Wilms' tumor gene 1 (WT1) functions including some contradictory effects may be explained by the presence and interactions of its isoforms, however, their evaluation has been so far complicated by several technical problems. We designed unique quantitative PCR systems for direct quantification of the major WT1 isoforms A[EX5-/KTS-], B[+/-], C[-/+] and D[+/+] and verified their sensitivity, specificity and reproducibility in extensive testing. With this method we evaluated WT1 total and isoform expression in 23 normal bone marrow (BM) samples, 73 childhood acute myeloid leukemia (AML), 20 childhood myelodysplastic syndrome (MDS), 9 childhood severe aplastic anemia (SAA), 30 adult AML and 29 adult MDS patients. WT1 isoform patterns showed differences among these samples and clustered them into groups representing the specific diagnoses (P<0.0001). Isoform profiles were independent of total WT1 expression and possess certain common features-overexpression of isoform D and EX5[+] variants. The KTS[+]/KTS[-] ratio was less variable than the EX5[+]/EX5[-] ratio and differed between children and adults (P<0.001); the EX5[+]/EX5[-] ratio varied between diagnoses (AML vs MDS, P<0.001). These findings bring new insights into WT1 isoform function and suggest that the ratio of WT1 isoforms, particularly EX5 variants, is probably crucial for the process of malignant transformation.
- MeSH
- akutní myeloidní leukemie genetika MeSH
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- kojenec MeSH
- kvantitativní polymerázová řetězová reakce MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- messenger RNA genetika MeSH
- mladiství MeSH
- mladý dospělý MeSH
- nádorové buňky kultivované MeSH
- novorozenec MeSH
- předškolní dítě MeSH
- protein - isoformy MeSH
- proteiny WT1 genetika MeSH
- senioři MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- kojenec MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- mladý dospělý MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- novorozenec MeSH
- předškolní dítě MeSH
- senioři MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- MeSH
- endopeptidasy metabolismus MeSH
- finanční podpora výzkumu jako téma MeSH
- kostní morfogenetické proteiny metabolismus MeSH
- missense mutace genetika MeSH
- nádory genetika metabolismus MeSH
- proteiny metabolismus MeSH
- protoonkogenní proteiny genetika metabolismus MeSH
- signální transdukce MeSH
- transformující růstový faktor beta agonisté genetika MeSH
- ubikvitin metabolismus MeSH
- ubikvitinligasy metabolismus MeSH
- MeSH
- autologní transplantace MeSH
- finanční podpora výzkumu jako téma MeSH
- fotochemoterapie metody využití MeSH
- kultivované buňky MeSH
- kyselina aminolevulová terapeutické užití MeSH
- leukemie terapie MeSH
- lidé MeSH
- nádorové cirkulující buňky MeSH
- transplantace kostní dřeně MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
- srovnávací studie MeSH
- MeSH
- akutní erytroblastická leukemie genetika metabolismus patologie MeSH
- chromatin metabolismus MeSH
- hematopoetické kmenové buňky metabolismus patologie MeSH
- myši MeSH
- nádorové kmenové buňky metabolismus patologie MeSH
- nádorové proteiny biosyntéza genetika MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- myši MeSH
- zvířata MeSH
- MeSH
- chelátory železa fyziologie MeSH
- hematopoetické kmenové buňky enzymologie genetika MeSH
- messenger RNA analýza MeSH
- myši MeSH
- železo metabolismus MeSH
- Check Tag
- myši MeSH
- Publikační typ
- srovnávací studie MeSH
