatory response fails, and the inflammation develops during recurrent seizures or status epilepticus. Thus, it plays a crucial role in the retaining seizure activity and the continuing seizures. A relation between inflammation and epilepsy is, therefore, reciprocal. Corticoids and ACTH partly mediate the anticonvulsant effect by their anti-inflammatory characteristics. The corticosteroids have achieved a wide range of use in epileptology, both in the chronic treatment of drug-resistant epilepsy and as a part of acute management of new-onset refractory status epilepticus, thanks to their complex effect.
- MeSH
- epilepsie * etiologie farmakoterapie MeSH
- hormony kůry nadledvin * farmakologie škodlivé účinky terapeutické užití MeSH
- lidé MeSH
- zánět farmakoterapie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
This work presents a case series of four children diagnosed with severe cerebrovascular disease in association with recent severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) infection, yet no patient from the group met typical diagnostic criteria for multisystem inflammatory syndrome in children. Our aim was to highlight the possible vascular involvement and coagulopathies associated with SARS-CoV-2 infection in the pediatric population. Further data are needed to better understand the pathophysiological basis of this condition in children and to ensure its optimal management.
- MeSH
- COVID-19 * komplikace MeSH
- dítě MeSH
- lidé MeSH
- SARS-CoV-2 MeSH
- syndrom systémové zánětlivé reakce MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
AIM: The primary goal was to determine the yield of next-generation sequencing (NGS) epilepsy gene panels used for epilepsy etiology diagnosing using a multidisciplinary approach and to demonstrate the importance of genotype-phenotype correlations. The secondary goal was to evaluate the application of precision medicine in selected patients. METHODS: This single-center retrospective study included a total of 175 patients (95 males and 80 females) aged 0-19 years. They were examined between 2015 and 2020 using an NGS epilepsy gene panel (270 genes). A bioinformatic analysis was performed including copy number variation identification. Thorough genotype-phenotype correlation was performed. RESULTS: Out of 175 patients, described pathogenic variants or novel variants with clear pathogenic impact were identified in 30 patients (17.14%). Genotype-phenotype correlations and parental DNA analysis were performed, and genetic diagnosis was confirmed on the basis of the results in another 16 out of 175 patients (9.14%). The diagnostic yield of our study increased from 30 to 46 patients (by 53.33%) by the precise genotype-phenotype correlation. INTERPRETATION: We emphasize a complex genotype-phenotype correlation and a multidisciplinary approach in evaluating the results of the NGS epilepsy gene panel, which enables the most accurate genetic diagnosis and correct interpretation of results.
- MeSH
- epilepsie * diagnóza genetika MeSH
- fenotyp MeSH
- genetické asociační studie MeSH
- genetické testování metody MeSH
- lidé MeSH
- mutace MeSH
- retrospektivní studie MeSH
- variabilita počtu kopií segmentů DNA * MeSH
- vysoce účinné nukleotidové sekvenování metody MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
Novorozenecké období představuje nejvulnerabilnější periodu pro rozvoj epileptických paroxysmů. Zásadním predisponujícím faktorem je zvýšená neuronální excitabilita plynoucí z nedokončené maturace nezralého mozku. Z tohoto pohledu jsou nejrizikovější skupinou pro vznik novorozeneckých záchvatů nedonošení novorozenci. Včasné zahájení racionálních diagnosticko-terapeutických intervencí mnohdy komplikuje vágní až absentní klinická manifestace novorozeneckých záchvatů. Variabilitu jejich klinického obrazu reflektuje nová klasifikace novorozeneckých záchvatů dle Mezinárodní ligy proti epilepsii (International League Against Epilepsy; ILAE) z roku 2018. Včasné stanovení diagnózy a zahájení adekvátní terapie s ohledem na etiologii je z prognostického hlediska stěžejní. Nejsilnějším prognostickým prediktorem je etiologie, dále pak gestační stáří, vstupní nález při neurologickém vyšetření a EEG iktální a interiktální charakteristiky.
The newborn period poses the most vulnerable time in the development of epileptic seizures. The main predisposing factor is an increased neuronal excitability resulting from the incomplete maturation of a premature brain. From this point of view, premature newborns are at the highest risk of developing neonatal seizures. Early initiation of rational diagnostic and therapeutic intervention is often complicated by the vague or absent clinical manifestation of neonatal seizures. The variability of their clinical picture is reflected in the new draft of Neonatal Seizure Classification by International League Against Epilepsy (ILAE) from 2018. Timely diagnosis and initiation of adequate therapy with regard to etiology is, from the prognosis viewpoint, crucial. The strongest predictor of prognosis is etiology, as well as gestational age, initial findings during the neurological examination and ictal and interictal electroencephalographic features.
- Klíčová slova
- novorozenecké záchvaty,
- MeSH
- antikonvulziva aplikace a dávkování toxicita MeSH
- epilepsie benigní neonatální MeSH
- křeče u dětí diagnostické zobrazování patofyziologie terapie MeSH
- lidé MeSH
- mozek fyziologie patofyziologie růst a vývoj MeSH
- nemoci novorozenců * diagnostické zobrazování patofyziologie terapie MeSH
- novorozenec MeSH
- prognóza MeSH
- záchvaty * diagnostické zobrazování klasifikace terapie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- novorozenec MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- přehledy MeSH
