Východiska: Vývoj biofarmaceutik je nejrychleji se rozvíjející oblastí dnešního farmaceutického průmyslu. Analýza proteinových terapeutik je však velice náročný úkol kvůli jejich velikosti a komplexnosti prostorové struktury. Jakékoliv změny v primární, sekundární, terciální či kvarterní struktuře proteinů mohou mít výrazný vliv na jejich funkci, účinnost a v neposlední řadě i toxicitu. Hmotnostní spektrometrie se v minulosti osvědčila jako kvalitní nástroj pro analýzu primární struktury proteinů (aminokyselinové sekvence) a v posledních letech je díky rozvoji nových metod schopná analyzovat i vyšší proteinové struktury. Jednou z těchto nových metod je vodík/deuteriová výměna (HDX). HDX je založena na výměně amidových vodíků aminokyselinového řetězce za deuteria z okolního roztoku. Vodíky nacházející se na povrchu proteinu jsou za deuteria vyměňovány mnohem rychleji než vodíky schované uvnitř proteinu. Získané výsledky z HDX metody mohou poskytnout informace o prostorové struktuře proteinu a také o protein-proteinových a protein-ligandových interakcí. Navíc analýzou výměny deuterií v různých časových intervalech může tato metoda poskytnout informace i o dynamických změnách proteinové struktury a dynamice proteinových interakcí. Vzhledem k možnostem, které tato metoda nabízí, se HDX stala atraktivní metodou pro charakterizaci proteinových biofarmaceutik. Cíl: Cílem tohoto přehledového článku je poukázat na možnosti využití hmotnostní spektrometrie v biofarmaceutickém průmyslu se zaměřením na metodu HDX a její aplikace.

Background: The development of biopharmaceutics is the fastest growing segment of the present pharmaceutical industry. The analysis of proteins therapeutics is a challenging task due to their large size and complexity of spatial structure. Any changes in the primary, secondary, tertiary or quaternary protein structure can have huge impact on their function, efficiency and toxicity. Mass spectrometry proved itself to be a powerful tool for analysis of primary protein structure (amino acid sequence) and thanks to the development of new techniques in last years it is able to analyse higher order protein structures. One of these new techniques is hydrogen/deuterium exchange (HDX). HDX is based on exchange of amid protons with deuterium from solution on the protein backbone chain. Protons on the surface of protein are exchanging with deuterium much faster than protons buried inside of protein. HDX results could provide information about spatial protein structure and also about protein-protein interactions and protein-ligand interactions. Furthermore, by analysing of deuterium exchange in different time points this method could give information about dynamic changes of protein structure and dynamics of proteins interactions. Because of possibilities of this method, HDX become attractive method for characterization of protein biopharmaceuticals. Aims: This review article is focused on the utilization of mass spectrometry in biopharmaceutical industry and mainly on HDX method and its applications.

• Klíčová slova
• vodík/deuteriová výměna,
• MeSH
• farmaceutický průmysl MeSH
• hmotnostní spektrometrie metody   využití   MeSH
• konformace proteinů MeSH
• krystalografie rentgenová využití   MeSH
• lidé MeSH
• mapování epitopu metody   využití   MeSH
• objevování léků metody   MeSH
• proteiny analýza   terapeutické užití   MeSH
• proteomika metody   MeSH
• translační modifikace proteinu MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH
• přehledy MeSH

• MeSH
• Borrelia burgdorferi imunologie   MeSH
• elektronová mikroskopie MeSH
• finanční podpora výzkumu jako téma MeSH
• lektiny aplikace a dávkování   diagnostické užití   MeSH
• mapování epitopu metody   využití   MeSH
• techniky in vitro MeSH

Navrhujeme izolaci a frakcionaci peptidů z kapsy molekul HLA a srovnání profilu u nemocných a kontrol.Studie přispěje k pochopení funkce HLA u onemocnění,upřesní diagnózu a naznačí cestu k léčbě autoimunních onemocnění.

• MeSH
• autoimunitní nemoci diagnóza   MeSH
• beta-2-mikroglobulin MeSH
• chromatografie kapalinová využití   metody   MeSH
• HLA antigeny MeSH
• HLA-B27 antigen analýza   MeSH
• mapování epitopu využití   metody   MeSH
• spektrofotometrie využití   metody   MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• alergologie a imunologie
• radiologie, nukleární medicína a zobrazovací metody
• chemie, klinická chemie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Studium mechanismů podílejících se na funkční inaktivaci p53 proteinu u vybraných lidských nádorů a klinický význam detekce abnormalit v expresi genů p53 a mdm2 a jejich produktů.

• MeSH
• geny p53 imunologie   genetika   MeSH
• imunohistochemie využití   metody   MeSH
• mapování epitopu využití   metody   MeSH
• monoklonální protilátky chemie   imunologie   MeSH
• nádorový supresorový protein p53 analýza   MeSH
• onkogenní protein p21(ras) chemie   imunologie   MeSH
• regulace genové exprese u nádorů imunologie   genetika   MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• alergologie a imunologie
• histologie
• cytologie, klinická cytologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR