We analyzed mucormycosis data from the Zygomyco.net registry (2009-2022), encompassing cases from 16 countries. India, Russia and the Czech Republic provided the largest contributions. India reported the highest case number, consistent with its substantially higher incidence compared to that of high-income countries. Among the 382 patients with mucormycosis, 236 (61.8%) were male (male-to-female ratio 1.6). The median age was 48 years [interquartile range (IQR) 32-60]. There were 59 pediatric patients (median age ranging from < 1 month to 19 years). Diabetes mellitus type 2 was the most common underlying condition (39%), with significant geographic variation (> 70% of cases in India and Iran but only 6.9% in Europe). Hematologic malignancies (HM, 31.4%), the second most common underlying condition, were absent in India and Iran. The primary clinical presentations were rhino-orbito-cerebral mucormycosis (ROCM, 36.6%), pulmonary (33.2%) and cutaneous mucormycosis (17.5%). Patients with diabetes mellitus typically developed ROCM (55.9%), while pulmonary infections were more common in those with HM or hematopoietic cell transplantation (HCT) (47.5%, p < 0.001). Rhizopus was the leading fungal genus (58%), followed by Lichtheimia (13.7%) and Mucor (7%), with regional variations. Pulmonary infections in HM patients were linked to L. corymbifera and R. microsporus, while Apophysomyces spp. and Saksenaea spp. were more frequent in Indian healthcare-associated cutaneous cases. Concomitant infections were observed in 8.7% of patients with HM, complicating diagnosis and treatment. In most of them (57.1%), Aspergillus spp. was involved. Improved diagnostic practices, including direct microscopy and cultures, showed higher positivity rates, although PCR remained underutilized. Antifungal therapy, primarily with an amphotericin B formulation, combined with surgery, was the most common therapeutic approach. Overall mortality was high (47.8%), particularly in disseminated or advanced ROCM cases. Multivariable analysis identified older age, advanced ROCM, and HM/HCT as independent mortality risk factors (p < 0.05); whereas localized sinusitis and combined medical and surgical therapy were independently associated with improved outcomes (p < 0.006). This study underscores regional disparities in the mucormycosis epidemiology and species distribution. Improved early detection is needed, particularly in immunocompromised populations with HM. Enhanced surveillance and tailored public health strategies are crucial to address this ongoing global health threat.

• MeSH
• celosvětové zdraví MeSH
• dítě MeSH
• dospělí MeSH
• incidence MeSH
• kojenec MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• mladý dospělý MeSH
• mukormykóza * epidemiologie   mikrobiologie   farmakoterapie   MeSH
• novorozenec MeSH
• předškolní dítě MeSH
• registrace * MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• dospělí MeSH
• kojenec MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• mladý dospělý MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• novorozenec MeSH
• předškolní dítě MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• Geografické názvy
• Evropa MeSH

• MeSH
• antibakteriální látky farmakologie   terapeutické užití   MeSH
• aplikace intravaginální MeSH
• bakteriální vaginóza * diagnóza   etiologie   farmakoterapie   MeSH
• lidé MeSH
• probiotika terapeutické užití   MeSH
• vaginální stěr MeSH
• vaginální výtok MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• přehledy MeSH

BACKGROUND: The European Confederation of Medical Mycology (ECMM) collected data on epidemiology, risk factors, treatment, and outcomes of patients with culture-proven candidaemia across Europe to assess how adherence to guideline recommendations is associated with outcomes. METHODS: In this observational cohort study, 64 participating hospitals located in 20 European countries, with the number of eligible hospitals per country determined by population size, included the first ten consecutive adults with culture-proven candidaemia after July 1, 2018, and entered data into the ECMM Candida Registry (FungiScope CandiReg). We assessed ECMM Quality of Clinical Candidaemia Management (EQUAL Candida) scores reflecting adherence to recommendations of the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases and the Infectious Diseases Society of America guidelines. FINDINGS: 632 patients with candidaemia were included from 64 institutions. Overall 90-day mortality was 43% (265/617), and increasing age, intensive care unit admission, point increases in the Charlson comorbidity index score, and Candida tropicalis as causative pathogen were independent baseline predictors of mortality in Cox regression analysis. EQUAL Candida score remained an independent predictor of mortality in the multivariable Cox regression analyses after adjusting for the baseline predictors, even after restricting the analysis to patients who survived for more than 7 days after diagnosis (adjusted hazard ratio 1·08 [95% CI 1·04-1·11; p<0·0001] in patients with a central venous catheter and 1·09 [1·05-1·13; p<0·0001] in those without one, per one score point decrease). Median duration of hospital stay was 15 days (IQR 4-30) after diagnosis of candidaemia and was extended specifically for completion of parenteral therapy in 100 (16%) of 621 patients. Initial echinocandin treatment was associated with lower overall mortality and longer duration of hospital stay among survivors than treatment with other antifungals. INTERPRETATION: Although overall mortality in patients with candidaemia was high, our study indicates that adherence to clinical guideline recommendations, reflected by higher EQUAL Candida scores, might increase survival. New antifungals, with similar activity as current echinocandins but with longer half-lives or oral bioavailability, are needed to reduce duration of hospital stay. FUNDING: Scynexis.

• MeSH
• antifungální látky terapeutické užití   MeSH
• Candida * MeSH
• dodržování směrnic MeSH
• dospělí MeSH
• kandidemie * farmakoterapie   epidemiologie   mikrobiologie   MeSH
• kohortové studie MeSH
• lidé MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• pozorovací studie MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• Geografické názvy
• Evropa MeSH

Identification of filamentous fungi based on morphological features is the most available approach used in clinical mycology laboratories. However, MALDI-TOF mass spectrometry is currently invaluable for identification of microorganisms because of its rapidity, simplicity, and accuracy. This study aimed to find the optimal way of identifying filamentous fungi using MALDI-TOF MS.The sample comprised 193 isolates of filamentous fungi. The identification started with morphological assessment. Then isolates were identified using MALDI-TOF MS, both directly from culture and following culture in liquid media with extraction. Subsequently, identification of 20 selected isolates was compared by sequencing of the benA gene, ITS1-5,8-ITS2, and D1-D2 LSU regions.Based on morphological criteria, 17 genera of fungi were identified. With MALDI-TOF MS performed directly from culture, nine isolates were identified to the genus level and 184 to the species level, with a total of 75 species being noted. With the MALDI-TOF MS extraction method, 190 isolates were identified to the species level, with 43 species being noted. The rates of agreement between identification using morphology and the MALDI-TOF MS direct method were 58.55% at the genus level and 22.24% at the species level. The rates of agreement between identification using morphology and the MALDI-TOF MS extraction method were 84.97% at the genus level and 46.11% at the species level. Using sequencing, 87.5% agreement was found for identification with the MALDI-TOF MS extraction method, as compared with only 43.75% for the direct method.The results suggest that the optimal approach to identification of filamentous fungi is a combination of morphological features and MALDI-TOF MS using the extraction method.

• MeSH
• Arthrodermataceae * genetika   MeSH
• diagnostické testy rutinní MeSH
• houby genetika   MeSH
• kultivační média MeSH
• spektrometrie hmotnostní - ionizace laserem za účasti matrice MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH

• MeSH
• antifungální látky terapeutické užití   MeSH
• kandidóza vulvovaginální * terapie   MeSH
• lidé MeSH
• management nemoci MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• přehledy MeSH

• MeSH
• antifungální látky farmakologie   MeSH
• Arthrodermataceae * MeSH
• mikrobiální testy citlivosti MeSH
• Publikační typ
• dopisy MeSH
• komentáře MeSH
• multicentrická studie MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

Tento návrh doporučeného postupu laboratorní diagnostiky dermatomykóz byl vypracován na základě odborné diskuze členů Pracovní skupiny pro mykologii Společnosti pro lékařskou mikrobiologii České lékařské společnosti JEP (PSM SLM ČLS JEP). Vychází z dokumentu „Doporučený postup laboratorní diagnostiky dermatomykóz“ zveřejněného na webových stránkách SLM ČLS JEP 23. 6. 2020 k všeobecné odborné diskuzi. Dosud byly pokyny v této oblasti mykologické laboratorní diagnostiky omezeny pouze na informace v příručkách a neexistoval žádný ucelený a systematický dokument na uvedené téma. Tuto mezeru se členové PSM SLM ČLS JEP snažili zaplnit, a vzniklo tak doporučení, pokrývající všechny části dermatomykologické laboratorní problematiky, od způsobu získání kvalitní anamnézy, správného postupu při odběru vzorků, jejich vyšetřování konvenčními mikroskopickými a kultivačními technikami, až po interpretaci získaných výsledků. Do této základní osnovy byly začleněny informace o diagnostickém potenciálu nových, moderních technologií, zejména molekulárně genetických metod a hmotnostní spektrometrie. Nedávno došlo k vypracování standardní evropské metodiky pro testování citlivosti dermatofytů k antimykotikům, proto byla i tato problematika do doporučení zahrnuta. Je samozřejmě počítáno s budoucí periodickou revizí tohoto dokumentu na základě nových poznatků.

This draft of guidelines for the laboratory diagnosis of dermatomycoses was developed based on discussion among members of the Czech Society for Medical Microbiology Working Group on Mycology. The document Guidelines for the Laboratory Diagnosis of Dermatomycoses was published for discussion on the Czech Society for Medical Microbiology website on 23 March 2020. Until recently, recommendations concerning this area of laboratory diagnosis in mycology were only limited to information in manuals and no comprehensive and systematic document concerning these issues was available. In an effort to fill the gap, members of the working group developed recommendations covering various laboratory aspects of mycology, from obtaining a proper history, to adequate sampling techniques, sample analyses using conventional microscopy and culture techniques, to interpretation of results. Additional information was on the diagnostic potential of novel, modern technology, in particular molecular genetic methods and mass spectrometry. The recently developed European standards for testing the susceptibility of dermatophytes to antifungals were also included in the recommendations. The document will be regularly updated based on new findings.

Projekt má za cíl prostudovat současnou epidemiologii dermatofytických infekcí na území České republiky. Výsledky studie budou mít přímý dopad v oblasti prevence, diagnostiky a terapie nejběžnějších fungálních onemocnění člověka, kterými jsou právě dermatofytózy. Pilotní epidemiologická studie probíhající na našem území od roku 2011 přinesla řadu výsledků, na které navrhovaný projekt navazuje. Projekt umožní pokračování a rozšíření započaté práce, získání přesnějších dat a také uskutečnění dílčích cílů projektu, kterými jsou monitoring nových a nově se objevujících infekcí na našem území, testování citlivostí k antimykotikům u vybraných druhových komplexů, zpracování taxonomických studií s popisy nových lidských patogenů a tvorbu nových identifikačních manuálů. Populačně genetická a fylogeografická studie druhu Arthroderma benhamiae umožní poznat původ tohoto nově se šířícího patogenu. V rámci zlepšení identifikačních postupů bude vytvořena volně dostupná databáze MALDI-TOF profilů.; The project aims to study the current epidemiology of dermatophyte infections in the Czech Republic. Its results will have a direct impact on the prevention, diagnosis and treatment of the most common fungal infections in humans. A pilot epidemiological study that has been running in our country since 2011 revealed a number of interesting results on which this project is based. The grant support would allow the continuation and expansion of the ongoing work, obtaining more accurate data and meet the other objectives of the project. These are monitoring of new and re-emerging infections, antifungal susceptibility testing of selected species, preparation of updated manuals for identification of dermatophytes and taxonomic studies with descriptions of new human pathogenic fungi. Population genetics and phytogeography study of Arthroderma benhamiae will enable trace origin of this emerging pathogen. The free available MALDI-TOF database, providing choice of cheap and rapid identification, will be developed based on the local isolates.

• MeSH
• antifungální látky terapeutické užití   MeSH
• Arthrodermataceae patogenita   účinky léků   MeSH
• lidé MeSH
• molekulární epidemiologie MeSH
• pilotní projekty MeSH
• ribozomální DNA MeSH
• spektrometrie hmotnostní - ionizace laserem za účasti matrice MeSH
• tinea diagnóza   epidemiologie   mikrobiologie   MeSH
• výzkumný projekt MeSH
• zoonózy mikrobiologie   MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• zvířata MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• dermatovenerologie
• infekční lékařství
• epidemiologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

• MeSH
• antifungální látky aplikace a dávkování   terapeutické užití   MeSH
• Candida albicans patogenita   MeSH
• flukonazol aplikace a dávkování   terapeutické užití   MeSH
• kandidóza vulvovaginální diagnóza   farmakoterapie   MeSH
• klotrimazol aplikace a dávkování   terapeutické užití   MeSH
• mykózy * diagnóza   etiologie   farmakoterapie   MeSH

Mukormykózy představují heterogenní skupinu vzácných invazivních mykóz s agresivním průběhem a vysokou mortalitou. Nejvíce ohroženou skupinou v evropské populaci jsou nemocní podstupující intenzivní léčbu pro hematologické malignity a alogenní transplantaci krvetvorných buněk. Plicní postižení je nejčastější formou mukormykózy u těchto nemocných. Předkládaná práce shrnuje aktuální literární poznatky z oblasti epidemiologie, diagnostiky a doporučení pro terapii. Přehledový článek je doplněný o kazuistiku – raritní manifestaci kožní formy mukormykózy u nemocného s akutní myeloidní leukemií. Cílem sdělení je podat přehledně aktuální poznatky o této skupině oportunních infekcí s narůstajícím klinickým významem. Jen včasná diagnostika a rychlé zahájení komplexní terapie může vést k vyléčení a záchraně nemocného.

Mucormycosis represents a heterogenous group of rare invasive fungal infections associated with an aggressive course and high mortality. In Europe, patients undergoing intensive treatment for haematological malignancies and allogeneic hematopoietic stem cell transplantation are at the highest risk of mucormycosis infection. The lungs are the most frequently affected site in these patients. This work summarizes current data regarding epidemiology, diagnosis and treatment recommendations. The review article is followed by a case report regarding the rare manifestation of cutaneous mucormycosis in an acute myeloid leukaemia patient. The aim of this work is to provide current information regarding this group of opportunistic infections with an increasing clinical impact. Only early diagnosis and rapid initiation of complex therapy can lead to a favourable outcome and complete cure.

• MeSH
• akutní myeloidní leukemie komplikace   MeSH
• antifungální látky terapeutické užití   MeSH
• invazivní mykotické infekce diagnóza   terapie   MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mukormykóza * diagnóza   etiologie   patofyziologie   terapie   MeSH
• výsledek terapie MeSH
• Check Tag
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• kazuistiky MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• přehledy MeSH