Coeliac disease (CD) is an autoimmune disorder caused by the ingestion of gluten-containing grains. One of the prerequisites for the development of the disease is the presence of specific combinations of HLA alleles at the DQA1 and DQB1 loci. The HLA test is a supportive diagnostic test. In the Czech Republic, approximately 3,500 HLA tests for CD diagnosis are performed annually in almost three dozen laboratories. The HLA Department of the Institute of Haematology and Blood Transfusion in Prague has been offering the EPT "Detection of HLA Alleles Associated with Diseases" for more than 10 years. The results are evaluated in terms of the correct determination of predisposing alleles/allelic groups and clinical interpretation. Every year, we notice some problems with the detection of CD-associated alleles and the interpretation of results. Annual workshops are part of this EPT, and they also include recommendations for the interpretation of results. This interpretation is evolving based on the current knowledge in the field. The current recommendation for interpretation was adopted in 2023, dividing HLA-DQA1/DQB1 genotypes into three categories: 1) detected HLA genotype is associated with predisposition to coeliac disease; 2) coeliac disease could not be excluded based on the detected HLA genotype; 3) coeliac disease could be excluded with high probability based on the detected HLA genotype. The quality of examination is increasing but still needs improvement. Correct results and accurate interpretation can inform clinicians' decisions about the diagnosis of coeliac disease in appropriate patients.
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- přehledy MeSH
Předmětem naší práce je analýza vlivu imunologických parametrů s cílem optimalizace rutinního výběru nepříbuzných dárců krvetvorných buněk. Základním požadavkem úspěšnosti transplantace je shoda mezi dárcem a příjemcem v HLA systému I. a II. třídy. Využití genetických metod pro určení shody v HLA I. třídy znamenalo v našem souboru zlepšení přežití transplantovaných pacientů. Další zpřesnění genetických metod ale již žádné významné zlepšení nepřineslo. U souboru 240 dárců byla sledována míra shody v HLA-DPB1, pouze 8,2 % z nich bylo shodných se svými pacienty. Dalších 114 dárců mělo neshody tolerovatelné dle klinického prognostického modelu DPB1 T-Cell Epitope Algorithm. Netolerovatelné neshody byly detekovány u 37 % dárců. KIR genotyp, který ovlivňuje potransplantační průběh především u pacientů s akutní myeloidní leukemií (AML), byl testován u 347 dárců, 70 % bylo zařazeno do kategorie „neutrální“, 19,3 % bylo v kategorii „lepší“ a 10, 7 % v kategorii „nejlepší“ dle Donor KIR B-content group calculator. Zastoupení jednotlivých kategorií se nelišilo mezi skupinou neselektovaných dárců a dárců vybraných pro transplantaci pro pacienty s AML. Do rutinního výběru dárců bylo zařazeno vyhledání dle tolerovatelnosti neshod v HLA-DPB1, kategorie KIR jsou pouze doplňkovým parametrem aktuálního algoritmu výběru dárců.
The aim of our work was to analyse the influence of immunological parameters in order to optimize routine selection of unrelated stem cell donors. Match in HLA class I and II between the donor and the recipient is the essential requirement for success of the transplantation. The use of genetic methods for match determination in HLA class I improved survival of transplanted patients in our cohort. Further refinement of genetic methods has not resulted in any significant improvement. In a group of 240 donors, the match rate in HLA-DPB1 was monitored, only 8.2% were comletely matched with their patients. Another 114 donors had mismatches tolerable in the DPB1 T-Cell Epitope Algorithm clinical prognostic model. Intolerable mismatches were detected in 37% of donors. The KIR genotype, which affects the post-transplantation course especially in patients with acute myeloid leukemia (AML), was tested in 347 donors, 70% were classified as “neutral”, 19.3% were in “better” and 10.7% in “best” category by Donor KIR B-content group calculator. The representation of individual categories did not differ between the group of non-selected donors and donors selected for transplantation for patients with AML. Routine selection of donors included a search according to the tolerability of mismatches in HLA-DPB1, KIR categories are only a supplementary parameter of the current donor selection algorithm.
- MeSH
- HLA antigeny genetika imunologie MeSH
- lidé MeSH
- nepříbuzný dárce MeSH
- prospektivní studie MeSH
- receptory KIR genetika imunologie MeSH
- retrospektivní studie MeSH
- transplantace hematopoetických kmenových buněk * MeSH
- výběr dárců * MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- MeSH
- celiakie diagnóza genetika imunologie MeSH
- genetická predispozice k nemoci MeSH
- genetické testování metody využití MeSH
- HLA antigeny analýza MeSH
- HLA-DQ antigeny analýza MeSH
- lidé MeSH
- polymerázová řetězová reakce metody MeSH
- testování odbornosti laboratoří MeSH
- zajištění kvality zdravotní péče MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
Alogenní transplantace hematopoetických kmenových buněk je jedním ze způsobů léčby hematologických malignit. Cílem naší práce byla analýza vlivu použitých testů pro výběr dárce a následné potransplantační monitorování na přežití pacientů po provedené transplantaci. Analyzovaný soubor zahrnoval 611 transplantací od HLA shodných dárců. Část zaměřená na výběr dárce posuzovala vliv přesnosti testů shody hlavního histokompatibilního systému (HLA). V této části byl analyzován soubor 292 pacientů transplantovaných od nepříbuzných dárců. Ten byl rozdělen podle používaných genetických metod. Výsledky prokázaly statisticky významný rozdíl v délce přežití po alo-HSCT mezi skupinou pacientů, u nichž shoda HLA byla geneticky stanovena pouze v HLA II. třídy, a skupinou, kde byla genetickými metodami stanovena shoda v HLA I. i II. třídy (p = 0,0189). Přesnost použitých metod (PCR se sekvenčně specifickými primery vs. Sangerovo sekvenování) přežití transplantovaných pacientů dále zásadně neovlivnila (p = 0,6077). Část zabývající se potransplantačním monitorováním hodnotila míru buněčného chimerismu (kompletní, smíšený, mikrochimerismus) a použitou metodu. V této části byl analyzován soubor 474 pacientů transplantovaných od nepříbuzných i příbuzných dárců. Při porovnání délky přežití mezi kategoriemi pacientů se smíšeným a kompletním chimerismem byl zaznamenán vysoce signifikantní rozdíl jak ve skupině pacientů monitorovaných pomocí Variable Number of Tandem Repeats analýzy v kombinaci se Short Tandem Repeats analýzou, tak i ve skupině monitorované vysoce citlivou metodou kvantitativní PCR v reálném čase (p < 0,0001, respektive p = 0,0002). Detekce smíšeného chimerismu je tak vysoce rizikovým faktorem potransplantačního průběhu. Jako potenciálně riziková byla prokázána i skupina pacientů s mikrochimerismem (p = 0,0201). Předpokladem úspěšné transplantace je výběr vhodného dárce na základě genotypové shody v HLA systému a sledování dynamiky buněčného chimerismu po provedení vlastní transplantace pomocí citlivých metod.
Allogeneic haematopoietic stem cell transplantation is one of the curative approaches in haematological malignancies. The aim of our work was to analyse the influence of genetic tests used in the selection of stem cell donor and post-transplant monitoring on patient survival post-transplant. The analysed cohort consisted of 611 transplantations from HLA matched donors. The section of donor selection assessed the impact of HLA test accuracy. The cohort analysed in this section included 292 patients transplanted from unrelated donors. It was divided according to the genetic methods used. The results showed a statistically significant difference between the group of patients with HLA match genetically determined in HLA class II only and the group with both HLA I and II match tested, respectively (p =value 0.0189). The accuracy of the methods used (PCR with sequence specific primers vs. Sanger sequencing) did not significantly affect the survival of the transplanted patients (p = 0.6077). The section of post-transplant monitoring evaluated the degree of cell chimerism (complete, mixed, microchimerism) and the method used. This section analysed 474 patients transplanted from unrelated and related donors. A significant difference in survival was observed between patients with complete and mixed chimerism, respectively: p < 0.0001 using Variable Number of Tandem Repeats analysis in combination with Short Tandem Repeats analysis and p = 0.0002 using highly sensitive quantitative real-time PCR. Detection of mixed chimerism is thus a high-risk factor in the post-transplantation course. The group of patients with microchimerism (p = 0.0201) was also shown to be potentially at risk. The selection of a suitable donor based on genotypic HLA match and cell chimerism monitoring after transplantation using sensitive methods are prerequisites of a successful allo-HSCT.
- Klíčová slova
- alo-HSCT,
- MeSH
- analýza přežití MeSH
- chimérismus MeSH
- genetické testování MeSH
- genotypizační techniky * MeSH
- HLA antigeny analýza genetika MeSH
- homologní transplantace MeSH
- lidé MeSH
- retrospektivní studie MeSH
- transplantace kmenových buněk * MeSH
- výběr dárců * MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
The aim of our study was to analyze the distribution of HLA-DQB1 in Czech patients with central hypersomnias and differences between diagnostic groups of narcolepsy type 1 (NT1), type 2 (NT2), idiopathic hypersomnia (IH) and no central hypersomnia subjects (no-CH). Statistical analysis of DQB1 genotyping was performed on the cohort of 716 patients (375 men, 341 women) with reported excessive daytime sleepiness. DQB1*06:02 allele was present in 94% of the NT1 patients. The decrease of DQB1*06:03 allele was also confirmed. No other DQB1*06 allele nor any other DQB1 allele group was differently distributed in the NT1. In the cohort of NT2 patients DQB1*06:02 allele was present in 43%. Allele group DQB*05 was detected with a significantly higher frequency in this diagnostic unit. Any differences in presence of DQB1*05 alleles in NT2 patients were not reported so far. The cohort of patients with IH did not show any difference in allele distribution of DQB1 alleles/allele groups comparing to healthy controls. DQB1*06:02 allele was significantly increased in the no hypersomnia group. No other DQB1 allele/allele group had any difference in distribution in patients comparing to healthy controls. The different distribution of DQB1*06:02 and other DQB1 alleles/allele groups was detected in analyzed diagnostic groups. These results indicate that DQB1 contributes to the genetic predisposition to NT1, NT2, IH and no-CH in different manners.
- MeSH
- alely MeSH
- bdění MeSH
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- frekvence genu MeSH
- genetická predispozice k nemoci MeSH
- genotyp MeSH
- HLA-DQ beta řetězec genetika MeSH
- idiopatická hypersomnie genetika MeSH
- kohortové studie MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- narkolepsie genetika MeSH
- orexiny metabolismus MeSH
- poruchy iniciace a udržování spánku genetika MeSH
- poruchy nadměrné spavosti genetika MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- spánek MeSH
- studie případů a kontrol MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
