Závěrečná zpráva o řešení grantu Agentury pro zdravotnický výzkum MZ ČR
Nestr.
Myelodysplastic syndrome (MDS) is a clonal disorder characterized by ineffective hematopoiesis and increased risk of transformation to leukemia. Low-risk MDS patients are typically transfusion dependent, and their chelation therapy not only removes surplus of toxic iron stores, but has also antiproliferative and proapoptotic effects on tumor cells. Our preliminary data revealed activation of DNA damage response (DDR) signaling and induction of apoptosis in pluripotent stem cells exposed to iron chelator in vitro. In vivo, 6-week applications of chelator to preleukemia mice lead to decrease of actively replicating myeloid cells and activation of G2/M checkpoint. Correspondingly, we observed activation of stress signaling pathways in CD34+ cells from low-risk MDS patients receiving chelation therapy. We propose: to elucidate how iron chelation reinforces DDR and cell cycle checkpoints in oncogene-positive pre-leukemia cells in vivo; to identify biomarkers in MDS useful in clinical practice, allowing prediction of positive effect of chelation therapy for leukemia free survival.
Myelodysplastický syndrom (MDS) je klonální onemocnění charakterizované neefektivní krvetvorbou projevující se periferní cytopenií a dysplastickými změnami v kostní dřeni. Pro pacienty ze skupiny s nízkým rizikem je typická transfúzní závislost, která vede k přetížení organismu železem. Chelatační terapie by mohla mít, kromě odstranění nadbytku toxického železa, i antiproliferační a proapoptotické účinky. Ukázali jsme, že in vitro došlo u pluripotentních kmenových buněk vystaveným chelátoru k aktivaci odpovědi na poškozenou DNA a k indukci apoptózy. In vivo, u myšího modelu preleukémie, vedla 6ti-týdenní aplikace chelatačních látek k poklesu aktivně replikujících buněk a k aktivaci G2/M kontrolního uzlu buněčného cyklu. Cílem projektu je popsat vliv chelatace na aktivaci stresových drah a kontrolních bodů buněčného cyklu a nalézt nové molekulární markery k identifikaci pacientů, kteří budou z léčby profitovat vzhledem k délce přežití bez progrese do leukemie. Kandidátní biomarkery budou ověřovány molekulárně-geneticky a imunohistochemicky na souboru chelatovaných nemocných s MDS.
- MeSH
- antitumorózní látky terapeutické užití MeSH
- chelátory železa terapeutické užití MeSH
- chelátová terapie metody MeSH
- lidé MeSH
- myelodysplastické syndromy farmakoterapie MeSH
- nádorové biomarkery MeSH
- poškození DNA MeSH
- přetížení železem farmakoterapie MeSH
- signální transdukce MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- onkologie
- hematologie a transfuzní lékařství
- farmakoterapie
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR
Závěrečná zpráva o řešení grantu Agentury pro zdravotnický výzkum MZ ČR
Nestr.
Currently, there is no clinical marker which allows a pre-therapeutic selection of patients with head and neck tumors that would profit more from the conservative therapy or primary surgery, respectively. We meaningfully contribute to solution of this "First Therapy Dilemma" by developing a method for in vitro detection of DNA breaks mediating the effects of (chemo)radiotherapy. By this method, we will sensitively determine the radiosensitivity of tumors before beginning the treatment, identify patients hypersensitive or resistant to radiation, and help to optimize the therapy. The method also enables us to elucidate the effectiveness of alternative irradiation regimes, explore and develop new therapeutic approaches (the replication stress induction and proton irradiation) and categorize patients for the best therapy. For the first time in this context, we compare primocultures of different cell types isolated from the tumor. Though, the main aim of this project remains to develop a cost-efficient, fast, robust, and easy to perform diagnostic method with a large room for automation.
V současnosti není znám klinický marker, který by umožňoval odlišit pacienty s nádory hlavy a krku, kteří budou více profitovat z konvenční léčby, od těch, kterým lépe poslouží chirurgický zákrok. V rámci projektu významně přispějeme k řešení tohoto "Dilematu první léčby" zavedením metody in vitro detekce zlomů DNA, jež zodpovídají za účinek konvenční (chemo)radioterapie. V našem výzkumu a v praxi tato metoda umožní velmi citlivě stanovit radiosensitivitu jednotlivých nádorů již před započetím léčby, spolehlivě odhalit pacienty hypersensitivní či rezistentní k záření a optimalizovat terapii. Takto vytipujeme nádory neodpovídající na současnou léčbu, u kterých budeme, opět s využitím zavedené metody, zkoumat účinnost alternativních režimů ozařování a nových terapií – indukce replikačního stresu a ozařování protony. Vůbec poprvé budeme uvedené problémy studovat na paralelních primokulturách různých buněčných typů vyizolovaných z nádoru. Hlavním cílem projektu však zůstává vývoj levné, rychlé, robustní a snadno proveditelné diagnostické metody s možnostmi automatizace.
- MeSH
- diagnostické techniky molekulární metody MeSH
- genetické testování metody MeSH
- lidé MeSH
- nádorové biomarkery genetika MeSH
- nádory hlavy a krku diagnóza genetika terapie MeSH
- poškození DNA genetika MeSH
- protonová terapie MeSH
- radioterapie metody MeSH
- techniky in vitro MeSH
- tolerance záření MeSH
- výsledek terapie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- onkologie
- genetika, lékařská genetika
- radiologie, nukleární medicína a zobrazovací metody
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR
Závěrečná zpráva o řešení grantu Agentury pro zdravotnický výzkum MZ ČR
Nestr.
The increasing frequency of infertility has become a major public health concern. Male infertility is the primary or contributing cause in approximately 60% of all cases. Diabetes mellitus (DM) reflected by persistent hyperglycaemia (PH) is suspected to be a contributing factor in male infertility. Increase in DM frequency together with its lower age at diagnosis is negatively compounded by the increasing age at reproduction. Epidemiological data together with analyses in animal models provided evidence of the association of PH on decreased sperm quality and impaired spermatogenesis. The role of PH in male infertility has been under-diagnosed thus far, while the exact molecular pathogenesis related to PH has not been studied in human subjects. This project therefore focuses on the 1) pathogenetic role of PH in male infertility and success in ART in these patients, 2) selection of an optimal andrologic dg. method in such instances, and 3) elucidation of the mol. pathogenesis and epigenetic disturbances due to PH in an animal model.
Celkově se zvyšující podíl neplodných párů je v současné době závažným problémem. Mužský faktor je příčinou v přibližně 60% a tento podíl bude narůstat. Jedním z rizikových faktorů u mužské neplodnosti je i diabetes mellitus (DM), který se projevuje jako persistentní hyperglykémie u obou svých typů. Nárůst četnosti DM a snižující věk diagnózy se negativně kombinuje se zvyšujícím se věkem reprodukce. Epidemiologické studie prokazují asociaci persistentní hyperglykémie se sníženou kvalitou spermií a zvířecí modely přinesly první data ohledně jejího dopadu na spermatogenezi. Dosud byl dopad DM při vyhodnocování mužské infertility opomíjen a plný rozsah molekulárně patogenetických změn u DM na lidskou spermatogenezi nebyl probádaný. Tento projekt je proto zaměřen na: 1) zhodnocení vlivu persistentní hyperglykémie u idiopatické mužské neplodnosti a při úspěšnosti asistované reprodukce (ART) u DM, 2) výběr vhodné andrologické metody při ART u DM, a 3) objasnění epigenetických a molekulárních změn při spermatogenezi indukovaných persistentní hyperglykémií na zvířecím modelu
- MeSH
- andrologie MeSH
- asistovaná reprodukce MeSH
- diabetes mellitus 2. typu MeSH
- fragmentace DNA MeSH
- genomika MeSH
- komplikace diabetu MeSH
- modely nemocí na zvířatech MeSH
- mužská infertilita diagnóza genetika MeSH
- myši MeSH
- spermatogeneze genetika MeSH
- spermie MeSH
- vysoce účinné nukleotidové sekvenování MeSH
- Check Tag
- myši MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- genetika, lékařská genetika
- reprodukční lékařství
- diabetologie
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR
Závěrečná zpráva o řešení grantu Agentury pro zdravotnický výzkum MZ ČR
Nestr.
The project consists of preclinical development of novel small-molecule selective inhibitor of CHK1 kinase (OH209EN1) with expected effective antitumour activity based on the concept of synthetic lethality. This revolutionary concept in targeted anticancer therapy is based on simultaneous elimination of two or more complementary pathways essential for the cell, which results in lethal effect. This mechanism of action, already validated in the clinic, can be selectively applied to cancer cells while taking advantage of the mutations (e. g., in TP53 or ATM genes) acquired during the development of malignancy. In the pilot test, our unique inhibitor OH209EN1 demonstrated significantly better activity than the structurally related compound SCH900776, which is already profiled in clinical trials. Our newly developed organic synthesis is envisioned to afford gram quantities of OH209EN1 that are necessary for thorough testing of the compound. Efficacy of OH209EN1 will be assessed in solid tumours and leukaemias where targeted inhibition of CHK1 will provide the synthetic lethal response.
Navržený projekt představuje preklinický vývoj nového nízkomolekulárního selektivního inhibitoru kinázy CHK1 (OH209EN1), u kterého se předpokládá silná protinádorová aktivita, založená na mechanismu syntetické letality. Jedná se o přelomový koncept cíleného působení protinádorových léčiv, kdy simultánním vyřazením dvou či více vzájemně komplementárních a pro buňku esenciálních biologických drah dojde k jejímu letálnímu poškození. Tento mechanismus účinku, o jehož funkčnosti již existují silné klinické důkazy, lze selektivně omezit pouze na nádorové buňky, využije-li se mutací získaných v důsledku maligní transformace (např. v genech TP53, ATM). V pilotních testech vykázal náš unikátní inhibitor OH209EN1 podstatně lepší účinnost než strukturně příbuzná sloučenina SCH900776, která je nyní klinicky testována. Námi nově vyvinutá organická syntéza by měla umožnit přípravu OH209EN1 v gramových množstvích, potřebných pro důkladné testování této sloučeniny. Účinky OH209EN1 budou analyzovány u solidních tumorů a leukémií, kde předpokládáme, že cílená inhibice CHK1 navodí syntetickou letali...
- MeSH
- checkpoint kinasa 1 antagonisté a inhibitory MeSH
- chronická lymfatická leukemie farmakoterapie MeSH
- cytostatické látky terapeutické užití MeSH
- geny p53 MeSH
- nádorové supresorové proteiny terapeutické užití MeSH
- nádory endometria farmakoterapie MeSH
- nádory prsu farmakoterapie MeSH
- nádory vaječníků farmakoterapie MeSH
- poškození DNA MeSH
- preklinické hodnocení léčiv MeSH
- umělé letální mutace MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- onkologie
- molekulární biologie, molekulární medicína
- farmacie a farmakologie
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR
1. vydání 351 stran : ilustrace, tabulky ; 20 cm
- MeSH
- Alzheimerova nemoc MeSH
- chytrý telefon MeSH
- elektromagnetická pole škodlivé účinky MeSH
- elektromagnetické záření MeSH
- internet MeSH
- nádory MeSH
- počítače MeSH
- poškození DNA MeSH
- rizikové faktory MeSH
- Publikační typ
- populární práce MeSH
- Konspekt
- Veřejné zdraví a hygiena
- NLK Obory
- veřejné zdravotnictví
- patologie
- fyzika, biofyzika
Závěrečná zpráva o řešení grantu Interní grantové agentury MZ ČR
1 svazek : ilustrace, grafy ; 30 cm
The project is aimed to verify the practical use of selected molecular markers in the diagnosis, progression monitoring and prediction of further behavior of gastric cancer and the possible estimation of prognosis. The genes encoding key members of the signaling pathways participating in the etiopathogenesis of gastric cancer will be investigated. These are mainly genes coding proteins of the receptor and nonreceptor proteinkinases, signaling pathways involved in proliferation, differentiation, apoptosis and invasiveness of tumor cells (PI3K/Akt/PTEN, Ras / Raf / MAPK, Wnt / ß-catenin and others with them associated) and finally, factors of cell adhesion, cell cycle control and the DNA repair systems. Candidate markers will be identified on the basis of a detailed literature search and their presence in tumor tissue be correlated with patient anamnestic data and clinical parameters such as tumor stage, histological subtype, etc.
Projekt je zaměřený na ověření možnosti praktického použití vybraných molekulárních markerů (somatických mutací a genových amplifikací) v diagnostice, sledování progrese a predikci dalšího chování nádoru žaludku a možného odhadu prognózy pacientů. Vyšetřovány budou geny kódující klíčové členy signálních drah participujících na etiopatogenezi karcinomu žaludku. Jedná se především o geny kódující proteiny z oblasti receptorových i nonreceptorových proteinkináz, signálních drah působících na proliferaci, diferenciaci, invazivitu a apoptózu nádorových buněk (PI3K/Akt/PTEN, Ras/Raf/MAPK, Wnt/ß-catenin a další dráhy s nimi sdružené) a konečně faktory buněčné adheze, kontrololy buněčného cyklu a tzv. DNA repair systémů. Kandidátní markery budou identifikovány na základě detailní literární rešerše a jejich výskyt v tumorózní tkáni bude korelován s anamnestickými údaji pacienta a klinickými parametry nádoru jako jsou stádium, histologický subtyp, apod.
- MeSH
- adhezivita MeSH
- amplifikace genu MeSH
- mutace MeSH
- nádorové biomarkery MeSH
- nádory žaludku MeSH
- poškození DNA MeSH
- prognóza MeSH
- proliferace buněk MeSH
- Konspekt
- Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
- NLK Obory
- molekulární biologie, molekulární medicína
- gastroenterologie
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR
Závěrečná zpráva o řešení grantu Interní grantové agentury MZ ČR
1 svazek : grafy ; 30 cm
To use chip technologies and molecular genetic methods in the study of gene changes in the tumor genome of patients with CLL to determine genetic changes of a prognostic significance and to acquire knowledge applied in studying the role and impact of genetic changes in the pathogenesis of CLL. Based on the knowledge: A) the arrayCGH method with oligonucleotide, SNPs and chromosome-specific chips will be used to analyze the genome of CLL patients at diagnosis and in the course of the disease B) arrayCGH and FISH with specific probes will be used for mapping the breakpoints in patients with changes on chromosomes 6, 11 and 13 C) molecular genetic methods (e.g. RT-PCR, Q-RT-PCR, sequencing) will be used to study expression of selected genes and other potential candidate genes D) the protein analysis will be used to follow signaling pathways of DNA damage response (DDR) E) clinical data will be analyzed to obtain detailed clinically prognostic characteristics of the analyzed subgroups of patients
Využití čipových technologií a metod molekulární genetiky pro studium genových změn v nádorovém genomu nemocných s CLL s cílem určit genetické změny prognostického významu a tyto poznatky využít ke studiu role a významu genetických změn v patogenezi onemocnění a cílené léčbě "šité na míru". Projekt bude: A) metodou arrayCGH s oligonukleotidovými, SNPs a chromosomově specifickými čipy analyzovat genom nemocných s CLL v době diagnózy a průběhu onemocnění B) pomocí metod molekulární cytogenetiky mapovat zlomová místa na chromosomech 6, 11 a 13 C) pomocí molekulárně genetických metod (např. RT-PCR, Q-RT-PCR, HRMC) sledovat expresi vybraných genů včetně miRNA D) pomocí analýzy proteinů sledovat signální dráhy odpovědi na poškozenou DNA E) pomocí analýzy klinických dat chceme co nejpřesněji prognosticky charakterizovat nepříznivé podskupiny nemocných a najít pro ně optimální léčebný přístup využívající cílenou léčbou šitou na míru
Závěrečná zpráva o řešení grantu Interní grantové agentury MZ ČR
1 svazek : ilustrace ; 30 cm
The goal of the project is to find new prognostic markers characterizing the disease progression and response to therapy of myelodysplastic syndrome (MDS) using 5-azacytidine (Vidaza) that is currently used as the first choice remedy. We assume that MDS as preneoplastic stadium is caused by genome instability of stem and stromal bone marrow cells, which leads to DNA damage response, resulting in cellular senescence or apoptosis. From immunologic point of view, this state is associated with functional and phenotypic changes of effector and regulatory cells. The treatment with Vidaza results in the phenotypic changes of the bone marrow cells also in respect to senescence, as well as in the cytokine milieu that influence the disease progression. Analysis of changes in the cytokine production, expression of senescence markers and the phenotype of bone marrow cells before and during the treatment will enable us to find prognostic markers for the disease development and Vidaza treatment efficacy monitoring.
Cílem projektu je nalézt nové prognostické markery charakterizující rozvoj onemocnění a účinnost terapie myelodysplastického syndromu (MDS) pomocí 5-azacytidinu (Vidázy). Vycházíme z předpokladu, že MDS jako preneoplastické stadium je způsoben nestabilitou genomu kmenových či stromálních buněk kostní dřeně, která vede k aktivaci odpovědi na poškození DNA doprovázené aktivací cytokinové signalizace a buněčné senescence či apoptózy. Z imunologického hlediska je tento stav spojen se změnami funkce efektorových a regulačních buněk. Terapeutickým působením 5-azacytidinu dochází k ovlivnění fenotypu (i z hlediska senescence) buněk kostní dřeně a změnám v cytokinovém milieu, které ovlivní další progresi onemocnění. Z porovnání produkce cytokinů, senescentních markerů a fenotypu buněk kostní dřeně před léčbou a v jejím průběhu lze najít prognostické markery pro sledování průběhu onemocnění a účinnost terapie 5-azacytidinem.
Závěrečná zpráva o řešení grantu Interní grantové agentury MZ ČR
1 svazek : ilustrace, tabulky ; 30 cm
The main aim of the project is detection of DNA instability resulting in chromosomal aberrations of somatic cells, gametes, embryos, disturbances of preimplantation and embryonal development associated with dysfertility. Utilised methods will detect submicroscopic chromosomal aberrations, thereby assessing the degree of genotoxicity, effects of oncological therapy, nonindividualised FSH variant-based hormonal therapy in IVF, risks of gamete / embryo / gonad cryopreservation in patients with ovarian / testicular carcinomas and in children with hematological malignancies or solid tumors. Using polarization microscopy we will study secondary effects of instability on the vacuolization of the sperm head, impairment of oocyte membranes or mitotic spindle, which leads to chromosomal aneuploidies. Single-cell arrayCGH will detect deletions, duplications and aneuploidies, thereby assuring efficacious preimplantation diagnostics at the level of all chromosomes.
Předmětem projektu je zdokonalení detekce instability DNA, vedoucí k chromozomálním aberacím somatických buněk, gamet a embryí po úspěšné onkologické léčbě, jejíž důsledkem je narušení preimplantačního a embryonálního vývoje a dysfertilita. Použité metody umožní detekci submikroskopichých chromozomálních aberací a tím zjištění stupně genotoxicity onkologické léčby, rizik hormonální terapie nerespektující genotyp hormonálních receptorů a rizika kryoprezervace gamet, embryí a gonád u pacientů s karcinomem ovaria, testes, dětí a dospívajících s hematologickými malignitami či solidními nádory. Polarizační mikroskopií budou studovány sekundární účinky instability na vakuolizaci hlaviček spermií, poškození oocytárních membrán a dělícího vřeténka, které jsou asociovány s rizikem chromosomálních aneuploidií u embrya. ArrayCGH umožní zachytit submikroskopické delece, duplikace a aneuploidie, i na úrovni jedné embryonální buňky či gamety, a tak zdokonalit preimplantační diagnostiku všech chromozomů.
- MeSH
- androgenní receptory MeSH
- chromozomální aberace MeSH
- gonadální dysgeneze MeSH
- infertilita MeSH
- kryoprezervace MeSH
- kvantitativní polymerázová řetězová reakce MeSH
- lékařská onkologie MeSH
- multiplexová polymerázová řetězová reakce MeSH
- polymorfismus genetický MeSH
- poškození DNA MeSH
- preimplantační diagnóza MeSH
- protaminy MeSH
- receptory FSH MeSH
- receptory LH MeSH
- srovnávací genomová hybridizace MeSH
Závěrečná zpráva o řešení grantu Interní grantové agentury MZ ČR
1 svazek : ilustrace, tabulky ; 30 cm
Although the adducts with blood protein globin are known biomarkers of long-term exposures to reactive compounds, their fate after termination of the carrier protein lifetime has been totally unexplored. We hypothesize that proteolytic degradation of adducted globin will liberate amino acid adducts, which will be partly metabolized and excreted in urine, thus constituting a unique new type of noninvasive biomarkers. To address this hypothesis, a series of model amino acid adducts derived from selected industrial chemicals will be synthesized and administered to rats to assess the adducts´ recovery and metabolic products in urine. Then, rat blood will be incubated in vitro with specific reagents to produce native adducted globin in viable erythrocytes. These will be transferred to circulation of other rats, and excretion of the amino acid adducts and their metabolites in urine will be monitored. The study is a gate-opening to novel applications in toxicology and possibly also pharmacology.
Přestože adukty s globinem jsou využívány jako biomarkery dlouhodobé expozice reaktivním látkám, jejich další osud v organismu po ukončení životnosti globinu je zcela neprobádaný. Cílem projektu je ověření hypotézy, že proteolytickou degradací globinových aduktů se uvolní jednotlivé aminokyselinové adukty, které se buď volné nebo po dalších přeměnách vylučují močí, a že tyto produkty představují novou skupinu biomarkerů s velmi výhodnými vlastnostmi (specifita, dlouhá persistence, neinvazivní odběr). Modelové aminokyselinové adukty odvozené od vybraných toxických látek budou podány potkanům s cílem popsat vylučování těchto látek a jejich metabolitů v moči. Dále budou in vitro inkubací potkaní krve s reaktivními prekursory připraveny globinové adukty přímo v erythrocytech, které budou vráceny zpět do krevního oběhu. V moči pak budou sledovány volné adukty a jejich metabolity vzniklé degradací globinových aduktů. Studie otevírá nové pole aplikací v toxikologii a případně také ve farmakologii.
- MeSH
- adukty DNA MeSH
- biologické markery analýza moč MeSH
- globiny analýza moč MeSH
- jedy metabolismus MeSH
- krysa rodu rattus MeSH
- modely u zvířat MeSH
- preventivní lékařství MeSH
- produkty rozkladu proteinů MeSH
- tandemová hmotnostní spektrometrie MeSH
- vysokoúčinná kapalinová chromatografie MeSH
- xenobiotika metabolismus MeSH
- Check Tag
- krysa rodu rattus MeSH
- Konspekt
- Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
- NLK Obory
- biochemie
- toxikologie
- preventivní medicína
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR