In chronic lymphocytic leukemia, the reliability of next-generation sequencing (NGS) to detect TP53 variants ≤10% allelic frequency (low-VAF) is debated. We tested the ability to detect 23 such variants in 41 different laboratories using their NGS method of choice. The sensitivity was 85.6%, 94.5%, and 94.8% at 1%, 2%, and 3% VAF cut-off, respectively. While only one false positive (FP) result was reported at >2% VAF, it was more challenging to distinguish true variants <2% VAF from background noise (37 FPs reported by 9 laboratories). The impact of low-VAF variants on time-to-second-treatment (TTST) and overall survival (OS) was investigated in a series of 1092 patients. Among patients not treated with targeted agents, patients with low-VAF TP53 variants had shorter TTST and OS versus wt-TP53 patients, and the relative risk of second-line treatment or death increased continuously with increasing VAF. Targeted therapy in ≥2 line diminished the difference in OS between patients with low-VAF TP53 variants and wt-TP53 patients, while patients with high-VAF TP53 variants had inferior OS compared to wild type-TP53 cases. Altogether, NGS-based approaches are technically capable of detecting low-VAF variants. No strict threshold can be suggested from a technical standpoint, laboratories reporting TP53 mutations should participate in a standardized validation set-up. Finally, whereas low-VAF variants affected outcomes in patients receiving chemoimmunotherapy, their impact on those treated with novel therapies remains undetermined. Our results pave the way for the harmonized and accurate TP53 assessment, which is indispensable for elucidating the role of TP53 mutations in targeted treatment.

• Publication type
• Journal Article MeSH

• Publication type
• Journal Article MeSH

BACKGROUND: Among the non-traditional antibacterial agents in development, only a few targets critical Gram-negative bacteria such as carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter baumannii or cephalosporin-resistant Enterobacteriaceae. Endolysins and their genetically modified versions meet the World Health Organization criteria for innovation, have a novel mode of antibacterial action, no known bacterial cross-resistance, and are being intensively studied for application against Gram-negative pathogens. METHODS: The study presents a multidisciplinary approach, including genetic engineering of LysECD7-SMAP and production of recombinant endolysin, its analysis by crystal structure solution following molecular dynamics simulations and evaluation of antibacterial properties. Two types of antimicrobial dosage forms were formulated, resulting in lyophilized powder for injection and hydroxyethylcellulose gel for topical administration. Their efficacy was estimated in the treatment of sepsis, and pneumonia models in BALB/c mice, diabetes-associated wound infection in the leptin receptor-deficient db/db mice and infected burn wounds in rats. RESULTS: In this work, we investigate the application strategies of the engineered endolysin LysECD7-SMAP and its dosage forms evaluated in preclinical studies. The catalytic domain of the enzyme shares the conserved structure of endopeptidases containing a putative antimicrobial peptide at the C-terminus of polypeptide chain. The activity of endolysins has been demonstrated against a range of pathogens, such as Klebsiella pneumoniae, A. baumannii, P. aeruginosa, Staphylococcus haemolyticus, Achromobacter spp, Burkholderia cepacia complex and Haemophylus influenzae, including those with multidrug resistance. The efficacy of candidate dosage forms has been confirmed in in vivo studies. Some aspects of the interaction of LysECD7-SMAP with cell wall molecular targets are also discussed. CONCLUSIONS: Our studies demonstrate the potential of LysECD7-SMAP therapeutics for the systemic or topical treatment of infectious diseases caused by susceptible Gram-negative bacterial species and are critical to proceed LysECD7-SMAP-based antimicrobials trials to advanced stages.

• MeSH
• Anti-Bacterial Agents pharmacology   administration & dosage   MeSH
• Endopeptidases * pharmacology   administration & dosage   MeSH
• Gram-Negative Bacterial Infections * drug therapy   MeSH
• Gram-Negative Bacteria * drug effects   MeSH
• Rats MeSH
• Mice, Inbred BALB C * MeSH
• Mice MeSH
• Protein Engineering methods   MeSH
• Animals MeSH
• Check Tag
• Rats MeSH
• Male MeSH
• Mice MeSH
• Animals MeSH
• Publication type
• Journal Article MeSH

• MeSH
• Communication MeSH
• Humans MeSH
• Neoplasms MeSH
• Psychology methods   MeSH
• Truth Disclosure * ethics   MeSH
• Physician-Patient Relations MeSH
• Check Tag
• Humans MeSH
• Publication type
• Interview MeSH

Publikace se zaměřuje na různé právní spory a soudní řízení, která se týkají lékařství a zdravotních výkonů. Určeno odborné veřejnosti.; Publikace přináší celistvý pohled na problematiku sporů mezi pacienty a poskytovateli zdravotní péče a jejich řešení. Zabývá se medicínskoprávními spory od jejich samotného vzniku a nastiňuje více variant, jak se může řešení sporu vyvíjet. Vedle mimosoudního narovnání proto zahrnuje i úvahy o alternativních způsobech řešení sporu, jako jsou mediace či rozhodčí řízení. Motivace smírného řešení sporu provází publikaci i v dalších kapitolách zabývajících se řízením před soudem. Ačkoli kniha vychází z teoretických základů občanskoprávní odpovědnosti za újmu na zdraví a civilního procesu, pojímá medicínskoprávní spor a jeho vývoj především z praktického pohledu obou jeho účastníků. Nabízí proto i úvahy, kterými se oba účastníci sporu mohou při vedení sporu řídit, a předkládá praktická doporučení pro konkrétní procesní situace. Velmi podrobně se kniha věnuje posuzování standardu náležité odborné úrovně při poskytování zdravotních služeb (lege artis), a to i při znaleckém dokazování, od něhož se zásadně odvíjí výsledek medicínskoprávních sporů. Nabízí také řešení obtížné problematiky odstraňování rozporů mezi odporujícími si znaleckými posudky, které respektuje dosavadní postupy a soudní rozhodovací praxi. Zároveň se publikace zaměřuje se na i pochybení soudů, ke kterým v řízení o medicínskoprávních sporech typicky dochází, a navrhuje konkrétní námitky, kterými lze dosáhnout jejich nápravy. Publikace tak představuje praktickou příručku určenou nejen pro advokáty a právní veřejnost, ale i pro lékaře a poskytovatele zdravotních služeb obecně, a konečně i pro pacienty, kteří v důsledku nesprávného postupu zdravotnického pracovníka utrpěli újmu na zdraví a zvažují vymáhání svých nároků s tím spojených.

• MeSH
• Dissent and Disputes legislation & jurisprudence   MeSH
• Patient Care MeSH
• Patient Harm legislation & jurisprudence   MeSH
• Judicial Role MeSH
• Legislation, Medical MeSH
• Expert Testimony legislation & jurisprudence   MeSH
• Publication type
• Monograph MeSH
• Geographicals
• Czech Republic MeSH

• Conspectus
• Právo
• NML Fields
• právo, zákonodárství

Activating transcription factor 4 (ATF4) is a master transcriptional regulator of the integrated stress response, leading cells toward adaptation or death. ATF4's induction under stress was thought to be due to delayed translation reinitiation, where the reinitiation-permissive upstream open reading frame 1 (uORF1) plays a key role. Accumulating evidence challenging this mechanism as the sole source of ATF4 translation control prompted us to investigate additional regulatory routes. We identified a highly conserved stem-loop in the uORF2/ATF4 overlap, immediately preceded by a near-cognate CUG, which introduces another layer of regulation in the form of ribosome queuing. These elements explain how the inhibitory uORF2 can be translated under stress, confirming prior observations but contradicting the original regulatory model. We also identified two highly conserved, potentially modified adenines performing antagonistic roles. Finally, we demonstrated that the canonical ATF4 translation start site is substantially leaky scanned. Thus, ATF4's translational control is more complex than originally described, underpinning its key role in diverse biological processes.

• MeSH
• Stress, Physiological MeSH
• HEK293 Cells MeSH
• Humans MeSH
• Open Reading Frames * genetics   MeSH
• Protein Biosynthesis * MeSH
• Ribosomes * metabolism   MeSH
• Base Sequence MeSH
• Activating Transcription Factor 4 * metabolism   genetics   MeSH
• Check Tag
• Humans MeSH
• Publication type
• Journal Article MeSH
• Research Support, Non-U.S. Gov't MeSH

Úvod: Zmeny v hlase sú súčasťou starnutia človeka. S pribúdajúcim počtom starších ľudí v populácii narastá aj výskyt porúch hlasu. Na Slovensku však doposiaľ neboli spracované dáta, ktoré by sa zamerali na problematiku subjektívneho hodnotenia hlasu. Cieľom štúdie je zistiť prevalenciu porúch hlasu u starších osôb na základe subjektívneho hodnotenia hlasu a analyzovať premenné ovplyvňujúce hlas. Materiál a metodika: Analyzované sú dáta prospektívne získavané od roku 2019 do roku 2022 od osôb nad 60 rokov bez poruchy hlasu. Hlavnou metódou je validovaný dotazník Index hlasového hendikepu (VHI-30) a subjektívne hodnotenie osoby. Na štatistickú analýzu je použitý Kolmogorov-Smirnov test normality, Mann-Whitneyho U-test pre 2 nezávislé výbery, Kruskall-Wallisov test a Spearmanov korelačný test. Výsledky: Analýzou výsledkov sa zistilo, že zmeny v hlase vníma 28,7 % respondentov. Pohlavie (p = 0,92), fajčenie (p = 0,09) a vek (p = 0,19) signifikantne neovplyvňuje skóre v dotazníku VHI-30. Respondenti, ktorí subjektívne referovali zhoršenie hlasu za posledných 10 rokov, dosahovali v celkovom skóre dotazníka VHI-30 signifikantne vyššie skóre než tí, ktorých hlas sa za posledných 10 rokov nezmenil/zlepšil (p = 0,00). Záver: Z výsledkov vyplýva, že väčšina participantov považuje svoju kvalitu života spojenú s hlasom za akceptovateľnú a nepozoruje za posledných 10 rokov vo svojom hlase zmeny. Na záver dodávame, že hoci výsledky nepoukazujú na závažné zmeny v slovenskej populácii ľudí nad 60 rokov, je potrebné zvýšiť povedomie o zmenách v hlase a redukovať prejavy presbyfónie.

Introduction: Changes in the voice are a part of the aging process in humans. With the increasing number of older individuals in the population, the incidence of voice disorders also rises. However, to date, data addressing the issue of subjective voice evaluation have not been processed in Slovakia. The aim of the study is to determine the prevalence of voice disorders in older individuals based on subjective voice evaluation and to analyze variables influencing the voice. Materials and methods: The data analyzed were prospectively collected from individuals aged 60 and above without voice disorders, spanning from 2019 to 2022. The primary method employed is the validated Voice Handicap Index questionnaire (VHI-30) and subjective evaluation of individuals. Statistical analysis includes the utilization of the Kolmogorov-Smirnov test of normality, Mann-Whitney U-test for two independent samples, Kruskall-Wallis test, and Spearman correlation test. Results: Analysis of the results revealed that 28.7 % of respondents perceive changes in their voice. Gender (p = 0.92), smoking (p = 0.09), and age (p = 0.19) do not significantly influence the scores in the VHI-30 questionnaire. Respondents who subjectively reported a deterioration in their voice over the last 10 years achieved significantly higher scores in the overall VHI-30 questionnaire compared to those whose voice remained unchanged/improved over the last 10 years (p = 0.00). Conclusion: The results suggest that the majority of participants consider the quality of their life related to their voice to be acceptable and have not noticed any changes in their voice over the last 10 years. In conclusion, while the results do not indicate significant changes in the Slovak population of individuals over 60 years of age, it is necessary to raise awareness about voice changes and reduce the manifestations of presbyphonia.

• MeSH
• Dysphonia epidemiology   MeSH
• Voice Quality * MeSH
• Quality of Life MeSH
• Middle Aged MeSH
• Humans MeSH
• Voice Disorders epidemiology   MeSH
• Surveys and Questionnaires MeSH
• Aged MeSH
• Aging pathology   MeSH
• Age Factors MeSH
• Check Tag
• Middle Aged MeSH
• Humans MeSH
• Male MeSH
• Aged MeSH
• Female MeSH

Liquid biopsy is a very topical issue in clinical diagnostics research nowadays. In this study, we explored and compared various analytical approaches to blood plasma analysis. Finally, we proposed a comprehensive procedure, which, thanks to the utilization of multiple analytical techniques, allowed the targeting of various biomolecules in blood plasma reflecting diverse biological processes underlying disease development. The potential of such an approach, combining proteomics, metabolomics, and vibrational spectroscopy along with preceding blood plasma fractionation, was demonstrated on blood plasma samples of patients suffering from hepatocellular carcinoma in cirrhotic terrain (n = 20) and control subjects with liver cirrhosis (n = 20) as well as healthy subjects (n = 20). Most of the applied methods allowed the classification of the samples with an accuracy exceeding 80.0 % and therefore have the potential to be used as a stand-alone method in clinical diagnostics. Moreover, a final panel of 48 variables obtained by a combination of the utilized analytical methods enabled the discrimination of the hepatocellular carcinoma samples from cirrhosis with 94.3 % cross-validated accuracy. Thus, this study, although limited by the cohort size, clearly demonstrated the benefit of the multimethod approach in clinical diagnosis.

• MeSH
• Carcinoma, Hepatocellular * MeSH
• Liver Cirrhosis diagnosis   MeSH
• Humans MeSH
• Liver Neoplasms * diagnosis   MeSH
• Proteomics methods   MeSH
• Spectrum Analysis MeSH
• Liquid Biopsy MeSH
• Check Tag
• Humans MeSH
• Publication type
• Journal Article MeSH

BACKGROUND: Patients with chronic lymphocytic leukemia (CLL) have a higher risk of developing other malignancies (OMs) compared to the general population. However, the impact of CLL-related risk factors and CLL-directed treatment is still unclear and represents the focus of this work. METHODS: We conducted a retrospective international multicenter study to assess the incidence of OMs and detect potential risk factors in 19,705 patients with CLL, small lymphocytic lymphoma, or high-count CLL-like monoclonal B-cell lymphocytosis, diagnosed between 2000 and 2016. Data collection took place between October 2020 and March 2022. FINDINGS: In 129,254 years of follow-up after CLL diagnosis, 3513 OMs were diagnosed (27.2 OMs/1000 person-years). The most common hematological OMs were Richter transformation, myelodysplastic syndrome (MDS) and acute myeloid leukemia (AML). Non-melanoma skin (NMSC) and prostate cancers were the most common solid tumors (STs).The only predictor for MDS and AML development was treatment with fludarabine and cyclophosphamide with/without rituximab (FC ± R) (OR = 3.7; 95% CI = 2.79-4.91; p < 0.001). STs were more frequent in males and patients with unmutated immunoglobulin heavy variable genes (OR = 1.77; 95% CI = 1.49-2.11; p < 0.001/OR = 1.89; 95% CI = 1.6-2.24; p < 0.001).CLL-directed treatment was associated with non-melanoma skin and prostate cancers (OR = 1.8; 95% CI = 1.36-2.41; p < 0.001/OR = 2.11; 95% CI = 1.12-3.97; p = 0.021). In contrast, breast cancers were more frequent in untreated patients (OR = 0.17; 95% CI = 0.08-0.33; p < 0.001).Patients with CLL and an OM had inferior overall survival (OS) than those without. AML and MDS conferred the worst OS (p < 0.001). INTERPRETATION: OMs in CLL impact on OS. Treatment for CLL increased the risk for AML/MDS, prostate cancer, and NMSC. FCR was associated with increased risk for AML/MDS. FUNDING: AbbVie, and EU/EFPIAInnovative Medicines Initiative Joint Undertaking HARMONY grant n° 116026.

• Publication type
• Journal Article MeSH

Tento komentář poskytuje podrobný výklad jednotlivých ustanovení správního řádu, tedy obecného předpisu pro vedení správních řízení, uzavírání veřejnoprávních smluv, přijímání opatření obecné povahy nebo provádění dalších úkonů ve veřejné správě. Nové vydání tohoto komentáře reaguje na poslední novely správního řádu, které zohledňovaly přijetí nového zákona o právu na digitální služby a s tím související využívání podkladů z úředních evidencí, zpřesnily úpravu závazných stanovisek, zejména pak v otázce lhůt pro jejich vydávání a přezkoumání, apod. Dále reaguje na změny v souvisejících právních předpisech, na které je v komentáři odkazováno, a doplňuje novou judikaturu správních soudů, resp. Ústavního soudu ČR. Zohledňovány jsou zde samozřejmě také nové zkušenosti s praktickým vedením správních řízení a nejnovější závěry Poradního sboru ministra vnitra ke správnímu řádu a správnímu trestání. Po formální stránce byl po vzoru dalších komentářů této ediční řady doplněn do tohoto vydání obsah výkladu a komentář jednotlivých paragrafů se nově již nečlenění podle odstavců, ale podle tematických oblastí uvedených nadpisy. Tímto vydáním komentáře bychom rádi přispěli k tomu, aby byla jednotlivá ustanovení správního řádu správně pochopena i správně aplikována v praxi.