Je předložena charakteristika současné klinické mikrobiologie a její role v moderní medicíně. Článek definuje hlavní cíle mikrobiologického vyšetření a zásady antibiotického i diagnostického stewardshipu. Hlavní důraz je kladen na správnou interpretaci mikrobiologických výsledků.
The characteristics of current clinical microbiology and its role in modern medicine are presented. The article defines the main objectives of microbiological examination, principles of antibiotic and diagnostic stewardship. The main emphasis is placed on the correct interpretation of microbiological results.
- MeSH
- antibakteriální látky * aplikace a dávkování farmakologie klasifikace terapeutické užití MeSH
- antibiotická politika metody MeSH
- antibiotická rezistence MeSH
- bakteriální infekce farmakoterapie MeSH
- cefalosporiny aplikace a dávkování terapeutické užití MeSH
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- lidé MeSH
- medikační omyly prevence a kontrola MeSH
- peniciliny aplikace a dávkování terapeutické užití MeSH
- racionální návrh léčiv MeSH
- spotřeba léčiv statistika a číselné údaje MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
x
x
- MeSH
- antibakteriální látky klasifikace MeSH
- antibiotická politika metody MeSH
- aplastická anemie etiologie prevence a kontrola MeSH
- chloramfenikol * aplikace a dávkování škodlivé účinky terapeutické užití toxicita MeSH
- hodnocení léčiv metody statistika a číselné údaje MeSH
- lidé MeSH
- průzkumy a dotazníky MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Cíl práce: V této práci seznamujeme odborníky s relativně novou kategorií rezistence typu difficult-to-treat (DTR), jejíž použití má signifikantní vliv na predikci morbidity a mortality pacientů s invazivní infekcí způsobenou bakteriálními DTR kmeny. Její sledování se tak stává užitečným nástrojem v komunikaci mikrobiologa a klinického lékaře, a tím významnou součástí antimikrobiálního stewardshipu (AMS). Dále reportujeme prevalenci kmenů splňujících kritéria této kategorie v nemocnici fakultního typu, Všeobecné fakultní nemocnici v Praze. Metody: Jedná se o retrospektivní kohortovou monocentrickou studii, do níž byly zahrnuty invazivní izoláty vybraných gramnegativních tyčinek od pacientů hospitalizovaných ve Všeobecné fakultní nemocnici v Praze v období let 2009–2013 a 2017–2021. Výsledky: Z celkového počtu 920, resp. 812 unikátních kmenů gramnegativních tyčinek z hemokultur ze sledovaných období bylo 6,6 %, resp. 6,0 % rezistentních ke karbapenemům a v obou obdobích 3,7 % splňovalo definici typu DTR. V období 2009–2013 bylo v kategorii DTR zachyceno 23,1 % kmenů A. baumannii a 22,2 % kmenů P. aeruginosa, v období 2017– 2021 bylo nejvíce v kategorii DTR kmenů A. baumannii (45 %) a P. aeruginosa (15,3 %). Nezachytili jsme žádný kmen E. coli rezistentní ke karbapenemům, tudíž žádný nespadal do kategorie DTR. Závěr: Kmeny splňující kritéria DTR jsou závažnou komplikací a infekce jimi způsobené jsou obtížně léčitelné. Prevalence závažných infekcí způsobených kmeny s DTR fenotypem je ve sledovaném zdravotnickém zařízení relativně nízká. Antibiotika s efektem proti DTR je nutné nadále zachovávat jako záložní, a proto je nezbytné postupovat dle pravidel AMS a citlivost k těmto antibiotikům testovat.
x
- Klíčová slova
- difficult-to-treat,
- MeSH
- antibiotická politika metody MeSH
- antibiotická rezistence * účinky léků MeSH
- bakteriální léková rezistence MeSH
- kohortové studie MeSH
- lidé MeSH
- retrospektivní studie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
Jedním z největších problémů současné medicíny je extrémní nárůst rezistence bakterií k antibiotikům. Léčba antibiotiky se tak výrazně komplikuje, a to nejen u pacientů na jednotkách intenzivní péče. Ale i v komunitě. Pro zachování účinnosti stávajících antibiotik je nutná multioborová spolupráce, jak na úrovni diagnostiky infekcí, tak především správné volby antibiotik, aby byla používána pouze na léčbu bakteriálních infekcí, nikoliv kolonizace pacienta. Antibiotický stewardship se stává etickým imperativem a mezi jeho klíčové prvky patří i kumulativní antibiogramy, které pomáhají při racionálním výběru antibiotik v iniciální terapii, jestliže konkrétní výsledky u daného pacienta nejsou ještě k dispozici. Avšak tvorba kumulativních antibiogramů není jasně definovaná, k dispozici jsou pouze americká doporučení, která nejsou zcela odpovídající potřebám klinické mikrobiologie u hospitalizovaných pacientů. Cílem práce je prezentovat možná úskalí tvorby kumulativních antibiogramů s ohledem na jediné existující doporučení CLSI a návrh doporučení pro jejich přípravu v ČR.
In today’s medicine, one of the main challenges is an extreme increase in bacterial resistance, making antibiotic treatment in both intensive care units and in the community considerably more difficult. To maintain the efficacy of existing antibiotics, close interdisciplinary cooperation is crucial for diagnosing infectious diseases as well as for selecting appropriate antibiotics so that these are only used for treating bacterial infections, not natural bacterial colonization. Antibiotic stewardship has become an ethical imperative, with cumulative antibiograms being one of its core elements. Cumulative antibiograms help with rational choice of antibiotics for initial therapy when the patient’s results are still pending. However, preparation of cumulative antibiograms is not clearly defined. Only two American guidelines are available that do not correspond with the needs of clinical microbiology in hospitalized patients. The article aims to present the potential pitfalls of preparing cumulative antibiograms based on the only CLSI guidelines and a draft of recommendation for their preparation in the Czech Republic.
In the microbiological diagnosis of bloodstream infections (BSI), blood culture (BC) is considered the gold standard test despite its limitations such as low sensitivity and slow turnaround time. A new FDA-cleared and CE-marked platform utilizing magnetic resonance to detect amplified DNA of the six most common and/or problematic BSI pathogens (Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, and Escherichia coli; referred to as ESKAPEc) is available and may shorten the time to diagnosis and potentially improve antimicrobial utilization. Whole blood samples from hospitalized patients with clinical signs of sepsis were analyzed using the T2Bacteria Panel (T2Biosystems) and compared to simultaneously collected BC. Discrepant results were evaluated based on clinical infection criteria, combining supporting culture results and the opinion of treating physicians. A total of 55 samples from 53 patients were evaluated. The sensitivity and specificity of the T2Bacteria panel was 94% (16 out of 17 detections of T2Bacteria-targeted organisms) and 100%, respectively, with 36.4% (8 of 22) causes of BSI detected only by this method. The T2Bacteria Panel detected pathogens on average 55 hours faster than standard BC. In our study, 9 of 15 patients with positive T2Bacteria Panel results received early-targeted antibiotic therapy and/or modification of antimicrobial treatment based on T2Bacteria Panel findings. Given the high reliability, faster time to detection, and easy workflow, the technique qualifies as a point-of-care testing approach.
- MeSH
- Acinetobacter baumannii účinky léků genetika izolace a purifikace MeSH
- antibakteriální látky farmakologie MeSH
- antibiotická politika metody MeSH
- bakteriemie krev farmakoterapie mikrobiologie MeSH
- Enterococcus faecium účinky léků genetika izolace a purifikace MeSH
- Escherichia coli účinky léků genetika izolace a purifikace MeSH
- Klebsiella pneumoniae účinky léků genetika izolace a purifikace MeSH
- krev mikrobiologie MeSH
- kultivační vyšetření krve MeSH
- lidé MeSH
- prospektivní studie MeSH
- Pseudomonas aeruginosa účinky léků genetika izolace a purifikace MeSH
- Staphylococcus aureus účinky léků genetika izolace a purifikace MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
BACKGROUND: Antimicrobial Stewardship Programs (ASPs) have been promoted to optimize antimicrobial usage and patient outcomes, and to reduce the emergence of antimicrobial-resistant organisms. However, the best strategies for an ASP are not definitively established and are likely to vary based on local culture, policy, and routine clinical practice, and probably limited resources in middle-income countries. The aim of this study is to evaluate structures and resources of antimicrobial stewardship teams (ASTs) in surgical departments from different regions of the world. METHODS: A cross-sectional web-based survey was conducted in 2016 on 173 physicians who participated in the AGORA (Antimicrobials: A Global Alliance for Optimizing their Rational Use in Intra-Abdominal Infections) project and on 658 international experts in the fields of ASPs, infection control, and infections in surgery. RESULTS: The response rate was 19.4%. One hundred fifty-six (98.7%) participants stated their hospital had a multidisciplinary AST. The median number of physicians working inside the team was five [interquartile range 4-6]. An infectious disease specialist, a microbiologist and an infection control specialist were, respectively, present in 80.1, 76.3, and 67.9% of the ASTs. A surgeon was a component in 59.0% of cases and was significantly more likely to be present in university hospitals (89.5%, p < 0.05) compared to community teaching (83.3%) and community hospitals (66.7%). Protocols for pre-operative prophylaxis and for antimicrobial treatment of surgical infections were respectively implemented in 96.2 and 82.3% of the hospitals. The majority of the surgical departments implemented both persuasive and restrictive interventions (72.8%). The most common types of interventions in surgical departments were dissemination of educational materials (62.5%), expert approval (61.0%), audit and feedback (55.1%), educational outreach (53.7%), and compulsory order forms (51.5%). CONCLUSION: The survey showed a heterogeneous organization of ASPs worldwide, demonstrating the necessity of a multidisciplinary and collaborative approach in the battle against antimicrobial resistance in surgical infections, and the importance of educational efforts towards this goal.
- MeSH
- antibiotická politika metody MeSH
- antiinfekční látky terapeutické užití MeSH
- celosvětové zdraví trendy MeSH
- lidé MeSH
- nitrobřišní infekce farmakoterapie MeSH
- pooperační komplikace farmakoterapie MeSH
- průřezové studie MeSH
- průzkumy a dotazníky MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH