During ageing of human organism the heart is subject to functional, morphological and cellular changes. Independent of the age the telomeres may be engaged to the beginning and/or to the progression of cardiovascular diseases. On the basis of current knowledge we supposed that the length of telomeres both in peripheral blood and in the samples of tissue will differ with patients with organ rejection and that the length of telomeres will be connected with the duration of survival after transplantation. We will determine relative length of telomeres by means of the recently developed method using Q PCR, successfully introduced in our laboratory. In the project we count with the analysis of about 500 individuals.

Během stárnutí lidského organismu podléhá srdce funkčním, morfologickým a buněčným změnám. Na základě současných znalostí předpokládáme, že délka telomer jak v periferní krvi, tak ve vzorcích tkáně bude odlišná u pacientů s orgánovou rejekcí , a délka telomer bude souviset s délkou přežívání po transplantaci. Relativní délku telomer budeme stanovovat pomocí nedávno vyvinuté metody využívající Q PCR, úspěšně zavedené v naší laboratoři. V projektu počítáme s analýzou cca 500 jedinců.

• MeSH
• polymorfismus genetický MeSH
• rejekce štěpu MeSH
• telomery MeSH
• transplantace srdce MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• kardiologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Survivors of childhood cancer have laboratory signs of accelerated aging, especially telomere shortening which is caused by chemotherapy and /or by radiotherapy. It was described increased risk of cancer in persons with shorter telomeres in blood leukocytes. Therefore, we presume that these signs of aging (short telomeres and/or increased expression of markers of cellular senescence) can serve as a predictive factor(s) of secondary cancers. These laboratory predictive factors are important for improving, price reduction and simplification of surveillances of secondary malignancies because it will allow selective controls in different groups of survivors according to laboratory parameters

Osoby vyléčené v dětství z nádorů mají laboratorní známky urychleného stárnutí, především zkrácení telomer což je vyvoláno chemoterapií a/nebo radioterapií. Zkrácení telomer v leukocytech periferní krve bylo popsáno u některých nádorů. Proto předpokládáme, že tyto známky stárnutí (zkrácení telomer nebo zvýšená exprese markerů buněčné senescence v leukocytech) mohou sloužit jako prediktivní faktor(y) vzniku sekundárních malignit. Tyto prediktivní faktory jsou důležité pro zlepšení ale i zlevnění a zjednodušení včasného záchytu sekundárních malignit, protože umožní selektivní kontroly různě rizikových skupin přeživších rozdělených podle laboratorních parametrů.

• Klíčová slova
• pozdní následky léčby pro nádory dětského věku, známky urychleného stárnutí, sekundární nádory, délka telomer, rizikové faktory sekundárních nádorů, late effects of therapy for childhood cancer, signs of accelerated aging, subsequent malignant neoplasms, telomeres length,

• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

We will deal with changes of telomere length and telomerase activity in myeloid leukemia and myelodysplastic syndromes.The TRF,PRINS,TRAP,and quantitative RT-PCR methods will be performed on bone marrow samples of the patients and healthy controls. The results correlated with hTERT gene expression,clinical data and chromosomal aberrations could establish diagnoszic and prognostic markers of leukemia and MDS.Also,telomeric pathway of leukemogenesis might be elucidated and therapy targets found.

Projekt je zaměřen na výzkum změn délky telomér chromozomů a aktivity telomerázy u myeloidní leukémie a myelodysplázie s cílem nalézt nové diagnostické a prognostické markéry i přispět k objasnění jejich role v leukemogenezi a využití jako cílů léčby. Výsledky stanovení délky telomér,exprese telomerázy a hTERT genu metodami TRF,PRINS,TRAP a kvantitativní RT-PCR ve vzorcích DNA,cDNA a proteinových extraktů z kostní dřeně pacientů budou korelovány s klinickými údaji a výskytem genomových změn.

• MeSH
• hematologické nádory diagnóza   genetika   MeSH
• hematopoetické kmenové buňky MeSH
• nádorová transformace buněk MeSH
• nádorové biomarkery MeSH
• telomerasa MeSH
• telomery MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• hematologie a transfuzní lékařství
• onkologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

The project will deal with the study of molecular factors influencicng telomere length and telomerase activity in patients with hematological neopasms and with assessment of their validity as prognostic markers of leukemia and myelodysplastic syndromes.Separated cell fractions of bone marrow and peripheral blood from patients in various stage of leukemia and myelodysplastic syndromes will be analyzed by molecular and scytogenetic methods - quantitative RT-PCr, TRF, TRAP, SPPE, cycling -PRINS and FISH.Comprehending of signaling pathways of telomere-telomerase complex in malignant and normal hematopoietic cells could elucidate a molecular basis of leukemogenesis and might lead to development and clinical application of novel anti-leukemic therapeutics.

Záměrem projektu je studium délky telomér, telomerázové aktivity a jejich molekulárních regulátorů u pacientů s maligními chorobami krvetvorby a určení jejich významu jako nových prediktivních parametrů, jež poskytují podklady pro individualizaci léčby.separované buněčné populace kostní dřeně a teriferní krve nemocných v různých stádiích leukémie a myelodysplastického syndromu budou analyzovány molekulárními a cytogenetickými metodami - kvantitativní RTPCR, TRF, TRAP, SPPE, cycling PRINS a FISH. Znalost signalizačních drah teloméro-telomerázového komplexu v normálních a transformovaných krvetvorných buňkách přispívá k objasnění molekulárních změn v průběhu leukemogeneze a je nezbytnou podmínkou pro vývoj a klinickou aplikaci nové generace léči Perspektivní léčiva, zacílená na inhibici enzymatického komplexu telomerázy se pak mohou stát součástí moderní komplení terapie, která vede ke zvýšení efektivity léčby hematologických malignit.

• MeSH
• fyziologie buňky MeSH
• klinické protokoly MeSH
• leukemie MeSH
• myelodysplastické syndromy MeSH
• nádorové biomarkery MeSH
• telomerasa MeSH
• telomery MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• hematologie a transfuzní lékařství
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

The hypothesis will be tested that the critical period for the origin of atherosclerotic changes in women is menopausal transition depending of genetic, metabolic and environmental insults. Longitudinal study will be performed focused on the damage of vascular wall by measurement of circulating endothelial progenitor cells in different reproductive stages and their association will be determined with external (mainly smoking), metabolic (mainly indicators of decreased insulin resistance and reverse cholesterol transport) and new genetic (length of telomeres) risk factors. Population sample of 909 women of the age 45-54 will be re-examined after 6 years. In addition, sixty women will be selected on the basis of reproduction stage and smoker's habits anddetailed evaluation will be performed of the relation of vascular wall rigidity to sexual hormones and reverse cholesterol transport in this group to determine the effect of the fluctuation of sex hormones on the vessel wall and metabolic parameters.

Předmětem řešení je testování hypotézy, že kritickým obdobím pro vznik aterosklerotických změn a jejich následků u žen je přechod do menopauzy. Bude provedena longitudinální studie zaměřená na poškození cévní stěny stanovením počtu cirkulujících endoteliálních progenitorových buněk v různých reprodukčních obdobích a bude určena jejich asociace se zevními (především kouření), metabolickými (především ukazateli snížené inzulínové senzitivity a reverzního transportu cholesterolu) a novými genetickými (délka telomér) rizikovými faktory. Bude vyšetřen populační vzorek 909 žen ve věku 45-54 let vyšetřených v letech 2003-2005. U 60 žen vybraných na základě reprodukčního stavu a kuřáckých návyků bude provedeno podrobnější vyšetření vztahu tuhosti cévní stěny kpohlavním hormonům a reverznímu transportu cholesterolu. Tím bude otestována hypotéza, že v období přechodu do menopauzy za zvýšenou citlivostí cévní stěny k zevním a metabolickým inzultům stojí výrazné kolísání hladin pohlavních hormonů.

• MeSH
• ateroskleróza MeSH
• cholesterol MeSH
• inzulinová rezistence MeSH
• kardiovaskulární nemoci etiologie   MeSH
• kouření MeSH
• longitudinální studie MeSH
• membránové transportní proteiny MeSH
• perimenopauza genetika   metabolismus   MeSH
• progenitory granulocytů a makrofágů MeSH
• telomery MeSH
• věkové faktory MeSH
• ženy MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• gynekologie a porodnictví
• angiologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Annotation I: Detection of specific genomic aberrations in patients with B-CLL using molecular cytogenetic methods, assessment of the telomere length and hTERT gene expression profile. Annotation II: Correlation of molecular cytogenetic and molecular genetic results with IgVH mutation status, morphological and immunophenotypical parameters and their prognostic significance.

Anotace I: Detekce specifických chromosomových aberací u nemocných s chronickou lymfatickou leukémií B typu metodami molekulární cytogenetiky, stanovení délky telomér a expresního profilu genu hTERT. Anotace II: Vyhodnocení korelace výsledků molekulárměgenetických a molekulárně cytogenetických metod s mutačním stavem IgVH genů, s klinickými a imunofenotypickými nálezy a určení jejich diagnostického a prognostického významu.

• MeSH
• chromozomální aberace MeSH
• chronická lymfatická leukemie diagnóza   terapie   MeSH
• cytogenetické vyšetření MeSH
• hybridizace in situ fluorescenční MeSH
• imunofenotypizace MeSH
• prognóza MeSH
• reverzní transkriptasa MeSH
• telomerasa MeSH
• telomery MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• biologie
• hematologie a transfuzní lékařství
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

1. Analysis of gene expression profile in MDS patients using cDNA microarray assay . Investigation of mutation status of proliferation genes and by determination of methylation status of differentiation genes. 2. Comparison of results obtained by gene expression profiling with results of clonality assay, measurement of telomere length and with karyotype analysis using molecular cytogenetics methods as well as with clinical data. 3. Determination of valid prognostic factors on the base of results of molecular genetics methods contributing to identification of a subgroup of risk patients with early MDS and potentially adverse outcome which should be indicated for stem cell transplantation. 4. Usefulness of a complex of molecular genetics methods for evaluation of clonal remission after chemotherapy or after administration of drugs targeting methylation status of differentiation genes or activity of proliferation genes.

1. Analýza genového expresního profilu u nemocných s MDS pomocí biočipů, sledování mutačního stavu proliferačních genů a stupně metylace promotorů diferenciačních genů. 2. Porovnání nálezů získaných při vyšetření genového expresního profilu s vyšetřenímstupně klonality, délky telomér, s analýzou karyotypu pomocí metod molekulární cytogentiky a s klinickými daty. 3. Určení prognostických faktorů na molekulárně genetické úrovni, jež by pomohly identifikovat u časných fází MDS rizikové nemocné s potenciálně nepříznivou prognosou a indikovaných k transplantaci krvetvorných buněk. 4. Využití komplexu molekulárně genetických metodik k hodnocení klonální remise po chemoterapii či po podání látek cíleně ovlivňujicích stupeń metylace diferenciačních genů a aktivitu proliferačních genů.

• MeSH
• diagnostické techniky molekulární MeSH
• DNA sondy MeSH
• exprese genu MeSH
• geny ras MeSH
• karyotypizace MeSH
• klonální delece MeSH
• metylace DNA MeSH
• myelodysplastické syndromy MeSH
• prognóza MeSH
• telomery MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• hematologie a transfuzní lékařství
• onkologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Spinal muscular atrophy is autosomal-recessive disease caused in ca. 95% of cases by homozygous deletion of the SMN1 gene. The SMN1 gene and its SMN2 copy localise to chromosome 5q13. Differences between SMN1 and SMN2 result in different splicing. Transcription and splicing of the SMN1 gene results in full-length mRNA in about 70%, while about the same fraction of SMN2 products shows deletion of the exon 7. Compounds affecting SMN mRNA splicing towards exon 7 inclusion could be used in therapy. The project expands SMA diagnostics by detection of point mutations (ca.5% of SMA cases are caused by SMN1 deletion at one chromosome and point mutation at the other), evaluation of copy no. of SMN2 and correlation of the copy no. and disease phenotype. The project goal is to analyse changes in SMN2 expression at the mRNA and protein level in lymphoblastoid cell lines derived from SMA patients, cultivated with or without phenylbutyrate, i.e., the compound affecting mRNA splicing.

Spinální svalová atrofie je autosomálně recesivní onemocnění způsobené v cca 95% případů homozygotní delecí genu SMN1. Gen SMN1 je se svou kopií, genem SMN2, lokalizován na chromosomu 5q13. Rozdíly mezi genem SMN1 a SMN2 se projevují rozdílným sestřihem.Transkripcí a sestřihem genu SMN1 vzniká v 70% mRNA o plné délce, transkripcí a sestřihem genu SMN2 v 70% mRNA s delecí exonu 7. Látky modifikující sestřih mRNA genu SMN2 směrem k začlenění exonu 7 mohou mít v případě SMA potenciální terapeutický efekt.Úkolem projektu bude rozšíření diagnostiky SMA o detekci bodových mutací (cca 5% případů SMA je způsobeno delecí genu SMN1 na jednom chromosomu a bodou mutací na druhém), dále stanovení počtu kopií genu SMN2 a korelace počet kopií/fenotyp onemocnění. Úkolem projektu bude sledování změn exprese genu SMN2 na úrovni mRNA a proteinu u lymfoblastoidních buněčných linií odvozených od pacientů s diagnózou SMA a kultivovaných v přítomnosti fenylbutyrátu, tj. látky modifikující sestřih mRNA.

• MeSH
• aktivace lymfocytů MeSH
• diagnostické techniky molekulární MeSH
• fenylbutyráty MeSH
• místa sestřihu RNA MeSH
• polymerázová řetězová reakce MeSH
• protein přežití motorických neuronů 1 MeSH
• protein přežití motorických neuronů 2 MeSH
• sestřih RNA MeSH
• spinální svalová atrofie diagnóza   terapie   MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• biologie
• neurovědy
• ortopedie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR