Studium funkčního spojení mezi expresí a reverzibilní fosforylací nukleolár.protein. faktorů a regulací syntézy ribozomální RNA prováděné na buněčných modelech reprezent. normál.a leukem. hematopoetic.i buňkami indukovat.i k aktivaci či represi prolifer.; Investigation of the fuctional link between expression and phosphorylation of nucleolar transcription factors and regulatory mechanism of ribosomal RNA synthesis performed on normal and leukemic blood cells with stimulated or respressed growth activity.

• MeSH
• aktivace lymfocytů MeSH
• messenger RNA MeSH
• nádorová transformace buněk MeSH
• RNA nádorová biosyntéza   MeSH
• RNA ribozomální biosyntéza   MeSH
• vazebná místa MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• hematologie a transfuzní lékařství
• biologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

• MeSH
• polymerázová řetězová reakce MeSH
• ribonukleoproteiny MeSH
• RNA izolace a purifikace   MeSH
• sekvenční analýza RNA MeSH
• Publikační typ
• monografie MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• biochemie
• molekulární biologie, molekulární medicína

• Klíčová slova
• DNA, Laboratorní technika,
• MeSH
• DNA MeSH
• klinické laboratorní techniky MeSH
• nukleové kyseliny MeSH
• referenční knihy MeSH
• RNA MeSH
• Publikační typ
• příručky MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• biologie
• biochemie

• MeSH
• molekulární biologie MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• biologie

• MeSH
• genetika člověka MeSH
• nukleové kyseliny MeSH
• Publikační typ
• vysokoškolské kvalifikační práce MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• genetika, lékařská genetika

S100A4 je ve zvýšených hladinách přítomen v plazmě pacientů s chronickým průběhem RA a koreluje s aktivitou onemocnění. Hladiny S100A4 budou měřeny metodou ELISA u pacientů s časnou a etablovanou RA a jeho hladiny v plazmě budou korelovány s laboratorními a klinickými ukazateli onemocnění, především s rentgenovou progresí. Vzhledem k tomu, že se S100A4 může podílet na regulaci některých patofyziologických mechanismů souvisejících s tkáňovým poškozením, bude významná část našeho projektu zaměřena na studium vlivu S100A4 na chondrocyty a osteoblasty, a intracelulární roli S100A4 v monocytech. Pro „in vitro“ experimenty bude využita metoda genových arrays a proteinové detekce. Vliv inhibice S100A4 na zánět synoviální membrány a destrukci kloubu bude studován na experimentálním myším modelu artritidy.; S100A4 protein is increased in the blood circulation of patients with established RA and correlates with the disease activity. The protein will be analysed by ELISA in patients with early and established disease and its plasma levels will be correlated with laboratory markers and clinical characteristics of the disease, particularly with radiographic progression. S100A4 can regulate some pathophysiological functions involved in tissue destruction; therefore we will study the effect of the protein on chondrocytes and osteoblasts, and intracellular function of S100A4 using gene array and protein determination in “in vitro” experiments. The effect of S100A4 blockade on synovial inflammation and joint destruction will be studied in an experimental model of arthritis.

• MeSH
• ELISA MeSH
• exprese genu MeSH
• malá interferující RNA MeSH
• myši transgenní MeSH
• revmatoidní artritida MeSH
• S100 kalcium vázající protein A4 MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• molekulární biologie, molekulární medicína
• revmatologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

MicroRNA (miRNA), zapojené do post-transkripční genové regulace, sehrávají důležitou roli v karcinogenezi. Změny jejich exprese a funkce často nalézáme v kolorektálním karcinomu (CRC). Jednonukleotidové polymorfismy (SNPs) v miRNA genech a v 3`nepřepisovaných regionech cílových genů mohou ovlivnit individuální jak riziko vzniku rakoviny, tak i klinické výstupy. Naše nedávne studie na SNPs ve vazebných místech miRNA genů opravy DNA nás inspirovali k dalším studiím jejich vlivu u všech genů DNA opravy a genů důležitých pro CRC ve vztahu k riziku rakoviny, celkovému přežití a účinnosti terapie u pacientů s CRC v ČR, kde incidence CRC vykazuje nejvyšší hodnoty. Varianty spjaté s rizikem CRC a/nebo celkovým přežíváním budou rovněž funkčně testovány. Exprese jednotlivých miRNA, spojené s rizikem CRC, budou následně analyzovány u nově diagnostikovaných pacientů s CRC. Identifikace a validace příslušných SNPs v interakci miRNA regulaci a s klinickými údaji možňuje posoudit individuální vnímavost k CRC a poskytuje nové důležitá data o prognóze a individuální terapii.; MicroRNAs (miRNAs), involved in post-transcriptional gene regulation, play relevant role in human cancer. Their aberrant function and/or expression often occur in colorectal cancer (CRC). Single nucleotide polymorphisms (SNPs) in miRNA genes and in 3`untranslated regions of target gene may influence individual cancer risk and clinical outcome. Our recent results on the effect of SNPs in miRNA binding sites of DNA repair genes provided the rationale to expand the study on SNPs in all DNA repair genes, in CRC relevant genes and in miRNA-related genes in relation to cancer risk, survival and therapy outcome in a group of CRC patients from the Czech Republik where the incidence of CRC tends to be the highest. SNPs associated with CRC risk and/or survival will be tested for their functionality. Expression levels of miRNAs affected by variations will also be assessed in incident CRC patients. Identification and validation of SNPs interfering with miRNA regulation may provide new important data on CRC susceptibility, prognosis and personalized therapy.

• MeSH
• adjuvantní chemoterapie MeSH
• karcinogeneze genetika   MeSH
• kolorektální nádory terapie   MeSH
• mikro RNA genetika   MeSH
• mutace genetika   MeSH
• rizikové faktory MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• genetika, lékařská genetika
• onkologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

K bližší charakterizaci ztráty DMPK a vlivu CUG repetice na rozvoj patologie myotonické dystrofie se zaměříme na (1) identifikaci normálních tkání, ve kterých jsou exprimovány DMPK protein a jeho mRNA, (2) identifikaci ložisek obsahujících CUG/CCUG repetice u pacientů s DM1 DM2, a (3) sledování exprese a lokalizace muscleblind a dalších mRNA vazebných proteinů v normálních lidských tkáních i ve tkáních pacientů s myotonickou dystrofií.; In order to better characterize the role of DMPK loss and the effects of CUG repeat expression in the development of DM pathology, we plan (1) to establish the identity of normal tissues and cell types in which the DMPK protein and the DMPK mRNA are expressed, and, (2) to identify foci containing CUG/CCUG repeats in the tissues of patients with MD1 and MD2, and (3) to check the expression and localization of muscleblind (and other RNA-binding proteins) in normal human tissues and in DM patients´ tissueswith the expanded RNA.

• MeSH
• genetická transkripce MeSH
• hybridizace in situ fluorescenční MeSH
• imunohistochemie MeSH
• mutační analýza DNA MeSH
• myotonická dystrofie patofyziologie   MeSH
• nestabilita genomu MeSH
• proteinový komplex asociovaný s dystrofinem MeSH
• tkáně MeSH
• vazba proteinů MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• biologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

• MeSH
• DNA genetika   MeSH
• genetické jevy MeSH
• genom MeSH
• geny fyziologie   MeSH
• proteiny genetika   MeSH
• RNA genetika   MeSH
• Publikační typ
• monografie MeSH

• Konspekt
• Obecná genetika. Obecná cytogenetika. Evoluce
• NLK Obory
• genetika, lékařská genetika

Mechanismy integrity a nestability genomu v patogeneze a potenciální individualizovaná molekulárně-cílená léčba karcinomu prostaty Hl. řešitel J. Bártek Předmětem projektu je studium mechanismů regulace buněčného cyklu a integrity genomu (např. u radio-a chemoterapie) u rakoviny prostaty, s cílem lépe pochopit molekulární patogenezi, citlivost či rezistenci na léčbu a úlohu nádorových kmenových buněk v těchto procesech. K řešení bude využito modelů buněčných kultur a genového přenosu, klinického materiálu a imunohistochemie a metod buněčné a molekulární biologie. Projekt přispěje k objasnění rezistence na klasickou léčbu, k odhadu odpovědi na terapii a k přiblížení individualizace léčby, zejména u obtížně léčitelných, na androgenech nezávislych nadorůprostaty, včetně lepšího pochopení genetické nestability a návrhu strategie kombinace klasické radio-/chemoterapie a molekulárně-cílené modulace signalizace a opravy poškozené DNA. Projekt tedy přispěje k řešení závažného problému současné onkologie.; Genomic integrity and instability mechanisms in the pathogenesis and potential personalized targeted treatment of prostate cancer. PI: J. Bártek The key topic of this project is analysis of cell cycle checkpoints and genome integrity maintenance mechanisms (e.g. in radio/chemotherapy) in prostate cancer, to better understand molecular pathogenesis, treatment responsiveness or resistance, and the role of cancer stem cells in these processes. We will use cell culture and gene transfer models, clinical material and a wide range of immunohistochemical, cell and molecular biology methods. The project will elucidate resistance to standard treatment, predictive assessment and individualized management, especially in androgen-independent prostate tumours, to provide new insights into genetic instability and proposals for combining standard radio/chemotherapy and targeted modulation of DNA damage signaling and repair pathways. This project should therefore address one of the major concerns in current oncology.

• MeSH
• buněčný cyklus MeSH
• cílená molekulární terapie MeSH
• DNA vazebné proteiny MeSH
• genom lidský MeSH
• nádorové kmenové buňky MeSH
• nádory prostaty MeSH
• oprava DNA MeSH
• poškození DNA MeSH
• sekvenční analýza RNA MeSH
• western blotting MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• andrologie
• onkologie
• biologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR