Jasné bílé struktury („shiny white structures“, SWS) představují skupinu dermatoskopických znaků viditelných pouze v dermatoskopu využívající polarizované světlo. Rozlišovány jsou tři typy SWS, konkrétně jasné bílé proužky, jasné bílé skvrny/pruhy a rozety. SWS se vyskytují u celé řady benigních a maligních nádorů a zánětlivých dermatóz, častější jsou však u nádorů maligních. Jejich znalost může být, i přes svoji nižší specificitu, užitečným diferenciačním dermatoskopickým znakem.

Shiny white structures (SWS) represent a group of dermoscopic features visible only under dermoscope using polarized light. Three types of SWS are distinguished, namely shiny white streaks, shiny white blotches/strands and rosettes. SWS are present in a range of benign and malignant tumors and inflammatory dermatoses, however they are observed more frequently in malignant tumors. Their knowledge could be, despite their lower specificity, useful differentiating dermoscopic feature.

• MeSH
• dermatoskopie MeSH
• diferenciální diagnóza MeSH
• kožní nemoci * diagnóza   MeSH
• lidé MeSH
• nádory kůže diagnóza   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

Každý badatel čas od času čelí problému správného výběru statistické metody, která by měla být aplikována, aby vhodně analyzovala jeho data. Naší snahou je zjednodušit tento proces ve smyslu vytvoření webové aplikace, která nabízí pomocnou ruku výzkumníkovi, který řeší statistickou analýzu ve své práci. Aplikace je vytvořena pomocí jazyka R a jednoho z jeho balíčků, Shiny, a je volně dostupná online. R je otevřený programovací jazyk a prostředí věnované zejména statistickým výpočtům a následným grafickým náhledům. Aplikace je dostupná na R-serveru 1. lékařské fakulty Univerzity Karlovy na http://shiny.statest.cz:3838/statisticke_nastroje/ a je založena na vývojovém diagramu navigujícím k aplikovatelné statistické metodě. Integrovaný vývojový diagram umožňuje výzkumníkovi vybrat nejvhodnější statistickou metodu ve smyslu průchodu diagramem krok po kroku tak, jak výzkumník dělá rozhodnutí odpovídáním na kladené otázky. Po určení nejvhodnější metody je přímým odkazem přesměrován na záložku aplikace, která nabízí provedení dané metody nad daty, která badatel do aplikace nahrál. Poskytnutí uživatelsky přátelské aplikace a vývojového diagramu mapujícího rozhodovací proces potenciálních statistických metod a vybírající tu nejvhodnější považujeme za cestu, jak tento proces zjednodušit. Přímé spojení – pomocí odkazu – mezi návrhem metody a záložkou s její realizací může zlepšit uživatelský komfort.

• Klíčová slova
• webová aplikace, Shiny, výběr statistické metody,
• MeSH
• automatizované zpracování dat metody   MeSH
• biostatistika metody   MeSH
• navrhování softwaru * MeSH
• programovací jazyk MeSH
• statistika jako téma * metody   MeSH
• výzkum MeSH

Využití metod průzkumové analýzy dat (exploratory data analysis, EDA) je při hodnocení klinických dat v medicíně klíčovou fází. Vizualizační principy, modely poukazující na trendy vývoje či např. znázornění potenciálních závislostí, pomáhají k lepší interpretaci měření a v diagnostickém rozhodování. Počet dostupných moderních EDA balíků pro vývojáře v posledních letech roste v souvislosti s rozvojem oboru Data Science. NeuroEDA je interaktivní webová aplikace pro hodnocení biomedicínských dat. Aplikace byla naprogramována ve statistickém jazyce R, v rámci reaktivního paradigmatu frameworku Shiny. Je dále rozvíjena a využívána Katedrou biomedicínské informatiky FBMI ČVUT ve spolupráci s Neurologickou klinikou 1. LF UK a VFN v Praze, především pro hodnocení pacientů s dystoniemi a Parkinsonovou nemocí. Zpracování uživatelských dat v tabulkové formě (.csv, excel) probíhá v serverové části. Kromě základních popisných statistik, průzkumových grafů a shlukové analýzy, které jsou vhodné i pro hodnocení velkých dat, nabízí aplikace metody pro robustní a neparametrickou analýzu. Ty jsou v neurologii obzvlášť vhodné. Typicky z důvodu malých počtů a vlivných pozorování. Dále kvůli častému nesplnění dalších statistických předpokladů. Mezi její výhody patří snadná rozšiřitelnost o nové R balíky a rychlá odezva ve webových prohlížečích. Uživatelské interaktivní prostředí umožňuje práci s funkcemi jazyka R bez znalosti skriptování.

Usage of methods for exploratory data analysis (EDA) plays an important role in assessment of clinical medical data. Visualizations, models and illustration of dependency can help for better understanding of measurements in the diagnostics and making decision. The number of available modern EDA packages for developers is increasing as well as the development of the Data Science field. NeuroEDA is an interactive web application for biomedical data assessment. The application was programmed in the R statistical language, based on reactive paradigm framework called Shiny. It is further developed and used by the Department of Biomedical Informatics FBME CTU in cooperation with the Neurological Clinic of the 1st Medical Faculty, Charles University in Prague. Especially for the patients with dystonia and Parkinson's disease. Computations and processing of user data are executed on the server side. Basic descriptive statistics, interactive graphs, clustering, robust and LOESS regression were implemented and are suitable for analytics of big data. Robust regression is especially suitable in neurology. Typically, due to the small numbers of measured observations and failure to prove other statistical assumptions. Among its advantages we can consider easy expandability of new R packages and quick response in web browsers. User interface allows to work with the R language features without any scripting knowledge.

• Klíčová slova
• neuroinformatika, neuroEDA,
• MeSH
• internet MeSH
• interpretace statistických dat MeSH
• lékařská informatika * MeSH
• navrhování softwaru MeSH
• neurologie * MeSH
• software MeSH
• statistika jako téma MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH

• MeSH
• nemoci kůže a pojivové tkáně diagnóza   klasifikace   terapie   MeSH
• nemoci nehtů diagnóza   klasifikace   terapie   MeSH
• Publikační typ
• atlasy MeSH
• monografie MeSH
• příručky MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• dermatovenerologie

Cíl studie: Popis případu vzácného onemocnění, Zoonovy vulvitidy. Typ studie: Kazuistika a diferenciální diagnostika. Název a sídlo pracoviště: Gynekologicko-porodnická klinika, Fakultní nemocnice Ostrava. Vlastní pozorování: Zoonova vulvitida neboli plazmocytární vulvitida (PCV) patří mezi extrémně vzácná a často špatně diagnostikovaná zánětlivá onemocnění vulvy. Její léze bývají ostře ohraničené, lesklého povrchu či charakteru erytematózního pole. Doposud bylo v literatuře popsáno méně než 50 případů tohoto onemocnění. V naší práci se podrobněji věnujeme klinice, diferenciální diagnostice i léčbě plazmocytární vulvitidy a na konkrétní kazuistice popisujeme případ s typickou klinickou i histopatologickou manifestací. Onemocnění s možným rizikem rozvoje dysplastických změn vyžaduje dlouhodobé sledování.

Objective: Description of finding out rare disease Zoon vullvitis. Desing: Case report and differential diagnosis. Setting: Department of Obstetric and Gynecology, University Hospital Ostrava. Case report: Zoon vulvitis or plasma cell vulvitis (PCV) belongs to extremely rare and often misdiagnosed inflammatory disease of the vulva. Lesions may look like shiny, sharply bordered , erythematosus patches or macular lesions. Less than 50 cases have been reported. This article is devoted to clinical findings, differential diagnosis and treatment of PCV. We present one clinical case with typical clinical and histopathological manifestations. Risk of dysplasia exists and long-term follow-up is desirable.

• Klíčová slova
• Zoonova vulvitida,
• MeSH
• aplikace lokální MeSH
• diferenciální diagnóza MeSH
• lidé MeSH
• pruritus vulvae etiologie   MeSH
• senioři MeSH
• steroidy terapeutické užití   MeSH
• vulvitida * diagnóza   terapie   MeSH
• výsledek terapie MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• kazuistiky MeSH

Rock varnish is a microbial habitat, characterised by thin (5-500 μm) and shiny coatings of iron (Fe) and manganese (Mn) oxides associated with clay minerals. This structure is well studied by geologists, and recently there have been reports about the taxonomical composition of its microbiome. In this study, we investigated the rock varnish microbiome using shotgun metagenomics together with analyses of elemental composition, lipid and small molecule biomarkers, and rock surface analyses to explore the biogeography of microbial communities and their functional features. We report taxa and encoded functions represented in metagenomes retrieved from varnish or non-varnish samples, additionally, eight nearly complete genomes have been reconstructed spanning four phyla (Acidobacteria, Actinobacteria, Chloroflexi and TM7). The functional and taxonomic analyses presented in this study provide new insights into the ecosystem dynamics and survival strategies of microbial communities inhabiting varnish and non-varnish rock surfaces.

• MeSH
• Acidobacteria genetika   MeSH
• Actinobacteria genetika   MeSH
• Chloroflexi genetika   MeSH
• genom bakteriální genetika   MeSH
• metagenom genetika   MeSH
• metagenomika metody   MeSH
• mikrobiota fyziologie   MeSH
• nátěrové hmoty MeSH
• oxidy MeSH
• půdní mikrobiologie * MeSH
• sloučeniny manganu MeSH
• železo MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

Cíl studie spočíval v určení dermatoskopických struktur bazaliomu pro lepší diagnostiku v klinické praxi s možným předvídáním jeho histopatologického typu. Retrospektivně byly hodnoceny dermatoskopické struktury u 115 histopatologicky potvrzených bazaliomů. Dermatoskopické snímky byly nasnímány digitálním dermatoskopem Derm-Doc 2.3 během diagnosticko-terapeutického procesu u pacientů kožní ambulance po jejich předchozím písemném souhlasu od ledna 2012 do března 2017. Hodnotil se výskyt dermatoskopických struktur u nejčastějších typů bazaliomu. Nodulární formy bazaliomu měly více zastoupené arborizující cévy. Superficiální formy měly vyšší podíl loukoťovitých kol, javorových listů a hnědošedých globulí. Smíšené typy bazaliomu měly nejčastěji bílé lesklé čárky a ulcerace. Přesnější diagnostika s možným předvídáním histopatologického typu vede ke správné léčbě tohoto nádoru.

The aim of the study was to determine dermoscopic structures of basal cell carcinoma for better diagnosis in clinical practice with possible prediction of its histological type. In total 115 dermoscopic images of histopathologically confirmed basal cell carcinomas were retrospectively evaluated for the presence of specific dermoscopic structures. Dermoscopic images were taken with the digital dermoscope Derm-Doc 2.3, during the diagnostic-therapeutic process at the outpatient skin department upon patients written consent from January 2012 until February 2017. The dermoscopic structures found in the most common types of basal cell carcinoma were evaluated. Arborizing vessels were common in nodular basal cell carcinomas, spoke wheel-like structures, maple-leaf-like structures and graybrown globules were common in the superficial forms. White shiny streaks and ulcerations were typical of mixed forms of the basal cell carcinoma. More accurate diagnosis with possible prediction of its histological type leads to correct therapy of this tumour.

• Klíčová slova
• dermatoskopické struktury,
• MeSH
• bazocelulární karcinom * diagnóza   klasifikace   MeSH
• dermatoskopie metody   MeSH
• lidé MeSH
• retrospektivní studie MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

The optimal acceptance threshold hypothesis provides a general predictive framework for testing behavioural responses to discrimination challenges. Decision-makers should respond to a stimulus when the perceived difference between that stimulus and a comparison template surpasses an acceptance threshold. We tested how individual components of a relevant recognition cue (experimental eggs) contributed to behavioural responses of chalk-browed mockingbirds, Mimus saturninus, a frequent host of the parasitic shiny cowbird, Molothrus bonariensis. To do this, we recorded responses to eggs that varied with respect to two components: colour, ranging from bluer to browner than the hosts' own eggs, and spotting, either spotted like their own or unspotted. Although tests of this hypothesis typically assume that decisions are based on perceived colour dissimilarity between own and foreign eggs, we found that decisions were biased toward rejecting browner eggs. However, as predicted, hosts tolerated spotted eggs more than unspotted eggs, irrespective of colour. These results uncover how a single component of a multicomponent cue can shift a host's discrimination threshold and illustrate how the optimal acceptance threshold hypothesis can be used as a framework to quantify the direction and amount of the shift (in avian perceptual units) of the response curve across relevant phenotypic ranges. This article is part of the theme issue 'The coevolutionary biology of brood parasitism: from mechanism to pattern'.

• MeSH
• barva MeSH
• hnízdění * MeSH
• ovum MeSH
• podněty * MeSH
• rozhodování MeSH
• rozpoznávání (psychologie) MeSH
• vnímání barev * MeSH
• zpěvní ptáci parazitologie   fyziologie   MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• zvířata MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

External application of seabuckthorn oil (Hippophae rhamnoides L.) is difficult due to its liquid state in spite of its benefits for damaged skin. In order to overcome this inadequacy the semisolid emulsion with seabuckthorn oil was prepared. Previous research showed that this emulsion possessing an enhanced structure with liquid crystals showed a higher wound healing potential than seabuckthorn oil. The aim of this investigation was to characterize suitability of this emulsion for topical use. The emulsion was prepared by combining emulsifiers that form liquid crystals. Two different quantities of seabuckthorn oil were incorporated. Samples were prepared with 10% and 40% of seabuckthorn oil. Organoleptic characteristics were estimated visually and by smearing samples on a thin glass plate. Type of emulsion was determined by a conductometric method, while a pH value of the emulsion was measured by a pH meter. Samples of seabuckthorn emulsion were orange, semisolid, shiny, easily spreadable on skin, and the smear on the glass plate was homogeneous. There was an absence of smell and the emulsion could be rinsed by water after the application on skin, which is a desired characteristic of oil/water emulsions. Results of an electrical conductivity confirmed that an outer phase is water. Samples possesed an acceptable pH value for an external topical use. This research confirmed that constituents and a method used were suitable for preparing semisolid emulsion with seabuckthorn oil. Organoleptic properties, a pH value and a type of obtained emuslion appear to be adequate for topical use.

• MeSH
• aplikace lokální MeSH
• chemické techniky analytické metody   MeSH
• elektrická vodivost MeSH
• emulze chemická syntéza   MeSH
• financování organizované MeSH
• fytoterapie MeSH
• Hippophae MeSH
• hojení ran MeSH
• koncentrace vodíkových iontů MeSH
• konduktometrie statistika a číselné údaje   MeSH
• krušina MeSH
• ovoce chemie   MeSH
• rostlinné přípravky chemie   terapeutické užití   MeSH
• výzkum MeSH

Molusky sú lesklé pupienky rôznej veľkosti, od drobných, 1 mm ohraničených papuliek až po väčšie, spravidla okolo 5 mm. Majú pleťovú alebo svetlo ružovú farbu, keď sa okolitá koža podráždi môžu mať červený lem. Pripomínajú špendlíkovú hlavičku. Molusky, infekčné epiteliálne tumorčeky, patria do skupiny kožných vírusových ochorení. Ochorenie molusky spôsobuje vírus Molluscum contagiosum, ide o kožnú infekciu. Pôvodcom je dermatotropný vírus zo skupiny poxvírusov. Je to kmeň výlučne ľudský a prenos sa uskutočňuje iba z ľudí osobným kontaktom, sprostredkovane cez uterák, na plavárňach alebo v kolektívoch. Inkubačná doba je v rozmedzí od týždňa až po 6 mesiacov. Vírusovým ochorením, moluskami, trpia predovšetkým deti v predškolskom a školskom veku. Nakaziť sa však môžu aj dospelí, pretože molusky spôsobujú štyri typy vírusu, a práve dva z nich napádajú dospelého človeka. U nich je možná nákaza aj pohlavným stykom, keďže sa vyskytujú aj v oblastiach genitálií.

Mollusks are shiny pimples of various sizes, from small, 1 mm bordered pimples to larger ones, usually around 5 mm. They have a skin or light pink color, when the surrounding skin is irritated, they can have a red border. They resemble the head of a pin. Molluscum infectious epithelial tumors belong to the group of skin viral diseases. Molluscum contagiosum is caused by the Molluscum contagiosum virus, it is a skin infection. The origin is a dermatotropic virus from the group of poxviruses. It is an exclusively human strain and transmission takes place only from people through personal contact, indirectly through a towel, in swimming pools or in collectives. The incubation period ranges from a week to six months. Children of pre-school and school age mainly suffer from the viral disease. However, adults can also become infected, because molluscs cause four types of the Molluscum contagiosum virus, and exactly two of them attack an adult. In adults, molluscs can also be transmitted through sexual intercourse, as they also occur in the genital areas.

• MeSH
• lidé MeSH
• molluscum contagiosum * patologie   přenos   terapie   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH